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CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
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Automated evaluation and correction of generation bias in immune receptor repertoires

Descrizione del progetto

Software di analisi del repertorio immunitario

I progressi nella tecnologia di sequenziamento offrono agli scienziati la capacità di determinare il repertorio immunitario di un individuo e identificare i patogeni che ha incontrato nella vita. Un tale sequenziamento immunitario, tuttavia, genera megadati difficili o laboriosi da analizzare. L’obiettivo del progetto PGEN, finanziato dall’UE, è sviluppare un software per l’analisi dei dati di sequenziamento immunitario. La soluzione PGEN sarà facile da utilizzare e non richiederà competenze bioinformatiche. Ciò significa che può essere implementato dai medici per identificare potenziali disfunzioni del sistema immunitario o dal personale scientifico delle aziende farmaceutiche per la progettazione di vaccini.

Obiettivo

Personalized medicine is promising to change the health and prophylactics sectors, already showing large societal and economic impact. High throughput immune sequencing technologies give us insight into a unique personal medical record - our immune system’s memory of all encountered infections and the successful solutions our body found. Unfortunately, reading this record requires advanced statistical tools making it often inaccessible to biologists and medical practitioners. PGEN offers a solution that will fill this gap between modern technology and applications by developing commercialisation solutions for an immune repertoire analysis software. PGEN builds on the methodologies developed during the ERC Starting Grant RECOGNIZE to provide a user-friendly versatile software prototype that will give researchers in the life scientists and medical practitioners without bioinformatic training an overview of the statistical properties of the immune repertoires they are studying. PGEN will explore the impact on medicine and biotechnology of this software platform that identifies non-standard immune responses that can be exploited in vaccine design and novel personalised therapies. Currently no software exists that a medical practitioner can use to characterize the baseline immune repertoire of a healthy person. Knowing this baseline is essential for identifying immune system disfunction and applying immune repertoire sequencing technologies in biotechnology and medicine. The PGEN software platform will provide doctors and biologists with a statistical tool that will help them make informed decisions about treatment, prophylactics and future research. PGEN will pursue commercialization and market solutions both within academia, the biotechnology and medical sectors.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Meccanismo di finanziamento

ERC-POC -

Istituzione ospitante

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contributo netto dell'UE
€ 142 406,00
Indirizzo
RUE MICHEL ANGE 3
75794 Paris
Francia

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Regione
Ile-de-France Ile-de-France Hauts-de-Seine
Tipo di attività
Organizzazioni di ricerca
Collegamenti
Costo totale
€ 149 906,00

Beneficiari (2)