Influenza Virus - Sugar Interactions, From Glycan Arrays To Better Vaccines

Informations projet

Sugar-Enable

N° de convention de subvention: 802780

DOI

10.3030/802780

Projet clôturé

Date de signature de la CE 26 Novembre 2018

Date de début 1 Decembre 2018

Date de fin 30 Novembre 2023

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 441 681,00

Contribution de l’UE

€ 1 441 681,00

Coordonné par

UNIVERSITEIT UTRECHT
Netherlands

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Publications

Peer reviewed articles (19)

Glycan remodeled erythrocytes facilitate antigenic characterization of recent A/H3N2 influenza viruses

Auteurs: Frederik Broszeit, Rosanne J. van Beek, Luca Unione, Theo M. Bestebroer, Digantkumar Chapla, Jeong-Yeh Yang, Kelley W. Moremen, Sander Herfst, Ron A. M. Fouchier, Robert P. de Vries & Geert-Jan Boons
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-25713-1

N-Glycolylneuraminic Acid in Animal Models for Human Influenza A Virus

Auteurs: Cindy M. Spruit, Nikoloz Nemanichvili, Masatoshi Okamatsu, Hiromu Takematsu, Geert-Jan Boons, Robert P. de Vries
Publié dans: Viruses, Numéro 13/5, 2021, Page(s) 815, ISSN 1999-4915
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v13050815

The Intestinal Microbiota Contributes To The Control Of Highly Pathogenic H5N9 Influenza Virus Replication In Ducks

Auteurs: Thomas Figueroa; Pierre Bessière; Amelia Coggon; Roosmarijn van der Woude; Maxence Delverdier; Monique H. Verheije; Robert P. de Vries; Romain Volmer
Publié dans: Journal of Virology, Numéro 1, 2020, ISSN 1098-5514
Éditeur: ASM
DOI: 10.1101/778258

Contemporary human H3N2 influenza A viruses require a low threshold of suitable glycan receptors for efficient infection

Auteurs: Cindy M. Spruit; Igor R. Sweet; Theo Bestebroer; Pascal Lexmond; Boning Qiu; Mirjam J.A. Damen; Ron A. M. Fouchier; Joost Snijder; Sander Herfst; Geert-Jan Boons; Robert P. de Vries
Publié dans: Glycobiology, Numéro 5, 2023, ISSN 1460-2423
Éditeur: Oxford
DOI: 10.1101/2022.11.16.516725

Three Amino Acid Changes in Avian Coronavirus Spike Protein Allow Binding to Kidney Tissue

Auteurs: Kim M. Bouwman, Lisa M. Parsons, Alinda J. Berends, Robert P. de Vries, John F. Cipollo, Monique H. Verheije
Publié dans: Journal of Virology, Numéro 94/2, 2020, ISSN 0022-538X
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.01363-19

Functionality of the putative surface glycoproteins of the Wuhan spiny eel influenza virus

Auteurs: Arunkumar, Guha Asthagiri; Bhavsar, Disha; Li, Tiehai; Strohmeier, Shirin; Chromikova, Veronika; Amanat, Fatima; Bunyatov, Mehman; Wilson, Patrick C.; Ellebedy, Ali H.; Boons, Geert Jan; Simon, Viviana; de Vries, Robert P.; Krammer, Florian; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Sub Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery
Publié dans: Nature Communications, Numéro 1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2021.01.04.425274

Heparan sulfate proteoglycans as attachment factor for SARS-CoV-2

Auteurs: Liu, Lin; Chopra, Pradeep; Li, Xiuru; Bouwman, Kim M; Tompkins, S Mark; Wolfert, Margreet A; de Vries, Robert P; Boons, Geert-Jan; Chemical Biology and Drug Discovery; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Sub Chemical Biology and Drug Discovery
Publié dans: ACS Central Science, Numéro 1, 2020, ISSN 2374-7943
Éditeur: ACS
DOI: 10.1101/2020.05.10.087288

Sialic acid-containing glycolipids mediate binding and viral entry of SARS-CoV-2

Auteurs: Linh Nguyen, Kelli A. McCord, Duong T. Bui, Kim M. Bouwman, Elena N. Kitova, Mohamed Elaish, Dhanraj Kumawat, Gour C. Daskhan, Ilhan Tomris, Ling Han, Pradeep Chopra, Tzu-Jing Yang, Steven D. Willows, Andrew L. Mason, Lara K. Mahal, Todd L. Lowary, Lori J. West, Shang-Te Danny Hsu, Tom Hobman, Stephen M. Tompkins, Geert-Jan Boons, Robert P. de Vries, Matthew S. Macauley & John S. Klassen
Publié dans: Nature Chemical Biology, 2022, ISSN 1552-4450
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-021-00924-1

SARS-CoV-2 Spike N-Terminal Domain Engages 9-<i>O</i>-Acetylated α2–8-Linked Sialic Acids

Auteurs: Ilhan Tomris; Luca Unione; Linh Nguyen; Pouya Zaree; Kim M. Bouwman; Lin Liu; Zeshi Li; Jelle A. Fok; María Ríos Carrasco; Roosmarijn van der Woude; Anne L. M. Kimpel; Mirte W. Linthorst; Sinan E. Kilavuzoglu; Enrico C. J. M. Verpalen; Tom G. Caniels; Rogier W. Sanders; Balthasar A. Heesters; Roland J. Pieters; Jesús Jiménez-Barbero; John S. Klassen; Geert-Jan Boons; Robert P. de Vries
Publié dans: ACS Chemical Biology, Numéro 1, 2023, ISSN 1554-8937
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/acschembio.3c00066

Influenza Virus Hemagglutinins H2, H5, H6, and H11 Are Not Targets of Pulmonary Surfactant Protein D: N -Glycan Subtypes in Host-Pathogen Interactions

Auteurs: Lisa M. Parsons, Yanming An, Li Qi, Mitchell R. White, Roosmarijn van der Woude, Kevan L. Hartshorn, Jeffery K. Taubenberger, Robert P. de Vries, John F. Cipollo
Publié dans: Journal of Virology, Numéro 94/5, 2020, ISSN 0022-538X
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.01951-19

N-Glycolylneuraminic Acid as a Receptor for Influenza A Viruses

Auteurs: Frederik Broszeit, Netanel Tzarum, Xueyong Zhu, Nikoloz Nemanichvili, Dirk Eggink, Tim Leenders, Zeshi Li, Lin Liu, Margreet A. Wolfert, Andreas Papanikolaou, Carles Martínez-Romero, Ivan A. Gagarinov, Wenli Yu, Adolfo García-Sastre, Tom Wennekes, Masatoshi Okamatsu, Monique H. Verheije, Ian A. Wilson, Geert-Jan Boons, Robert P. de Vries
Publié dans: Cell Reports, Numéro 27/11, 2019, Page(s) 3284-3294.e6, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.05.048

Wild and domestic animals variably display Neu5Ac and Neu5Gc sialic acids

Auteurs: Nemanichvili, Nikoloz; Spruit, Cindy M; Berends, Alinda J; Gröne, Andrea; Rijks, Jolianne M; Verheije, Monique H; de Vries, Robert P; dPB I&I; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Afd Pharmacology; dI&I I&I-1; VPDC pathologie; dPB CR
Publié dans: Glycobiology, Numéro 1, 2021, ISSN 0959-6658
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/glycob/cwac033

Well-Defined Heparin Mimetics Can Inhibit Binding of the Trimeric Spike of SARS-CoV-2 in a Length-Dependent Manner

Auteurs: Lifeng Sun; Pradeep Chopra; Ilhan Tomris; Roosmarijn van der Woude; Lin Liu; Robert P. de Vries; Geert-Jan Boons
Publié dans: JACS au, Numéro 1, 2023, ISSN 2691-3704
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/jacsau.3c00042

Characterization of human FDCs reveals regulation of T cells and antigen presentation to B cells.

Auteurs: Heesters, Balthasar A; van Megesen, Kyah; Tomris, Ilhan; de Vries, Robert P; Magri, Giuliana; Spits, Hergen; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Discovery
Publié dans: The Journal of Experimental Medicine, Numéro 1, 2022, ISSN 1540-9538
Éditeur: Rockefeller University Press
DOI: 10.1084/jem.20210790

Revealing the Specificity of Human H1 Influenza A Viruses to Complex N-Glycans

Auteurs: Canales, Angeles; Sastre, Javier; Orduña, Jose M.; Spruit, Cindy M.; Pérez-Castells, Javier; Domínguez, Gema; Bouwman, Kim M.; van der Woude, Roosmarijn; Cañada, Francisco Javier; Nycholat, Corwin M.; Paulson, James C.; Boons, Geert Jan; Jiménez-Barbero, Jesús; de Vries, Robert P.; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Sub Chemical Biology and Drug Discovery; Chemical Biology and Drug Dis
Publié dans: JACS Au, Numéro 1, 2022, ISSN 2691-3704
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/jacsau.2c00664

Drivers of recombinant soluble influenza A virus hemagglutinin and neuraminidase expression in mammalian cells

Auteurs: Roosmarijn Woude, Hannah L. Turner, Ilhan Tomris, Kim M. Bouwman, Andrew B. Ward, Robert P. Vries
Publié dans: Protein Science, Numéro 29/9, 2020, Page(s) 1975-1982, ISSN 0961-8368
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1002/pro.3918

Hierarchical Multivalent Effects Control Influenza Host Specificity

Auteurs: Nico J. Overeem, P. H. Erik Hamming, Oliver C. Grant, Daniele Di Iorio, Malte Tieke, M. Candelaria Bertolino, Zeshi Li, Gaël Vos, Robert P. de Vries, Robert J. Woods, Nicholas B. Tito, Geert-Jan P. H. Boons, Erhard van der Vries, Jurriaan Huskens
Publié dans: ACS Central Science, Numéro 6/12, 2020, Page(s) 2311-2318, ISSN 2374-7943
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/acscentsci.0c01175

Multimerization- and glycosylation-dependent receptor binding of SARS-CoV-2 spike proteins

Auteurs: Kim M. Bouwman, Ilhan Tomris, Hannah L. Turner, Roosmarijn van der Woude, Tatiana M. Shamorkina, Gerlof P. Bosman, Barry Rockx, Sander Herfst, Joost Snijder, Bart L. Haagmans, Andrew B. Ward, Geert-Jan Boons, Robert P. de Vries
Publié dans: PLOS Pathogens, Numéro 17/2, 2021, Page(s) e1009282, ISSN 1553-7374
Éditeur: Plos Pathogens
DOI: 10.1371/journal.ppat.1009282

Distinct spatial arrangements of ACE2 and TMPRSS2 expression in Syrian hamster lung lobes dictates SARS-CoV-2 infection patterns

Auteurs: Tomris, Ilhan; Bouwman, Kim M; Adolfs, Youri; Noack, Danny; van der Woude, Roosmarijn; Kerster, Gius; Herfst, Sander; Sanders, Rogier W; van Gils, Marit J; Boons, Geert-Jan; Haagmans, Bart L; Pasterkamp, R Jeroen; Rockx, Barry; de Vries, Robert P; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; dPB I&I; Sub Chemical Biology and Drug Discovery
Publié dans: Plos Pathogens, Numéro 1, 2021, ISSN 1553-7374
Éditeur: PLOS
DOI: 10.1371/journal.ppat.1010340

Non-peer reviewed articles (1)

Tissue Microarrays to Visualize Influenza D Attachment to Host Receptors in the Respiratory Tract of Farm Animals.

Auteurs: Nemanichvili, Nikoloz; Berends, Alinda J; Wubbolts, Richard W; Gröne, Andrea; Rijks, Jolianne M; de Vries, Robert P; Verheije, Monique H; VP pathologie; dI&I I&I-1; dPB I&I; Celbiologie; IOV CCB; dB&C I&I; dPB CR; VPDC pathologie; Afd Chemical Biology and Drug Discovery; Pharmacology; Chemical Biology and Drug Discovery
Publié dans: Viruses, Numéro 1, 2021, ISSN 1999-4915
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v13040586