Sampling Protein cOmplex Conformational Space with native top down Mass Spectrometry

Informazioni relative al progetto

SPOCkS MS

ID dell’accordo di sovvenzione: 759661

DOI

10.3030/759661

Progetto chiuso

Data della firma CE 4 Ottobre 2017

Data di avvio 1 Gennaio 2018

Data di completamento 30 Settembre 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 999 000,00

Contributo UE

€ 1 999 000,00

Coordinato da

LEIBNIZ-INSTITUT FUR VIROLOGIE
Germany

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I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Non-peer reviewed articles (1)

Overview of the 2023 Physical Virology Gordon Research Conference—Viruses at Multiple Levels of Complexity

Autori: Michael F. Hagan, Roya Zandi, Charlotte Uetrecht
Pubblicato in: Viruses, Numero 16, 2024, Pagina/e 895, ISSN 1999-4915
Editore: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v16060895

Peer reviewed articles (11)

Caldendrin and myosin V regulate synaptic spine apparatus localization via ER stabilization in dendritic spines

Autori: Anja Konietzny; Jasper Grendel; Alan Kadek; Michael Bucher; Yuhao Han; Nathalie Hertrich; Dick H W Dekkers; Jeroen A A Demmers; Kay Grünewald; Charlotte Uetrecht; Marina Mikhaylova
Pubblicato in: The EMBO Journal, Numero 1, 2021, ISSN 1460-2075
Editore: EMBOpress
DOI: 10.15252/embj.2020106523

Subtleties in Clathrin heavy chain binding boxes provide selectivity among adaptor proteins of budding yeast

Autori: Lucas A. Defelipe, Katharina Veith, Osvaldo Burastero, Tatiana Kupriianova, Isabel Bento, Michal Skruzny, Knut Kölbel, Charlotte Uetrecht, Roland Thuenauer, Maria M. García-Alai
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-54037-z

A validated protocol to UV-inactivate SARS-CoV-2 and herpesvirus-infected cells

Autori: Timothy K. Soh, Susanne Pfefferle, Stephanie Wurr, Ronald von Possel, Lisa Oestereich, Toni Rieger, Charlotte Uetrecht, Maria Rosenthal, Jens B. Bosse
Pubblicato in: PLOS ONE, Numero 18, 2023, Pagina/e e0274065, ISSN 1932-6203
Editore: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0274065

Further insights from structural mass spectrometry into endocytosis adaptor protein assemblies

Autori: Johannes Heidemann, Knut Kölbel, Albert Konijnenberg, Jeroen Van Dyck, Maria Garcia-Alai, Rob Meijers, Frank Sobott, Charlotte Uetrecht
Pubblicato in: International Journal of Mass Spectrometry, Numero 447, 2020, Pagina/e 116240, ISSN 1387-3806
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.IJMS.2019.116240

Processing of the SARS-CoV pp1a/ab nsp7–10 region

Autori: Boris Krichel, Sven Falke, Rolf Hilgenfeld, Lars Redecke, Charlotte Uetrecht
Pubblicato in: Biochemical Journal, Numero 477/5, 2020, Pagina/e 1009-1019, ISSN 0264-6021
Editore: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bcj20200029

Crystal structure of a domain‐swapped photoactivatable sfGFP variant provides evidence for GFP folding pathway

Autori: Stephanie Kesgin‐Schaefer, Johannes Heidemann, Anke Puchert, Knut Koelbel, Briony A. Yorke, Nils Huse, Arwen R. Pearson, Charlotte Uetrecht, Henning Tidow
Pubblicato in: The FEBS Journal, Numero 286/12, 2019, Pagina/e 2329-2340, ISSN 1742-464X
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/febs.14797

Top-Down and Bottom-Up Proteomics Methods to Study RNA Virus Biology

Autori: Yogy Simanjuntak, Kira Schamoni-Kast, Alice Grün, Charlotte Uetrecht, Pietro Scaturro
Pubblicato in: Viruses, 2021, ISSN 1999-4915
Editore: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v13040668

X-ray screening identifies active site and allosteric inhibitors of SARS-CoV-2 main protease.

Autori: Sebastian Günther; P. Reinke; Yaiza Fernández-García; J. Lieske; Thomas J. Lane; Helen M. Ginn; Faisal Hammad Mekky Koua; Christiane Ehrt; W. Ewert; Dominik Oberthuer; Oleksandr Yefanov; S. Meier; Kristina Lorenzen; Boris Krichel; Janine-Denise Kopicki; Luca Gelisio; W. Brehm; Ilona Dunkel; B. Seychell; Henry Gieseler; Brenna Norton-Baker; Brenna Norton-Baker; Beatriz Escudero-Pérez; M. Domara
Pubblicato in: Science, Numero 3, 2021, ISSN 0036-8075
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abf7945

Hallmarks of Alpha- and Betacoronavirus non-structural protein 7+8 complexes.

Autori: Boris Krichel; Ganesh Bylapudi; C. Schmidt; Clement E. Blanchet; Robin Schubert; L. Brings; Martin Koehler; Renato Zenobi; Dmitri I. Svergun; Kristina Lorenzen; Ramakanth Madhugiri; John Ziebuhr; Charlotte Uetrecht; Charlotte Uetrecht
Pubblicato in: Science Advances, Numero 1, 2021, ISSN 2375-2548
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.abf1004

RNA to Rule Them All: Critical Steps in Lassa Virus Ribonucleoparticle Assembly and Recruitment

Autori: Lennart Sänger, Harry M. Williams, Dingquan Yu, Dominik Vogel, Jan Kosinski, Maria Rosenthal, Charlotte Uetrecht
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 145, 2023, Pagina/e 27958-27974, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c07325

NMR Experiments Provide Insights into Ligand-Binding to the SARS-CoV-2 Spike Protein Receptor-Binding Domain

Autori: Robert Creutznacher; Thorben Maass; Barbora Veselkova; George Ssebyatika; Thomas Krey; Martin Empting; Norbert Tautz; Martin Frank; Knut Kölbel; Charlotte Uetrecht; Thomas Peters
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 29, 2022, Pagina/e 13060-13065, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c05603

Other (1)

The kinetics of SARS-CoV-2 nsp7-11 polyprotein processing and impact on complexation with nsp16

Autori: Kira Schamoni-Kast, Boris Krichel, Tomislav Damjanović, Thomas Kierspel, Sibel Toker, Charlotte Uetrecht
Pubblicato in: bioRxiv, 2024
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.01.06.574466

Book chapters (1)

Structural mass spectrometry goes viral

Autori: Jasmin Dülfer, Alan Kadek, Janine-Denise Kopicki, Boris Krichel, Charlotte Uetrecht
Pubblicato in: Complementary Strategies to Understand Virus Structure and Function, Numero 105, 2019, Pagina/e 189-238, ISBN 9780128184561
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/bs.aivir.2019.07.003