Description du projet
Une sélection efficace des poissons destinés à la reproduction
Pour être durable, le secteur de l’aquaculture doit inclure la domestication et la reproduction sélective des principales espèces de poissons commerciales. Cependant, les programmes d’amélioration existants s’appuient exclusivement sur des marqueurs génétiques, sans tenir compte du fait que les conditions environnementales affectent la sélection. Ils négligent également le fait que l’épigénétique est probablement responsable d’une grande partie de la variation phénotypique observée. EPIMARK a récemment identifié un groupe de 5mC, 5hmC et miARN qui sont des marqueurs épigénétiques potentiels (épimarqueurs) d’une meilleure croissance chez le tilapia du Nil. Le projet EPIMARK, financé par l’UE, évaluera la faisabilité commerciale d’un kit innovant d’épimarqueurs de croissance avant de l’appliquer à des programmes de reproduction sélective permettant une sélection plus efficace des poissons dans les systèmes de reproduction.
Objectif
Domestication and selective breeding of the major commercial fish species are essential to enable sustainability of the rapidly expanding aquaculture sector. The existing improvement programmes are based exclusively on genetic markers, overlooking the fact that selection for complex traits is strongly affected by environmental conditions and that epigenetics likely account for a large proportion of the observed phenotypic variation. Non-coding RNAs (e.g. miRNAs) and cytosine methylation (5mC) and hydroxymethylation (5hmC) of DNA are key mechanisms underlying epigenetic regulation of gene expression. We have recently identified a panel of 5mCs, 5hmCs and miRNAs that are potential epigenetic markers (epimarkers) of improved growth in Nile tilapia (Oreochromis niloticus). EPIMARK will evaluate the commercial feasibility of our novel kit of growth epimarkers, so that they can be applied in selective breeding programmes. This will be achieved by (i) validating the miRNA, 5mC and 5hmC epimarkers, (ii) developing an assay for their quantification, (iii) investigating the commercial and financial feasibility and (iv) developing the optimal business strategy, consolidated in a business plan. The EPIMARK kit will lead to a more efficient selection of fish in breeding programs based on growth potential, thereby increasing the profitability and sustainability of the aquaculture industry. The technology developed in EPIMARK will also open important avenues of innovation, including the use of epimarkers for selection of other superior production traits and disease resistance in Nile tilapia and in other species of commercial importance.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Norvège