Development of comprehensive and user-friendly bioinformatics tools to study protein structures and interactions in mass spectrometry-based chemical cross-linking

Informations projet

BiT-XLMS

N° de convention de subvention: 792536

DOI

10.3030/792536

Projet clôturé

Date de signature de la CE 1 Mars 2018

Date de début 1 Septembre 2019

Date de fin 31 Decembre 2021

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total

€ 171 460,80

Contribution de l’UE

€ 171 460,80

Coordonné par

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

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Publications

Peer reviewed articles (2)

MaxDIA enables library-based and library-free data-independent acquisition proteomics

Auteurs: Pavel Sinitcyn, Hamid Hamzeiy, Favio Salinas Soto, Daniel Itzhak, Frank McCarthy, Christoph Wichmann, Martin Steger, Uli Ohmayer, Ute Distler, Stephanie Kaspar-Schoenefeld, Nikita Prianichnikov, Şule Yılmaz, Jan Daniel Rudolph, Stefan Tenzer, Yasset Perez-Riverol, Nagarjuna Nagaraj, Sean J. Humphrey & Jürgen Cox
Publié dans: Nature Biotechnology, Numéro 39, 2021, Page(s) 1563–1573, ISSN 1087-0156
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-021-00968-7

Accurate and Automated High-Coverage Identification of Chemically Cross-Linked Peptides with MaxLynx

Auteurs: Şule Yılmaz, Florian Busch, Nagarjuna Nagaraj, and Jürgen Cox
Publié dans: Analytical Chemistry, Numéro 94(3), 2022, Page(s) 1608–1617, ISSN 0003-2700
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.1c03688