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Computational design of proteins binding nucleosomal DNA with specificity for therapeutic applications

Ziel

DNA compresses in the cell by forming nucleosome particles, which diminish the accessibility of transcription factors to DNA and provide fine regulatory mechanisms for gene expression and replication. Some proteins can still bind the exposed face of nucleosomal DNA and are known to promote cancer or viral infection, and strategies to block such binding events are promising for developing new epigenetic-like therapies. However, structural information on proteins binding nucleosomal DNA is too limited for the rational design of new drugs. The current proposal aims to combine expertise of the researcher (on protein design) and the host group (on DNA and protein-DNA interactions) to computationally design and experimentally test proteins binding nucleosomal DNA with specificity. The researcher will first develop a computational design protocol and subsequently test it against nucleosomes of known structure. After experimental validation, he will design proteins blocking the nucleosomal DNA sites targeted by two proteins (FoxA1 and GATA) known to promote breast and prostate cancer. The proposed project uses computational approaches for designing protein structures and protein-DNA interactions, and experimental approaches to characterize protein-DNA binding and structure of the designed complexes. This multidisciplinary project is devised to expand the design capabilities of the researcher towards protein-DNA interactions, which hold great potential for medical and biotechnological applications, in a research context of high biomedical impact. This project devises a training plan on computational, experimental and transferable skills necessary for an independent research position, and provides an opportunity to bring protein design approaches into the European research. The novelty of this protein-DNA design approach will be of wide interest for the scientific and non-scientific communities, and will be disseminated accordingly.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2016

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

FUNDACIO INSTITUT DE RECERCA BIOMEDICA (IRB BARCELONA)
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 170 121,60
Adresse
CARRER BALDIRI REIXAC 10-12 PARC SCIENTIFIC DE BARCELONA
08028 BARCELONA
Spanien

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Region
Este Cataluña Barcelona
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 170 121,60
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