Objetivo
"Fungal crop pathogens cause severe yield losses and threaten food security. To prevent epidemics, deploying resistant varieties is currently the major avenue. However, agricultural ecosystems are highly conducive to the emergence of virulent pathogens and host resistance is rapidly overcome. The evolutionary mechanisms how virulence is gained on previously resistant hosts remains largely elusive. Identifying the genetic basis of adaptive evolution of pathogenic fungi in agricultural fields will be crucial to design future sustainable disease control strategies.
The proposed project will analyze the process of pathogen adaptation to overcome crop resistance in agricultural ecosystem. The genomic architecture (i.e. ""two-speed genome"") of filamentous pathogens is thought to favor the rapid evolution of virulence genes and the rapid breakdown of host resistance. However, the causal link between pathogen adaptation in the field and rapidly evolving loci has not been established.
I propose to use “reverse ecology”, an unbiased and holistic approach to associate genomic loci with adaptation to the host and environment using the fungal pathogen Zymoseptoria tritici as a model. Z. tritici is a pandemic pathogen causing the severe Septoria Tritici Blotch (STB) on wheat. Populations are highly diverse with high levels of gene flow and wheat resistance was repeatedly lost in field settings. To identify loci responding to selection driven by host resistance, I will analyze full genomes of large pathogen collections isolated from replicated field plots using a robust statistical frameworks. This will allow me to test for an association of selection responses and genomic locations. I will also identify the phenotypic traits under selection with a combination of association mapping data and functional predictions. My research will substantially increase our understanding of pathogen adaptation and guide future resistance deployment strategies in agricultural ecosystem."
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología micología
- ciencias médicas y de la salud ciencias de la salud nutrición
- ciencias naturales ciencias biológicas ecología ecosistemas
- ciencias agrícolas agricultura, silvicultura y pesca agricultura
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2017
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
2000 NEUCHATEL
Suiza
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.