Objectif
Somatic expression of the retrogene DUX4 in skeletal muscle is associated with the development of the common myopathy facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD). As FSHD patients mainly present with muscular symptoms, research in the FSHD field has focused on unraveling the functional consequences of DUX4 expression in skeletal muscle. Research on DUX4 expression in non-muscle tissues is limited, but increasing evidence suggests a biological function for DUX4 in somatic tissues. I aim to characterize DUX4 expression in non-muscle tissues, to determine the genome-wide transcriptional consequences of DUX4 expression, to identify DUX4 target genes in these tissues, and to establish whether treatment with DUX4 antisense oligonucleotides negatively impacts somatic tissues in which DUX4 has a biological function. First, I will use a combination of quantitative reverse transcriptase PCR, immunofluorescence staining, and flow cytometry to establish which tissues and what cell types express DUX4 in human and mouse. Next, I will use the innovative technique of single-cell RNA sequencing to determine the autonomous and non-autonomous functional consequences of DUX4 expression in DUX4-positive tissues. In parallel, to establish which genes and pathways are direct targets of DUX4 and whether tissue-specific differences exist, I will employ DUX4-chromatin immunoprecipitation sequencing. Finally, I will determine the effect of DUX4 suppression in vitro and in vivo. The proposed work will provide in depth analysis into the biological function of DUX4 in somatic tissues, contribute to the long-standing enigma in the field why FSHD presents as a muscle-specific disease, and provide guidance to DUX4-targeted therapies that are currently being developed.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale neurologie dystrophie musculaire
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2017
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
2333 ZA Leiden
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.