Assessing, preserving and restoring man-microbes symbiosis

Projektinformationen

Homo.symbiosus

ID Finanzhilfevereinbarung: 788191

DOI

10.3030/788191

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 6 November 2018

Startdatum 1 Januar 2019

Enddatum 31 Dezember 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 491 014,00

EU-Beitrag

€ 2 491 014,00

Koordiniert durch

INSTITUT NATIONAL DE RECHERCHE POUR L'AGRICULTURE, L'ALIMENTATION ET L'ENVIRONNEMENT
France

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (19)

Temporary dietary fiber depletion prompts rapid and lasting gut microbiota restructuring in mice

Autoren: Colombe Rous, Julie Cadiou, Hiba Yazbek, Elena Monzel, Mahesh S. Desai, Joel Doré, Maarten van de Guchte, Stanislas Mondot
Veröffentlicht in: Microbiology Spectrum, Ausgabe 13, 2025, ISSN 2165-0497
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/spectrum.01517-24

Microbiome testing in Europe: navigating analytical, ethical and regulatory challenges

Autoren: Julie Rodriguez, Magali Cordaillat-Simmons, Nelly Badalato, Bernard Berger, Heloise Breton, Raynald de Lahondès, Mélanie Deschasaux-Tanguy, Clara Desvignes, Camille D’Humières, Stephan Kampshoff, Aonghus Lavelle, Amira Metwaly, Narciso M. Quijada, Jos F. M. L. Seegers, Austin Udocor, Hub Zwart, null null, Alessio Fasano, Federica Carraturo, Jonel Trebicka, Yolanda Godoy, Robert Schierwagen, P
Veröffentlicht in: Microbiome, Ausgabe 12, 2024, ISSN 2049-2618
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s40168-024-01991-x

Anorexia nervosa and gut microbiota: A systematic review and quantitative synthesis of pooled microbiological data

Autoren: Laura Di Lodovico, Stanislas Mondot, Joël Doré, Isabelle Mack, Mouna Hanachi, Philip Gorwood
Veröffentlicht in: Progress in Neuro-Psychopharmacology and Biological Psychiatry, 2020, Seite(n) 110114, ISSN 0278-5846
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pnpbp.2020.110114

Roseburia, a decreased bacterial taxon in the gut microbiota of patients suffering from anorexia nervosa

Autoren: Stanislas Mondot, Laurine Lachkar, Joël Doré, Hervé M. Blottière, Mouna Hanachi
Veröffentlicht in: European Journal of Clinical Nutrition, Ausgabe 76, 2022, Seite(n) 1486-1489, ISSN 0954-3007
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41430-022-01116-3

Effects of isolation and confinement on gastrointestinal microbiota–a systematic review

Autoren: Bea Klos, Christina Steinbach, Jasmin Ketel, Claude Lambert, John Penders, Joël Doré, Paul Enck, Isabelle Mack
Veröffentlicht in: Frontiers in Nutrition, Ausgabe 10, 2023, ISSN 2296-861X
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fnut.2023.1214016

Human-microbes symbiosis in health and disease, on earth and beyond planetary boundaries

Autoren: Joel Doré, Sandra Ortega Ugalde
Veröffentlicht in: Frontiers in Astronomy and Space Sciences, Ausgabe 10, 2023, ISSN 2296-987X
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fspas.2023.1180522

Multicenter evaluation of gut microbiome profiling by next-generation sequencing reveals major biases in partial-length metabarcoding approach

Autoren: Hugo Roume, Stanislas Mondot, Adrien Saliou, Sophie Le Fresne-Languille, Joël Doré
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 13, 2023, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-46062-7

Diet, fruit and vegetables and One Health: benefits for health, environment, society and the consumer—proceedings of the 9th edition of EGEA conference

Autoren: Nathalie Komati, Elio Riboli, Joël Dore, Emma Boyland, Jean-Pierre Cravedi, Frans Folkvord, Jean-Michel Lecerf, Françoise Lescourret, Alain Peeters, Christian Reynolds, Benjamin Alles, Marie-Josèphe Amiot, Philippe Binard, Nathalie Delzenne, Nita Forouhi, Céline Giner, Boitshepo Giyose, Carmen Gloria Gonzalez, Marc J. Gunter, Rémi Kahane, Anna Herforth, Roel Hermans, Diego S. Intrigliolo, Giu
Veröffentlicht in: European Journal of Nutrition, Ausgabe 64, 2025, ISSN 1436-6207
Herausgeber: Dr. Dietrich Steinkopff Verlag
DOI: 10.1007/s00394-025-03610-3

Increasing the diversity of dietary fibers in a daily-consumed bread modifies gut microbiota and metabolic profile in subjects at cardiometabolic risk

Autoren: Harimalala Ranaivo, Florence Thirion, Christel Béra-Maillet, Susie Guilly, Chantal Simon, Monique Sothier, Laurie Van Den Berghe, Nathalie Feugier-Favier, Stéphanie Lambert-Porcheron, Isabelle Dussous, Loïc Roger, Hugo Roume, Nathalie Galleron, Nicolas Pons, Emmanuelle Le Chatelier, Stanislav Dusko Ehrlich, Martine Laville, Joël Doré, Julie-Anne Nazare
Veröffentlicht in: Gut Microbes, Ausgabe 14, 2025, ISSN 1949-0976
Herausgeber: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/19490976.2022.2044722

Associations Among Diet, Health, Lifestyle, and Gut Microbiota Composition in the General French Population: Protocol for the Le French Gut – Le Microbiote Français Study

Autoren: Chloe Connan, Sébastien Fromentin, Mourad Benallaoua, Anne-Sophie Alvarez, Nicolas Pons, Benoît Quinquis, Christian Morabito, Julie-Anne Nazare, Elise Borezée-Durant, null null, Florence Haimet, Stanislav Dusko Ehrlich, Karine Valeille, Alexandre Cavezza, Hervé Blottière, Patrick Veiga, Mathieu Almeida, Joël Doré, Robert Benamouzig
Veröffentlicht in: JMIR Research Protocols, Ausgabe 14, 2025, Seite(n) e64894, ISSN 1929-0748
Herausgeber: JMIR Publications Inc.
DOI: 10.2196/64894

Questioning the fetal microbiome and pitfalls of low-biomass microbial studies

Autoren: Kennedy, Katherine M.; de Goffau, Marcus C.; Perez-Munoz, Maria Elisa; Arrieta, Marie-Claire; Bäckhed, Fredrick; Bork, Peer; Braun, Thorsten; Bushman, Frederic D.; Dore, Joel; de Vos, Willem M.; Earl, Ashley M.; Eisen, Jonathan A.; Elovitz, Michal A.; Ganal-Vonarburg, Stephanie C.; Gänzle, Michael G.; Garrett, Wendy S.; Hall, Lindsay J.; Hornef, Mathias W.; Huttenhower, Curtis; Konnikova, Liza;
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 19, 2023, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05546-8

Gut Microbiota Resilience: Definition, Link to Health and Strategies for Intervention

Autoren: Shaillay Kumar Dogra, Joel Doré, Sami Damak
Veröffentlicht in: Frontiers in Microbiology, Ausgabe 11, 2020, ISSN 1664-302X
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2020.572921

A mechanistic modelling approach of the host–microbiota interactions to investigate beneficial symbiotic resilience in the human gut

Autoren: Marie Haghebaert, Béatrice Laroche, Lorenzo Sala, Stanislas Mondot, Joël Doré
Veröffentlicht in: Journal of The Royal Society Interface, Ausgabe 21, 2024, ISSN 1742-5662
Herausgeber: The Royal Society
DOI: 10.1098/rsif.2023.0756

Introduction to host microbiome symbiosis in health and disease

Autoren: Florent Malard, Joel Dore, Béatrice Gaugler, Mohamad Mohty
Veröffentlicht in: Mucosal Immunology, Ausgabe 14/3, 2021, Seite(n) 547-554, ISSN 1933-0219
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41385-020-00365-4

Dynamic properties of the intestinal ecosystem call for combination therapies, targeting inflammation and microbiota, in ulcerative colitis

Autoren: Maarten van de Guchte, Stanislas Mondot, Joël Doré
Veröffentlicht in: Gastroenterology, 2021, ISSN 0016-5085
Herausgeber: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1053/j.gastro.2021.08.057

Alternative stable states in the intestinal ecosystem: proof of concept in a rat model and a perspective of therapeutic implications

Autoren: Maarten Van de Guchte, Sebastian D. Burz, Julie Cadiou, Jiangbo Wu, Stanislas Mondot, Hervé M. Blottière, Joël Doré
Veröffentlicht in: Microbiome, Ausgabe 8/1, 2020, ISSN 2049-2618
Herausgeber: BMS
DOI: 10.1186/s40168-020-00933-7

Alterations in gut microbiota characteristics along a type 2 diabetes risk gradient linked with family history

Autoren: Oscar Gitton-Quent, Mathilde Sola, Nicolas Maziers, Anne Hiol, Nicolas Dechamp, Emmanuelle Le Chatelier, Mathilde Touvier, Pilar Galan, Aymeric David, Christian Morabito, Alexandre Famechon, Benoit Quinquis, Mahendra Mariadassou, Patrick Veiga, Joel Dore, Magali Berland, Melanie Deschasaux-Tanguy
Veröffentlicht in: Gut Microbes Reports, Ausgabe 2, 2025, ISSN 2993-3935
Herausgeber: Informa UK Limited
DOI: 10.1080/29933935.2025.2527766

Cognition and gut microbiota in schizophrenia spectrum and mood disorders: A systematic review

Autoren: S. Frileux, M. Boltri, J. Doré, M. Leboyer, P. Roux
Veröffentlicht in: Neuroscience & Biobehavioral Reviews, Ausgabe 162, 2024, Seite(n) 105722, ISSN 0149-7634
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.neubiorev.2024.105722

Gut microbiota diversity after autologous fecal microbiota transfer in acute myeloid leukemia patients

Autoren: Florent Malard, Anne Vekhoff, Simona Lapusan, Francoise Isnard, Evelyne D’incan-Corda, Jérôme Rey, Colombe Saillard, Xavier Thomas, Sophie Ducastelle-Lepretre, Etienne Paubelle, Marie-Virginie Larcher, Clément Rocher, Christian Recher, Suzanne Tavitian, Sarah Bertoli, Anne-Sophie Michallet, Lila Gilis, Pierre Peterlin, Patrice Chevallier, Stéphanie Nguyen, Emilie Plantamura, Lilia Boucinha,
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-23376-6