Descripción del proyecto
Codificar o no codificar, esa es la cuestión evolutiva
La xxpresar de un gen (que codifica la proteína correspondiente) requiere transcripción y traducción. Durante la transcripción, la información del ADN se transfiere a una molécula de ARN mensajero (ARNm) y, durante la traducción, esta secuencia de ARNm se utiliza para ensamblar los aminoácidos que forman la proteína. En algunos genes, no toda la secuencia de ADN codifica para una proteína. Estos intrones son eliminados tras la transcripción, dejando solo a los exones en la molécula de ARN madura para formar la proteína. El corte y empalme del ARN es fundamental para la evolución de las secuencias, pero se desconocen los mecanismos subyacentes. EvolSpliceKinetics está llevando a cabo el primer estudio de definición de exones e intrones a nivel de todo el genoma. La secuenciación pionera de un organismo modelo combinada con el aprendizaje automático y la genética de poblaciones debería proporcionar información inédita sobre el papel evolutivo de la cinética del corte y empalme del ARN.
Objetivo
The need to preserve correct splicing is a major source of constraint on sequence evolution. This includes selection on the splice sites as well as on regulatory elements in exons and introns. Are all exons and introns constrained similarly by splicing related pressures? This is a crucial problem not only for understanding genome evolution but also for predicting where disease-causing mutations occur.
Any variation in the prevalence of splicing information most likely reflects mechanistic variation in how the splicing process unfolds at different introns. Notably, it is often assumed that the relative importance of intronic and exonic splicing information depends on whether the splicing machinery recognizes introns or exons as the initial unit. However, this common model has never been tested directly because it is currently not possible to investigate splicing mechanism at this level of detail genome-wide. Existing studies on the distribution of splicing information are therefore based on proxies of unclear mechanistic significance, such as intron size.
My host lab has developed a nascent RNA sequencing technique that allows unprecedented insight into splicing dynamics transcriptome-wide. They have recently applied this method to Drosophila melanogaster, a species thought to use a diversity of splicing strategies. I propose to use this data, combined with a machine learning approach, to conduct the first genome-wide study into exon and intron definition based on direct kinetic evidence. I will then use population genetics methods to determine how the prevalence and strength of selection on different types of splicing information covaries with splicing dynamics.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN transcriptomas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
- ciencias naturales informática y ciencias de la información inteligencia artificial aprendizaje automático
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2018
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1649 028 Lisboa
Portugal
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.