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Bacterial small RNAs networks unravelling novel features of transcription and translation

Description du projet

Le rôle des petits ARN dans la régulation de l’expression génétique des bactéries

Des preuves récentes indiquent la présence de petits ARN régulateurs chez des bactéries participant à la régulation de l’expression génétique. Toutefois, il s’avère nécessaire d’obtenir davantage d’informations mécanistiques sur les circuits de régulation influençant la dynamique de l’expression génétique chez les cellules procaryotes. À cette fin, le projet BactRNA, financé par l’UE, caractérisera les répercussions des petits ARN sur la traduction et la transcription des gènes. Les résultats permettront d’obtenir des connaissances inédites sur la complexité de la régulation de l’expression génétique des bactéries. Ils aideront également les scientifiques à comprendre la capacité inhérente des bactéries à s’adapter rapidement à de nouveaux environnements et à réussir la colonisation de divers habitats.

Objectif

Regulation of gene expression plays a key role in the ability of bacteria to rapidly adapt to changing environments and to colonize extremely diverse habitats. The relatively recent discovery of a plethora of small regulatory RNAs and the beginning of their characterization has unravelled new aspects of bacterial gene expression. First, the expression of many bacterial genes responds to a complex network of both transcriptional and post-transcriptional regulators. However, the properties of the resulting regulatory circuits on the dynamics of gene expression and in the bacterial adaptive response have been poorly addressed so far. In a first part of this project, we will tackle this question by characterizing the circuits that are formed between two widespread classes of bacterial regulators, the sRNAs and the two-component systems, which act at the post-transcriptional and the transcriptional level, respectively. The study of sRNAs also led to major breakthroughs regarding the basic mechanisms of gene expression. In particular, we recently showed that repressor sRNAs can target activating stem-loop structures located within the coding region of mRNAs that promote translation initiation, in striking contrast with the previously recognized inhibitory role of mRNA structures in translation. The second objective of this project is thus to draw an unprecedented map of non-canonical translation initiation events and their regulation by sRNAs.
Overall, this project will greatly improve our understanding of how bacteria can so rapidly and successfully adapt to many different environments, and in the long term, provide clues towards the development of anti-bacterial strategies.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Régime de financement

ERC-COG - Consolidator Grant

Institution d’accueil

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contribution nette de l'UE
€ 1 999 754,00
Coût total
€ 1 999 754,00

Bénéficiaires (1)