Objectif
CRISPR-Cas systems are microbial defense systems that provide prokaryotes with acquired and heritable DNA-based immunity against selfish genetic elements, primarily viruses. However, the full scope of benefits that these systems can provide, as well as their costs remain unknown. Specifically, it is unclear whether the benefits against viral infection outweigh the continual costs incurred even in the absence of parasitic elements, and whether CRISPR-Cas systems affect microbial genome diversity in nature.
Since CRISPR-Cas systems can impede lateral gene transfer, it is often assumed that they reduce genetic diversity. Conversely, our recent results suggest the exact opposite: that these systems generate a high level of genomic diversity within populations. We have recently combined genomics of environmental strains and experimental genetics to show that archaea frequently acquire CRISPR immune memory, known as spacers, from chromosomes of related species in the environment. The presence of these spacers reduces gene exchange between lineages, indicating that CRISPR-Cas contributes to diversification. We have also shown that such inter-species mating events induce the acquisition of spacers against a strain's own replicons, supporting a role for CRISPR-Cas systems in generating deletions in natural plasmids and unessential genomic loci, again increasing genome diversity within populations.
Here we aim to test our hypothesis that CRISPR-Cas systems increase within-population diversity, and quantify their benefits to both cells and populations, using large-scale genomics and experimental evolution. We will explore how these systems alter the patterns of recombination within and between species, and explore the potential involvement of CRISPR-associated proteins in cellular DNA repair.
This work will reveal the eco-evolutionary role of CRISPR-Cas systems in shaping microbial populations, and open new research avenues regarding additional roles beyond anti-viral defense
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
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ERC-ADG - Advanced Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2017-ADG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
69978 Tel Aviv
Israël
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.