Objectif
Transcription in single cells is a stochastic process that arises from the random collision of molecules, resulting in heterogeneity in gene expression in cell populations. This heterogeneity in gene expression influences cell fate decisions and disease progression. Interestingly, gene expression variability is not the same for every gene: noise can vary by several orders of magnitude across transcriptomes. The reason for this transcript-specific behavior is that genes are not transcribed in a continuous fashion, but can show transcriptional bursting, with periods of gene activity followed by periods of inactivity. The noisiness of a gene can be tuned by changing the duration and the rate of switching between periods of activity and inactivity. Even though transcriptional bursting is conserved from bacteria to yeast to human cells, the origin and regulators of bursting remain largely unknown. Here, I will use cutting-edge single-molecule RNA imaging techniques to directly observe and measure transcriptional bursting in living yeast cells. First, bursting properties will be quantified at different endogenous and mutated genes to evaluate the contribution of cis-regulatory promoter elements on bursting. Second, the role of trans-regulatory complexes will be characterized by dynamic depletion or gene-specific targeting of transcription regulatory proteins and observing changes in RNA synthesis in real-time. Third, I will develop a new technology to visualize the binding dynamics of single transcription factor molecules at the transcription site, so that the stability of upstream regulatory factors and the RNA output can directly be compared in the same cell. Finally, I will examine the phenotypic effect of different bursting patterns on organismal fitness. Overall, these approaches will reveal how bursting is regulated at the molecular level and how different bursting patterns affect the heterogeneity and fitness of the organism.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2017-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1066 CX AMSTERDAM
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.