Plant Mobile RNAs: Function, Transport and Features

Projektinformationen

PLAMORF

ID Finanzhilfevereinbarung: 810131

DOI

10.3030/810131

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 14 Januar 2019

Startdatum 1 April 2019

Enddatum 30 September 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 6 134 102,00

EU-Beitrag

€ 6 134 102,00

Koordiniert durch

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

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Leistungen

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

ORDP

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (19)

The glycine-rich domain of GRP7 plays a crucial role in binding long RNAs and facilitating phase separation

Autoren: Kim Lara Lühmann, Silja Seemann, Nina Martinek, Steffen Ostendorp, Julia Kehr
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 14, 2024, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-66955-5

Methylated RNA Immunoprecipitation Assay to Study m⁵C Modification in Arabidopsis

Autoren: Eleftheria Saplaoura, Valentina Perrera, Friedrich Kragler
Veröffentlicht in: Journal of Visualized Experiments, Ausgabe 159, 2020, ISSN 1940-087X
Herausgeber: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/61231

Re-analysis of mobile mRNA datasets raises questions about the extent of long-distance mRNA communication

Autoren: Pirita Paajanen, Melissa Tomkins, Franziska Hoerbst, Ruth Veevers, Michelle Heeney, Hannah Rae Thomas, Federico Apelt, Eleftheria Saplaoura, Saurabh Gupta, Margaret Frank, Dirk Walther, Christine Faulkner, Julia Kehr, Friedrich Kragler, Richard J. Morris
Veröffentlicht in: Nature Plants, Ausgabe 11, 2025, Seite(n) 977-984, ISSN 2055-0278
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41477-025-01979-x

Controlled liquid-liquid phase separation via the simulation-guided, targeted engineering of the RNA-binding protein PARCL

Autoren: Ruth Veevers, Steffen Ostendorp, Anna Ostendorp, Julia Kehr, Richard J. Morris
Veröffentlicht in: iScience, Ausgabe 28, 2025, Seite(n) 112852, ISSN 2589-0042
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.isci.2025.112852

Heritable transgene-free genome editing in plants by grafting of wild-type shoots to transgenic donor rootstocks

Autoren: Lei Yang, Frank Machin, Shuangfeng Wang, Eleftheria Saplaoura, Friedrich Kragler
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, Ausgabe 12, 2023, ISSN 1087-0156
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-022-01585-8

Studies on the Japanese soil-borne wheat mosaic virus movement protein highlight its ability to bind plant RNA

Autoren: Claudia Janina Strauch, Nico Sprotte, Estefania Peña Lozano, Emmanuel Boutant, Khalid Amari, Steffen Ostendorp, Anna Ostendorp, Julia Kehr, Annette Niehl
Veröffentlicht in: Virology Journal, Ausgabe 22, 2025, ISSN 1743-422X
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12985-025-02757-z

Arabidopsis callus grafts: a system to study symplasmic intercellular macromolecular transport and gene silencing spread

Autoren: Yağmur Hasbioğlu; Stephanie Weber; Friedrich Kragler; Frank Qasim Machin
Veröffentlicht in: The Plant Journal, 2023, ISSN 1365-313X
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1111/tpj.16326

m5C Methylation Guides Systemic Transport of Messenger RNA over Graft Junctions in Plants

Autoren: Lei Yang, Valentina Perrera, Eleftheria Saplaoura, Federico Apelt, Mathieu Bahin, Amira Kramdi, Justyna Olas, Bernd Mueller-Roeber, Ewelina Sokolowska, Wenna Zhang, Runsheng Li, Nicolas Pitzalis, Manfred Heinlein, Shoudong Zhang, Auguste Genovesio, Vincent Colot, Friedrich Kragler
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 29/15, 2019, Seite(n) 2465-2476.e5, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2019.06.042

Validation of a novel associative transcriptomics pipeline in Brassica oleracea: Identifying candidates for vernalisation response

Autoren: Shannon Woodhouse; Zhesi He; Hugh C. Woolfenden; Burkhard Steuernagel; Wilfried Haerty; Ian Bancroft; Judith A. Irwin; Richard J. Morris; Rachel Wells
Veröffentlicht in: BMC Genomics, Ausgabe 3, 2021, ISSN 1471-2164
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12864-021-07805-w

PyEscape: A narrow escape problem simulator package for Python

Autoren: Nathan Hughes, Richard Morris, Melissa Tomkins
Veröffentlicht in: Journal of Open Source Software, Ausgabe 5/47, 2020, Seite(n) 2072, ISSN 2475-9066
Herausgeber: JOSS
DOI: 10.21105/joss.02072

The Impact of Metabolic Scion-Rootstock Interactions in Different Grapevine Tissues and Phloem Exudates.

Autoren: Sara Tedesco; Alexander Erban; Saurabh Gupta; Joachim Kopka; Pedro Fevereiro; Friedrich Kragler; Ana Pina
Veröffentlicht in: Metabolites, Ausgabe 18, 2022, ISSN 2218-1989
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/metabo11060349

Primary carbohydrate metabolism genes participate in heat-stress memory at the shoot apical meristem of Arabidopsis thaliana

Autoren: Justyna Jadwiga-Olas, Federico Apelt, Maria Grazia Annunziata, Sheeba John, Sarah Isabel Richard, Saurabh Gupta, Friedrich Kragler, Salma Balazadeh, Bernd Mueller-Roeber
Veröffentlicht in: Molecular Plants, Ausgabe 14/9, 2021, ISSN 1674-2052
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1016/j.molp.2021.05.024

Rapid on-site detection of crop RNA viruses using CRISPR/Cas13a

Autoren: Hagit Hak, Steffen Ostendorp, Anton Reza, Shany Ishgur Greenberg, Gur Pines, Julia Kehr, Ziv Spiegelman
Veröffentlicht in: Journal of Experimental Botany, Ausgabe 76, 2025, Seite(n) 6335-6346, ISSN 0022-0957
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/erae495

Non-cell-autonomous HSC70.1 chaperone displays homeostatic feed-back regulation by binding its own mRNA.

Autoren: Lei Yang; Yuan Zhou; Shuangfeng Wang; Ying Xu; Steffen Ostendorp; Melissa Tomkins; Julia Kehr; Richard J. Morris; Friedrich Kragler
Veröffentlicht in: New Phytologist, Ausgabe 15, 2022, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.18703

The biology of grafting and its applications in studying information exchange between plants

Autoren: Friedrich Kragler, Ralph Bock
Veröffentlicht in: Nature Plants, Ausgabe 11, 2025, Seite(n) 955-966, ISSN 2055-0278
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41477-025-01982-2

Shoot and root single cell sequencing reveals tissue- and daytime-specific transcriptome profiles

Autoren: Federico Apelt, Eleni Mavrothalassiti, Saurabh Gupta, Frank Machin, Justyna Jadwiga Olas, Maria Grazia Annunziata, Dana Schindelasch,Friedrich Kragler
Veröffentlicht in: Plant Physiology, Ausgabe 188/2, 2022, Seite(n) 861–878, ISSN 0032-0889
Herausgeber: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plphys/kiab537

Structural and functional analysis of a plant nucleolar RNA chaperone-like protein

Autoren: Rita Fernandes; Anna Ostendorp; Steffen Ostendorp; Judith Mehrmann; Sven Falke; Melissa Ann Graewert; Magdalena Weingartner; Julia Kehr; Stefan Hoth
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 13, 2023, Seite(n) 9656-, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-36426-4

Intrinsically disordered plant protein PARCL colocalizes with RNA in phase-separated condensates whose formation can be regulated by mutating the PLD

Autoren: Anna Ostendorp; Steffen Ostendorp; Yuan Zhou; Zoé Chaudron; Lukas Wolffram; Khadija Rombi; Linn von Pein; Sven Falke; Cy M. Jeffries; Dmitri I. Svergun; Christian Betzel; Richard J. Morris; Friedrich Kragler; Julia Kehr
Veröffentlicht in: The journal of biological chemistry, Ausgabe 298, 2022, Seite(n) 102631, ISSN 0021-9258
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.3204/pubdb-2022-06899

Long-Distance Transported RNAs: From Identity to Function

Autoren: Julia Kehr Richard J. Morris Friedrich Kragler
Veröffentlicht in: Annual Reviews of Plant Biology, Ausgabe 73, 2022, Seite(n) 457-474, ISSN 1543-5008
Herausgeber: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-arplant-070121-033601

Book chapters (1)

An Arabidopsis Callus Grafting Method to Test Cell-to-Cell Mobility of Proteins

Autoren: Frank Machin, Yağmur Hasbioğlu, Friedrich Kragler
Veröffentlicht in: Plasmodesmata. Methods in Molecular Biology, Ausgabe 2022, 2022, ISBN 978-1-0716-2131-8
Herausgeber: Humana
DOI: 10.1007/978-1-0716-2132-5_20