Advancing European Aquaculture by Genome Functional Annotation

Informations projet

AQUA-FAANG

N° de convention de subvention: 817923

DOI 10.3030/817923

Projet clôturé

Date de signature de la CE 3 Mai 2019

Date de début 1 Mai 2019

Date de fin 31 Octobre 2023

Financé au titre de

• SOCIETAL CHALLENGES - Food security, sustainable agriculture and forestry, marine, maritime and inland water research, and the bioeconomy

Coût total € 6 355 182,50

Contribution de l’UE € 6 000 000,00

Coordonné par

NORGES MILJO-OG BIOVITENSKAPLIGE UNIVERSITET
Norway

Description du projet

La génomique est la clé pour l’avenir de l’aquaculture européenne

L’aquaculture, processus contrôlé d’élevage d’organismes aquatiques, est le secteur de production alimentaire qui connaît la croissance la plus rapide au monde. Maintenir la santé des poissons est vital pour assurer une production efficace, toutefois les maladies infectieuses constituent une menace constante. Le projet AQUA-FAANG, financé par l’UE, a pour objectif d’améliorer notre compréhension de la fonction du génome et de l’utilisation de la prédiction génotype à phénotype chez les six principales espèces halieutiques de l’aquaculture européenne. Comprendre comment le génome complet du poisson est contrôlé peut permettre d’aborder des questions clés telles que les maladies infectieuses et peut par conséquent contribuer à une production aquacole durable et rentable. Le projet va créer un consortium d’experts qui développera un centre interactif sur le long terme dans le cadre de la recherche fondamentale en biologie génomique.

Objectif

Recent developments in genomics have advanced innovation in European aquaculture. However, despite the creation of reference quality genome sequences for the main species, our understanding of genome functions remains limited. AQUA-FAANG will deliver a step improvement in understanding of genome function and exploitation of genotype-to-phenotype prediction in the six most important European farmed fish species. The project brings together world-leading interdisciplinary expertise and industry partners providing direct pathways to commercial exploitation. AQUA-FAANG will functionally annotate the genomes of all six species, employing standardized experimental assays and analysis pipelines defined by the FAANG initiative. AQUA-FAANG datasets will be shared and coordinated with other FAANG initiatives via the FAANG data coordination centre, and made available through the Ensembl genome browser. As infectious disease is of paramount concern for sustainable aquaculture, the project focuses on understanding functional genomic regions in both healthy and immune-challenged fish. This will improve knowledge of the genomic basis for disease resistance and is complemented by novel approaches to increase understanding of immune cell heterogeneity. Standardized comparative analyses will provide essential insights into genome functions that cannot be gained from study of single species. Functional assays will be used to study intermediate phenotypes and prioritise causative genetic variants in trait-associated genomic regions to accelerate selection of disease-resistant stocks. Functionally-enriched marker panels will be developed to improve accuracy of genomic selection. An active programme of stakeholder engagement and dissemination will ensure uptake of project outputs by industry, academia, the public and in policy. The outputs will enhance precision breeding, drive competitiveness within the aquaculture sector, and enhance food and nutrition security in Europe.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

• sciences agricoles › agriculture, sylviculture et pêche › pêche
• sciences médicales et de la santé › sciences de la santé › maladie infectieuse
• sciences médicales et de la santé › médecine fondamentale › immunologie
• sciences naturelles › sciences biologiques › zoologie › ichtyologie
• sciences naturelles › sciences biologiques › génétique › génome

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Mots‑clés

• Functional annotation of fish genomes

Programme(s)

• H2020-EU.3.2. - SOCIETAL CHALLENGES - Food security, sustainable agriculture and forestry, marine, maritime and inland water research, and the bioeconomy Main Programme
• H2020-EU.3.2.1.1. - Increasing production efficiency and coping with climate change, while ensuring sustainability and resilience
• H2020-EU.3.2.3.1. - Developing sustainable and environmentally-friendly fisheries

Thème(s)

• SFS-30-2018-2019-2020 - Agri-Aqua Labs

Appel à propositions

H2020-SFS-2018-2020

Voir d’autres projets de cet appel

Sous appel

H2020-SFS-2018-2

Régime de financement

RIA - Research and Innovation action

Coordinateur

NORGES MILJO-OG BIOVITENSKAPLIGE UNIVERSITET

• Contribution nette de l'UE: € 1 810 394,75
• Adresse: UNIVERSITETSTUNET 3 ; 1433 As ; Norvège
• Type d’activité: Higher or Secondary Education Establishments
• Coût total: € 2 106 719,75

Participants (23)

THE UNIVERSITY OF EDINBURGH

Royaume-Uni

• Contribution nette de l'UE: € 835 264,00
• Adresse: OLD COLLEGE, SOUTH BRIDGE ; EH8 9YL Edinburgh
• Région: Scotland › Eastern Scotland › Edinburgh
• Type d’activité: Higher or Secondary Education Establishments
• Coût total: € 835 264,00

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY

Allemagne

• Contribution nette de l'UE: € 606 657,50
• Adresse: Meyerhofstrasse 1 ; 69117 Heidelberg
• Région: Baden-Württemberg › Karlsruhe › Heidelberg, Stadtkreis
• Type d’activité: Research Organisations
• Coût total: € 606 657,50

WAGENINGEN UNIVERSITY

Pays-Bas

• Contribution nette de l'UE: € 431 477,50
• Adresse: DROEVENDAALSESTEEG 4 ; 6708 PB Wageningen
• Région: Oost-Nederland › Gelderland › Veluwe
• Type d’activité: Higher or Secondary Education Establishments
• Coût total: € 431 477,50

INSTITUT NATIONAL DE RECHERCHE POUR L'AGRICULTURE, L'ALIMENTATION ET L'ENVIRONNEMENT

France

• Contribution nette de l'UE: € 560 055,00
• Adresse: 147 RUE DE L'UNIVERSITE ; 75007 Paris
• Région: Ile-de-France › Ile-de-France › Paris
• Type d’activité: Research Organisations
• Coût total: € 560 055,00

EUROPEAN FORUM OF FARM ANIMAL BREEDERS

Pays-Bas

• Contribution nette de l'UE: € 181 727,50
• Adresse: SILKEBORG 75 ; 2905 AT Capelle Aan Den Ijssel
• Type d’activité: Other
• Coût total: € 181 727,50

THE UNIVERSITY COURT OF THE UNIVERSITY OF ABERDEEN

Royaume-Uni

• Contribution nette de l'UE: € 194 436,25
• Adresse: KING'S COLLEGE REGENT WALK ; AB24 3FX Aberdeen
• Région: Scotland › North Eastern Scotland › Aberdeen City and Aberdeenshire
• Type d’activité: Higher or Secondary Education Establishments
• Coût total: € 194 436,25

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI PADOVA

Italie

• Contribution nette de l'UE: € 369 293,75
• Adresse: VIA 8 FEBBRAIO 2 ; 35122 Padova
• Région: Nord-Est › Veneto › Padova
• Type d’activité: Higher or Secondary Education Establishments
• Coût total: € 369 293,75

HELLENIC CENTRE FOR MARINE RESEARCH

Grèce

• Contribution nette de l'UE: € 268 393,75
• Adresse: LEOFOROS ATHENS SOUNIO 46 7KM ; 19013 Attikia Anavissos
• Région: Αττική › Aττική › Ανατολική Αττική
• Type d’activité: Research Organisations
• Coût total: € 268 393,75

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA

Espagne

• Contribution nette de l'UE: € 226 518,75
• Adresse: COLEXIO DE SAN XEROME PRAZA DO OBRADOIRO S/N ; 15782 Santiago De Compostela
• Région: Noroeste › Galicia › A Coruña
• Type d’activité: Higher or Secondary Education Establishments
• Coût total: € 226 518,75

POLSKA AKADEMIA NAUK

Pologne

• Contribution nette de l'UE: € 158 652,50
• Adresse: PLAC DEFILAD 1 ; 00 901 Warszawa
• Région: Makroregion województwo mazowieckie › Warszawski stołeczny › Miasto Warszawa
• Type d’activité: Higher or Secondary Education Establishments
• Coût total: € 158 652,50

UNIVERSITAT DE BARCELONA

Espagne

• Contribution nette de l'UE: € 20 500,00
• Adresse: GRAN VIA DE LES CORTS CATALANES 585 ; 08007 Barcelona
• Région: Este › Cataluña › Barcelona
• Type d’activité: Higher or Secondary Education Establishments
• Coût total: € 20 500,00

THE UNIVERSITY OF BIRMINGHAM

Royaume-Uni

• Contribution nette de l'UE: € 62 950,00
• Adresse: Edgbaston ; B15 2TT Birmingham
• Région: West Midlands (England) › West Midlands › Birmingham
• Type d’activité: Higher or Secondary Education Establishments
• Coût total: € 62 950,00

IMPERIAL COLLEGE OF SCIENCE TECHNOLOGY AND MEDICINE

Royaume-Uni

• Contribution nette de l'UE: € 111 353,75
• Adresse: SOUTH KENSINGTON CAMPUS EXHIBITION ROAD ; SW7 2AZ LONDON
• Région: London › Inner London — West › Westminster
• Type d’activité: Higher or Secondary Education Establishments
• Coût total: € 111 353,75

XELECT LIMITED

Royaume-Uni

• Contribution nette de l'UE: € 87 325,00
• Adresse: KINBURN CASTLE, DOUBLEDYKES ROAD ; KY16 9DR St Andrews
• PME L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention. Oui:
  Région
  Scotland › Eastern Scotland › Clackmannanshire and Fife
• Région: Scotland › Eastern Scotland › Clackmannanshire and Fife
• Type d’activité: Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
• Coût total: € 93 307,50

AQUA GEN AS

Norvège

• Contribution nette de l'UE: € 6 250,00
• Adresse: HAVNEGATA 9 ; 7462 Trondheim
• PME L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention. Oui:
  Région
  Norge › Trøndelag › Trøndelag
• Région: Norge › Trøndelag › Trøndelag
• Type d’activité: Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
• Coût total: € 16 568,75

VALLE CA'ZULIANI SOCIETA' AGRICOLAS.R.L

Italie

• Contribution nette de l'UE: € 25 000,00
• Adresse: VIA GARDIZZA 9/B ; 48017 Conselice
• PME L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention. Oui:
  Région
  Nord-Est › Emilia-Romagna › Ravenna
• Région: Nord-Est › Emilia-Romagna › Ravenna
• Type d’activité: Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
• Coût total: € 30 000,00

PANITTICA ITALIA SOCIETA AGRICOLA SRL

Italie

• Contribution nette de l'UE: € 6 250,00
• Adresse: STRADA DEL PROCACCIO ; 72015 Fasano
• PME L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention. Oui:
  Région
  Sud › Puglia › Brindisi
• Région: Sud › Puglia › Brindisi
• Type d’activité: Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
• Coût total: € 11 250,00

OVAPISCIS SA

Espagne

• Contribution nette de l'UE: € 6 250,00
• Adresse: LUGAR DE FONTEO S/N - BALEIRA ; 27278 Lugo
• Région: Noroeste › Galicia › Lugo
• Type d’activité: Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
• Coût total: € 10 000,00

STOLT SEA FARM S.A.

Espagne

• Contribution nette de l'UE: € 6 250,00
• Adresse: PUNTA DE LOS REMEDIOS, S.N. LIRA ; 15292 A Coruna
• Région: Noroeste › Galicia › A Coruña
• Type d’activité: Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
• Coût total: € 13 750,00

AQUICULTURA BALEAR SA

Espagne

• Contribution nette de l'UE: € 6 250,00
• Adresse: CARRETERA DE CAN PASTILLA S/N ; 07007 Palma De Mallorca
• Région: Este › Illes Balears › Mallorca
• Type d’activité: Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
• Coût total: € 10 000,00

GENEAQUA SL

Espagne

• Contribution nette de l'UE: € 6 250,00
• Adresse: CALLE RIBADEO 18 1 IZQUIERDA ; 27002 Lugo
• PME L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention. Oui:
  Région
  Noroeste › Galicia › Lugo
• Région: Noroeste › Galicia › Lugo
• Type d’activité: Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
• Coût total: € 12 070,00

SYNDICAT DES SELECTIONNEURS AVICOLES ET AQUACOLES FRANCAIS

France

• Contribution nette de l'UE: € 6 250,00
• Adresse: CENTRE INRA DE TOURS NOUZILLY ; 37380 Nouzilly
• PME L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention. Oui:
  Région
  Centre — Val de Loire › Centre — Val de Loire › Indre-et-Loire
• Région: Centre — Val de Loire › Centre — Val de Loire › Indre-et-Loire
• Type d’activité: Other
• Coût total: € 13 611,25

AVRAMAR AQUACULTURE SOCIETE ANONYME

Grèce

• Contribution nette de l'UE: € 6 250,00
• Adresse: LEOFOROS MARKOPOULOU 19,3KM ; 190 02 ATHINA
• Région: Αττική › Aττική › Ανατολική Αττική
• Type d’activité: Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
• Coût total: € 10 625,00