Dissecting and targeting ubiquitin networks in the course of bacterial infections

Informazioni relative al progetto

Ub-BAC

ID dell’accordo di sovvenzione: 742720

DOI

10.3030/742720

Progetto chiuso

Data della firma CE 8 Giugno 2017

Data di avvio 1 Luglio 2017

Data di completamento 30 Giugno 2022

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 500 000,00

Contributo UE

€ 2 500 000,00

Coordinato da

JOHANN WOLFGANG GOETHE-UNIVERSITAET FRANKFURT AM MAIN
Germany

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Pubblicazioni

Non-peer reviewed articles (1)

Gasdermin B in the host–pathogen tug-of-war

Autori: Maculins, T & Dikic I
Pubblicato in: Cell Research, Numero 31, 2021, Pagina/e 1043-1044, ISSN 1001-0602
Editore: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1038/s41422-021-00544-3

Peer reviewed articles (17)

Biochemical characterization of protease activity of Nsp3 from SARS-CoV-2 and its inhibition by nanobodies.

Autori: Lee A. Armstrong; Sven M. Lange; Virginia Dee Cesare; Stephen P. Matthews; Raja Sekhar Nirujogi; Isobel Cole; Anthony G. Hope; Fraser Cunningham; Rachel Toth; Rukmini Mukherjee; Denisa Bojkova; Franz S. Gruber; David W. Gray; Paul G. Wyatt; Jindrich Cinatl; Ivan Dikic; Ivan Dikic; Paul Davies; Yogesh Kulathu
Pubblicato in: PLoS ONE, Numero 4, 2021, ISSN 1932-6203
Editore: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0253364

SIK2 orchestrates actin-dependent host response uponSalmonella infection

Autori: Marcel Hahn, Adriana Covarrubias-Pinto, Lina Herhaus, Shankha Satpathy, Kevin Klann, Keith B. Boyle, Christian Münch, Krishnaraj Rajalingam, Felix Randow, Chunaram Choudhary, and Ivan Dikic
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 118(19), 2021, ISSN 1091-6490
Editore: PNAS
DOI: 10.1073/pnas.2024144118

Insights into catalysis and function of phosphoribosyl-linked serine ubiquitination

Autori: Sissy Kalayil, Sagar Bhogaraju, Florian Bonn, Donghyuk Shin, Yaobin Liu, Ninghai Gan, Jérôme Basquin, Paolo Grumati, Zhao-Qing Luo, Ivan Dikic
Pubblicato in: Nature, Numero 557/7707, 2018, Pagina/e 734-738, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-018-0145-8

Mechanism and medical implications of mammalian autophagy

Autori: Ivan Dikic, Zvulun Elazar
Pubblicato in: Nature Reviews Molecular Cell Biology, Numero 19/6, 2018, Pagina/e 349-364, ISSN 1471-0072
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-018-0003-4

Curvature induction and membrane remodeling by FAM134B reticulon homology domain assist selective ER-phagy

Autori: Ramachandra M. Bhaskara, Paolo Grumati, Javier Garcia-Pardo, Sissy Kalayil, Adriana Covarrubias-Pinto, Wenbo Chen, Mikhail Kudryashev, Ivan Dikic, Gerhard Hummer
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-10345-3

A selective ER ‐phagy exerts procollagen quality control via a Calnexin‐ FAM 134B complex

Autori: Alison Forrester, Chiara De Leonibus, Paolo Grumati, Elisa Fasana, Marilina Piemontese, Leopoldo Staiano, Ilaria Fregno, Andrea Raimondi, Alessandro Marazza, Gemma Bruno, Maria Iavazzo, Daniela Intartaglia, Marta Seczynska, Eelco Anken, Ivan Conte, Maria Antonietta De Matteis, Ivan Dikic, Maurizio Molinari, Carmine Settembre
Pubblicato in: The EMBO Journal, Numero 38/2, 2018, ISSN 0261-4189
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.201899847

ER-phagy and human diseases

Autori: Christian A. Hübner, Ivan Dikic
Pubblicato in: Cell Death & Differentiation, 2019, ISSN 1350-9047
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41418-019-0444-0

Cellular quality control by the ubiquitin-proteasome system and autophagy

Autori: Christian Pohl, Ivan Dikic
Pubblicato in: Science, Numero 366/6467, 2019, Pagina/e 818-822, ISSN 0036-8075
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aax3769

CYRI/FAM49B negatively regulates RAC1-driven cytoskeletal remodelling and protects against bacterial infection

Autori: Kyoko E. Yuki, Hadir Marei, Evgenij Fiskin, Megan M. Eva, Angelica A. Gopal, Jeremy A. Schwartzentruber, Jacek Majewski, Mathieu Cellier, Judith N. Mandl, Silvia M. Vidal, Danielle Malo, Ivan Dikic
Pubblicato in: Nature Microbiology, Numero 4/9, 2019, Pagina/e 1516-1531, ISSN 2058-5276
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-019-0484-8

Ubiquitin signaling and autophagy

Autori: Paolo Grumati, Ivan Dikic
Pubblicato in: Journal of Biological Chemistry, Numero 293/15, 2018, Pagina/e 5404-5413, ISSN 0021-9258
Editore: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.tm117.000117

Open questions: why should we care about ER-phagy and ER remodelling?

Autori: Ivan Dikic
Pubblicato in: BMC Biology, Numero 16/1, 2018, ISSN 1741-7007
Editore: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-018-0603-7

ER-phagy at a glance

Autori: Paolo Grumati, Ivan Dikic, Alexandra Stolz
Pubblicato in: Journal of Cell Science, Numero 131/17, 2018, Pagina/e jcs217364, ISSN 0021-9533
Editore: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jcs.217364

Dimerization quality control via ubiquitylation

Autori: Lina Herhaus, Ivan Dikic
Pubblicato in: Science, Numero 362/6411, 2018, Pagina/e 151-152, ISSN 0036-8075
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aav1391

Inhibition of bacterial ubiquitin ligases by SidJ–calmodulin catalysed glutamylation

Autori: Sagar Bhogaraju, Florian Bonn, Rukmini Mukherjee, Michael Adams, Moritz M. Pfleiderer, Wojciech P. Galej, Vigor Matkovic, Jaime Lopez-Mosqueda, Sissy Kalayil, Donghyuk Shin, Ivan Dikic
Pubblicato in: Nature, Numero 572/7769, 2019, Pagina/e 382-386, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1440-8

Regulation of Phosphoribosyl-Linked Serine Ubiquitination by Deubiquitinases DupA and DupB

Autori: Donghyuk Shin, Rukmini Mukherjee, Yaobin Liu, Alexis Gonzalez, Florian Bonn, Yan Liu, Vladimir V. Rogov, Marcel Heinz, Alexandra Stolz, Gerhard Hummer, Volker Dötsch, Zhao-Qing Luo, Sagar Bhogaraju, Ivan Dikic
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 77/1, 2020, Pagina/e 164-179.e6, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.10.019

Mitochondrial Functions in Infection and Immunity

Autori: Varnesh Tiku, Man-Wah Tan, Ivan Dikic
Pubblicato in: Trends in Cell Biology, Numero 30/4, 2020, Pagina/e 263-275, ISSN 0962-8924
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tcb.2020.01.006

Serine-ubiquitination regulates Golgi morphology and the secretory pathway upon Legionella infection

Autori: Liu Y, Mukherjee R, Bonn F, Colby T, Matic I, Glogger M, Heilemann M, Dikic I
Pubblicato in: Cell Death & Differntiation, Numero 28, 2021, Pagina/e 2957-2969, ISSN 1350-9047
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41418-021-00830-y