Descripción del proyecto
Una nueva herramienta de edición del genoma
El descubrimiento de la capacidad de editar el genoma de las bacterias mediante el sistema CRISPR-Cas ha revolucionado la edición del genoma. Sin embargo, las limitaciones asociadas con otros efectos colaterales obstaculizan la explotación de CRISPR-Cas en aplicaciones médicas. El proyecto financiado con fondos europeos MIGHTY_RNA está investigando el mecanismo molecular de la eliminación del ADN de «Tetrahymena thermophila» como enfoque alternativo de edición del genoma. Los investigadores determinarán la forma en que el sistema de ARN eucariota (Twi1) que media esta eliminación del ADN en los ciliados reconoce y corta sus secuencias diana. El estudio MIGHTY_RNA podría crear una nueva herramienta de edición del genoma que pueda superar a CRISPR-Cas en varias aplicaciones.
Objetivo
Genome editing is an essential tool for life sciences. Recent ground-breaking discovery in microbiology drew our attention to the genome editing ability of bacteria (CRISPR). Since its discovery, CRISPR has revolutionized the way of editing a genome. Despite its wide use, CRISPR-genome editing has limitations, especially in the use for medical applications. Numerous studies have shown that it suffers from the off-target effect. Its use is also restricted by its particular sequence requirement and its poor accessibility to a structured genome. Furthermore, recent studies suggested that it might act as a virulence factor within human cells. These limitations demand new genome editing tools.
This proposal sets out to understand the molecular mechanism of Tetrahymena DNA elimination. This naturally occuring genome editing is mediated by a eukaryotic RNA system (Twi1). This system uses an entirely different mechanism from CRISPR and has potential to perform more effectively. I will first investigate how small RNA-loaded Twi1 (“target searcher”) recognizes its target and whether its performance exceeds other target searchers including CRISPR/Cas9. I will use single-molecule fluorescence for high resolution observations and develop a high-throughput single-molecule method for transcriptome-wide understanding. Second, I aim to identify a Twi1-related DNA nuclease(s) that carries out DNA elimination. I will use cutting-edge tools of single-molecule pull-down and multi-color FRET together with mass spectrometry. The nanoscopic understanding of a searcher (Twi1) and the identification of a nuclease will help create a new genome editing tool (e.g. a fusion of Twi1 and the nuclease) that potentially perform better than Cas9. Thereby, this fundamental study on “mighty RNA” will make a long-term impact for applications in science and technology. To realize this ambitious project, I will utilize my experience of studying small RNAs (funded by ERC Starting Grant).
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: https://op.europa.eu/es/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: https://op.europa.eu/es/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- ciencias médicas y de la salud biotecnología médica ingeniería genética terapia génica
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
- ciencias naturales ciencias químicas química analítica espectrometría de masas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse
Le pedimos disculpas, pero se ha producido un error inesperado durante la ejecución.
Necesita estar autentificado. Puede que su sesión haya finalizado.
Gracias por su comentario. En breve recibirá un correo electrónico para confirmar el envío. Si ha seleccionado que se le notifique sobre el estado del informe, también se le contactará cuando el estado del informe cambie.
Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
-
H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
Ver todos los proyectos financiados en el marco de este programa
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
ERC-COG - Consolidator Grant
Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2018-COG
Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoriaInstitución de acogida
Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
2628 CN DELFT
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.