Protometabolic pathways: exploring the chemical roots of systems biology

Informations projet

ProtoMet

N° de convention de subvention: 813873

DOI 10.3030/813873

Projet clôturé

Date de signature de la CE 6 Août 2018

Date de début 1 Novembre 2018

Date de fin 31 Octobre 2023

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total € 2 174 048,28

Contribution de l’UE € 2 174 048,28

Coordonné par

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI TRENTO
Italy

Livrables

Documents, reports (2)

Dissemination Plan

D5.2 Dissemination plan (M6).

Final dissemination report

D5.5 Final Dissemination report (M60).

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

ProtoMet Website launch

D5.1 ProtoMet Website (M3).

Other (2)

Symposium

D.4.6 ProtoMet Symposium (M42).

ProtoMet Summer School

D.4.5 ProtoMet Summer School (M18) (M30).

Publications

Peer reviewed articles (16)

A Nonenzymatic Analog of Pyrimidine Nucleobase Biosynthesis

Auteurs: Jing Yi; Harpreet Kaur; Wahnyalo Kazöne; Sophia A. Rauscher; Louis‐Albin Gravillier; Kamila B. Muchowska; Joseph Moran
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 15, 2022, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/ange.202117211

Definitions of life as epistemic tools that reflect and foster the advance of biological knowledge

Auteurs: Alba Amilburu; Alvaro Moreno; Kepa Ruiz-Mirazo
Publié dans: Synthese, Numéro 4, 2020, ISSN 1573-0964
Éditeur: Springer
DOI: 10.1007/s11229-020-02736-7

Stability characterization of microfluidics lipid-stabilized double emulsions under physiologically-relevant conditions

Auteurs: Camila Betterelli Giuliano; Joseph Moran; Jessica Ayache; Lisa Muiznieks
Publié dans: Open Research Europe, Numéro 11, 2022, ISSN 2732-5121
Éditeur: European Commission
DOI: 10.12688/openreseurope.14766.1

Mechanistic Insight into Metal Ion-Catalyzed Transamination.

Auteurs: Robert J. Mayer; Harpreet Kaur; Sophia A. Rauscher; Joseph Moran
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 17, 2021, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c08535

The Construction of Biological ‘Inter-Identity’ as the Outcome of a Complex Process of Protocell Development in Prebiotic Evolution

Auteurs: Kepa Ruiz-Mirazo, Ben Shirt-Ediss, Miguel Escribano-Cabeza, Alvaro Moreno
Publié dans: Frontiers in Physiology, Numéro 11, 2020, ISSN 1664-042X
Éditeur: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fphys.2020.00530

Methods to identify and characterize iron-sulfur oligopeptides in water

Auteurs: Valer L, Rossetto D, Scintilla S, Tomar A, Nader S, Hu YJ, Betinol IO, Mansy SS
Publié dans: Canadian Journal of Chemistry, 2022, ISSN 2090-9071
Éditeur: Canadian Science Publishing
DOI: 10.1139/cjc-2021-0237

Wasserstoff ermöglicht Teile des reduktiven Krebs‐Zyklus unter Katalyse von Metallen oder Meteoriten

Auteurs: Sophia A. Rauscher; Joseph Moran
Publié dans: Angewandte Chemie, Numéro 9, 2022, ISSN 0044-8249
Éditeur: Wiley ONline
DOI: 10.1002/ange.202212932

"""Minimal metabolism"": A key concept to investigate the origins and nature of biological systems."

Auteurs: Nino Lauber; Christoph Flamm; Kepa Ruiz-Mirazo
Publié dans: Bio Essays, Numéro 11, 2021, ISSN 1475-4762
Éditeur: Wiley online
DOI: 10.1002/bies.202100103

Hydrogen Drives Part of the Reverse Krebs Cycle under Metal or Meteorite Catalysis

Auteurs: Sophia A. Rauscher; Joseph Moran
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 15, 2022, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202212932

Ferric heme b in aqueous micellar and vesicular systems: State-of-the-art and challenges

Auteurs: Cvjetan, Nemanja; Walde, Peter Johann
Publié dans: Royal Society Chemistry Advances, 12, 13154-13167, Numéro 8, 2022, ISSN 2046-2069
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.3929/ethz-b-000601176

Statistical mechanics of biomolecular condensates via cavity methods

Auteurs: Nino Lauber, Ondrej Tichacek, Rudrarup Bose,Christoph Flamm,Luca Leuzzi,Dora Tang, Kepa Ruiz-Mirazo,and Daniele De Martino
Publié dans: IScience, 2023, ISSN 2589-0042
Éditeur: Science Direct
DOI: 10.1016/j.isci.2023.106300

Multivesicular Vesicles.− Preparations and Applications.

Auteurs: Peter Walde, Camila Beterelli Giuliano, Nemanja Cvjetan, Jessica Ayache
Publié dans: ChemSystemsChem, 2020, ISSN 2570-4206
Éditeur: Chemistry Europe
DOI: 10.1002/syst.202000049

"Boundary versus enabling conditions for the origins of life: Comment on ""Mineral self-organization on a lifeless planet"" by García-Ruiz et al."

Auteurs: Kepa Ruiz-Mirazo
Publié dans: Physics of Life Reviews, Numéro 2, 2020, ISSN 1571-0645
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.plrev.2020.06.001

Ferric heme <i>b</i> in aqueous micellar and vesicular systems: state-of-the-art and challenges

Auteurs: Nemanja Cvjetan; Peter Walde
Publié dans: Quarterly Review of Biophysics, Numéro 11, 2023, ISSN 1469-8994
Éditeur: Cambrige University Press
DOI: 10.1017/s0033583522000130

Can coacervation unify disparate hypotheses in the origin of cellular life?

Auteurs: Basusree Ghosh , Rudrarup Bose, T-Y. Dora Tang
Publié dans: Current Opinion in Colloid & Interface Science, 2021, ISSN 0021-9797
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.cocis.2020.101415

Prebiotic triose glycolysis promoted by co-catalytic proline and phosphate in neutral water

Auteurs: Álvaro F. Magalhães; Matthew W. Powner
Publié dans: Chemical Communications, Numéro 14, 2022, ISSN 1359-7345
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2cc05466c