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From Evolution to Clockworks: Unravelling the molecular basis of circalunar clocks

Description du projet

Les mécanismes moléculaires des horloges lunaires

Les organismes vivants possèdent des horloges biologiques qui leur permettent d’ajuster leur comportement et leurs fonctions corporelles aux constantes variations de l’environnement. L’horloge circadienne de 24 heures est bien comprise au niveau moléculaire. Cependant, les mécanismes des horloges de marée, des horloges lunaires et des horloges annuelles sont encore largement méconnus. Le projet EVOCLOCK, financé par l’UE, a pour objectif d’identifier les mécanismes de l’horloge lunaire chez l’insecte marin Clunio marinus (C. marinus), qui synchronise sa reproduction avec les marées les plus basses aux alentours de la nouvelle et de la pleine lune. L’utilisation de souches de C. marinus jouissant de différentes horloges lunaires peut contribuer à identifier les molécules régulatrices associées. Les objectifs du projet incluent notamment la conception d’outils permettant de manipuler C. marinus au niveau moléculaire et la caractérisation du répertoire de gènes, du système nerveux et des récepteurs liés aux marées et aux phases lunaires.

Objectif

Circalunar clocks are endogenous biological clocks, which allow organisms to time development and reproduction to lunar phase. They are common in marine organisms, but their molecular basis is still entirely unknown. Candidate gene approaches have failed so far. In the marine midge Clunio marinus (Diptera: Chironomidae), I can elegantly overcome this problem by exploiting an array of local genetic adaptations in circalunar timing. Through evolutionary analysis, QTL mapping and genome screens my group currently produces evidence-based circalunar candidate genes without any need for prior knowledge or assumptions.

In this ERC proposal, I aim to take this work to the next level and identify the molecular and cellular basis of circalunar clocks. I will establish molecular tools for Clunio and use them to confirm and characterize circalunar clock candidate genes. Specifically, I aim to: (WP1) Establish genome editing and confirm candidate genes via knockout and allelic replacement. (WP2) Study gene expression modules across the lunar cycle and identify the transcriptional regulators that exert circalunar control on development and maturation. (WP3) Describe Clunio’s larval nervous system and trace circalunar clock sensory input pathways to their convergence point. This will identify the cellular substrate of the circalunar clock. (WP4) Settle the on-going debate on the role of circadian clocks in circalunar timing. I will particularly study the role of the famous period gene.

In the future, this molecular endeavour will also boost evolutionary work: Clunio will provide insights into fundamental questions, such as the role of genome architecture in local adaptation. But immediately, unravelling the molecular basis of circalunar clocks will be a breakthrough in chronobiology. It will inspire new ideas and experiments. Comparing circalunar to circadian clocks, we will for the first time be able to see basic principles in the molecular design of biological clocks.

Régime de financement

ERC-STG - Starting Grant

Institution d’accueil

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Contribution nette de l'UE
€ 1 499 728,00
Coût total
€ 1 499 728,00

Bénéficiaires (1)