Description du projet
Un aperçu de l’immunité bactérienne
Les bactéries possèdent de nombreux mécanismes de défense qui leur permettent de contrer les bactériophages, des virus qui les attaquent. Ces mécanismes ont évolué au cours de la perpétuelle confrontation entre l’hôte et les virus. Ils induisent la mort cellulaire programmée par le biais de toxines ou impliquent des protéines qui ciblent et modifient les génomes des bactériophages envahisseurs. Le projet MSOPGDM, financé par l’UE, étudie deux mécanismes de défense des procaryotes qui n’ont encore jamais été explorés. Dans le cadre d’une approche interdisciplinaire, les chercheurs entreprendront la caractérisation biochimique et structurelle des protéines de défense, afin de faire la lumière sur l’immunité moléculaire des bactéries. Par ailleurs, une meilleure compréhension des îlots génomiques associés à ces mécanismes de défense permettra de mieux comprendre leur évolution.
Objectif
The constant biological arms race between prokaryotic organisms and invading mobile genetic elements has resulted in the evolution of sophisticated genome defense mechanisms. The genes encoding for immunity commonly reside in genomic clusters known as defense islands that are in the vicinity of other host-defense loci. Recent studies of defense islands have uncovered ten novel host defense mechanisms whose molecular mechanisms remain elusive at present. The proposed project aims to provide a mechanistic basis for genetic immunity in two novel host defense systems: Druantia and Shedu. These systems contain genes encoding nucleases, ATPases and helicases, which strongly suggests that they provide immunity by directly targeting invading nucleic acids. To unravel the molecular mechanisms that underpin immunity in these systems, I will apply a highly interdisciplinary approach by using biochemical and state-of-the-art structural biology techniques, including high-throughput X-ray crystallography, cryo-EM and crosslink-coupled mass spectrometry. Understanding these mechanisms will provide fundamentally new insights into prokaryotic biology and the evolution of host-virus defense systems. Furthermore, these studies might uncover novel molecular activities that may be exploited for use as genetic engineering tools.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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