Descripción del proyecto
Simulación del hacinamiento macromolecular en las células
Se cree que el hacinamiento macromolecular en las células afecta a la función de las proteínas al modular su estabilidad y su dinámica. Sin embargo, el estudio de este fenómeno a nivel experimental en las células ha demostrado ser todo un reto. El proyecto CROWDY, financiado con fondos europeos, se propone simular el hacinamiento macromolecular a través de un marco intrincado que tiene en cuenta la naturaleza compleja de las proteínas y su presencia en distintos entornos celulares. Además, los científicos investigarán los efectos del hacinamiento cerca de las membranas celulares. En conjunto, el proyecto mejorará nuestra comprensión de la función proteica «in vivo» en enfermedades como la esclerosis lateral amiotrófica.
Objetivo
In living cells, proteins operate in an extremely crowded environment, which has a substantial impact on their structural and dynamical properties. Taking into account the effects of macromolecular crowding is thus imperative for a full understanding of protein function in vivo. However, despite a growing interest in the characterization of in-cell crowding, its net effect remains only partially understood as experimental studies addressing such phenomena in the cytoplasm are very challenging. In this project, we aim to examine the effect of macromolecular crowding on protein mobility and stability at the microscopic resolution. To this end, we will deploy a novel multi-scale simulation approach developed in the host laboratory. This multi-scale framework combines a detailed description of proteins with an efficient lattice-based model of solvent hydrodynamics. In the course of the project, we will consider systems of progressive complexity, ranging from crowded binary protein suspensions through a model of a bacterial cytoplasm and a lipid vesicle forming a biological nanoreactor. Our computational studies will be performed in close contact with two top-level experimental groups active in the field. We will pay particular attention to the behavior of superoxide dismutase 1, a protein involved in amyotrophic lateral sclerosis. Our multi-scale molecular simulations will shed light on how protein dynamics and stability are locally affected by the heterogeneity of the cellular environment. Moreover, we will investigate how crowding is modulated by the presence of membrane surfaces. The simulations will allow us to clarify the origins of crowding effects at an atomistic level, which will provide a vital support for the microscopic interpretation of experimental data. Thus, our project will offer unprecedented insights into the structure and dynamics of the crowded environment inside living cells.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas lípidos
- ciencias naturales informática y ciencias de la información ciencias de la computación multifísica
- ciencias médicas y de la salud medicina básica neurología esclerosis lateral amiotrófica
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2018
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
75794 PARIS
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.