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Foundations of Geometric Statistics and Their Application in the Life Sciences

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Book chapters (6)
Advances in Geometric Statistics for Manifold Dimension Reduction (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Xavier Pennec
Publié dans: Handbook of Variational Methods for Nonlinear Geometric Data, 2020, Page(s) 339-359, ISBN 978-3-030-31350-0
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-31351-7_11

Beyond Riemannian geometry: The affine connection setting for transformation groups (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Pennec, Xavier; Lorenzi, Marco
Publié dans: Riemannian Geometric Statistics in Medical Image Analysis, 2021, Page(s) pp.169-229, ISBN 978-0-12-814725-2
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/b978-0-12-814725-2.00012-1

Manifold-valued image processing with SPD matrices (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Xavier Pennec
Publié dans: Riemannian Geometric Statistics in Medical Image Analysis, 2020, Page(s) 75-134, ISBN 9780-128147252
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/B978-0-12-814725-2.00010-8

Parallel transport, a central tool in geometric statistics for computational anatomy: Application to cardiac motion modeling (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nicolas Guigui; Xavier Pennec
Publié dans: Handbook of Statistics, volume 46: Geometry and Statistics; Editors: Frank Nielsen; Arni S.R. Srinivasa Rao; C.R. Rao., Numéro 46, 2022, Page(s) 285-326, ISBN 978-0-323-91345-4
Éditeur: Elsevier - Academic Press
DOI: 10.1016/bs.host.2022.03.006

Statistical Analysis of Organs’ Shapes and Deformations: The Riemannian and the Affine Settings in Computational Anatomy (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Xavier Pennec
Publié dans: Digital Anatomy - Applications of Virtual, Mixed and Augmented Reality, 2021, Page(s) 159-183, ISBN 978-3-030-61904-6
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-61905-3_9

Bias on estimation in quotient space and correction methods (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nina Miolane, Loic Devilliers, Xavier Pennec
Publié dans: Riemannian Geometric Statistics in Medical Image Analysis, 2024, Page(s) 343-376, ISBN 978-0-12-814725-2
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/b978-0-12-814725-2.00017-0

Thesis and dissertations (4)
Barycentric embeddings for geometric manifold learning : with application to shapes and graphs

Auteurs: Elodie Maignant
Publié dans: Numéro 06-12-2023, 2023
Éditeur: Université Côte d’Azur

Riemannian and stratified geometries on covariance and correlation matrices

Auteurs: Thanwerdas, Yann
Publié dans: Numéro 2022-05-22, 2022
Éditeur: Universite Côte d'Azur

Riemannian and sub-riemannian methods for dimension reduction

Auteurs: Morten Akhøj Pedersen
Publié dans: Numéro 23-11-2023, 2023
Éditeur: Université Côte d’Azur, France & University of Copenhagen, Denmark

Computational methods for statistical estimation on Riemannian manifolds and application to the study of cardiac deformations

Auteurs: Guigui, Nicolas
Publié dans: Numéro 2023-11-18, 2021
Éditeur: Univresité Côte d'Azur

Peer reviewed articles (14)
A Bi-Invariant Statistical Model Parametrized by Mean and Covariance on Rigid Motions (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Emmanuel Chevallier, Nicolas Guigui
Publié dans: Entropy, Numéro 22/4, 2020, Page(s) 432, ISSN 1099-4300
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/e22040432

O(n)-invariant Riemannian metrics on SPD matrices (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Yann Thanwerdas; Xavier Pennec
Publié dans: Linear Algebra and its Applications, Numéro Vol. 661, 2023, Page(s) 163-201, ISSN 0024-3795
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.laa.2022.12.009

Theoretically and computationally convenient geometries on full-rank correlation matrices (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Yann Thanwerdas; Xavier Pennec
Publié dans: SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, Numéro Vol. 43, no 4, 2022, Page(s) 1851 - 1872, ISSN 1095-7162
Éditeur: SIAM
DOI: 10.48550/arxiv.2201.06282

The Measurement and Analysis of Shapes (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Benn, James; Marsland, Stephen
Publié dans: Annals of Global Analysis and Geometry, inPress, 62, pp.47-70., Numéro 62, 2022, Page(s) 47–70, ISSN 0232-704X
Éditeur: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10455-022-09839-z

Permutation-Invariant Log-Euclidean Geometries on Full-Rank Correlation Matrices (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Yann Thanwerdas
Publié dans: SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, Numéro 45, 2024, Page(s) 930-953, ISSN 0895-4798
Éditeur: Society for Industrial and Applied Mathematics
DOI: 10.1137/22m1538144

Bures–Wasserstein Minimizing Geodesics between Covariance Matrices of Different Ranks (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
Publié dans: SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, Numéro 44, 2023, Page(s) 1447-1476, ISSN 0895-4798
Éditeur: Society for Industrial and Applied Mathematics
DOI: 10.1137/22m149168x

Numerical Accuracy of Ladder Schemes for Parallel Transport on Manifolds (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nicolas Guigui, Xavier Pennec
Publié dans: Foundations of Computational Mathematics, 2021, ISSN 1615-3375
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s10208-021-09515-x

Geometry of sample spaces (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Philipp Harms, Peter W. Michor, Xavier Pennec, Stefan Sommer
Publié dans: Differential Geometry and its Applications, Numéro 90, 2023, Page(s) 102029, ISSN 0926-2245
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.difgeo.2023.102029

Introduction to Riemannian Geometry and Geometric Statistics: from basic theory to implementation with Geomstats (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nicolas Guigui; Nina Miolane; Xavier Pennec
Publié dans: Foundations and Trends® in Machine Learning, Numéro Vol 16, Numéro 3, 2023, Page(s) 329-493, ISSN 1935-8237
Éditeur: Now Publishers Inc.
DOI: 10.1561/2200000098

Classifying histograms of medical data using information geometry of beta distributions (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Alice Le Brigant, Nicolas Guigui, Sana Rebbah, Stéphane Puechmorel
Publié dans: IFAC-PapersOnLine, Numéro 54, 2021, Page(s) 514-520, ISSN 2405-8963
Éditeur: International Federation of Automatic Control.
DOI: 10.1016/j.ifacol.2021.06.110

Voxel-based assessments of treatment effects on longitudinal brain changes in the Multidomain Alzheimer Preventive Trial cohort (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Raphaël Sivera, Nicolas Capet, Valeria Manera, Roxane Fabre, Marco Lorenzi, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Philippe Robert
Publié dans: Neurobiology of Aging, Numéro 94, 2020, Page(s) 50-59, ISSN 0197-4580
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.neurobiolaging.2019.11.020

The geometry of mixed-Euclidean metrics on symmetric positive definite matrices (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Yann Thanwerdas; Xavier Pennec
Publié dans: Differential Geometry and its Applications, Numéro Vol.81, 2022, Page(s) 101867, ISSN 0926-2245
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.difgeo.2022.101867

Graph alignment exploiting the spatial organization improves the similarity of brain networks (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Anna Calissano, Theodore Papadopoulo, Xavier Pennec, Samuel Deslauriers‐Gauthier
Publié dans: Human Brain Mapping, Numéro 45, 2024, Page(s) e26554, ISSN 1065-9471
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hbm.26554

Geomstats: A Python Package for Riemannian Geometry in Machine Learning

Auteurs: Nina Miolane, Nicolas Guigui, Alice Le Brigant, Johan Mathe, Benjamin Hou, Yann Thanwerdas, Stefan Heyder, Olivier Peltre, Niklas Koep, Hadi Zaatiti, Hatem Hajri, Yann Cabanes, Thomas Gerald, Paul Chauchat, Christian Shewmake, Daniel Brooks, Bernhard Kainz, Claire Donnat, Susan Holmes, Xavier Pennec
Publié dans: JMLR - Journal of Machine Learning Research, Numéro 21, 2020, Page(s) 19-027, ISSN 1533-7928
Éditeur: JMLR

Conference proceedings (15)
Parallel Transport on Kendall Shape Spaces (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nicolas Guigui, Elodie Maignant, Alain Trouvé, Xavier Pennec
Publié dans: Geometric Science of Information - 5th International Conference, GSI 2021, Paris, France, July 21–23, 2021, Proceedings, Numéro 12829, 2021, Page(s) 103-110, ISBN 978-3-030-80208-0
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-80209-7_12

Rethinking the Riemannian Logarithm on Flag Manifolds as an Orthogonal Alignment Problem (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Tom Szwagier, Xavier Pennec
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science, Geometric Science of Information, Numéro Proc of Geometric Science of Information (GSI 2023) - LNCS 14071, 2023, Page(s) 375-383
Éditeur: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-38271-0_37

Cardiac Motion Modeling With Parallel Transport And Shape Splines (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nicolas Guigui, Pamela Moceri, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
Publié dans: 2021 IEEE 18th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2021, Page(s) 1394-1397, ISBN 978-1-6654-1246-9
Éditeur: IEEE
DOI: 10.1109/isbi48211.2021.9433887

Towards Quotient Barycentric Subspaces (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Anna Calissano, Elodie Maignant, Xavier Pennec
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science, Geometric Science of Information, Numéro LNCS 14071, 2023, Page(s) 366-374
Éditeur: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-38271-0_36

Geodesics and Curvature of the Quotient-Affine Metrics on Full-Rank Correlation Matrices (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
Publié dans: Geometric Science of Information - 5th International Conference, GSI 2021, Paris, France, July 21–23, 2021, Proceedings, Numéro 12829, 2021, Page(s) 93-102, ISBN 978-3-030-80208-0
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-80209-7_11

Riemannian Locally Linear Embedding with Application to Kendall Shape Spaces (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Elodie Maignant, Alain Trouvé, Xavier Pennec
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science, Geometric Science of Information, Numéro LNCS 14071, 2023, Page(s) 12-20
Éditeur: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-38271-0_2

Exploration of Balanced Metrics on Symmetric Positive Definite Matrices (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
Publié dans: Geometric Science of Information - 4th International Conference, GSI 2019, Toulouse, France, August 27–29, 2019, Proceedings, Numéro 11712, 2019, Page(s) 484-493, ISBN 978-3-030-26979-1
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-26980-7_50

Symmetric Algorithmic Components for Shape Analysis with Diffeomorphisms (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nicolas Guigui, Shuman Jia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
Publié dans: Geometric Science of Information - 4th International Conference, GSI 2019, Toulouse, France, August 27–29, 2019, Proceedings, Numéro 11712, 2019, Page(s) 759-768, ISBN 978-3-030-26979-1
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-26980-7_79

Is Affine-Invariance Well Defined on SPD Matrices? A Principled Continuum of Metrics (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
Publié dans: Geometric Science of Information - 4th International Conference, GSI 2019, Toulouse, France, August 27–29, 2019, Proceedings, Numéro 11712, 2019, Page(s) 502-510, ISBN 978-3-030-26979-1
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-26980-7_52

Wrapped statistical models on manifolds: motivations, the case SE(n), and generalization to symmetric spaces (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Emmanuel Chevallier; Nicolas Guigui
Publié dans: Proc. of SPIGL 2020: Geometric Structures of Statistical Physics, Information Geometry, and Learning, 2021, Page(s) 96–106
Éditeur: Springer
DOI: 10.1007/978-3-030-77957-3_5

Introduction to Geometric Learning in Python with Geomstats (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nina Miolane, Nicolas Guigui, Hadi Zaatiti, Christian Shewmake, Hatem Hajri, Daniel Brooks, Alice Le Brigant, Johan Mathe, Benjamin Hou, Yann Thanwerdas, Stefan Heyder, Olivier Peltre, Niklas Koep, Yann Cabanes, Thomas Gerald, Paul Chauchat, Bernhard Kainz, Claire Donnat, Susan Holmes, Xavier Pennec
Publié dans: Proceedings of the 19th Python in Science Conference, 2020, Page(s) 48-57
Éditeur: SciPy
DOI: 10.25080/majora-342d178e-007

A Reduced Parallel Transport Equation on Lie Groups with a Left-Invariant Metric (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nicolas Guigui, Xavier Pennec
Publié dans: Geometric Science of Information - 5th International Conference, GSI 2021, Paris, France, July 21–23, 2021, Proceedings, Numéro 12829, 2021, Page(s) 119-126, ISBN 978-3-030-80208-0
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-80209-7_14

Characterization of Invariant Inner Products (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science, Geometric Science of Information, Numéro Proc of Geometric Science of Information (GSI 2023) - LNCS 14071, 2023, Page(s) 384-391
Éditeur: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-38271-0_38

Tangent Phylogenetic PCA (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Morten Akhøj, Xavier Pennec, Stefan Sommer
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science, Image Analysis, Numéro Proc of Scandinavian Conference on Image Analysis 2023, LNCS13886, 2023, Page(s) 77-90
Éditeur: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-31438-4_6

Investigation of the Impact of Normalization on the Study of Interactions Between Myocardial Shape and Deformation (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maxime Di Folco, Nicolas Guigui, Patrick Clarysse, Pamela Moceri, Nicolas Duchateau
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science, Functional Imaging and Modeling of the Heart, Numéro LNCS 12738, 2024, Page(s) 223-231
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-78710-3_22

Other (8)
The curse of isotropy: from principal components to principal subspaces (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Tom Szwagier, Xavier Pennec
Publié dans: 2024
Éditeur: arxiv preprint
DOI: 10.48550/arxiv.2307.15348

The Geometry of Right-Invariant Metrics

Auteurs: James Benn, Stephen Marsland
Publié dans: https://hal.science/hal-04360903, 2024
Éditeur: hal preprint

Flagfolds (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Buet, Blanche; Pennec, Xavier
Publié dans: https://inria.hal.science/hal-04112465, 2023
Éditeur: arxiv preprint
DOI: 10.48550/arxiv.2305.10583

Principal subbundles for dimension reduction (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Akhøj, Morten; Benn, James; Grong, Erlend; Sommer, Stefan; Pennec, Xavier
Publié dans: https://inria.hal.science/hal-04156036, 2023
Éditeur: arxiv preprint
DOI: 10.48550/arxiv.2307.03128

Effective formulas for the geometry of normal homogeneous spaces. Application to flag manifolds (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Rabenoro, Dimbihery; Pennec, Xavier
Publié dans: https://doi.org/10.48550/arxiv.2302.14810, 2024
Éditeur: arxiv preprint
DOI: 10.48550/arxiv.2302.14810

The Currents Space of Graphs

Auteurs: Benn, James; Calissano, Anna; Marsland, Stephen; Pennec, Xavier
Publié dans: https://hal.inria.fr/hal-03910825, 2022
Éditeur: arxiv preprint

Curvature effects on the empirical mean in Riemannian and affine Manifolds: a non-asymptotic high concentration expansion in the small-sample regime (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Pennec, Xavier
Publié dans: https://inria.hal.science/hal-02157952, 2019
Éditeur: arxiv preprint
DOI: 10.48550/arxiv.1906.07418

A geometric framework for asymptotic inference of principal subspaces in PCA (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Rabenoro, Dimbihery; Pennec, Xavier
Publié dans: https://inria.hal.science/hal-03842125, 2024
Éditeur: arxiv preprint
DOI: 10.48550/arxiv.2209.02025

Monographic books (2)
Riemannian Geometric Statistics in Medical Image Analysis (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Xavier Pennec, Stefan Sommer, Tom Fletcher
Publié dans: 2020, ISBN 9780-128147252
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/C2017-0-01561-6

Multimodal Brain Image Analysis and Mathematical Foundations of Computational Anatomy - 4th International Workshop, MBIA 2019, and 7th International Workshop, MFCA 2019, Held in Conjunction with MICCAI 2019, Shenzhen, China, October 17, 2019, Proceedings (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Dajiang Zhu, Jingwen Yan, Heng Huang, Li Shen, Paul M. Thompson, Carl-Fredrik Westin, Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen, Tom Fletcher, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science (LNCS), Numéro 11846, 2019, ISBN 978-3-030-33226-6
Éditeur: Springer
DOI: 10.1007/978-3-030-33226-6

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Dernière mise à jour: 26 Mai 2025

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