Influenza Virus - Sugar Interactions, From Glycan Arrays To Better Vaccines

Información del proyecto

Sugar-Enable

Identificador del acuerdo de subvención: 802780

DOI

10.3030/802780

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 26 Noviembre 2018

Fecha de inicio 1 Diciembre 2018

Fecha de finalización 30 Noviembre 2023

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 441 681,00

Aportación de la UE

€ 1 441 681,00

Coordinado por

UNIVERSITEIT UTRECHT
Netherlands

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Publicaciones

Peer reviewed articles (19)

Glycan remodeled erythrocytes facilitate antigenic characterization of recent A/H3N2 influenza viruses

Autores: Frederik Broszeit, Rosanne J. van Beek, Luca Unione, Theo M. Bestebroer, Digantkumar Chapla, Jeong-Yeh Yang, Kelley W. Moremen, Sander Herfst, Ron A. M. Fouchier, Robert P. de Vries & Geert-Jan Boons
Publicado en: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-25713-1

N-Glycolylneuraminic Acid in Animal Models for Human Influenza A Virus

Autores: Cindy M. Spruit, Nikoloz Nemanichvili, Masatoshi Okamatsu, Hiromu Takematsu, Geert-Jan Boons, Robert P. de Vries
Publicado en: Viruses, Edición 13/5, 2021, Página(s) 815, ISSN 1999-4915
Editor: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v13050815

The Intestinal Microbiota Contributes To The Control Of Highly Pathogenic H5N9 Influenza Virus Replication In Ducks

Autores: Thomas Figueroa; Pierre Bessière; Amelia Coggon; Roosmarijn van der Woude; Maxence Delverdier; Monique H. Verheije; Robert P. de Vries; Romain Volmer
Publicado en: Journal of Virology, Edición 1, 2020, ISSN 1098-5514
Editor: ASM
DOI: 10.1101/778258

Contemporary human H3N2 influenza A viruses require a low threshold of suitable glycan receptors for efficient infection

Autores: Cindy M. Spruit; Igor R. Sweet; Theo Bestebroer; Pascal Lexmond; Boning Qiu; Mirjam J.A. Damen; Ron A. M. Fouchier; Joost Snijder; Sander Herfst; Geert-Jan Boons; Robert P. de Vries
Publicado en: Glycobiology, Edición 5, 2023, ISSN 1460-2423
Editor: Oxford
DOI: 10.1101/2022.11.16.516725

Three Amino Acid Changes in Avian Coronavirus Spike Protein Allow Binding to Kidney Tissue

Autores: Kim M. Bouwman, Lisa M. Parsons, Alinda J. Berends, Robert P. de Vries, John F. Cipollo, Monique H. Verheije
Publicado en: Journal of Virology, Edición 94/2, 2020, ISSN 0022-538X
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.01363-19

Functionality of the putative surface glycoproteins of the Wuhan spiny eel influenza virus

Autores: Arunkumar, Guha Asthagiri; Bhavsar, Disha; Li, Tiehai; Strohmeier, Shirin; Chromikova, Veronika; Amanat, Fatima; Bunyatov, Mehman; Wilson, Patrick C.; Ellebedy, Ali H.; Boons, Geert Jan; Simon, Viviana; de Vries, Robert P.; Krammer, Florian; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Sub Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery
Publicado en: Nature Communications, Edición 1, 2020, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2021.01.04.425274

Heparan sulfate proteoglycans as attachment factor for SARS-CoV-2

Autores: Liu, Lin; Chopra, Pradeep; Li, Xiuru; Bouwman, Kim M; Tompkins, S Mark; Wolfert, Margreet A; de Vries, Robert P; Boons, Geert-Jan; Chemical Biology and Drug Discovery; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Sub Chemical Biology and Drug Discovery
Publicado en: ACS Central Science, Edición 1, 2020, ISSN 2374-7943
Editor: ACS
DOI: 10.1101/2020.05.10.087288

Sialic acid-containing glycolipids mediate binding and viral entry of SARS-CoV-2

Autores: Linh Nguyen, Kelli A. McCord, Duong T. Bui, Kim M. Bouwman, Elena N. Kitova, Mohamed Elaish, Dhanraj Kumawat, Gour C. Daskhan, Ilhan Tomris, Ling Han, Pradeep Chopra, Tzu-Jing Yang, Steven D. Willows, Andrew L. Mason, Lara K. Mahal, Todd L. Lowary, Lori J. West, Shang-Te Danny Hsu, Tom Hobman, Stephen M. Tompkins, Geert-Jan Boons, Robert P. de Vries, Matthew S. Macauley & John S. Klassen
Publicado en: Nature Chemical Biology, 2022, ISSN 1552-4450
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-021-00924-1

SARS-CoV-2 Spike N-Terminal Domain Engages 9-<i>O</i>-Acetylated α2–8-Linked Sialic Acids

Autores: Ilhan Tomris; Luca Unione; Linh Nguyen; Pouya Zaree; Kim M. Bouwman; Lin Liu; Zeshi Li; Jelle A. Fok; María Ríos Carrasco; Roosmarijn van der Woude; Anne L. M. Kimpel; Mirte W. Linthorst; Sinan E. Kilavuzoglu; Enrico C. J. M. Verpalen; Tom G. Caniels; Rogier W. Sanders; Balthasar A. Heesters; Roland J. Pieters; Jesús Jiménez-Barbero; John S. Klassen; Geert-Jan Boons; Robert P. de Vries
Publicado en: ACS Chemical Biology, Edición 1, 2023, ISSN 1554-8937
Editor: ACS
DOI: 10.1021/acschembio.3c00066

Influenza Virus Hemagglutinins H2, H5, H6, and H11 Are Not Targets of Pulmonary Surfactant Protein D: N -Glycan Subtypes in Host-Pathogen Interactions

Autores: Lisa M. Parsons, Yanming An, Li Qi, Mitchell R. White, Roosmarijn van der Woude, Kevan L. Hartshorn, Jeffery K. Taubenberger, Robert P. de Vries, John F. Cipollo
Publicado en: Journal of Virology, Edición 94/5, 2020, ISSN 0022-538X
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.01951-19

N-Glycolylneuraminic Acid as a Receptor for Influenza A Viruses

Autores: Frederik Broszeit, Netanel Tzarum, Xueyong Zhu, Nikoloz Nemanichvili, Dirk Eggink, Tim Leenders, Zeshi Li, Lin Liu, Margreet A. Wolfert, Andreas Papanikolaou, Carles Martínez-Romero, Ivan A. Gagarinov, Wenli Yu, Adolfo García-Sastre, Tom Wennekes, Masatoshi Okamatsu, Monique H. Verheije, Ian A. Wilson, Geert-Jan Boons, Robert P. de Vries
Publicado en: Cell Reports, Edición 27/11, 2019, Página(s) 3284-3294.e6, ISSN 2211-1247
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.05.048

Wild and domestic animals variably display Neu5Ac and Neu5Gc sialic acids

Autores: Nemanichvili, Nikoloz; Spruit, Cindy M; Berends, Alinda J; Gröne, Andrea; Rijks, Jolianne M; Verheije, Monique H; de Vries, Robert P; dPB I&I; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Afd Pharmacology; dI&I I&I-1; VPDC pathologie; dPB CR
Publicado en: Glycobiology, Edición 1, 2021, ISSN 0959-6658
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/glycob/cwac033

Well-Defined Heparin Mimetics Can Inhibit Binding of the Trimeric Spike of SARS-CoV-2 in a Length-Dependent Manner

Autores: Lifeng Sun; Pradeep Chopra; Ilhan Tomris; Roosmarijn van der Woude; Lin Liu; Robert P. de Vries; Geert-Jan Boons
Publicado en: JACS au, Edición 1, 2023, ISSN 2691-3704
Editor: ACS
DOI: 10.1021/jacsau.3c00042

Characterization of human FDCs reveals regulation of T cells and antigen presentation to B cells.

Autores: Heesters, Balthasar A; van Megesen, Kyah; Tomris, Ilhan; de Vries, Robert P; Magri, Giuliana; Spits, Hergen; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery
Publicado en: The Journal of Experimental Medicine, Edición 1, 2022, ISSN 1540-9538
Editor: Rockefeller University Press
DOI: 10.1084/jem.20210790

Revealing the Specificity of Human H1 Influenza A Viruses to Complex N-Glycans

Autores: Canales, Angeles; Sastre, Javier; Orduña, Jose M.; Spruit, Cindy M.; Pérez-Castells, Javier; Domínguez, Gema; Bouwman, Kim M.; van der Woude, Roosmarijn; Cañada, Francisco Javier; Nycholat, Corwin M.; Paulson, James C.; Boons, Geert Jan; Jiménez-Barbero, Jesús; de Vries, Robert P.; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Sub Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Dis
Publicado en: JACS Au, Edición 1, 2022, ISSN 2691-3704
Editor: ACS
DOI: 10.1021/jacsau.2c00664

Drivers of recombinant soluble influenza A virus hemagglutinin and neuraminidase expression in mammalian cells

Autores: Roosmarijn Woude, Hannah L. Turner, Ilhan Tomris, Kim M. Bouwman, Andrew B. Ward, Robert P. Vries
Publicado en: Protein Science, Edición 29/9, 2020, Página(s) 1975-1982, ISSN 0961-8368
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1002/pro.3918

Hierarchical Multivalent Effects Control Influenza Host Specificity

Autores: Nico J. Overeem, P. H. Erik Hamming, Oliver C. Grant, Daniele Di Iorio, Malte Tieke, M. Candelaria Bertolino, Zeshi Li, Gaël Vos, Robert P. de Vries, Robert J. Woods, Nicholas B. Tito, Geert-Jan P. H. Boons, Erhard van der Vries, Jurriaan Huskens
Publicado en: ACS Central Science, Edición 6/12, 2020, Página(s) 2311-2318, ISSN 2374-7943
Editor: ACS
DOI: 10.1021/acscentsci.0c01175

Multimerization- and glycosylation-dependent receptor binding of SARS-CoV-2 spike proteins

Autores: Kim M. Bouwman, Ilhan Tomris, Hannah L. Turner, Roosmarijn van der Woude, Tatiana M. Shamorkina, Gerlof P. Bosman, Barry Rockx, Sander Herfst, Joost Snijder, Bart L. Haagmans, Andrew B. Ward, Geert-Jan Boons, Robert P. de Vries
Publicado en: PLOS Pathogens, Edición 17/2, 2021, Página(s) e1009282, ISSN 1553-7374
Editor: Plos Pathogens
DOI: 10.1371/journal.ppat.1009282

Distinct spatial arrangements of ACE2 and TMPRSS2 expression in Syrian hamster lung lobes dictates SARS-CoV-2 infection patterns

Autores: Tomris, Ilhan; Bouwman, Kim M; Adolfs, Youri; Noack, Danny; van der Woude, Roosmarijn; Kerster, Gius; Herfst, Sander; Sanders, Rogier W; van Gils, Marit J; Boons, Geert-Jan; Haagmans, Bart L; Pasterkamp, R Jeroen; Rockx, Barry; de Vries, Robert P; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; dPB I&I; Sub Chemical Biology and Drug Discovery
Publicado en: Plos Pathogens, Edición 1, 2021, ISSN 1553-7374
Editor: PLOS
DOI: 10.1371/journal.ppat.1010340

Non-peer reviewed articles (1)

Tissue Microarrays to Visualize Influenza D Attachment to Host Receptors in the Respiratory Tract of Farm Animals.

Autores: Nemanichvili, Nikoloz; Berends, Alinda J; Wubbolts, Richard W; Gröne, Andrea; Rijks, Jolianne M; de Vries, Robert P; Verheije, Monique H; VP pathologie; dI&I I&I-1; dPB I&I; Celbiologie; IOV CCB; dB&C I&I; dPB CR; VPDC pathologie; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Pharmacology; Chemical Biology and Drug Discovery
Publicado en: Viruses, Edición 1, 2021, ISSN 1999-4915
Editor: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v13040586