Sampling Protein cOmplex Conformational Space with native top down Mass Spectrometry

Informations projet

SPOCkS MS

N° de convention de subvention: 759661

DOI

10.3030/759661

Projet clôturé

Date de signature de la CE 4 Octobre 2017

Date de début 1 Janvier 2018

Date de fin 30 Septembre 2024

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 999 000,00

Contribution de l’UE

€ 1 999 000,00

Coordonné par

LEIBNIZ-INSTITUT FUR VIROLOGIE
Germany

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Publications

Non-peer reviewed articles (1)

Overview of the 2023 Physical Virology Gordon Research Conference—Viruses at Multiple Levels of Complexity

Auteurs: Michael F. Hagan, Roya Zandi, Charlotte Uetrecht
Publié dans: Viruses, Numéro 16, 2024, Page(s) 895, ISSN 1999-4915
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v16060895

Peer reviewed articles (11)

Caldendrin and myosin V regulate synaptic spine apparatus localization via ER stabilization in dendritic spines

Auteurs: Anja Konietzny; Jasper Grendel; Alan Kadek; Michael Bucher; Yuhao Han; Nathalie Hertrich; Dick H W Dekkers; Jeroen A A Demmers; Kay Grünewald; Charlotte Uetrecht; Marina Mikhaylova
Publié dans: The EMBO Journal, Numéro 1, 2021, ISSN 1460-2075
Éditeur: EMBOpress
DOI: 10.15252/embj.2020106523

Subtleties in Clathrin heavy chain binding boxes provide selectivity among adaptor proteins of budding yeast

Auteurs: Lucas A. Defelipe, Katharina Veith, Osvaldo Burastero, Tatiana Kupriianova, Isabel Bento, Michal Skruzny, Knut Kölbel, Charlotte Uetrecht, Roland Thuenauer, Maria M. García-Alai
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-54037-z

A validated protocol to UV-inactivate SARS-CoV-2 and herpesvirus-infected cells

Auteurs: Timothy K. Soh, Susanne Pfefferle, Stephanie Wurr, Ronald von Possel, Lisa Oestereich, Toni Rieger, Charlotte Uetrecht, Maria Rosenthal, Jens B. Bosse
Publié dans: PLOS ONE, Numéro 18, 2023, Page(s) e0274065, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0274065

Further insights from structural mass spectrometry into endocytosis adaptor protein assemblies

Auteurs: Johannes Heidemann, Knut Kölbel, Albert Konijnenberg, Jeroen Van Dyck, Maria Garcia-Alai, Rob Meijers, Frank Sobott, Charlotte Uetrecht
Publié dans: International Journal of Mass Spectrometry, Numéro 447, 2020, Page(s) 116240, ISSN 1387-3806
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.IJMS.2019.116240

Processing of the SARS-CoV pp1a/ab nsp7–10 region

Auteurs: Boris Krichel, Sven Falke, Rolf Hilgenfeld, Lars Redecke, Charlotte Uetrecht
Publié dans: Biochemical Journal, Numéro 477/5, 2020, Page(s) 1009-1019, ISSN 0264-6021
Éditeur: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bcj20200029

Crystal structure of a domain‐swapped photoactivatable sfGFP variant provides evidence for GFP folding pathway

Auteurs: Stephanie Kesgin‐Schaefer, Johannes Heidemann, Anke Puchert, Knut Koelbel, Briony A. Yorke, Nils Huse, Arwen R. Pearson, Charlotte Uetrecht, Henning Tidow
Publié dans: The FEBS Journal, Numéro 286/12, 2019, Page(s) 2329-2340, ISSN 1742-464X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/febs.14797

Top-Down and Bottom-Up Proteomics Methods to Study RNA Virus Biology

Auteurs: Yogy Simanjuntak, Kira Schamoni-Kast, Alice Grün, Charlotte Uetrecht, Pietro Scaturro
Publié dans: Viruses, 2021, ISSN 1999-4915
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v13040668

X-ray screening identifies active site and allosteric inhibitors of SARS-CoV-2 main protease.

Auteurs: Sebastian Günther; P. Reinke; Yaiza Fernández-García; J. Lieske; Thomas J. Lane; Helen M. Ginn; Faisal Hammad Mekky Koua; Christiane Ehrt; W. Ewert; Dominik Oberthuer; Oleksandr Yefanov; S. Meier; Kristina Lorenzen; Boris Krichel; Janine-Denise Kopicki; Luca Gelisio; W. Brehm; Ilona Dunkel; B. Seychell; Henry Gieseler; Brenna Norton-Baker; Brenna Norton-Baker; Beatriz Escudero-Pérez; M. Domara
Publié dans: Science, Numéro 3, 2021, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abf7945

Hallmarks of Alpha- and Betacoronavirus non-structural protein 7+8 complexes.

Auteurs: Boris Krichel; Ganesh Bylapudi; C. Schmidt; Clement E. Blanchet; Robin Schubert; L. Brings; Martin Koehler; Renato Zenobi; Dmitri I. Svergun; Kristina Lorenzen; Ramakanth Madhugiri; John Ziebuhr; Charlotte Uetrecht; Charlotte Uetrecht
Publié dans: Science Advances, Numéro 1, 2021, ISSN 2375-2548
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.abf1004

RNA to Rule Them All: Critical Steps in Lassa Virus Ribonucleoparticle Assembly and Recruitment

Auteurs: Lennart Sänger, Harry M. Williams, Dingquan Yu, Dominik Vogel, Jan Kosinski, Maria Rosenthal, Charlotte Uetrecht
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 145, 2023, Page(s) 27958-27974, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c07325

NMR Experiments Provide Insights into Ligand-Binding to the SARS-CoV-2 Spike Protein Receptor-Binding Domain

Auteurs: Robert Creutznacher; Thorben Maass; Barbora Veselkova; George Ssebyatika; Thomas Krey; Martin Empting; Norbert Tautz; Martin Frank; Knut Kölbel; Charlotte Uetrecht; Thomas Peters
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 29, 2022, Page(s) 13060-13065, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c05603

Other (1)

The kinetics of SARS-CoV-2 nsp7-11 polyprotein processing and impact on complexation with nsp16

Auteurs: Kira Schamoni-Kast, Boris Krichel, Tomislav Damjanović, Thomas Kierspel, Sibel Toker, Charlotte Uetrecht
Publié dans: bioRxiv, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.01.06.574466

Book chapters (1)

Structural mass spectrometry goes viral

Auteurs: Jasmin Dülfer, Alan Kadek, Janine-Denise Kopicki, Boris Krichel, Charlotte Uetrecht
Publié dans: Complementary Strategies to Understand Virus Structure and Function, Numéro 105, 2019, Page(s) 189-238, ISBN 9780128184561
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/bs.aivir.2019.07.003