Description du projet
Des études sur les «bonnes» bactéries et les virus mangeurs de bactéries ouvrent la voie à de nouvelles thérapies
Propionibacterium freudenreichii (Pf) est une bactérie produisant de la vitamine B12 active et dont les bienfaits pour la santé humaine sont bien documentés. Les mécanismes de défense protégeant Pf contre les attaques des bactériophages (phages) sont très diversifiés. Le projet CO‑DEfENDENCE, financé par l’UE, utilise une approche innovante pour étudier systématiquement les mécanismes de défense du point de vue de Pf et des phages. La recherche utilise des souches et des phages isolés à partir d’échantillons de différentes origines afin de garantir la diversité du matériel pour les analyses en utilisant une combinaison de méthodes phénotypiques, génomiques, protéomiques et d’imagerie. Les résultats mettront en lumière les interactions entre les phages attaquants et les mécanismes de défense protégeant Pf, ce qui permettra de développer de nouveaux outils génétiques et des thérapies par les phages.
Objectif
Bacteriophages (phages) infecting Propionibacterium freudenreichii, a bacterium known for production of active vitamin B12 and for causing well-documented benefits to human health, are more diverse than those identified for closely related genera. At the same time, the defence mechanisms protecting the bacterial strains (hosts) from phage attacks are more diverse as well. These two phenomena suggest that P. freudenreichii strains and their phages have experienced complex interactions in phage-bacterium arms race. However, both phages attacking, and the defence mechanisms that this important food-grade Actinobacterium uses to protect itself from phage attacks are currently severely understudied. In CO-DEfENDENCE, I will use an innovative approach of systematic study of the defence mechanisms not only from the perspective of the bacterium, but also from the perspective of the phage. The use of strains and phages isolated from samples of different origin will ensure diversity of material subjected to analyses by a combination of phenotypic, genomic, proteomic and imaging methods. This multidisciplinary approach is possible due to guidance offered by world-class phage specialists at one of the world’s top universities, the University of Copenhagen. The expected result of CO-DEfENDENCE is elucidation of complex interactions between P. freudenreichii and its phages, which led to the high diversity of the phages and the multitude of defence mechanisms employed by the strains. As an added benefit, these results have a great potential for being translated into novel genetic tools and to aid the development of phage therapies, especially those aimed at pathogenic Actinobacteria.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Programme(s)
Appel à propositions
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
1165 Kobenhavn
Danemark