Objectif
How do organisms evolve? I propose to study how biochemical networks reorganize during evolution without compromising fitness. This is a complex problem: firstly, it is hard to know if a mutation increased fitness because this depends on the environment it arose in, which is typically unknown. Secondly, it is hard to find out how adaptive mutations improve fitness, because in cells, all biochemical networks are connected. I will reduce the complexity by two approaches, focused on symmetry-breaking in budding yeast, a functionally conserved process, which is the first step for polarity establishment and essential for proliferation.
First, I will study how adaptive mutations improve fitness in yeast cells, which are evolved after the deletion of an important symmetry-breaking gene. I will use fluorescent live-cell microscopy of polarisation markers to measure fitness, defined as the rate of symmetry breaking. I will combine my data with a kinetic mathematical model to determine how specific network structures facilitate evolutionary network reorganisation.
Second, to test predicted network structures, I will build minimal evolvable networks for symmetry breaking in vitro. In my definition of such a network, all of the components are essential for either fitness or evolvability. I will encapsulate the necessary proteins in emulsion droplets to form a functional evolvable network and use fluorescence microscopy to measure its fitness (the rate of a single protein-spot formation on a droplet membrane) and evolvability (the number of accessible neutral or adaptive mutations in the one-step mutational landscape of the network). Next, I will study how increasing the number of components affects the network’s evolvability and fitness.
This research will explain how proteins essential in one species have been lost in closely related species. My expertise with in vitro systems, modelling, biophysics and evolution makes me uniquely qualified for this ambitious project.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences biologiques biophysique
- sciences naturelles mathématiques mathématiques appliquées modèle mathématique
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2017-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
2628 CN DELFT
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.