Objectif
Modifications to mRNA, collectively known as the epitranscriptome, comprise a neglected layer of gene regulation. The most abundant internal modification of mRNA is methylation of adenosine (m6A). The aim of this proposal is to explain a recently discovered interplay between mRNA methylation, gene silencing and gene expression in plants. Specific expressed Arabidopsis genes contain transposons within them that bear localised silencing marks that include methylation of DNA and modifications to histone proteins. The antagonism between stretches of so-called heterochromatin that should be “silent”, in genes that must be expressed, appears to provide a novel means to tune gene expression. Crucially, the Arabidopsis immune response gene RPP7 is regulated in this way. Recent findings suggest a link between mRNA methylation and intragenic heterochromatin: (1) The RNA binding protein FPA co-purifies with Arabidopsis m6A writers. (2) RNA-Sequencing analysis of fpa mutants and m6A writer complex mutants reveals changes in transcription through intragenic heterochromatin. (3) RNA-Sequencing maps m6A to intragenic heterochromatin. To determine the role of mRNA methylation in analyzed interplay, the order of events will be resolved by parallel measurement of heterochromatin (H3K9me2, m5C) and m6A marks in mutants defective in factors that control these marks. The directness by which FPA and mRNA methylation influences these events will be examined by ChIP-Seq and iCLIP-Seq of FPA and m6A writer complex components. The epigenetic stability of disrupting intragenic heterochromatin will be determined in stable lines with inducible FPA and m6A writer expression. Overall, we will assess a new role of mRNA methylation in tuning expression of crucially important plant genes.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2017
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
DD1 4HN Dundee
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.