Objetivo
The increasing availability of high-throughput ‘omics technologies results in unprecedented opportunities for precision medicine and biomedical research. With the increasing availability of large amounts of data (‘big data’), data analysis and interpretation have become a major bottleneck.
Pathway analysis techniques are used to incorporate existing biological knowledge into the data analysis and allow researchers to focus on the interpretation of regulated biological processes. Despite the existence of many advanced pathway analysis algorithms, most leading pathway analysis resources still rely on simplistic ‘gene set over representation’ analyses (ORA) and cannot integrate data from different ‘omics approaches. Reactome is one of the most popular resources for pathway information. Its open-access data model, powerful web interface, and stringent manual curation and peer-review provide an ideal foundation for this project’s developments.
In this project, I will extend Reactome towards an analysis platform for multi-omics biomedical studies. I will replace its current ORA approach with more sophisticated pathway algorithms supporting transcriptomics, microarray, proteomics, and metabolomics data. Next, I will extend Reactome to analyse datasets of samples that cannot be attributed to a phenotype. The extended version of Reactome will be able to derive one expression value per pathway which can then be correlated with clinical parameters to identify clinical relevant biological processes. This will make Reactome a prime resource for multi-omics biomedical studies. I anticipate that the successful completion of this project will allow me to integrate and extend my current skills as a medical doctor and a bioinformatician towards systems biology studies. The additional gained experience in project management and communication of scientific results will form the basis for my envisaged career to start my own interdisciplinary biomedical research group.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias naturales informática y ciencias de la información ciencia de datos macrodatos
- ciencias naturales ciencias químicas química analítica espectrometría de masas
- ciencias naturales matemáticas matemáticas aplicadas modelo matemático
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2017
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
69117 Heidelberg
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.