Mechanistic basis of nucleation and spreading underlying a Polycomb-mediated epigenetic switch

Informations projet

EPISWITCH

N° de convention de subvention: 833254

DOI

10.3030/833254

Projet clôturé

Date de signature de la CE 17 Avril 2019

Date de début 1 Septembre 2019

Date de fin 31 Août 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 101 325,00

Contribution de l’UE

€ 2 101 325,00

Coordonné par

JOHN INNES CENTRE
United Kingdom

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data Managaement Plan

Data Management Plan

Publications

Peer reviewed articles (14)

Distinct accessory roles of<i>Arabidopsis</i>VEL proteins in Polycomb silencing

Auteurs: Elsa Franco-Echevarría, Mathias Nielsen, Anna Schulten, Jitender Cheema, Tomos E. Morgan, Mariann Bienz, Caroline Dean
Publié dans: Genes &amp; Development, Numéro 37, 2023, Page(s) 801-817, ISSN 0890-9369
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gad.350814.123

In vivo single-molecule analysis reveals COOLAIR RNA structural diversity

Auteurs: Yang M, Zhu P, Cheema J, Bloomer R, Mikulski P, Liu Q, Zhang Y, Dean C, Ding Y
Publié dans: Nature, Numéro 00280836, 2022, Page(s) 394-399, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05135-9

The 3′ processing of antisense RNAs physically links to chromatin-based transcriptional control

Auteurs: Xiaofeng Fang, Zhe Wu, Oleg Raitskin, Kimberly Webb, Philipp Voigt, Tiancong Lu, Martin Howard, Caroline Dean
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 117/26, 2020, Page(s) 15316-15321, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2007268117

Causal role of a promoter polymorphism in natural variation of the Arabidopsis floral repressor gene FLC

Auteurs: Pan Zhu, Michael Schon, Julia Questa, Michael Nodine, Caroline Dean
Publié dans: Current Biology, Numéro 33, 2025, Page(s) 4381-4391.e3, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2023.08.079

Cold-induced nucleosome dynamics linked to silencing of Arabidopsis FLC

Auteurs: Miguel Montez, Danling Zhu, Jan Huertas, M. Julia Maristany, Bas Rutjens, Mathias Nielsen, Rosana Collepardo-Guevara, Caroline Dean
Publié dans: Nature Communications, Numéro 16, 2025, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-60735-z

<i>COOLAIR</i> and PRC2 function in parallel to silence <i>FLC</i> during vernalization

Auteurs: Mathias Nielsen, Govind Menon, Yusheng Zhao, Eduardo Mateo-Bonmati, Philip Wolff, Shaoli Zhou, Martin Howard, Caroline Dean
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 121, 2024, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2311474121

VAL1 acts as an assembly platform co-ordinating co-transcriptional repression and chromatin regulation at Arabidopsis FLC.

Auteurs: Mikulski P, Wolff P, Lu T, Nielsen M, Zhu D, Franco-Echevarria E, Questa J, Dean C
Publié dans: Nature Communications, Numéro 20411723, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-32897-7

Plant vernalization proteins contain unusual PHD superdomains without histone H3 binding activity

Auteurs: Franco-Echevarría E, Rutherford TJ, Fiedler M, Dean C, Bienz M
Publié dans: Journal of Biological Chemistry, Numéro 102540, 2022, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102540

VEL-dependent polymerization maintains the chromatin association of Polycomb proteins for the switch to epigenetic silencing

Auteurs: Anna Schulten, Geng-Jen Jang, Alex Payne-Dwyer, Marc Fiedler, Mathias L. Nielsen, Eduardo Mateo-Bonmatí, Mariann Bienz, Mark C. Leake, Caroline Dean
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 85, 2026, Page(s) 3321-3332.e5, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2025.08.002

The intersection of DNA replication with antisense 3' RNA processing in Arabidopsis FLC chromatin silencing

Auteurs: Baxter CL, Šviković S, Sale JE, Dean C, Costa S
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro Vol. 118 No. 28, 2021, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2107483118

R-loop resolution promotes co-transcriptional chromatin silencing

Auteurs: Congyao Xu, Zhe Wu, Hong-Chao Duan, Xiaofeng Fang, Guifang Jia, Caroline Dean
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-22083-6

Digital paradigm for Polycomb epigenetic switching and memory

Auteurs: Menon G, Schulten A., Dean C., Howard M.
Publié dans: Current Opinion in Plant Biology, Numéro Volume 61, 2021, Page(s) 102012, ISSN 1369-5266
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pbi.2021.102012

Cold-induced Arabidopsis FRIGIDA nuclear condensates for FLC repression

Auteurs: Zhu P, Lister, C, Dean C
Publié dans: Nature, Numéro 599, 2021, Page(s) 657-661, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-04062-5

Antagonistic cotranscriptional regulation through ARGONAUTE1 and the THO/TREX complex orchestrates FLC transcriptional output

Auteurs: Xu C, Fang X, Lu T, Dean C
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro Vol. 118 No. 47, 2021, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2113757118