Novel high speed and high resolution microscopy setup for cytoarchitectonic studies of mesoscale sized human brain tissues, healthy and affected by Focal Cortical Dysplasia

Informazioni relative al progetto

MesoBrainMicr

ID dell’accordo di sovvenzione: 793849

DOI

10.3030/793849

Progetto chiuso

Data della firma CE 2 Marzo 2018

Data di avvio 1 Ottobre 2018

Data di completamento 30 Settembre 2020

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Costo totale

€ 180 277,20

Contributo UE

€ 180 277,20

Coordinato da

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI FIRENZE
Italy

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I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Conference proceedings (6)

High-speed light-sheet microscopy imaging and data post-processing using custom hardware and software solutions

Autori: G. Mazzamuto, L. Silvestri, G. Sancataldo, V. Gavryusev, M. Scardigli, I. Costantini, and F. S. Pavone
Pubblicato in: Proc. SPIE 12385, Three-Dimensional and Multidimensional Microscopy: Image Acquisition and Processing XXX, Numero PC1238509, 2023
Editore: SPIE
DOI: 10.1117/12.2650374

Optimized dual-view light sheet microscopy for large area cleared specimens

Autori: V. Gavryusev, G. Mazzamuto, G. Sancataldo, L. Pesce, A. Laurino, M. Scardigli, I. Costantini, L. Silvestri, and F. S. Pavone
Pubblicato in: Virtual 12th Light Sheet Fluorescence Microscopy Conference 2020, 2020
Editore: RMS
DOI: 10.22443/rms.lsfm2020.43

Swift light sheet volumetric charting of large human brain portions

Autori: Vladislav Gavryusev, Luca Pesce, Annunziatina Laurino, Giacomo Mazzamuto, Giuseppe Sancataldo, Marina Scardigli, Matteo Roffilli, Ludovico Silvestri, Irene Costantini, Francesco Saverio Pavone
Pubblicato in: Biophotonics Congress: Biomedical Optics 2020 (Translational, Microscopy, OCT, OTS, BRAIN), 2020, Pagina/e JW5A.3, ISBN 978-1-943580-74-3
Editore: OSA
DOI: 10.1364/translational.2020.jw5a.3

Fast volumetric mapping of human brain slices

Autori: Luca Pesce, Annunziatina Laurino, Vladislav Gavryusev, Giacomo Mazzamuto, Giuseppe Sancataldo, Marina Scardigli, Matteo Roffilli, Ludovico Silvestri, Irene Costantini, Francesco Saverio Pavone
Pubblicato in: Neurophotonics, 2020, Pagina/e 10, ISBN 9781510634930
Editore: SPIE
DOI: 10.1117/12.2555644

An AOD breakthrough for volumetric 2P optogenetic applications

Autori: P. Ricci, M. Marchetti, M. Sorelli, L. Turrini, F. Resta, V. Gavryusev, G. de Vito, G. Sancataldo, F. Vanzi, L. Silvestri, and F. S. Pavone
Pubblicato in: Proc. SPIE 12144, Biomedical Spectroscopy, Microscopy, and Imaging II, Numero PC1214406, 2022
Editore: SPIE
DOI: 10.1117/12.2620313

Fast volumetric mapping of human brain slices

Autori: Luca Pesce, Annunziatina Laurino, Vladislav Gavryusev, Giacomo Mazzamuto, Giuseppe Sancataldo, Marina Scardigli, Matteo Roffilli, Ludovico Silvestri, Irene Costantini, Francesco Saverio Pavone
Pubblicato in: Neural Imaging and Sensing 2020, 2020, Pagina/e 10, ISBN 9781510632165
Editore: SPIE
DOI: 10.1117/12.2544133

Peer reviewed articles (9)

Fast multi-directional DSLM for confocal detection without striping artifacts

Autori: Pietro Ricci; Giuseppe Sancataldo; Vladislav Gavryusev; Alessandra Franceschini; Marie Caroline Müllenbroich; Ludovico Silvestri; Francesco Saverio Pavone
Pubblicato in: Biomedical Optics Express, Numero 11/6, 2020, Pagina/e 3111-3124, ISSN 2156-7085
Editore: The Optical Society
DOI: 10.1364/BOE.390916

Effects of excitation light polarization on fluorescence emission in two-photon light-sheet microscopy

Autori: Giuseppe de Vito, Pietro Ricci, Lapo Turrini, Vladislav Gavryusev, Caroline Müllenbroich, Natascia Tiso, Francesco Vanzi, Ludovico Silvestri, Francesco Saverio Pavone
Pubblicato in: Biomedical Optics Express, Numero 11/8, 2020, Pagina/e 4651, ISSN 2156-7085
Editore: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.396388

3D molecular phenotyping of cleared human brain tissues with light-sheet fluorescence microscopy

Autori: Pesce, Luca and Scardigli, Marina and Gavryusev, Vladislav and Laurino, Annunziatina and Mazzamuto, Giacomo and Brady, Niamh and Sancataldo, Giuseppe and Silvestri, Ludovico and Destrieux, Christophe and Hof, Patrick R. and Costantini, Irene and Pavone, Francesco S.
Pubblicato in: Communications Biology, Numero 5/1, 2022, Pagina/e 447, ISSN 2399-3642
Editore: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-022-03390-0

A cellular resolution atlas of Broca’s area

Autori: I. Costantini, L. Morgan, J. Yang, Y. Balbastre, D. Varadarajan, L. Pesce, M. Scardigli, G. Mazzamuto, V. Gavryusev, F.M. Castelli, M. Roffilli, L. Silvestri, J. Laffey, S. Raia, M. Varghese, B. Wicinski, S. Chang, A.C. I-Chun, H. Wang, D. Cordero, M. Vera, J. Nolan, K. Nestor, J. Mora, J.E. Iglesias, E.G. Pallares, K. Evancic, J. Augustinack, M. Fogarty, A.V. Dalca, M. Frosch, C. Magnain, R. Fros
Pubblicato in: Science Advances, Numero 9, 2023, ISSN 2375-2548
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.adg3844

Flexible Multi-Beam Light-Sheet Fluorescence Microscope for Live Imaging Without Striping Artifacts

Autori: Giuseppe Sancataldo, Vladislav Gavryusev, Giuseppe de Vito, Lapo Turrini, Massimiliano Locatelli, Chiara Fornetto, Natascia Tiso, Francesco Vanzi, Ludovico Silvestri, Francesco Saverio Pavone
Pubblicato in: Frontiers in Neuroanatomy, Numero 13, 2019, ISSN 1662-5129
Editore: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fnana.2019.00007

Dual-beam confocal light-sheet microscopy via flexible acousto-optic deflector

Autori: Vladislav Gavryusev, Giuseppe Sancataldo, Pietro Ricci, Alberto Montalbano, Chiara Fornetto, Lapo Turrini, Annunziatina Laurino, Luca Pesce, Giuseppe de Vito, Natascia Tiso, Francesco Vanzi, Ludovico Silvestri, Francesco S. Pavone
Pubblicato in: Journal of Biomedical Optics, Numero 24/10, 2019, Pagina/e 1, ISSN 1083-3668
Editore: S P I E - International Society for Optical Engineering
DOI: 10.1117/1.JBO.24.10.106504

Removing striping artifacts in light-sheet fluorescence microscopy: A review

Autori: P. Ricci, V. Gavryusev, C. Müllenbroich, L. Turrini, G. de Vito, L. Silvestri, G. Sancataldo, and F. S. Pavone
Pubblicato in: Progress in Biophysics and Molecular Biology, Numero 168, 2022, Pagina/e 52-65, ISSN 1873-1732
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/j.pbiomolbio.2021.07.003

Power-effective scanning with AODs for 3D optogenetic applications

Autori: P. Ricci, M. Marchetti, M. Sorelli, L. Turrini, F. Resta, V. Gavryusev, G. de Vito, G. Sancataldo, F. Vanzi, L. Silvestri, and F. S. Pavone
Pubblicato in: Journal of Biophotonics, Numero 15/4, 2022, Pagina/e e202100256, ISSN 1864-0648
Editore: Wiley GmbH
DOI: 10.1002/jbio.202100256

Comparison of Different Tissue Clearing Methods for Three-Dimensional Reconstruction of Human Brain Cellular Anatomy Using Advanced Imaging Techniques

Autori: Marina Scardigli; Marina Scardigli; Luca Pesce; Luca Pesce; Niamh Brady; Giacomo Mazzamuto; Giacomo Mazzamuto; Vladislav Gavryusev; Vladislav Gavryusev; Ludovico Silvestri; Ludovico Silvestri; Ludovico Silvestri; Patrick R. Hof; Christophe Destrieux; Irene Costantini; Irene Costantini; Irene Costantini; Francesco S. Pavone; Francesco S. Pavone; Francesco S. Pavone
Pubblicato in: Frontiers in Neuroanatomy, Numero 11, 2021, Pagina/e 90, ISSN 1662-5129
Editore: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fnana.2021.752234