Plant Mobile RNAs: Function, Transport and Features

Informations projet

PLAMORF

N° de convention de subvention: 810131

DOI

10.3030/810131

Projet clôturé

Date de signature de la CE 14 Janvier 2019

Date de début 1 Avril 2019

Date de fin 30 Septembre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 6 134 102,00

Contribution de l’UE

€ 6 134 102,00

Coordonné par

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

ORDP

Publications

Peer reviewed articles (19)

The glycine-rich domain of GRP7 plays a crucial role in binding long RNAs and facilitating phase separation

Auteurs: Kim Lara Lühmann, Silja Seemann, Nina Martinek, Steffen Ostendorp, Julia Kehr
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 14, 2024, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-66955-5

Methylated RNA Immunoprecipitation Assay to Study m⁵C Modification in Arabidopsis

Auteurs: Eleftheria Saplaoura, Valentina Perrera, Friedrich Kragler
Publié dans: Journal of Visualized Experiments, Numéro 159, 2020, ISSN 1940-087X
Éditeur: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/61231

Re-analysis of mobile mRNA datasets raises questions about the extent of long-distance mRNA communication

Auteurs: Pirita Paajanen, Melissa Tomkins, Franziska Hoerbst, Ruth Veevers, Michelle Heeney, Hannah Rae Thomas, Federico Apelt, Eleftheria Saplaoura, Saurabh Gupta, Margaret Frank, Dirk Walther, Christine Faulkner, Julia Kehr, Friedrich Kragler, Richard J. Morris
Publié dans: Nature Plants, Numéro 11, 2025, Page(s) 977-984, ISSN 2055-0278
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41477-025-01979-x

Controlled liquid-liquid phase separation via the simulation-guided, targeted engineering of the RNA-binding protein PARCL

Auteurs: Ruth Veevers, Steffen Ostendorp, Anna Ostendorp, Julia Kehr, Richard J. Morris
Publié dans: iScience, Numéro 28, 2025, Page(s) 112852, ISSN 2589-0042
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.isci.2025.112852

Heritable transgene-free genome editing in plants by grafting of wild-type shoots to transgenic donor rootstocks

Auteurs: Lei Yang, Frank Machin, Shuangfeng Wang, Eleftheria Saplaoura, Friedrich Kragler
Publié dans: Nature Biotechnology, Numéro 12, 2023, ISSN 1087-0156
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-022-01585-8

Studies on the Japanese soil-borne wheat mosaic virus movement protein highlight its ability to bind plant RNA

Auteurs: Claudia Janina Strauch, Nico Sprotte, Estefania Peña Lozano, Emmanuel Boutant, Khalid Amari, Steffen Ostendorp, Anna Ostendorp, Julia Kehr, Annette Niehl
Publié dans: Virology Journal, Numéro 22, 2025, ISSN 1743-422X
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12985-025-02757-z

Arabidopsis callus grafts: a system to study symplasmic intercellular macromolecular transport and gene silencing spread

Auteurs: Yağmur Hasbioğlu; Stephanie Weber; Friedrich Kragler; Frank Qasim Machin
Publié dans: The Plant Journal, 2023, ISSN 1365-313X
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1111/tpj.16326

m5C Methylation Guides Systemic Transport of Messenger RNA over Graft Junctions in Plants

Auteurs: Lei Yang, Valentina Perrera, Eleftheria Saplaoura, Federico Apelt, Mathieu Bahin, Amira Kramdi, Justyna Olas, Bernd Mueller-Roeber, Ewelina Sokolowska, Wenna Zhang, Runsheng Li, Nicolas Pitzalis, Manfred Heinlein, Shoudong Zhang, Auguste Genovesio, Vincent Colot, Friedrich Kragler
Publié dans: Current Biology, Numéro 29/15, 2019, Page(s) 2465-2476.e5, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2019.06.042

Validation of a novel associative transcriptomics pipeline in Brassica oleracea: Identifying candidates for vernalisation response

Auteurs: Shannon Woodhouse; Zhesi He; Hugh C. Woolfenden; Burkhard Steuernagel; Wilfried Haerty; Ian Bancroft; Judith A. Irwin; Richard J. Morris; Rachel Wells
Publié dans: BMC Genomics, Numéro 3, 2021, ISSN 1471-2164
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12864-021-07805-w

PyEscape: A narrow escape problem simulator package for Python

Auteurs: Nathan Hughes, Richard Morris, Melissa Tomkins
Publié dans: Journal of Open Source Software, Numéro 5/47, 2020, Page(s) 2072, ISSN 2475-9066
Éditeur: JOSS
DOI: 10.21105/joss.02072

The Impact of Metabolic Scion-Rootstock Interactions in Different Grapevine Tissues and Phloem Exudates.

Auteurs: Sara Tedesco; Alexander Erban; Saurabh Gupta; Joachim Kopka; Pedro Fevereiro; Friedrich Kragler; Ana Pina
Publié dans: Metabolites, Numéro 18, 2022, ISSN 2218-1989
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/metabo11060349

Primary carbohydrate metabolism genes participate in heat-stress memory at the shoot apical meristem of Arabidopsis thaliana

Auteurs: Justyna Jadwiga-Olas, Federico Apelt, Maria Grazia Annunziata, Sheeba John, Sarah Isabel Richard, Saurabh Gupta, Friedrich Kragler, Salma Balazadeh, Bernd Mueller-Roeber
Publié dans: Molecular Plants, Numéro 14/9, 2021, ISSN 1674-2052
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1016/j.molp.2021.05.024

Rapid on-site detection of crop RNA viruses using CRISPR/Cas13a

Auteurs: Hagit Hak, Steffen Ostendorp, Anton Reza, Shany Ishgur Greenberg, Gur Pines, Julia Kehr, Ziv Spiegelman
Publié dans: Journal of Experimental Botany, Numéro 76, 2025, Page(s) 6335-6346, ISSN 0022-0957
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/erae495

Non-cell-autonomous HSC70.1 chaperone displays homeostatic feed-back regulation by binding its own mRNA.

Auteurs: Lei Yang; Yuan Zhou; Shuangfeng Wang; Ying Xu; Steffen Ostendorp; Melissa Tomkins; Julia Kehr; Richard J. Morris; Friedrich Kragler
Publié dans: New Phytologist, Numéro 15, 2022, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.18703

The biology of grafting and its applications in studying information exchange between plants

Auteurs: Friedrich Kragler, Ralph Bock
Publié dans: Nature Plants, Numéro 11, 2025, Page(s) 955-966, ISSN 2055-0278
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41477-025-01982-2

Shoot and root single cell sequencing reveals tissue- and daytime-specific transcriptome profiles

Auteurs: Federico Apelt, Eleni Mavrothalassiti, Saurabh Gupta, Frank Machin, Justyna Jadwiga Olas, Maria Grazia Annunziata, Dana Schindelasch,Friedrich Kragler
Publié dans: Plant Physiology, Numéro 188/2, 2022, Page(s) 861–878, ISSN 0032-0889
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plphys/kiab537

Structural and functional analysis of a plant nucleolar RNA chaperone-like protein

Auteurs: Rita Fernandes; Anna Ostendorp; Steffen Ostendorp; Judith Mehrmann; Sven Falke; Melissa Ann Graewert; Magdalena Weingartner; Julia Kehr; Stefan Hoth
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 13, 2023, Page(s) 9656-, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-36426-4

Intrinsically disordered plant protein PARCL colocalizes with RNA in phase-separated condensates whose formation can be regulated by mutating the PLD

Auteurs: Anna Ostendorp; Steffen Ostendorp; Yuan Zhou; Zoé Chaudron; Lukas Wolffram; Khadija Rombi; Linn von Pein; Sven Falke; Cy M. Jeffries; Dmitri I. Svergun; Christian Betzel; Richard J. Morris; Friedrich Kragler; Julia Kehr
Publié dans: The journal of biological chemistry, Numéro 298, 2022, Page(s) 102631, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.3204/pubdb-2022-06899

Long-Distance Transported RNAs: From Identity to Function

Auteurs: Julia Kehr Richard J. Morris Friedrich Kragler
Publié dans: Annual Reviews of Plant Biology, Numéro 73, 2022, Page(s) 457-474, ISSN 1543-5008
Éditeur: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-arplant-070121-033601

Book chapters (1)

An Arabidopsis Callus Grafting Method to Test Cell-to-Cell Mobility of Proteins

Auteurs: Frank Machin, Yağmur Hasbioğlu, Friedrich Kragler
Publié dans: Plasmodesmata. Methods in Molecular Biology, Numéro 2022, 2022, ISBN 978-1-0716-2131-8
Éditeur: Humana
DOI: 10.1007/978-1-0716-2132-5_20