Description du projet
Étudier l’évolution des mutations des lignées germinales chez les espèces
Le taux de mutation de la lignée germinale (GMR pour «germline mutation rate») est un concept central dans toutes les disciplines de la biologie, qui varie d’une espèce à l’autre et au sein d’une même espèce. Bien qu’il existe plusieurs théories pour expliquer les causes de cette variation, elle reste peu claire car la variation du GMR au sein d’une même espèce n’a été étudiée que dans une certaine mesure chez l’homme. Le projet MutANTs, financé par l’UE, étudiera le GMR chez les fourmis attines cultivant des champignons et chez un autre groupe de fourmis non attines afin d’obtenir des données comparatives permettant de prédire le GMR entre les espèces et au sein d’une même espèce. Les fourmis attines sont parfaites pour comprendre la variation du GMR entre les espèces et au sein d’une même espèce, car elles présentent une écologie de base similaire, mais leur «histoire de vie» s’est énormément diversifiée de la base au sommet de leur arbre phylogénétique.
Objectif
Germline mutation rate (GMR) is a key concept in all disciplines of biology, and particularly in evolutionary biology and the biomedical sciences. GMR varies both across and within species, but what drives this variation is unclear. Theories predict that GMR variation is shaped by environmental selection pressures, by effective population sizes, and by prevailing life-history traits (across species) and parental age at reproduction (within species). However, our understanding is extremely limited because within-species GMR variation has been investigated only to some extent in humans, and larger comparative genome-level datasets in other clades have not yet been pursued.
I propose to start filling this gap by studying GMR in attine fungus-growing ants and a set of outgroup. non-attine ants. The attine ants, a ca. 55 MY old monophyletic lineage, are ideal for understanding GMR variation across and within species because their basic ecology is similar (obligate dependence of farmed fungi for food) but their life-histories diversified enormously from the base to the crown of their phylogenetic tree, which presently has 15 recognized genus-level branches and >230 species.
Against a background dataset of ~20 high quality genomes, I propose to obtain genome-wide GMR estimates for 12 attine ants and 7 non-attine ants while controlling for confounders of phylogeny, colony size, life-span and effective population size. In addition, I will do an in-depth analysis of a single leafcutter ant species with long-lived queens and stored sperm of the same age, where I can also control for parental age. I will implement the MutANTs project at the Centre for Social Evolution in Copenhagen, an internationally renowned research hub for interdisciplinary omics research on ants, with Professors Guojie Zhang and Jacobus Jan Boomsma as joint hosts. I expect that in the two years available MutANTs will yield the first comparative data to predict GMRs across and within species.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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1165 Kobenhavn
Danemark