Novel high speed and high resolution microscopy setup for cytoarchitectonic studies of mesoscale sized human brain tissues, healthy and affected by Focal Cortical Dysplasia

Informations projet

MesoBrainMicr

N° de convention de subvention: 793849

DOI

10.3030/793849

Projet clôturé

Date de signature de la CE 2 Mars 2018

Date de début 1 Octobre 2018

Date de fin 30 Septembre 2020

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total

€ 180 277,20

Contribution de l’UE

€ 180 277,20

Coordonné par

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI FIRENZE
Italy

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Publications

Conference proceedings (6)

High-speed light-sheet microscopy imaging and data post-processing using custom hardware and software solutions

Auteurs: G. Mazzamuto, L. Silvestri, G. Sancataldo, V. Gavryusev, M. Scardigli, I. Costantini, and F. S. Pavone
Publié dans: Proc. SPIE 12385, Three-Dimensional and Multidimensional Microscopy: Image Acquisition and Processing XXX, Numéro PC1238509, 2023
Éditeur: SPIE
DOI: 10.1117/12.2650374

Optimized dual-view light sheet microscopy for large area cleared specimens

Auteurs: V. Gavryusev, G. Mazzamuto, G. Sancataldo, L. Pesce, A. Laurino, M. Scardigli, I. Costantini, L. Silvestri, and F. S. Pavone
Publié dans: Virtual 12th Light Sheet Fluorescence Microscopy Conference 2020, 2020
Éditeur: RMS
DOI: 10.22443/rms.lsfm2020.43

Swift light sheet volumetric charting of large human brain portions

Auteurs: Vladislav Gavryusev, Luca Pesce, Annunziatina Laurino, Giacomo Mazzamuto, Giuseppe Sancataldo, Marina Scardigli, Matteo Roffilli, Ludovico Silvestri, Irene Costantini, Francesco Saverio Pavone
Publié dans: Biophotonics Congress: Biomedical Optics 2020 (Translational, Microscopy, OCT, OTS, BRAIN), 2020, Page(s) JW5A.3, ISBN 978-1-943580-74-3
Éditeur: OSA
DOI: 10.1364/translational.2020.jw5a.3

Fast volumetric mapping of human brain slices

Auteurs: Luca Pesce, Annunziatina Laurino, Vladislav Gavryusev, Giacomo Mazzamuto, Giuseppe Sancataldo, Marina Scardigli, Matteo Roffilli, Ludovico Silvestri, Irene Costantini, Francesco Saverio Pavone
Publié dans: Neurophotonics, 2020, Page(s) 10, ISBN 9781510634930
Éditeur: SPIE
DOI: 10.1117/12.2555644

An AOD breakthrough for volumetric 2P optogenetic applications

Auteurs: P. Ricci, M. Marchetti, M. Sorelli, L. Turrini, F. Resta, V. Gavryusev, G. de Vito, G. Sancataldo, F. Vanzi, L. Silvestri, and F. S. Pavone
Publié dans: Proc. SPIE 12144, Biomedical Spectroscopy, Microscopy, and Imaging II, Numéro PC1214406, 2022
Éditeur: SPIE
DOI: 10.1117/12.2620313

Fast volumetric mapping of human brain slices

Auteurs: Luca Pesce, Annunziatina Laurino, Vladislav Gavryusev, Giacomo Mazzamuto, Giuseppe Sancataldo, Marina Scardigli, Matteo Roffilli, Ludovico Silvestri, Irene Costantini, Francesco Saverio Pavone
Publié dans: Neural Imaging and Sensing 2020, 2020, Page(s) 10, ISBN 9781510632165
Éditeur: SPIE
DOI: 10.1117/12.2544133

Peer reviewed articles (9)

Fast multi-directional DSLM for confocal detection without striping artifacts

Auteurs: Pietro Ricci; Giuseppe Sancataldo; Vladislav Gavryusev; Alessandra Franceschini; Marie Caroline Müllenbroich; Ludovico Silvestri; Francesco Saverio Pavone
Publié dans: Biomedical Optics Express, Numéro 11/6, 2020, Page(s) 3111-3124, ISSN 2156-7085
Éditeur: The Optical Society
DOI: 10.1364/BOE.390916

Effects of excitation light polarization on fluorescence emission in two-photon light-sheet microscopy

Auteurs: Giuseppe de Vito, Pietro Ricci, Lapo Turrini, Vladislav Gavryusev, Caroline Müllenbroich, Natascia Tiso, Francesco Vanzi, Ludovico Silvestri, Francesco Saverio Pavone
Publié dans: Biomedical Optics Express, Numéro 11/8, 2020, Page(s) 4651, ISSN 2156-7085
Éditeur: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.396388

3D molecular phenotyping of cleared human brain tissues with light-sheet fluorescence microscopy

Auteurs: Pesce, Luca and Scardigli, Marina and Gavryusev, Vladislav and Laurino, Annunziatina and Mazzamuto, Giacomo and Brady, Niamh and Sancataldo, Giuseppe and Silvestri, Ludovico and Destrieux, Christophe and Hof, Patrick R. and Costantini, Irene and Pavone, Francesco S.
Publié dans: Communications Biology, Numéro 5/1, 2022, Page(s) 447, ISSN 2399-3642
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-022-03390-0

A cellular resolution atlas of Broca’s area

Auteurs: I. Costantini, L. Morgan, J. Yang, Y. Balbastre, D. Varadarajan, L. Pesce, M. Scardigli, G. Mazzamuto, V. Gavryusev, F.M. Castelli, M. Roffilli, L. Silvestri, J. Laffey, S. Raia, M. Varghese, B. Wicinski, S. Chang, A.C. I-Chun, H. Wang, D. Cordero, M. Vera, J. Nolan, K. Nestor, J. Mora, J.E. Iglesias, E.G. Pallares, K. Evancic, J. Augustinack, M. Fogarty, A.V. Dalca, M. Frosch, C. Magnain, R. Fros
Publié dans: Science Advances, Numéro 9, 2023, ISSN 2375-2548
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.adg3844

Flexible Multi-Beam Light-Sheet Fluorescence Microscope for Live Imaging Without Striping Artifacts

Auteurs: Giuseppe Sancataldo, Vladislav Gavryusev, Giuseppe de Vito, Lapo Turrini, Massimiliano Locatelli, Chiara Fornetto, Natascia Tiso, Francesco Vanzi, Ludovico Silvestri, Francesco Saverio Pavone
Publié dans: Frontiers in Neuroanatomy, Numéro 13, 2019, ISSN 1662-5129
Éditeur: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fnana.2019.00007

Dual-beam confocal light-sheet microscopy via flexible acousto-optic deflector

Auteurs: Vladislav Gavryusev, Giuseppe Sancataldo, Pietro Ricci, Alberto Montalbano, Chiara Fornetto, Lapo Turrini, Annunziatina Laurino, Luca Pesce, Giuseppe de Vito, Natascia Tiso, Francesco Vanzi, Ludovico Silvestri, Francesco S. Pavone
Publié dans: Journal of Biomedical Optics, Numéro 24/10, 2019, Page(s) 1, ISSN 1083-3668
Éditeur: S P I E - International Society for Optical Engineering
DOI: 10.1117/1.JBO.24.10.106504

Removing striping artifacts in light-sheet fluorescence microscopy: A review

Auteurs: P. Ricci, V. Gavryusev, C. Müllenbroich, L. Turrini, G. de Vito, L. Silvestri, G. Sancataldo, and F. S. Pavone
Publié dans: Progress in Biophysics and Molecular Biology, Numéro 168, 2022, Page(s) 52-65, ISSN 1873-1732
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.pbiomolbio.2021.07.003

Power-effective scanning with AODs for 3D optogenetic applications

Auteurs: P. Ricci, M. Marchetti, M. Sorelli, L. Turrini, F. Resta, V. Gavryusev, G. de Vito, G. Sancataldo, F. Vanzi, L. Silvestri, and F. S. Pavone
Publié dans: Journal of Biophotonics, Numéro 15/4, 2022, Page(s) e202100256, ISSN 1864-0648
Éditeur: Wiley GmbH
DOI: 10.1002/jbio.202100256

Comparison of Different Tissue Clearing Methods for Three-Dimensional Reconstruction of Human Brain Cellular Anatomy Using Advanced Imaging Techniques

Auteurs: Marina Scardigli; Marina Scardigli; Luca Pesce; Luca Pesce; Niamh Brady; Giacomo Mazzamuto; Giacomo Mazzamuto; Vladislav Gavryusev; Vladislav Gavryusev; Ludovico Silvestri; Ludovico Silvestri; Ludovico Silvestri; Patrick R. Hof; Christophe Destrieux; Irene Costantini; Irene Costantini; Irene Costantini; Francesco S. Pavone; Francesco S. Pavone; Francesco S. Pavone
Publié dans: Frontiers in Neuroanatomy, Numéro 11, 2021, Page(s) 90, ISSN 1662-5129
Éditeur: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fnana.2021.752234