Description du projet
Un nouvel outil d’édition du génome
La découverte de la capacité d’édition du génome des bactéries grâce au système CRISPR-Cas a révolutionné l’édition du génome. Cependant, les limitations associées aux effets hors cible entravent l’exploitation de CRISPR-Cas pour des applications médicales. Le projet MIGHTY_RNA, financé par l’UE, étudie le mécanisme moléculaire de l’élimination de l’ADN de Tetrahymena thermophila comme approche alternative de l’édition du génome. Les chercheurs détermineront comment le système d’ARN eucaryote (Twi1) qui intervient dans cette élimination de l’ADN chez les ciliés reconnaît et coupe ses séquences cibles. L’étude MIGHTY_RNA est susceptible de créer un nouvel outil d’édition du génome qui pourrait bien surpasser le système CRISPR-Cas dans différentes applications.
Objectif
Genome editing is an essential tool for life sciences. Recent ground-breaking discovery in microbiology drew our attention to the genome editing ability of bacteria (CRISPR). Since its discovery, CRISPR has revolutionized the way of editing a genome. Despite its wide use, CRISPR-genome editing has limitations, especially in the use for medical applications. Numerous studies have shown that it suffers from the off-target effect. Its use is also restricted by its particular sequence requirement and its poor accessibility to a structured genome. Furthermore, recent studies suggested that it might act as a virulence factor within human cells. These limitations demand new genome editing tools.
This proposal sets out to understand the molecular mechanism of Tetrahymena DNA elimination. This naturally occuring genome editing is mediated by a eukaryotic RNA system (Twi1). This system uses an entirely different mechanism from CRISPR and has potential to perform more effectively. I will first investigate how small RNA-loaded Twi1 (“target searcher”) recognizes its target and whether its performance exceeds other target searchers including CRISPR/Cas9. I will use single-molecule fluorescence for high resolution observations and develop a high-throughput single-molecule method for transcriptome-wide understanding. Second, I aim to identify a Twi1-related DNA nuclease(s) that carries out DNA elimination. I will use cutting-edge tools of single-molecule pull-down and multi-color FRET together with mass spectrometry. The nanoscopic understanding of a searcher (Twi1) and the identification of a nuclease will help create a new genome editing tool (e.g. a fusion of Twi1 and the nuclease) that potentially perform better than Cas9. Thereby, this fundamental study on “mighty RNA” will make a long-term impact for applications in science and technology. To realize this ambitious project, I will utilize my experience of studying small RNAs (funded by ERC Starting Grant).
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale génie génétique thérapie génique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2018-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
2628 CN DELFT
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.