Eukaryotic DNA replication: a single-molecule approach to the study of yeast replication on chromatin

Informations projet

REPLICHROMA

N° de convention de subvention: 789267

DOI

10.3030/789267

Projet clôturé

Date de signature de la CE 26 Juillet 2018

Date de début 1 Septembre 2018

Date de fin 31 Août 2023

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 388 100,00

Contribution de l’UE

€ 2 388 100,00

Coordonné par

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Netherlands

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (9)

CAF-1 deposits newly synthesized histones during DNA replication using distinct mechanisms on the leading and lagging strands

Auteurs: Clément Rouillon; Bruna V Eckhardt; Leonie Kollenstart; Fabian Gruss; Alexander E E Verkennis; Inge Rondeel; Peter H L Krijger; Giulia Ricci; Alva Biran; Theo van Laar; Charlotte M Delvaux de Fenffe; Georgiana Luppens; Pascal Albanese; Koichi Sato; Richard A Scheltema; Wouter de Laat; Puck Knipscheer; Nynke H Dekker; Anja Groth; Francesca Mattiroli
Publié dans: Nucleic acids research, 2023, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad171

A Biophysics Toolbox for Reliable Data Acquisition and Processing in Integrated Force–Confocal Fluorescence Microscopy

Auteurs: Zhaowei Liu, Edo van Veen, Humberto Sánchez, Belén Solano, Francisco J. Palmero Moya, Kaley A. McCluskey, Daniel Ramírez Montero, Theo van Laar, and Nynke H. Dekker
Publié dans: ACS Photonics, 2024, ISSN 2330-4022
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsphotonics.3c01739

De novo fabrication of custom-sequence plasmids for the synthesis of long DNA constructs with extrahelical features

Auteurs: Daniel Ramírez Montero, Zhaowei Liu, Nynke H. Dekker
Publié dans: Biophysical Journal, 2023, ISSN 0006-3495
Éditeur: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2023.11.008

DNA origins retain mobile licensing proteins

Auteurs: Humberto Sánchez, Kaley McCluskey, Theo van Laar, Edo van Veen, Filip M. Asscher, Belén Solano, John F.X. Diffley and Nynke H. Dekker
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12, 2021, Page(s) 1908, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-22216-x

Nucleotide binding halts diffusion of the eukaryotic replicative helicase during activation

Auteurs: Daniel Ramírez Montero; Humberto Sánchez; Edo van Veen; Theo van Laar; Belén Solano; John F. X. Diffley; Nynke H. Dekker
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2022.12.23.521684

A chromatinized origin reduces the mobility of ORC and MCM through interactions and spatial constraint

Auteurs: Humberto Sánchez; Zhaowei Liu; Edo van Veen; Theo van Laar; John F. X. Diffley; Nynke H. Dekker
Publié dans: Nature Communications, Vol 14, Iss 1, Pp 1-15 (2023), 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2023.05.18.541303

Global correction of optical distortions in multicolor single-molecule microscopy using Zernike polynomial gradients

Auteurs: Kaley McCluskey; Edo van Veen; Jelmer Cnossen; Wouter Wesselink; Filip M. Asscher; Carlas Smith; Nynke H. Dekker
Publié dans: Optics Express, 2021, Page(s) 42251-42264, ISSN 1094-4087
Éditeur: Optical Society of America
DOI: 10.1364/oe.445230

Three-dimensional localization microscopy with increased axial precision through TIRF angle modulation

Auteurs: Daniel Fan; Jelmer Cnossen; Shih-Te Hung; Dimitri Kromm; Nynke H. Dekker; Gerard J. Verbiest; Carlas S. Smith
Publié dans: Optics Communications, 2023, Page(s) 129548, ISSN 0030-4018
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.optcom.2023.129548

Principles and best practices of optimizing a micromirror-based multicolor TIRF microscopy system

Auteurs: Kaley McCluskey; Nynke H. Dekker
Publié dans: Optics Communications, 2023, Page(s) 129474, ISSN 0030-4018
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1101/2023.03.27.534330

Non-peer reviewed articles (1)

Physics meets biology: The joining of two forces to further our understanding of cellular function

Auteurs: Michelle D. Wang, Mario Nicodemi, Nynke H. Dekker, Thomas Gregor, David Holcman, Antoine M. van Oijen, and Suliana Manley,
Publié dans: Molecular Cell, 2021, Page(s) 3033-3037, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.07.009