SCIENTIA-FELLOWS II: International Postdoctoral Fellowship Programme

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Leistungen

3rd call: communication link to Euraxess

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1st call: communication link to Euroaxess

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2nd call: communication link to Euroaxess

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Veröffentlichungen

How CAR T Cells Breathe

Autoren: Christopher Forcados, Sandy Joaquina, Nicholas Paul Casey, Benjamin Caulier, Sébastien Wälchli
Veröffentlicht in: Cells, Ausgabe 11, 2025, Seite(n) 1454, ISSN 2073-4409
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/cells11091454

Human cytomegalovirus infection perturbs neural progenitor cell fate via the expression of viral microRNAs

Autoren: Xuan Jiang, Siqing Liu, Ya‐Ru Fu, Xi‐Juan Liu, Xiao‐Jun Li, Bo Yang, Hai‐Fei Jiang, Zhang‐Zhou Shen, Endalkachew Ashenafi Alemu, Pavel Vazquez, Yaping Tang, Mari Kaarbø, Michael A. McVoy, Simon Rayner, Min‐Hua Luo
Veröffentlicht in: Journal of Medical Virology, Ausgabe 95, 2024, ISSN 0146-6615
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/jmv.28574

Colorimetric and Electrochemical Screening for Early Detection of Diabetes Mellitus and Diabetic Retinopathy—Application of Sensor Arrays and Machine Learning

Autoren: Georgina Faura; Gerard Boix-Lemonche; Anne Kristin Holmeide; Rasa Verkauskiene; Vallo Volke; Jelizaveta Sokolovska; Goran Petrovski
Veröffentlicht in: Sensors, Ausgabe Vol 22, Iss 718, p 718, 2022, ISSN 1424-8220
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/s22030718

The ECM and tissue architecture are major determinants of early invasion mediated by E-cadherin dysfunction

Autoren: Soraia Melo, Pilar Guerrero, Maurício Moreira Soares, José Rafael Bordin, Fátima Carneiro, Patrícia Carneiro, Maria Beatriz Dias, João Carvalho, Joana Figueiredo, Raquel Seruca, Rui D. M. Travasso
Veröffentlicht in: Communications Biology, Ausgabe 6, 2023, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s42003-023-05482-x

Using Polygenic Hazard Scores to Predict Age at Onset of Alzheimer’s Disease in Nordic Populations

Autoren: Ehsan Motazedi, Weiqiu Cheng, Jesper Q. Thomassen, Oleksandr Frei, Arvid Rongve, Lavinia Athanasiu, Shahram Bahrami, Alexey Shadrin, Ingun Ulstein, Eystein Stordal, Anne Brækhus, Ingvild Saltvedt, Sigrid B. Sando, Kevin S. O’Connell, Guy Hindley, Dennis van der Meer, Sverre Bergh, Børge G. Nordestgaard, Anne Tybjærg-Hansen, Geir Bråthen, Lasse Pihlstrøm, Srdjan Djurovic, Ruth Frikke-Schmidt
Veröffentlicht in: Journal of Alzheimer's Disease, Ausgabe 88, 2024, Seite(n) 1533-1544, ISSN 1387-2877
Herausgeber: IOS Press
DOI: 10.3233/jad-220174

Protocells: Milestones and Recent Advances

Autoren: Irep Gözen, Elif Senem Köksal, Inga Põldsalu, Lin Xue, Karolina Spustova, Esteban Pedrueza‐Villalmanzo, Ruslan Ryskulov, Fanda Meng, Aldo Jesorka
Veröffentlicht in: Small, Ausgabe 18, 2023, ISSN 1613-6810
Herausgeber: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202106624

Divalent ligand-monovalent molecule binding.

Autoren: Mathijs Janssen; Harald Stenmark; Andreas Carlson
Veröffentlicht in: Soft Matter, 2021, ISSN 1744-683X
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1sm00070e

Predictors of early adulthood insomnia following exposure to a single mass violence attack during adolescence: 7–13 year follow-up from the Utøya and HUNT studies

Autoren: Kate Porcheret, Grete Dyb, Tore Wentzel-Larsen, Synne Øien Stensland
Veröffentlicht in: European Journal of Psychotraumatology, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2000-8066
Herausgeber: Taylor and Francis
DOI: 10.1080/20008066.2024.2312750

Divalent ligand-monovalent molecule binding

Autoren: Mathijs Janssen, Harald Stenmark, Andreas Carlson
Veröffentlicht in: Soft Matter, Ausgabe 17, 2024, Seite(n) 5375-5383, ISSN 1744-683X
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1sm00070e

Temporal expression and spatial distribution of the proteoglycan versican during cardiac fibrosis development

Autoren: Athiramol Sasi, Andreas Romaine, Pugazendhi Murugan Erusappan, Arne Olav Melleby, Almira Hasic, Christen Peder Dahl, Kaspar Broch, Vibeke Marie Almaas, Rosa Doñate Puertas, H. Llewelyn Roderick, Ida Gjervold Lunde, Ivar Sjaastad, Maria Vistnes, Geir Christensen
Veröffentlicht in: Matrix Biology Plus, Ausgabe 19-20, 2023, Seite(n) 100135, ISSN 2590-0285
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.mbplus.2023.100135

Efficient chimeric antigen receptor targeting of a central epitope of CD22

Autoren: Nicholas Paul Casey, Clara Helena Klee, Anne Fåne, Benjamin Caulier, Agnieszka Graczyk-Jarzynka, Marta Krawczyk, Klaudyna Fidyt, Sarah E. Josefsson, Hakan Köksal, Pierre Dillard, Elzbieta Patkowska, Malgorzata Firczuk, Erlend B. Smeland, Magdalena Winiarska, June H. Myklebust, Else Marit Inderberg, Sébastien Wälchli
Veröffentlicht in: Journal of Biological Chemistry, Ausgabe 299, 2023, Seite(n) 104883, ISSN 0021-9258
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2023.104883

Fipronil affects cockroach behavior and olfactory memory

Autoren: Maria Eduarda Rosa, Letícia Campos, Bruna Trindade Borges, Sara Santos, Yuri Correia Barreto, Denis Reis de Assis, Stephen Hyslop, Velci Queiroz de Souza, Lúcia Vinadé, Cháriston André Dal Belo
Veröffentlicht in: Journal of Experimental Biology, Ausgabe 226, 2023, ISSN 0022-0949
Herausgeber: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jeb.245239

Modulation of multidrug-resistant clone success in Escherichia coli populations: a longitudinal, multi-country, genomic and antibiotic usage cohort study

Autoren: Anna K Pöntinen, Rebecca A Gladstone, Henri Pesonen, Maiju Pesonen, François Cléon, Benjamin J Parcell, Teemu Kallonen, Gunnar Skov Simonsen, Nicholas J Croucher, Alan McNally, Julian Parkhill, Pål J Johnsen, Ørjan Samuelsen, Jukka Corander
Veröffentlicht in: The Lancet Microbe, Ausgabe 5, 2024, Seite(n) e142-e150, ISSN 2666-5247
Herausgeber: The Lancet Microbe
DOI: 10.1016/s2666-5247(23)00292-6

Abundant pleiotropy across neuroimaging modalities identified through a multivariate genome-wide association study

Autoren: E. P. Tissink, A. A. Shadrin, D. van der Meer, N. Parker, G. Hindley, D. Roelfs, O. Frei, C. C. Fan, M. Nagel, T. Nærland, M. Budisteanu, S. Djurovic, L. T. Westlye, M. P. van den Heuvel, D. Posthuma, T. Kaufmann, A. M. Dale, O. A. Andreassen
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-46817-4

A heavy-tailed model for analyzing miRNA-seq raw read counts

Autoren: Annika Krutto, Therese Haugdahl Nøst, Magne Thoresen
Veröffentlicht in: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, Ausgabe 23, 2024, ISSN 1544-6115
Herausgeber: Berkeley Electronic Press
DOI: 10.1515/sagmb-2023-0016

Genetic Association Between Schizophrenia and Cortical Brain Surface Area and Thickness

Autoren: Weiqiu Cheng, Oleksandr Frei, Dennis van der Meer, Yunpeng Wang, Kevin S. O’Connell, Yunhan Chu, Shahram Bahrami, Alexey A. Shadrin, Dag Alnæs, Guy F. L. Hindley, Aihua Lin, Naz Karadag, Chun-Chieh Fan, Lars T. Westlye, Tobias Kaufmann, Espen Molden, Anders M. Dale, Srdjan Djurovic, Olav B. Smeland, Ole A. Andreassen
Veröffentlicht in: JAMA Psychiatry, Ausgabe 78/9, 2021, Seite(n) 1020, ISSN 2168-622X
Herausgeber: American Medical Association
DOI: 10.1001/jamapsychiatry.2021.1435

Genetic Overlap Between Global Cortical Brain Structure, C-Reactive Protein, and White Blood Cell Counts

Autoren: Nadine Parker, Weiqiu Cheng, Guy F.L. Hindley, Kevin S. O’Connell, Sandeep Karthikeyan, Børge Holen, Alexey A. Shadrin, Zillur Rahman, Naz Karadag, Shahram Bahrami, Aihua Lin, Nils Eiel Steen, Thor Ueland, Pål Aukrust, Srdjan Djurovic, Anders M. Dale, Olav B. Smeland, Oleksandr Frei, Ole A. Andreassen
Veröffentlicht in: Biological Psychiatry, Ausgabe 95, 2024, Seite(n) 62-71, ISSN 0006-3223
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biopsych.2023.06.008

The cholesterol transport protein GRAMD1C regulates autophagy initiation and mitochondrial bioenergetics

Autoren: Matthew Yoke Wui Ng, Chara Charsou, Ana Lapao, Sakshi Singh, Laura Trachsel-Moncho, Sebastian W. Schultz, Sigve Nakken, Michael J. Munson, Anne Simonsen
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 13, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33933-2

Allelic variation of KIR and HLA tunes the cytolytic payload and determines functional hierarchy of NK cell repertoires

Autoren: Camille Philippon, Sudan Tao, Dennis Clement, Alvaro Haroun-Izquierdo, Katherine M. Kichula, Herman Netskar, Ludwig Brandt, Vincent Sheng Oei, Minoru Kanaya, Pilar Maria Lanuza, Marie Schaffer, Jodie P. Goodridge, Amir Horowitz, Faming Zhu, Quirin Hammer, Ebba Sohlberg, Rakesh Kumar Majhi, Lise Kveberg, Björn Önfelt, Paul J. Norman, Karl-Johan Malmberg
Veröffentlicht in: Blood Advances, Ausgabe 7, 2023, Seite(n) 4492-4504, ISSN 2473-9529
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1182/bloodadvances.2023009827

The population-level impact of Enterococcus faecalis genetics on intestinal colonisation and extraintestinal infection

Autoren: Chrispin Chaguza, Anna K. Pöntinen, Janetta Top, Sergio Arredondo-Alonso, Ana R. Freitas, Carla Novais, Carmen Torres, Stephen D. Bentley, Luisa Peixe, Teresa M. Coque, Rob J.L. Willems, Jukka Corander
Veröffentlicht in: Microbiology Spectrum, 2022, ISSN 2165-0497
Herausgeber: American Society for Microbiology (AsM)
DOI: 10.1101/2022.09.26.509451

Stability of a biomembrane tube covered with proteins

Autoren: Mathijs Janssen, Susanne Liese, Sami C. Al-Izzi, Andreas Carlson
Veröffentlicht in: Physical Review E, Ausgabe 109, 2024, ISSN 2470-0045
Herausgeber: American Physical Society
DOI: 10.1103/physreve.109.044403

rPanglaoDB: an R package to download and merge labeled single-cell RNA-seq data from the PanglaoDB database

Autoren: Daniel Osorio, Marieke L Kuijjer, James J Cai
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe 38, 2023, Seite(n) 580-582, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btab549

Intracorneal Implantation of 3D Bioprinted Scaffolds Containing Mesenchymal Stromal Cells Using Femtosecond‐Laser‐Assisted Intrastromal Keratoplasty

Autoren: Gerard Boix‐Lemonche; Richard M. Nagymihaly; Essi M. Niemi; Natasha Josifovska; Stian Johansen; Morten C. Moe; Hanne Scholz; Goran Petrovski
Veröffentlicht in: Macromolecular Bioscience, 2023, ISSN 1616-5195
Herausgeber: Wiley-VCH GmbH
DOI: 10.1002/mabi.202200422

Prevalence of insomnia in a general adult population cohort using different diagnostic criteria: The seventh survey of the Tromsø study 2015–2016

Autoren: Kate Porcheret, Laila A. Hopstock, Kristian Bernhard Nilsen
Veröffentlicht in: Sleep Medicine, Ausgabe 119, 2024, Seite(n) 289-295, ISSN 1389-9457
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sleep.2024.05.002

CELLULAR, A Cell Autophagy Imaging Dataset

Autoren: Amani Al Outa, Steven Hicks, Vajira Thambawita, Siri Andresen, Jorrit M. Enserink, Pål Halvorsen, Michael A. Riegler, Helene Knævelsrud
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe 10, 2023, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Nature
DOI: 10.1038/s41597-023-02687-x

Insomnia in survivors 8.5 years after the Utøya Island terrorist attack: transition from late adolescence to early adulthood - the Utøya study

Autoren: Kate Porcheret, Synne Øien Stensland, Tore Wentzel-Larsen, Grete Dyb
Veröffentlicht in: European Journal of Psychotraumatology, Ausgabe 13, 2023, ISSN 2000-8066
Herausgeber: Taylor & Francis
DOI: 10.1080/20008198.2021.2020472

The human lens is capable of trilineage differentiation towards osteo-, chondro-, and adipogenesis—a model for studying cataract pathogenesis

Autoren: Boix-Lemonche, Gerard; Nagymihaly, Richard M.; Lumi, Xhevat; Petrovski, Goran
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2023, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fbioe.2023.1164795

Copy number alterations: a catastrophic orchestration of the breast cancer genome

Autoren: Parastoo Shahrouzi, Farzaneh Forouz, Anthony Mathelier, Vessela N. Kristensen, Pascal H.G. Duijf
Veröffentlicht in: Trends in Molecular Medicine, Ausgabe 30, 2024, Seite(n) 750-764, ISSN 1471-4914
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.molmed.2024.04.017

Pangenome-spanning epistasis and coselection analysis via de Bruijn graphs

Autoren: Juri Kuronen, Samuel T. Horsfield, Anna K. Pöntinen, Sudaraka Mallawaarachchi, Sergio Arredondo-Alonso, Harry Thorpe, Rebecca A. Gladstone, Rob J.L. Willems, Stephen D. Bentley, Nicholas J. Croucher, Johan Pensar, John A. Lees, Gerry Tonkin-Hill, Jukka Corander
Veröffentlicht in: Genome Research, Ausgabe 34, 2024, Seite(n) 1081-1088, ISSN 1088-9051
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.278485.123

Vascular reconstruction of the decellularized biomatrix for whole-organ engineering—a critical perspective and future strategies

Autoren: Santosh Gupta, Akriti Sharma, Goran Petrovski, Rama Shanker Verma
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Ausgabe 11, 2023, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontier Media S.A.
DOI: 10.3389/fbioe.2023.1221159

Piezo1 activation by stretching of uterine myometrium supports pregnancy and prevents preterm labour

Autoren: Rakesh Kumar Majhi, Shirin Pourteymour
Veröffentlicht in: The Journal of Physiology, Ausgabe 601, 2023, Seite(n) 719-721, ISSN 0022-3751
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1113/jp283810

Determination of CAR T cell metabolism in an optimized protocol

Autoren: Sandy Joaquina; Christopher Forcados; Benjamin Caulier; Benjamin Caulier; Benjamin Caulier; Else Marit Inderberg; Sébastien Wälchli
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Vol 11 (2023), Ausgabe 2, 2023, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fbioe.2023.1207576

Stable and locally mass- and momentum-conservative control-volume finite-element schemes for the Stokes problem

Autoren: Martin Schneider, Timo Koch
Veröffentlicht in: Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, Ausgabe 420, 2024, Seite(n) 116723, ISSN 0045-7825
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cma.2023.116723

CD37 is a safe chimeric antigen receptor target to treat acute myeloid leukemia

Autoren: Benjamin Caulier, Sandy Joaquina, Pascal Gelebart, Tara Helén Dowling, Fatemeh Kaveh, Moritz Thomas, Luka Tandaric, Patrik Wernhoff, Niveditha Umesh Katyayini, Cara Wogsland, May Eriksen Gjerstad, Yngvar Fløisand, Gunnar Kvalheim, Carsten Marr, Sebastian Kobold, Jorrit M. Enserink, Bjørn Tore Gjertsen, Emmet McCormack, Else Marit Inderberg, Sébastien Wälchli
Veröffentlicht in: Cell Reports Medicine, Ausgabe 5, 2024, Seite(n) 101572, ISSN 2666-3791
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.xcrm.2024.101572

Thermoplastic Elastomer (TPE)–Poly(Methyl Methacrylate) (PMMA) Hybrid Devices for Active Pumping PDMS-Free Organ-on-a-Chip Systems

Autoren: Mathias Busek, Steffen Nøvik, Aleksandra Aizenshtadt, Mikel Amirola-Martinez, Thomas Combriat, Stefan Grünzner, Stefan Krauss
Veröffentlicht in: Biosensors, Ausgabe 11/5, 2021, Seite(n) 162, ISSN 2079-6374
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/bios11050162

Intracorneal Implantation of 3D Bioprinted Scaffolds Containing Mesenchymal Stromal Cells Using Femtosecond‐Laser‐Assisted Intrastromal Keratoplasty

Autoren: Gerard Boix‐Lemonche, Richard M. Nagymihaly, Essi M. Niemi, Natasha Josifovska, Stian Johansen, Morten C. Moe, Hanne Scholz, Goran Petrovski
Veröffentlicht in: Macromolecular Bioscience, Ausgabe 23, 2023, ISSN 1616-5187
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/mabi.202200422

Pump-less, recirculating organ-on-a-chip (rOoC) platform

Autoren: M. Busek; A. Aizenshtadt; T. Koch; A. Frank; L. Delon; M. Amirola Martinez; A. Golovin; C. Dumas; J. Stokowiec; S. Gruenzner; E. Melum; S. Krauss
Veröffentlicht in: Lab on a Chip, 2023, ISSN 1473-0197
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2lc00919f

Psychiatric disorders and brain white matter exhibit genetic overlap implicating developmental and neural cell biology

Autoren: Nadine Parker, Weiqiu Cheng, Guy F. L. Hindley, Pravesh Parekh, Alexey A. Shadrin, Ivan I. Maximov, Olav B. Smeland, Srdjan Djurovic, Anders M. Dale, Lars T. Westlye, Oleksandr Frei, Ole A. Andreassen
Veröffentlicht in: Molecular Psychiatry, Ausgabe 28, 2024, Seite(n) 4924-4932, ISSN 1359-4184
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41380-023-02264-z

The relationship between cannabis use, schizophrenia, and bipolar disorder: a genetically informed study

Autoren: Weiqiu Cheng, Nadine Parker, Naz Karadag, Elise Koch, Guy Hindley, Romain Icick, Alexey Shadrin, Kevin S O’Connell, Thomas Bjella, Shahram Bahrami, Zillur Rahman, Markos Tesfaye, Piotr Jaholkowski, Linn Rødevand, Børge Holen, Trine Vik Lagerberg, Nils Eiel Steen, Srdjan Djurovic, Anders M Dale, Oleksandr Frei, Olav B Smeland, Ole A Andreassen
Veröffentlicht in: The Lancet Psychiatry, Ausgabe 10, 2024, Seite(n) 441-451, ISSN 2215-0366
Herausgeber: Elsevier Limited
DOI: 10.1016/s2215-0366(23)00143-8

Transcriptional and functional effects of lithium in bipolar disorder iPSC-derived cortical spheroids

Autoren: Jordi Requena Osete, Ibrahim A. Akkouh, Oleksandr Ievglevskyi, Matthieu Vandenberghe, Denis Reis de Assis, Thor Ueland, Elena Kondratskaya, Børge Holen, Attila Szabo, Timothy Hughes, Olav B. Smeland, Vidar Martin Steen, Ole A. Andreassen, Srdjan Djurovic
Veröffentlicht in: Molecular Psychiatry, Ausgabe 28, 2023, Seite(n) 3033-3043, ISSN 1359-4184
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41380-023-01944-0

Identification of trypsin-degrading commensals in the large intestine

Autoren: Youxian Li, Eiichiro Watanabe, Yusuke Kawashima, Damian R. Plichta, Zhujun Wang, Makoto Ujike, Qi Yan Ang, Runrun Wu, Munehiro Furuichi, Kozue Takeshita, Koji Yoshida, Keita Nishiyama, Sean M. Kearney, Wataru Suda, Masahira Hattori, Satoshi Sasajima, Takahiro Matsunaga, Xiaoxi Zhang, Kazuto Watanabe, Jun Fujishiro, Jason M. Norman, Bernat Olle, Shutoku Matsuyama, Ho Namkoong, Yoshifumi Uwamino, Ma
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 609, 2022, Seite(n) 582-589, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05181-3

Transmission Line Circuit and Equation for an Electrolyte-Filled Pore of Finite Length

Autoren: Mathijs Janssen
Veröffentlicht in: Physical Review Letters, Ausgabe 126, 2025, ISSN 0031-9007
Herausgeber: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.126.136002

Detecting co-selection through excess linkage disequilibrium in bacterial genomes

Autoren: Sudaraka Mallawaarachchi, Gerry Tonkin-Hill, Anna K Pöntinen, Jessica K Calland, Rebecca A Gladstone, Sergio Arredondo-Alonso, Neil MacAlasdair, Harry A Thorpe, Janetta Top, Samuel K Sheppard, David Balding, Nicholas J Croucher, Jukka Corander
Veröffentlicht in: NAR Genomics and Bioinformatics, Ausgabe 6, 2024, ISSN 2631-9268
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqae061

A comprehensive <scp>AI</scp>‐driven analysis of large‐scale omic datasets reveals novel dual‐purpose targets for the treatment of cancer and aging

Autoren: Frank W. Pun, Geoffrey Ho Duen Leung, Hoi Wing Leung, Jared Rice, Tomas Schmauck‐Medina, Sofie Lautrup, Xi Long, Bonnie Hei Man Liu, Chun Wai Wong, Ivan V. Ozerov, Alex Aliper, Feng Ren, Ari J. Rosenberg, Nishant Agrawal, Evgeny Izumchenko, Evandro F. Fang, Alex Zhavoronkov
Veröffentlicht in: Aging Cell, Ausgabe 22, 2024, ISSN 1474-9718
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/acel.14017

Deciphering the Retinal Epigenome during Development, Disease and Reprogramming: Advancements, Challenges and Perspectives

Autoren: Cristina Zibetti
Veröffentlicht in: Cells, Ausgabe 11, 2024, Seite(n) 806, ISSN 2073-4409
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/cells11050806

Progress in Stem Cells-Based Replacement Therapy for Retinal Pigment Epithelium: In Vitro Differentiation to In Vivo Delivery

Autoren: Santosh Gupta, Lyubomyr Lytvynchuk, Taras Ardan, Hana Studenovska, Ruchi Sharma, Georgina Faura, Lars Eide, Rama Shanker Verma, Ljubo Znaor, Slaven Erceg, Knut Stieger, Jan Motlik, Goran Petrovski, Kapil Bharti
Veröffentlicht in: Stem Cells Translational Medicine, Ausgabe 12, 2023, Seite(n) 536-552, ISSN 2157-6564
Herausgeber: AlphaMed Press
DOI: 10.1093/stcltm/szad039

V-ATPase controls tumor growth and autophagy in a Drosophila model of gliomagenesis

Autoren: Miriam Formica, Alessandra Maria Storaci, Irene Bertolini, Francesca Carminati, Helene Knævelsrud, Valentina Vaira, Thomas Vaccari
Veröffentlicht in: Autophagy, Ausgabe 17, 2021, Seite(n) 4442-4452, ISSN 1554-8627
Herausgeber: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15548627.2021.1918915

Evolutionary and functional history of the Escherichia coli K1 capsule

Autoren: Sergio Arredondo-Alonso, George Blundell-Hunter, Zuyi Fu, Rebecca A. Gladstone, Alfred Fillol-Salom, Jessica Loraine, Elaine Cloutman-Green, Pål J. Johnsen, Ørjan Samuelsen, Anna K. Pöntinen, François Cléon, Susana Chavez-Bueno, Miguel A. De la Cruz, Miguel A. Ares, Manivanh Vongsouvath, Agnieszka Chmielarczyk, Carolyne Horner, Nigel Klein, Alan McNally, Joice N. Reis, José R. Penadés, Nich
Veröffentlicht in: nature communications, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39052-w

Estimating the Logarithm of Characteristic Function and Stability Parameter for Symmetric Stable Laws

Autoren: Jüri Lember; Annika Krutto
Veröffentlicht in: Methodology and Computing in Applied Probability, 2021, ISSN 1387-5841
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s11009-021-09908-z

BEACH domain proteins function as cargo-sorting adaptors in secretory and endocytic pathways

Autoren: Serhiy Pankiv, Anette Kathinka Dahl, Aleksander Aas, Rosa Linn Andersen, Andreas Brech, Petter Holland, Sakshi Singh, Christian Bindesbøll, Anne Simonsen
Veröffentlicht in: Journal of Cell Biology, Ausgabe 223, 2024, ISSN 0021-9525
Herausgeber: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.202408173

Pharmacologic Control of CAR T Cells.

Autoren: Benjamin Caulier; Jorrit M. Enserink; Sébastien Wälchli
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, 2021, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22094320

Longitudinal tracking of acute kidney injury reveals injury propagation along the nephron

Autoren: Luca Bordoni, Anders Kristensen, Donato Sardella, Hanne Kidmose, Layla Pohl, Søren Krag, Ina Maria Schiessl
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.21203/rs.3.rs-2487613/v1

Time‐dependent reduction in oxidative capacity among cultured myotubes from spinal cord injured individuals

Autoren: Stanislava Stevanovic, Andrea Dalmao‐Fernandez, Derya Mohamed, Tuula A. Nyman, Emil Kostovski, Per Ole Iversen, Mladen Savikj, Natasa Nikolic, Arild C. Rustan, G. Hege Thoresen, Eili T. Kase
Veröffentlicht in: Acta Physiologica, Ausgabe 240, 2024, ISSN 1748-1708
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/apha.14156

Interplay between Cultured Human Osteoblastic and Skeletal Muscle Cells: Effects of Conditioned Media on Glucose and Fatty Acid Metabolism

Autoren: Ngoc Nguyen Lunde, Nimo Mukhtar Mohamud Osoble, Andrea Dalmao Fernandez, Alfreda S. Antobreh, Abbas Jafari, Sachin Singh, Tuula A. Nyman, Arild C. Rustan, Rigmor Solberg, G. Hege Thoresen
Veröffentlicht in: Biomedicines, Ausgabe 11, 2025, Seite(n) 2908, ISSN 2227-9059
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/biomedicines11112908

Unraveling the shared genetics of common epilepsies and general cognitive ability

Autoren: Naz Karadag, Espen Hagen, Alexey A. Shadrin, Dennis van der Meer, Kevin S. O'Connell, Zillur Rahman, Gleda Kutrolli, Nadine Parker, Shahram Bahrami, Vera Fominykh, Kjell Heuser, Erik Taubøll, Torill Ueland, Nils Eiel Steen, Srdjan Djurovic, Anders M. Dale, Oleksandr Frei, Ole A. Andreassen, Olav B. Smeland
Veröffentlicht in: Seizure: European Journal of Epilepsy, Ausgabe 122, 2024, Seite(n) 105-112, ISSN 1059-1311
Herausgeber: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1016/j.seizure.2024.09.016

The crystal structure of mycothiol disulfide reductase (Mtr) provides mechanistic insight into the specific low-molecular-weight thiol reductase activity of Actinobacteria

Autoren: Javier Gutiérrez-Fernández, Hans-Petter Hersleth, Marta Hammerstad
Veröffentlicht in: Acta Crystallographica Section D Structural Biology, Ausgabe 80, 2025, Seite(n) 181-193, ISSN 2059-7983
Herausgeber: IUCr
DOI: 10.1107/s205979832400113x

Single-Cell Transcriptomic Profiling of Cholangiocyte Organoids Derived from Bile Ducts of Primary Sclerosing Cholangitis Patients

Autoren: Anna Katharina Frank, Brian K. Chung, Miguel Larraz Lopez De Novales, Lise Katrine Engesæter, Henry William Hoyle, Jonas Øgaard, James Heslop, Tom H. Karlsen, Olivia Tysoe, Teresa Brevini, Jan S. Tchorz, Ludovic Vallier, Irina Mohorianu, Fotios Sampaziotis, Espen Melum
Veröffentlicht in: Digestive Diseases and Sciences, Ausgabe 69, 2024, Seite(n) 3810-3823, ISSN 0163-2116
Herausgeber: Kluwer Academic/Plenum Publishers
DOI: 10.1007/s10620-024-08570-y

Population-level comparisons of gene regulatory networks modeled on high-throughput single-cell transcriptomics data

Autoren: Daniel Osorio, Anna Capasso, S. Gail Eckhardt, Uma Giri, Alexander Somma, Todd M. Pitts, Christopher H. Lieu, Wells A. Messersmith, Stacey M. Bagby, Harinder Singh, Jishnu Das, Nidhi Sahni, S. Stephen Yi, Marieke L. Kuijjer
Veröffentlicht in: Nature Computational Science, 2024, ISSN 2662-8457
Herausgeber: Nature
DOI: 10.1101/2023.01.20.524974

Robust monolithic solvers for the Stokes-Darcy problem with the Darcy equation in primal form

Autoren: Wietse M. Boon; Timo Koch; Miroslav Kuchta; Kent-André Mardal
Veröffentlicht in: SIAM Journal on Scientific Computing, 2022, ISSN 1064-8275
Herausgeber: Society for Industrial and Applied Mathematics
DOI: 10.1137/21m1452974

Mge-cluster: a reference-free approach for typing bacterial plasmids

Autoren: Sergio Arredondo-Alonso, Rebecca A Gladstone, Anna K Pöntinen, João A Gama, Anita C Schürch, Val F Lanza, Pål Jarle Johnsen, Ørjan Samuelsen, Gerry Tonkin-Hill, Jukka Corander
Veröffentlicht in: NAR Genomics and Bioinformatics, 2023, ISSN 2631-9268
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqad066

<scp>FEMA</scp>: Fast and efficient mixed‐effects algorithm for large sample whole‐brain imaging data

Autoren: Pravesh Parekh, Chun Chieh Fan, Oleksandr Frei, Clare E. Palmer, Diana M. Smith, Carolina Makowski, John R. Iversen, Diliana Pecheva, Dominic Holland, Robert Loughnan, Pierre Nedelec, Wesley K. Thompson, Donald J. Hagler, Ole A. Andreassen, Terry L. Jernigan, Thomas E. Nichols, Anders M. Dale
Veröffentlicht in: Human Brain Mapping, Ausgabe 45, 2024, ISSN 1065-9471
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hbm.26579

Recovering Escherichia coli Plasmids in the Absence of Long-Read Sequencing Data

Autoren: Julian A. Paganini, Nienke L. Plantinga, Sergio Arredondo-Alonso, Rob J. L. Willems, Anita C. Schürch
Veröffentlicht in: Microorganisms, Ausgabe 9/8, 2021, Seite(n) 1613, ISSN 2076-2607
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/microorganisms9081613

Charting the shared genetic architecture of Alzheimer's disease, cognition, and educational attainment, and associations with brain development

Autoren: Piotr Jaholkowski, Shahram Bahrami, Vera Fominykh, Guy F.L. Hindley, Markos Tesfaye, Pravesh Parekh, Nadine Parker, Tahir T. Filiz, Kaja Nordengen, Espen Hagen, Elise Koch, Nora R. Bakken, Evgeniia Frei, Viktoria Birkenæs, Zillur Rahman, Oleksandr Frei, Jan Haavik, Srdjan Djurovic, Anders M. Dale, Olav B. Smeland, Kevin S. O’Connell, Alexey A. Shadrin, Ole A. Andreassen
Veröffentlicht in: Neurobiology of Disease, Ausgabe 203, 2025, Seite(n) 106750, ISSN 0969-9961
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.nbd.2024.106750

Collaborative benchmarking of functional-structural root architecture models: Quantitative comparison of simulated root water uptake

Autoren: Andrea Schnepf, Christopher K Black, Valentin Couvreur, Benjamin M Delory, Claude Doussan, Adrien Heymans, Mathieu Javaux, Deepanshu Khare, Axelle Koch, Timo Koch, Christian W Kuppe, Magdalena Landl, Daniel Leitner, Guillaume Lobet, Félicien Meunier, Johannes A Postma, Ernst D Schäfer, Tobias Selzner, Jan Vanderborght, Harry Vereecken
Veröffentlicht in: in silico Plants, Ausgabe 5, 2023, ISSN 2517-5025
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/insilicoplants/diad005

Mixed fatty acid-phospholipid protocell networks.

Autoren: Inga Põldsalu; Elif Senem Köksal; Irep Gözen
Veröffentlicht in: Physical Chemistry Chemical Physics, 2021, ISSN 1463-9076
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cp03832j

Small molecule inhibitors targeting regulatory T cells for cancer treatment

Autoren: Nuria García‐Díaz, Qian Wei, Kjetil Taskén
Veröffentlicht in: European Journal of Immunology, Ausgabe 54, 2024, ISSN 0014-2980
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/eji.202350448

Mixed fatty acid-phospholipid protocell networks

Autoren: Inga Põldsalu, Elif Senem Köksal, Irep Gözen
Veröffentlicht in: Physical Chemistry Chemical Physics, Ausgabe 23, 2024, Seite(n) 26948-26954, ISSN 1463-9076
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cp03832j

Lithium increases mitochondrial respiration in iPSC-derived neural precursor cells from lithium responders

Autoren: Jordi Requena Osete, Ibrahim A. Akkouh, Denis Reis de Assis, Attila Szabo, Evgeniia Frei, Timothy Hughes, Olav B. Smeland, Nils Eiel Steen, Ole A. Andreassen, Srdjan Djurovic
Veröffentlicht in: Molecular Psychiatry, 2021, ISSN 1359-4184
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41380-021-01164-4

A (Dual) Network Model for Heat Transfer in Porous Media

Autoren: Timo Koch, Kilian Weishaupt, Johannes Müller, Bernhard Weigand, Rainer Helmig
Veröffentlicht in: Transport in Porous Media, Ausgabe 140/1, 2021, Seite(n) 107-141, ISSN 0169-3913
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s11242-021-01602-5

Mechanisms Behind NAFLD: a System Genetics Perspective

Autoren: Shirin Pourteymour, Christian A. Drevon, Knut Tomas Dalen, Frode A. Norheim
Veröffentlicht in: Current Atherosclerosis Reports, Ausgabe 25, 2023, Seite(n) 869-878, ISSN 1523-3804
Herausgeber: Current Science Inc.
DOI: 10.1007/s11883-023-01158-3

Discovery of host-directed modulators of virus infection by probing the SARS-CoV-2–host protein–protein interaction network

Autoren: Vandana Ravindran, Jessica Wagoner, Paschalis Athanasiadis, Andreas B Den Hartigh, Julia M Sidorova, Aleksandr Ianevski, Susan L Fink, Arnoldo Frigessi, Judith White, Stephen J Polyak, Tero Aittokallio
Veröffentlicht in: Briefings in Bioinformatics, Ausgabe 23, 2023, ISSN 1467-5463
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bib/bbac456

Efficient CAR T cell targeting of the CA125 extracellular repeat domain of MUC16

Autoren: Nicholas P Casey, Katrin Kleinmanns, Christopher Forcados, Pascal F Gelebart, Sandy Joaquina, Martine Lode, Emmanuelle Benard, Fatemeh Kaveh, Benjamin Caulier, Christiane Helgestad Gjerde, Elvira García de Jalón, David J Warren, Kristina Lindemann, Erik Rokkones, Ben Davidson, Marit Renee Myhre, Gunnar Kvalheim, Line Bjørge, Emmet McCormack, Else Marit Inderberg, Sébastien Wälchli
Veröffentlicht in: Journal for ImmunoTherapy of Cancer, Ausgabe 12, 2024, Seite(n) e008179, ISSN 2051-1426
Herausgeber: BMJ Journals
DOI: 10.1136/jitc-2023-008179

A high-throughput multiplexing and selection strategy to complete bacterial genomes

Autoren: Alonso, Sergio Arredondo; Pöntinen, Anna K.; Cleon, Francois Pierre Alexandre; Gladstone, Rebecca Ashley; Schürch, Anita C.; Johnsen, Pål Jarle; Samuelsen, Ørjan; Corander, Jukka
Veröffentlicht in: GigaScience, 2021, ISSN 2047-217X
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gigascience/giab079

Nonlinear mixed-dimension model for embedded tubular networks with application to root water uptake

Autoren: Timo Koch; Hanchuan Wu; Martin Schneider
Veröffentlicht in: Journal of Computational Physics, 2022, ISSN 0021-9991
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jcp.2021.110823

Protocol for production of tonic CAR T cells with dasatinib

Autoren: Léa Rosselle, Thibault Leray, Sandy Joaquina, Benjamin Caulier, Emmet McCormack, Pascal Gelebart, Sébastien Wälchli, Else Marit Inderberg
Veröffentlicht in: STAR Protocols, Ausgabe 6, 2025, Seite(n) 103529, ISSN 2666-1667
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.xpro.2024.103529

Photoannealing of Microtissues Creates High‐Density Capillary Network Containing Living Matter in a Volumetric‐Independent Manner

Autoren: Maik Schot, Malin Becker, Carlo Alberto Paggi, Francisca Gomes, Timo Koch, Tarek Gensheimer, Castro Johnbosco, Liebert Parreiras Nogueira, Andries van der Meer, Andreas Carlson, Håvard Haugen, Jeroen Leijten
Veröffentlicht in: Advanced Materials, Ausgabe 36, 2024, ISSN 0935-9648
Herausgeber: United Nations Industrial Developement Organization
DOI: 10.1002/adma.202308949

Improving bioinformatics software quality through teamwork

Autoren: Katalin Ferenc, Ieva Rauluseviciute, Ladislav Hovan, Vipin Kumar, Marieke L Kuijjer, Anthony Mathelier
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe 40, 2024, ISSN 1367-4811
Herausgeber: Oxford Academic
DOI: 10.1093/bioinformatics/btae632

PIEZO1 targeting in macrophages boosts phagocytic activity and foam cell apoptosis in atherosclerosis

Autoren: Shirin Pourteymour, Jingxue Fan, Rakesh Kumar Majhi, Shuyuan Guo, Xin Sun, Zhen Huang, Ying Liu, Hanna Winter, Alexandra Bäcklund, Nikolaos-Taxiarchis Skenteris, Ekaterina Chernogubova, Olivera Werngren, Zhaolong Li, Josefin Skogsberg, Yuhuang Li, Ljubica Matic, Ulf Hedin, Lars Maegdefessel, Ewa Ehrenborg, Ye Tian, Hong Jin
Veröffentlicht in: Cellular and Molecular Life Sciences, 2024, ISSN 1420-682X
Herausgeber: Birkhauser Verlag
DOI: 10.21203/rs.3.rs-4539639/v1

The human leukemic oncogene MLL-AF4 promotes hyperplastic growth of hematopoietic tissues in Drosophila larvae

Autoren: Julie A. Johannessen, Miriam Formica, Aina Louise C. Haukeland, Nora Rojahn Bråthen, Amani Al Outa, Miriam Aarsund, Marc Therrien, Jorrit M. Enserink, Helene Knævelsrud
Veröffentlicht in: iScience, Ausgabe 26, 2024, Seite(n) 107726, ISSN 2589-0042
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.isci.2023.107726

Insight Into the Metabolic Adaptations of Electrically Pulse-Stimulated Human Myotubes Using Global Analysis of the Transcriptome and Proteome

Autoren: Abel M. Mengeste, Nataša Nikolić, Andrea Dalmao Fernandez, Yuan Z. Feng, Tuula A. Nyman, Sander Kersten, Fred Haugen, Eili Tranheim Kase, Vigdis Aas, Arild C. Rustan, G. Hege Thoresen
Veröffentlicht in: Frontiers in Physiology, Ausgabe 13, 2022, ISSN 1664-042X
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fphys.2022.928195

User-View on Organ-on-a-Chip Technology

Autoren: Mathias Busek, Aleksandra Aizenshtadt, Mikel Amirola Martinez, Ludivine Delon, Stefan Krauss
Veröffentlicht in: Biosensors, 2023, ISSN 2079-6374
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.20944/preprints202202.0032.v1

Robust analysis of prokaryotic pangenome gene gain and loss rates with Panstripe

Autoren: Gerry Tonkin-Hill; Rebecca A Gladstone; Anna K Pöntinen; Sergio Arredondo-Alonso; Stephen D Bentley; Jukka Corander
Veröffentlicht in: Genome Research, 2023, ISSN 1088-9051
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.277340.122

The Effects of the Coating and Aging of Biodegradable Polylactic Acid Membranes on In Vitro Primary Human Retinal Pigment Epithelium Cells

Autoren: Georgina Faura, Hana Studenovska, David Sekac, Zdenka Ellederova, Goran Petrovski, Lars Eide
Veröffentlicht in: Biomedicines, Ausgabe 12, 2025, Seite(n) 966, ISSN 2227-9059
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/biomedicines12050966

Mutational analysis and protein profiling predict drug sensitivity in multiple myeloma cell lines

Autoren: Mariaserena Giliberto; Leonardo Miranda Santana; Toril Holien; Kristine Misund; Sigve Nakken; Daniel Vodak; Eivind Hovig; Leonardo A. Meza-Zepeda; Eivind Coward; Anders Waage; Kjetil Taskén; Sigrid S. Skånland
Veröffentlicht in: Frontiers in Oncology, 2022, ISSN 2234-943X
Herausgeber: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fonc.2022.1040730

WRN loss accelerates abnormal adipocyte metabolism in Werner syndrome

Autoren: Yuyao Tian, Sofie Lautrup, Patrick Wai Nok Law, Ngoc-Duy Dinh, Evandro Fei Fang, Wai-Yee Chan
Veröffentlicht in: Cell & Bioscience, Ausgabe 14, 2024, ISSN 2045-3701
Herausgeber: Society of Chinese Bioscientists in America
DOI: 10.1186/s13578-023-01183-4

Loss of chromosome cytoband 13q14.2 orchestrates breast cancer pathogenesis and drug response

Autoren: Parastoo Shahrouzi, Youness Azimzade, Wioletta Brankiewicz-Kopcinska, Sugandha Bhatia, David Kunke, Derek Richard, Xavier Tekpli, Vessela N. Kristensen, Pascal H. G. Duijf
Veröffentlicht in: Breast Cancer Research, Ausgabe 26, 2024, ISSN 1465-542X
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13058-024-01924-4

Colorimetric and Electrochemical Screening for Early Detection of Diabetes Mellitus and Diabetic Retinopathy—Application of Sensor Arrays and Machine Learning

Autoren: Georgina Faura, Gerard Boix-Lemonche, Anne Kristin Holmeide, Rasa Verkauskiene, Vallo Volke, Jelizaveta Sokolovska, Goran Petrovski
Veröffentlicht in: Sensors, Ausgabe 22, 2024, Seite(n) 718, ISSN 1424-8220
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/s22030718

Shared genetic architecture between schizophrenia and subcortical brain volumes implicates early neurodevelopmental processes and brain development in childhood

Autoren: Cheng, Weiqiu; van der Meer, Dennis; Parker, Nadine; Hindley, Guy Frederick Lanyon; O'Connell, Kevin Sean; Wang, Yunpeng; Shadrin, Alexey; Alnæs, Dag; Bahrami, Shahram; Lin, Aihua; Karadag, Naz; Holen, Børge; Fernández-Cabello, Sara; Fan, Chun-Chieh; Dale, Anders; Djurovic, Srdjan; Westlye, Lars Tjelta; Frei, Oleksandr; Smeland, Olav Bjerkehagen; Andreassen, Ole
Veröffentlicht in: molecular psychiatry, 2022, ISSN 1359-4184
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41380-022-01751-z

Charting the Landscape of Genetic Overlap Between Mental Disorders and Related Traits Beyond Genetic Correlation

Autoren: Guy Hindley, Oleksandr Frei, Alexey A Shadrin, Weiqiu Cheng, Kevin S O'Connell, Romain Icick, Nadine Parker, Shahram Bahrami, Naz Karadag, Daniel Roelfs, Børge Holen, Aihua Lin, Chun C Fan, Srdjan Djurovic, Anders M Dale, Olav B Smeland, Ole A Andreassen
Veröffentlicht in: American Journal of Psychiatry, 2022, ISSN 0002-953X
Herausgeber: American Psychiatric Publishing, Inc.
DOI: 10.1176/appi.ajp.21101051

Academic User View: Organ-on-a-Chip Technology

Autoren: Mathias Busek, Aleksandra Aizenshtadt, Mikel Amirola-Martinez, Ludivine Delon, Stefan Krauss
Veröffentlicht in: Biosensors, Ausgabe 12, 2024, Seite(n) 126, ISSN 2079-6374
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/bios12020126

Reversible heat production during electric double layer buildup depends sensitively on the electrolyte and its reservoir

Autoren: Fabian Glatzel, Mathijs Janssen, Andreas Härtel
Veröffentlicht in: The Journal of Chemical Physics, Ausgabe 154/6, 2021, Seite(n) 064901, ISSN 0021-9606
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0037218

Genome-wide Association Analysis of Schizophrenia and Vitamin D Levels Shows Shared Genetic Architecture and Identifies Novel Risk Loci

Autoren: Piotr Jaholkowski, Guy F L Hindley, Alexey A Shadrin, Markos Tesfaye, Shahram Bahrami, Mari Nerhus, Zillur Rahman, Kevin S O’Connell, Børge Holen, Nadine Parker, Weiqiu Cheng, Aihua Lin, Linn Rødevand, Naz Karadag, Oleksandr Frei, Srdjan Djurovic, Anders M Dale, Olav B Smeland, Ole A Andreassen
Veröffentlicht in: Schizophrenia Bulletin, Ausgabe 49, 2023, Seite(n) 1654-1664, ISSN 0586-7614
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/schbul/sbad063

Bacterial Toxin-Triggered Release of Antibiotics from Capsosomes Protects a Fly Model from Lethal Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) Infection

Autoren: Renée L. Tonkin, Anna Klöckner, Adrian Najer, Carolina J. Simoes da Silva, Cécile Echalier, Marc S. Dionne, Andrew M. Edwards, Molly M. Stevens
Veröffentlicht in: Advanced Healthcare Materials, 2022, ISSN 2192-2659
Herausgeber: World Scientific
DOI: 10.1002/adhm.202200036

Detecting co-selection through excess linkage disequilibrium in bacterial genomes

Autoren: Sudaraka Mallawaarachchi, Gerry Tonkin-Hill, Anna K. Pöntinen, Jessica K. Calland, Rebecca A. Gladstone, Sergio Arredondo-Alonso, Neil MacAlasdair, Harry A. Thorpe, Janetta Top, Samuel K. Sheppard, David Balding, Nicholas J. Croucher, Jukka Corander
Veröffentlicht in: NAR Genomics and Bioinformatics, 2023, ISSN 2631-9268
Herausgeber: Oxford Academic Press
DOI: 10.1101/2023.08.04.551407

Modulation of in Vitro SARS-CoV-2 Infection by Stephania tetrandra and Its Alkaloid Constituents

Autoren: Aswad Khadilkar, Zoie L. Bunch, Jessica Wagoner, Vandana Ravindran, Jessica M. Oda, Warren S. Vidar, Trevor N. Clark, Preston K. Manwill, Daniel A. Todd, Sarah A. Barr, Lauren K. Olinger, Susan L. Fink, Wendy K. Strangman, Roger G. Linington, John B. MacMillan, Nadja B. Cech, Stephen J. Polyak
Veröffentlicht in: Journal of Natural Products, Ausgabe 86, 2023, Seite(n) 1061-1073, ISSN 0163-3864
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jnatprod.3c00159

Seizing the moment: Zebrafish epilepsy models

Autoren: Kinga Gawel, Melanie Langlois, Teresa Martins, Wietske van der Ent, Ettore Tiraboschi, Maxime Jacmin, Alexander D. Crawford, Camila V. Esguerra
Veröffentlicht in: Neuroscience & Biobehavioral Reviews, Ausgabe 116, 2020, Seite(n) 1-20, ISSN 0149-7634
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.neubiorev.2020.06.010

Crowding-Regulated Binding of Divalent Biomolecules

Autoren: Tomasz Skóra, Mathijs Janssen, Andreas Carlson, Svyatoslav Kondrat
Veröffentlicht in: Physical Review Letters, Ausgabe 130, 2025, ISSN 0031-9007
Herausgeber: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.130.258401

Mutational analysis and protein profiling predict drug sensitivity in multiple myeloma cell lines

Autoren: Mariaserena Giliberto, Leonardo Miranda Santana, Toril Holien, Kristine Misund, Sigve Nakken, Daniel Vodak, Eivind Hovig, Leonardo A. Meza-Zepeda, Eivind Coward, Anders Waage, Kjetil Taskén, Sigrid S. Skånland
Veröffentlicht in: Frontiers in Oncology, Ausgabe 12, 2022, ISSN 2234-943X
Herausgeber: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fonc.2022.1040730

Omega-3 fatty acids and individual variability in plasma triglyceride response: A mini-review

Autoren: Amanda Rundblad, Viviana Sandoval, Kirsten B. Holven, José M. Ordovás, Stine M. Ulven
Veröffentlicht in: Redox Biology, Ausgabe 63, 2023, Seite(n) 102730, ISSN 2213-2317
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.redox.2023.102730

Retinal Pigment Epithelium Cell Development: Extrapolating Basic Biology to Stem Cell Research

Autoren: Santosh Gupta; Lyubomyr Lytvynchuk; Taras Ardan; Hana Studenovska; Georgina Faura; Lars Eide; Ljubo Znaor; Slaven Erceg; Knut Stieger; Jan Motlik; Kapil Bharti; Goran Petrovski
Veröffentlicht in: Biomedicines, Vol 11, Iss 2, p 310 (2023), Ausgabe 1, 2023, ISSN 2227-9059
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/biomedicines11020310

The G Protein–Coupled Receptor GPR56 Is an Inhibitory Checkpoint for NK Cell Migration

Autoren: Daniel Palacios, Rakesh Kumar Majhi, Edina K. Szabo, Dennis Clement, Mieszko Lachota, Herman Netskar, Leena Penna, Silje Z. Krokeide, Marianna Vincenti, Lise Kveberg, Karl-Johan Malmberg
Veröffentlicht in: The Journal of Immunology, Ausgabe 213, 2025, Seite(n) 1349-1357, ISSN 0022-1767
Herausgeber: American Association of Immunologists
DOI: 10.4049/jimmunol.2400228

Spontaneous Formation of Prebiotic Compartment Colonies on Hadean Earth and Pre-Noachian Mars

Autoren: Köksal, Elif; Põldsalu, Inga; Friis, Henrik; Mojzsis, Stephen J; Bizzarro, Martin; Gözen, Irep
Veröffentlicht in: chemsystemschem, 2022, ISSN 2570-4206
Herausgeber: Wiley-VCH GmbH
DOI: 10.1002/syst.202200012

Quantitative analysis of neuronal mitochondrial movement reveals patterns resulting from neurotoxicity of rotenone and 6-hydroxydopamine

Autoren: Rui F. Simões; Rute Pino; Maurício Moreira-Soares; Jaromira Kovarova; Jiri Neuzil; Jiri Neuzil; Rui D. M. Travasso; Paulo J. Oliveira; Teresa Cunha-Oliveira; Francisco B. Pereira
Veröffentlicht in: The FASEB Journal, 2021, ISSN 0892-6638
Herausgeber: Federation of American Societies for Experimental Biology
DOI: 10.1096/fj.202100899r

WRN promotes bone development and growth by unwinding SHOX-G-quadruplexes via its helicase activity in Werner Syndrome

Autoren: Yuyao Tian, Wuming Wang, Sofie Lautrup, Hui Zhao, Xiang Li, Patrick Wai Nok Law, Ngoc-Duy Dinh, Evandro Fei Fang, Hoi Hung Cheung, Wai-Yee Chan
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 13, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33012-6

Transmission Line Circuit and Equation for an Electrolyte-Filled Pore of Finite Length

Autoren: Mathijs Janssen
Veröffentlicht in: PHYSICAL REVIEW LETTERS, 2021, ISSN 0031-9007
Herausgeber: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.126.136002

Modeling properties of chromosome territories using polymer filaments in diverse confinement geometries

Autoren: Negar Nahali, Mohammadsaleh Oshaghi, Jonas Paulsen
Veröffentlicht in: Chromosome Research, Ausgabe 32, 2024, ISSN 1573-6849
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1007/s10577-024-09753-z

Childhood trajectories of emotional and behavioral difficulties are related to polygenic liability for mood and anxiety disorders

Autoren: Nora R. Bakken, Nadine Parker, Laurie J. Hannigan, Espen Hagen, Pravesh Parekh, Alexey Shadrin, Piotr Jaholkowski, Evgeniia Frei, Viktoria Birkenæs, Guy Hindley, Laura Hegemann, Elizabeth C. Corfield, Martin Tesli, Alexandra Havdahl, Ole A. Andreassen
Veröffentlicht in: Journal of Child Psychology and Psychiatry, 2024, ISSN 0021-9630
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jcpp.14063

Contrast-enhanced Micro-CT 3D visualization of cell distribution in hydrated human cornea

Autoren: Gerard Boix-Lemonche, Torben Hildebrand, Håvard Jostein Haugen, Goran Petrovski, Liebert Parreiras Nogueira
Veröffentlicht in: Heliyon, Ausgabe 10, 2024, Seite(n) e25828, ISSN 2405-8440
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.heliyon.2024.e25828

Characterizing the polygenic overlap and shared loci between rheumatoid arthritis and cardiovascular diseases

Autoren: Xiaohui Sun, Yu Qian, Weiqiu Cheng, Ding Ye, Bin Liu, Dan Zhou, Chengping Wen, Ole A. Andreassen, Yingying Mao
Veröffentlicht in: BMC Medicine, Ausgabe 22, 2024, ISSN 1741-7015
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12916-024-03376-1

Apparent nosocomial adaptation of Enterococcus faecalis predates the modern hospital era

Autoren: Anna K. Pöntinen, Janetta Top, Sergio Arredondo-Alonso, Gerry Tonkin-Hill, Ana R. Freitas, Carla Novais, Rebecca A. Gladstone, Maiju Pesonen, Rodrigo Meneses, Henri Pesonen, John A. Lees, Dorota Jamrozy, Stephen D. Bentley, Val F. Lanza, Carmen Torres, Luisa Peixe, Teresa M. Coque, Julian Parkhill, Anita C. Schürch, Rob J. L. Willems, Jukka Corander
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-21749-5

Identification of novel genomic loci for anxiety symptoms and extensive genetic overlap with psychiatric disorders

Autoren: Markos Tesfaye, Piotr Jaholkowski, Alexey A. Shadrin, Dennis van der Meer, Guy F.L. Hindley, Børge Holen, Nadine Parker, Pravesh Parekh, Viktoria Birkenæs, Zillur Rahman, Shahram Bahrami, Gleda Kutrolli, Oleksandr Frei, Srdjan Djurovic, Anders M. Dale, Olav B. Smeland, Kevin S. O'Connell, Ole A. Andreassen
Veröffentlicht in: Psychiatry and Clinical Neurosciences, Ausgabe 78, 2024, Seite(n) 783-791, ISSN 1323-1316
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/pcn.13742

Pump-less, recirculating organ-on-a-chip (rOoC) platform

Autoren: Mathias Busek, Aleksandra Aizenshtadt, Timo Koch, Anna Frank, Ludivine Delon, Mikel Amirola Martinez, Alexey Golovin, Clotilde Dumas, Justyna Stokowiec, Stefan Gruenzner, Espen Melum, Stefan Krauss
Veröffentlicht in: Lab on a Chip, Ausgabe 23, 2024, Seite(n) 591-608, ISSN 1473-0197
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2lc00919f

Retinal Pigment Epithelium Cell Development: Extrapolating Basic Biology to Stem Cell Research

Autoren: Santosh Gupta, Lyubomyr Lytvynchuk, Taras Ardan, Hana Studenovska, Georgina Faura, Lars Eide, Ljubo Znaor, Slaven Erceg, Knut Stieger, Jan Motlik, Kapil Bharti, Goran Petrovski
Veröffentlicht in: Biomedicines, Ausgabe 11, 2023, Seite(n) 310, ISSN 2227-9059
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/biomedicines11020310

Cryo-EM structure of Helicobacter pylori urease with an inhibitor in the active site at 2.0 Å resolution

Autoren: Eva S. Cunha, Xiaorui Chen, Marta Sanz-Gaitero, Deryck J. Mills, Hartmut Luecke
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-20485-6

GridFormat: header-only C++-library for grid fileI/O

Autoren: Dennis Gläser, Timo Koch, Bernd Flemisch
Veröffentlicht in: Journal of Open Source Software, Ausgabe 8, 2023, Seite(n) 5778, ISSN 2475-9066
Herausgeber: Journal of Open Source Software
DOI: 10.21105/joss.05778

Pump‐Less, Recirculating Organ‐on‐Chip (rOoC) Platform to Model the Metabolic Crosstalk between Islets and Liver

Autoren: Aleksandra Aizenshtadt, Chencheng Wang, Shadab Abadpour, Pedro Duarte Menezes, Ingrid Wilhelmsen, Andrea Dalmao‐Fernandez, Justyna Stokowiec, Alexey Golovin, Mads Johnsen, Thomas M. D. Combriat, Hanne Røberg‐Larsen, Nikolaj Gadegaard, Hanne Scholz, Mathias Busek, Stefan J. K. Krauss
Veröffentlicht in: Advanced Healthcare Materials, Ausgabe 13, 2024, ISSN 2192-2640
Herausgeber: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/adhm.202303785

Targeting shelterin proteins for cancer therapy

Autoren: Wioletta Brankiewicz-Kopcinska, Anoop Kallingal, Radoslaw Krzemieniecki, Maciej Baginski
Veröffentlicht in: Drug Discovery Today, Ausgabe 29, 2024, Seite(n) 104056, ISSN 1359-6446
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.drudis.2024.104056

Energy metabolism in skeletal muscle cells from donors with different body mass index

Autoren: Parmeshwar B. Katare, Andrea Dalmao-Fernandez, Abel M. Mengeste, Håvard Hamarsland, Stian Ellefsen, Hege G. Bakke, Eili Tranheim Kase, G. Hege Thoresen, Arild C. Rustan
Veröffentlicht in: Frontiers in Physiology, Ausgabe 13, 2022, ISSN 1664-042X
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fphys.2022.982842

Emergence and dissemination of antimicrobial resistance in Escherichia coli causing bloodstream infections in Norway in 2002–17: a nationwide, longitudinal, microbial population genomic study

Autoren: Gladstone, Rebecca Ashley; McNally, Alan; Pöntinen, Anna Kaarina; Tonkin-Hill, Gerry; Lees, John A.; Skytén, Kusti Onni; Cléon, Francois Pierre Alexandre; Christensen, Martin Owczarek Korsner; Haldorsen, Bjørg; Bye, Kristina K.; Gammelsrud, Karianne Wiger; Hjetland, Reidar; Kümmel, Angela; Larsen, Hege; Lindemann, Paul Christoffer; Löhr, Iren Høyland; Marvik, Åshild; Nilsen, Einar; Noer, M
Veröffentlicht in: The Lancet Microbe, 2021, ISSN 2666-5247
Herausgeber: Elsevier Ltd.
DOI: 10.1016/s2666-5247(21)00031-8

The population-level impact of Enterococcus faecalis genetics on intestinal colonization and extraintestinal infection

Autoren: Chrispin Chaguza, Anna K. Pöntinen, Janetta Top, Sergio Arredondo-Alonso, Ana R. Freitas, Carla Novais, Carmen Torres, Stephen D. Bentley, Luisa Peixe, Teresa M. Coque, Rob J. L. Willems, Jukka Corander
Veröffentlicht in: Microbiology Spectrum, Ausgabe 11, 2023, ISSN 2165-0497
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/spectrum.00201-23

Regulatory Network of PD1 Signaling Is Associated with Prognosis in Glioblastoma Multiforme

Autoren: Camila M. Lopes-Ramos; Tatiana Belova; Tess H. Brunner; Marouen Ben Guebila; Daniel Osorio; John Quackenbush; Marieke L. Kuijjer; Marieke L. Kuijjer
Veröffentlicht in: Cancer Research, 2021, ISSN 0008-5472
Herausgeber: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/0008-5472.can-21-0730

Roles of NAD+in Health and Aging

Autoren: Sofie Lautrup, Yujun Hou, Evandro F. Fang, Vilhelm A. Bohr
Veröffentlicht in: Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine, Ausgabe 14, 2024, Seite(n) a041193, ISSN 2157-1422
Herausgeber: Cold Spring Harbor Press
DOI: 10.1101/cshperspect.a041193

Multivariate genetic analysis of personality and cognitive traits reveals abundant pleiotropy

Autoren: Guy Hindley, Alexey A. Shadrin, Dennis van der Meer, Nadine Parker, Weiqiu Cheng, Kevin S. O’Connell, Shahram Bahrami, Aihua Lin, Naz Karadag, Børge Holen, Thomas Bjella, Ian J. Deary, Gail Davies, W. David Hill, Jan Bressler, Sudha Seshadri, Chun Chieh Fan, Torill Ueland, Srdjan Djurovic, Olav B. Smeland, Oleksandr Frei, Anders M. Dale, Ole A. Andreassen
Veröffentlicht in: Nature Human Behaviour, Ausgabe 7, 2023, Seite(n) 1584-1600, ISSN 2397-3374
Herausgeber: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41562-023-01630-9

Alternative cryoprotective agent for corneal stroma-derived mesenchymal stromal cells for clinical applications

Autoren: Kristoffer Larsen, Goran Petrovski, Gerard Boix-Lemonche
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 14, 2024, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-65469-4

Mice lacking intestinal Nr1i2 have normal intestinal homeostasis under steady‐state conditions and are not hypersensitive to inflammation under lipopolysaccharide treatment

Autoren: Salah Edden Amini, Sophie Emilie Bresson, Jérôme Ruzzin
Veröffentlicht in: The FASEB Journal, Ausgabe 37, 2024, ISSN 0892-6638
Herausgeber: Federation of American Societies for Experimental Biology
DOI: 10.1096/fj.202301126

Using iPSC Models to Understand the Role of Estrogen in Neuron-Glia Interactions in Schizophrenia and Bipolar Disorder.

Autoren: Denis Reis de Assis; Attila Szabo; Jordi Requena Osete; Francesca Puppo; Kevin S. O’Connell; Ibrahim A. Akkouh; Timothy P. Hughes; Evgeniia Frei; Ole A. Andreassen; Srdjan Djurovic
Veröffentlicht in: 10, Ausgabe 1, 2021, ISSN 2073-4409
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/cells10020209

Academic User View: Organ-on-a-Chip Technology

Autoren: Mathias Busek; Aleksandra Aizenshtadt; Mikel Amirola-Martinez; Ludivine Delon; Stefan Krauss
Veröffentlicht in: biosensors, 2022, ISSN 2079-6374
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/bios12020126

Robust analysis of prokaryotic pangenome gene gain and loss rates with Panstripe

Autoren: Gerry Tonkin-Hill, Rebecca A. Gladstone, Anna K. Pöntinen, Sergio Arredondo-Alonso, Stephen D. Bentley, Jukka Corander
Veröffentlicht in: Genome Research, Ausgabe 33, 2023, Seite(n) 129-140, ISSN 1088-9051
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.277340.122

Distinct biological signature and modifiable risk factors underlie the comorbidity between major depressive disorder and cardiovascular disease

Autoren: Jacob Bergstedt, Joëlle A. Pasman, Ziyan Ma, Arvid Harder, Shuyang Yao, Nadine Parker, Jorien L. Treur, Dirk J. A. Smit, Oleksandr Frei, Alexey A. Shadrin, Joeri J. Meijsen, Qing Shen, Sara Hägg, Per Tornvall, Alfonso Buil, Thomas Werge, Jens Hjerling-Leffler, Thomas D. Als, Anders D. Børglum, Cathryn M. Lewis, Andrew M. McIntosh, Unnur A. Valdimarsdóttir, Ole A. Andreassen, Patrick F. Sulliva
Veröffentlicht in: Nature Cardiovascular Research, Ausgabe 3, 2024, Seite(n) 754-769, ISSN 2731-0590
Herausgeber: Nature
DOI: 10.1038/s44161-024-00488-y

Quantitative analysis of neuronal mitochondrial movement reveals patterns resulting from neurotoxicity of rotenone and 6‐hydroxydopamine

Autoren: Rui F. Simões, Rute Pino, Maurício Moreira‐Soares, Jaromira Kovarova, Jiri Neuzil, Rui Travasso, Paulo J. Oliveira, Teresa Cunha‐Oliveira, Francisco B. Pereira
Veröffentlicht in: The FASEB Journal, Ausgabe 35, 2022, ISSN 0892-6638
Herausgeber: Federation of American Societies for Experimental Biology
DOI: 10.1096/fj.202100899r

Determination of CAR T cell metabolism in an optimized protocol

Autoren: Sandy Joaquina, Christopher Forcados, Benjamin Caulier, Else Marit Inderberg, Sébastien Wälchli
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Ausgabe 11, 2023, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fbioe.2023.1207576

Applying valency-based immuno-selection to generate broadly cross-reactive antibodies against influenza hemagglutinins

Autoren: Daniëla Maria Hinke, Ane Marie Anderson, Kirankumar Katta, Marlene Fyrstenberg Laursen, Demo Yemane Tesfaye, Ina Charlotta Werninghaus, Davide Angeletti, Gunnveig Grødeland, Bjarne Bogen, Ranveig Braathen
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-44889-w

Perinatal exposure to potential endocrine disrupting chemicals and autism spectrum disorder: From Norwegian birth cohort to zebrafish studies

Autoren: Anteneh Assefa Desalegn, Wietske van der Ent, Virissa Lenters, Nina Iszatt, Hein Stigum, Jan Ludvig Lyche, Vidar Berg, Karolina J. Kirstein-Smardzewska, Camila Vicencio Esguerra, Merete Eggesbø
Veröffentlicht in: Environment International, Ausgabe 181, 2023, Seite(n) 108271, ISSN 0160-4120
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.envint.2023.108271

The human lens is capable of trilineage differentiation towards osteo-, chondro-, and adipogenesis—a model for studying cataract pathogenesis

Autoren: Gerard Boix-Lemonche, Richard M. Nagymihaly, Xhevat Lumi, Goran Petrovski
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Ausgabe 11, 2023, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fbioe.2023.1164795

Krill oil supplementation in vivo promotes increased fuel metabolism and protein synthesis in cultured human skeletal muscle cells

Autoren: Parmeshwar B. Katare, Andrea Dalmao-Fernandez, Abel M. Mengeste, Farnaz Navabakbar, Håvard Hamarsland, Stian Ellefsen, Rolf K. Berge, Hege G. Bakke, Tuula Anneli Nyman, Eili Tranheim Kase, Arild C. Rustan, G. Hege Thoresen
Veröffentlicht in: Frontiers in Nutrition, Ausgabe 11, 2024, ISSN 2296-861X
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fnut.2024.1452768

Making sustainable healthcare decisions: three turns towards sustainable guidelines

Autoren: Sietse Wieringa, Hugh McGuire, Qi Wang, Philip van der Wees, Beth Shaw
Veröffentlicht in: BMJ Evidence-Based Medicine, Ausgabe 29, 2024, Seite(n) 219-222, ISSN 2515-446X
Herausgeber: BMJ
DOI: 10.1136/bmjebm-2023-112352

Estimates for the astrocyte endfoot sheath permeability of the extra-cellular pathway

Autoren: Timo Koch; Vegard Vinje; Kent-André Mardal
Veröffentlicht in: Fluids and Barriers of the CNS, 2023, ISSN 2045-8118
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12987-023-00421-8

Cross-trait genome-wide association analysis of C-reactive protein level and psychiatric disorders

Autoren: Guy Hindley, Ole Kristian Drange, Aihua Lin, Gleda Kutrolli, Alexey A. Shadrin, Nadine Parker, Kevin S. O’Connell, Linn Rødevand, Weiqiu Cheng, Shahram Bahrami, Naz Karadag, Børge Holen, Piotr Jaholkowski, Markos Tesfaye Woldeyohannes, Srdjan Djurovic, Anders M. Dale, Oleksandr Frei, Thor Ueland, Olav B. Smeland, Ole A. Andreassen
Veröffentlicht in: Psychoneuroendocrinology, Ausgabe 157, 2024, Seite(n) 106368, ISSN 0306-4530
Herausgeber: Pergamon Press
DOI: 10.1016/j.psyneuen.2023.106368

Estimates of the permeability of extra-cellular pathways through the astrocyte endfoot sheath

Autoren: Timo Koch, Vegard Vinje, Kent-André Mardal
Veröffentlicht in: Fluids and Barriers of the CNS, Ausgabe 20, 2023, ISSN 2045-8118
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12987-023-00421-8

Dynamic density functional theory for the charging of electric double layer capacitors

Autoren: Ma, Ke Janssen, Mathijs Adriaan Lian, Cheng Van Roij, René
Veröffentlicht in: Journal of Chemical Physics, 2022, ISSN 0021-9606
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0081827

Improved functional mapping of complex trait heritability with GSA-MiXeR implicates biologically specific gene sets

Autoren: Oleksandr Frei, Guy Hindley, Alexey A. Shadrin, Dennis van der Meer, Bayram C. Akdeniz, Espen Hagen, Weiqiu Cheng, Kevin S. O’Connell, Shahram Bahrami, Nadine Parker, Olav B. Smeland, Dominic Holland, null null, Christiaan de Leeuw, Danielle Posthuma, Ole A. Andreassen, Anders M. Dale
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 56, 2024, Seite(n) 1310-1318, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-024-01771-1

Nonlinear mixed-dimension model for embedded tubular networks with application to root water uptake

Autoren: Timo Koch, Hanchuan Wu, Martin Schneider
Veröffentlicht in: Journal of Computational Physics, Ausgabe 450, 2024, Seite(n) 110823, ISSN 0021-9991
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jcp.2021.110823

Protocells: Milestones and Recent Advances

Autoren: Irep Gözen; Elif Senem Köksal; Inga Põldsalu; Lin Xue; Karolina Spustova; Esteban Pedrueza‐Villalmanzo; Ruslan Ryskulov; Fanda Meng; Aldo Jesorka
Veröffentlicht in: Small, 2022, ISSN 1613-6829
Herausgeber: Wiley-VCH GmbH
DOI: 10.1002/smll.202106624

fieldcompare: A Python package for regression testing simulation results

Autoren: Dennis Gläser; Timo Koch; Sören Peters; Sven Marcus; Bernd Flemisch
Veröffentlicht in: Journal of Open Source Software, 2023, ISSN 2475-9066
Herausgeber: Journal of Open Source Software
DOI: 10.21105/joss.04905

Knockdown of sarcolipin (SLN) impairs substrate utilization in human skeletal muscle cells

Autoren: Abel M. Mengeste, Parmeshwar Katare, Andrea Dalmao Fernandez, Jenny Lund, Hege G. Bakke, David Baker, Stefano Bartesaghi, Xiao-Rong Peng, Arild C. Rustan, G. Hege Thoresen, Eili Tranheim Kase
Veröffentlicht in: Molecular Biology Reports, Ausgabe 49, 2023, Seite(n) 6005-6017, ISSN 0301-4851
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s11033-022-07387-0

NLRP3 inflammasome mediates astroglial dysregulation of innate and adaptive immune responses in schizophrenia

Autoren: Attila Szabo, Ibrahim Akkouh, Jordi Requena Osete, Denis Reis de Assis, Elena Kondratskaya, Timothy Hughes, Thor Ueland, Ole A. Andreassen, Srdjan Djurovic
Veröffentlicht in: Brain, Behavior, and Immunity, Ausgabe 124, 2025, Seite(n) 144-156, ISSN 0889-1591
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.bbi.2024.11.030

Development of three-dimensional primary human myospheres as culture model of skeletal muscle cells for metabolic studies

Autoren: Andrea Dalmao-Fernandez, Aleksandra Aizenshtadt, Hege G. Bakke, Stefan Krauss, Arild C. Rustan, G. Hege Thoresen, Eili Tranheim Kase
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Ausgabe 11, 2023, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fbioe.2023.1130693

SCN1A overexpression, associated with a genomic region marked by a risk variant for a common epilepsy, raises seizure susceptibility

Autoren: Katri Silvennoinen, Kinga Gawel, Despina Tsortouktzidis, Julika Pitsch, Saud Alhusaini, Karen M. J. van Loo, Richard Picardo, Zuzanna Michalak, Susanna Pagni, Helena Martins Custodio, James Mills, Christopher D. Whelan, Greig I. de Zubicaray, Katie L. McMahon, Wietske van der Ent, Karolina J. Kirstein-Smardzewska, Ettore Tiraboschi, Jonathan M. Mudge, Adam Frankish, Maria Thom, Margaret J. Wright,
Veröffentlicht in: Acta Neuropathologica, 2022, ISSN 0001-6322
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00401-022-02429-0

Linking sarcopenia, brain structure and cognitive performance: a large-scale UK Biobank study

Autoren: Tiril P Gurholt, Miguel Germán Borda, Nadine Parker, Vera Fominykh, Rikka Kjelkenes, Jennifer Linge, Dennis van der Meer, Ida E Sønderby, Gustavo Duque, Lars T Westlye, Dag Aarsland, Ole A Andreassen
Veröffentlicht in: Brain Communications, Ausgabe 6, 2024, ISSN 2632-1297
Herausgeber: Oxford Academic
DOI: 10.1093/braincomms/fcae083

Deletion of aquaporin‐4 improves capillary blood flow distribution in brain edema

Autoren: Luca Bordoni, Anna E. Thoren, Eugenio Gutiérrez‐Jiménez, Knut S. Åbjørsbråten, Daniel M. Bjørnstad, Wannan Tang, Mette Stern, Leif Østergaard, Erlend A. Nagelhus, Sebastian Frische, Ole P. Ottersen, Rune Enger
Veröffentlicht in: Glia, Ausgabe 71, 2023, Seite(n) 2559-2572, ISSN 0894-1491
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/glia.24439

Knockdown of sarcolipin (SLN) impairs substrate utilization in human skeletal muscle cells

Autoren: Abel M. Mengeste; Parmeshwar Katare; Andrea Dalmao Fernandez; Jenny Lund; Hege G. Bakke; David Baker; Stefano Bartesaghi; Xiao-Rong Peng; Arild C. Rustan; G. Hege Thoresen; Eili Tranheim Kase
Veröffentlicht in: Molecular Biology Reports, 2022, ISSN 0301-4851
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s11033-022-07387-0

Design and clinical application of injectable hydrogels for musculoskeletal therapy

Autoren: Øystein Øvrebø; Giuseppe Perale; Jonathan P. Wojciechowski; Cécile Echalier; Jonathan R. T. Jeffers; Molly M. Stevens; Håvard J. Haugen; Filippo Rossi
Veröffentlicht in: Bioengineering & Translational Medicine, 2022, ISSN 2380-6761
Herausgeber: American Institute of Chemical Engineers
DOI: 10.1002/btm2.10295

TrajPy: empowering feature engineering for trajectory analysis across domains

Autoren: Maurício Moreira-Soares, Eduardo Mossmann, Rui D M Travasso, José Rafael Bordin
Veröffentlicht in: Bioinformatics Advances, Ausgabe 4, 2024, ISSN 2635-0041
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioadv/vbae026

The Lysosomal Calcium Channel TRPML1 Maintains Mitochondrial Fitness in NK Cells through Interorganelle Cross-Talk

Autoren: Dennis Clement, Edina K. Szabo, Silje Zandstra Krokeide, Merete Thune Wiiger, Marianna Vincenti, Daniel Palacios, Young-Tae Chang, Christian Grimm, Sandip Patel, Harald Stenmark, Andreas Brech, Rakesh Kumar Majhi, Karl-Johan Malmberg
Veröffentlicht in: The Journal of Immunology, Ausgabe 211, 2025, Seite(n) 1348-1358, ISSN 0022-1767
Herausgeber: American Association of Immunologists
DOI: 10.4049/jimmunol.2300406

Exploring the gut DNA virome in fecal immunochemical test stool samples reveals associations with lifestyle in a large population-based study

Autoren: Paula Istvan, Einar Birkeland, Ekaterina Avershina, Ane S. Kværner, Vahid Bemanian, Barbara Pardini, Sonia Tarallo, Willem M. de Vos, Torbjørn Rognes, Paula Berstad, Trine B. Rounge
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-46033-0

The cholesterol transport protein GRAMD1C regulates autophagy initiation and mitochondrial bioenergetics

Autoren: Matthew Yoke Wui Ng, Chara Charsou, Ana Lapao, Sakshi Singh, Laura Trachsel-Moncho, Sebastian W. Schultz, Sigve Nakken, Michael J. Munson & Anne Simonsen
Veröffentlicht in: nature communications, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-3

fieldcompare: A Python package for regression testingsimulation results

Autoren: Dennis Gläser, Timo Koch, Sören Peters, Sven Marcus, Bernd Flemisch
Veröffentlicht in: Journal of Open Source Software, Ausgabe 8, 2023, Seite(n) 4905, ISSN 2475-9066
Herausgeber: Journal of Open Source Software
DOI: 10.21105/joss.04905

Projection-based resolved interface 1D-3D mixed-dimension method for embedded tubular network systems

Autoren: Timo Koch
Veröffentlicht in: Computers & Mathematics with Applications, 2022, ISSN 0898-1221
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.camwa.2022.01.021

PlasmidEC and gplas2: an optimized short-read approach to predict and reconstruct antibiotic resistance plasmids in Escherichia coli

Autoren: Julian A. Paganini, Jesse J. Kerkvliet, Lisa Vader, Nienke L. Plantinga, Rodrigo Meneses, Jukka Corander, Rob J. L. Willems, Sergio Arredondo-Alonso, Anita C. Schürch
Veröffentlicht in: Microbial Genomics, Ausgabe 10, 2024, ISSN 2057-5858
Herausgeber: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.001193

Design and clinical application of injectable hydrogels for musculoskeletal therapy

Autoren: Øystein Øvrebø, Giuseppe Perale, Jonathan P. Wojciechowski, Cécile Echalier, Jonathan R. T. Jeffers, Molly M. Stevens, Håvard J. Haugen, Filippo Rossi
Veröffentlicht in: Bioengineering & Translational Medicine, Ausgabe 7, 2023, ISSN 2380-6761
Herausgeber: American Institute of Chemical Engineers
DOI: 10.1002/btm2.10295

Estimating the Logarithm of Characteristic Function and Stability Parameter for Symmetric Stable Laws

Autoren: Jüri Lember, Annika Krutto
Veröffentlicht in: Methodology and Computing in Applied Probability, Ausgabe 24, 2022, Seite(n) 2149-2167, ISSN 1387-5841
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s11009-021-09908-z

Mitochondrial Role on Cellular Apoptosis, Autophagy, and Senescence during Osteoarthritis Pathogenesis

Autoren: Andrea Dalmao-Fernández, Tamara Hermida-Gómez, Uxia Nogueira-Recalde, Ignacio Rego-Pérez, Francisco J. Blanco-Garcia, Mercedes Fernández-Moreno
Veröffentlicht in: Cells, Ausgabe 13, 2025, Seite(n) 976, ISSN 2073-4409
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/cells13110976

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