Vienna International Postdoctoral Program

Informations projet

VIP-2

N° de convention de subvention: 847548

DOI

10.3030/847548

Projet clôturé

Date de signature de la CE 8 Mai 2019

Date de début 1 Janvier 2020

Date de fin 31 Decembre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total

€ 9 930 600,00

Contribution de l’UE

€ 4 965 300,00

Coordonné par

FORSCHUNGSINSTITUT FUR MOLEKULARE PATHOLOGIE GESELLSCHAFT MBH
Austria

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Documents, reports (3)

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Publications

Peer reviewed articles (25)

Structural basis for regulation of apoptosis and autophagy by the BIRC6/SMAC complex

Auteurs: Julian F. Ehrmann, Daniel B. Grabarczyk, Maria Heinke, Luiza Deszcz, Robert Kurzbauer, Otto Hudecz, Alexandra Shulkina, Rebeca Gogova, Anton Meinhart, Gijs A. Versteeg, and Tim Clausen
Publié dans: Science, 2023, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.ade8873

Optical Near-Field Electron Microscopy

Auteurs: Raphaël Marchand; Radek Šachl; Martin Kalbac; Martin Hof; Rudolf M. Tromp; Rudolf M. Tromp; Mariana Amaro; Sense Jan van der Molen; Thomas Juffmann
Publié dans: Physical Review Applied, 16(1), Numéro 9, 2021, ISSN 2331-7019
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevapplied.16.014008

Reconstitution defines the roles of p62, NBR1 and TAX1BP1 in ubiquitin condensate formation and autophagy initiation

Auteurs: Eleonora Turco, Adriana Savova, Flora Gere, Luca Ferrari, Julia Romanov, Martina Schuschnig & Sascha Martens
Publié dans: Nat Commun., 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-25572-w

The histone variant H2A.W and linker histone H1 co-regulate heterochromatin accessibility and DNA methylation

Auteurs: Pierre Bourguet, Colette L. Picard, Ramesh Yelagandula, Thierry Pélissier, Zdravko J. Lorković, Suhua Feng2, Marie-Noëlle Pouch-Pélissier, Anna Schmücker, Steven E. Jacobsen, Frédéric Berger & Olivier Mathieu
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-22993-5

Unlocking the Hydrolytic Mechanism of GH92 α‐1,2‐Mannosidases: Computation Inspires the use of C‐Glycosides as Michaelis Complex Mimics

Auteurs: Takatsugu Miyazaki; Santiago Alonso-Gil; Radek Pohl; Jakub Kaminsky; Kamil Parkan
Publié dans: Chem. Eur. J., Numéro 4, 2022, ISSN 1521-3765
Éditeur: European Chemical Societies Publishing
DOI: 10.1002/chem.202200148

Molecular principles of Piwi-mediated cotranscriptional silencing through the dimeric SFiNX complex

Auteurs: Jakob Schnabl, Juncheng Wang, Ulrich Hohmann, Maja Gehre, Julia Batki, Veselin I. Andreev, Kim Purkhauser, Nina Fasching, Peter Duchek, Maria Novatchkova, Karl Mechtler, Clemens Plaschka, Dinshaw J. Patel and Julius Brennecke
Publié dans: Genes & development, 2021, ISSN 1549-5477
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gad.347989.120

Domestication and lowland adaptation of coastal preceramic maize from Paredones, Peru

Auteurs: Miguel Vallebueno-Estrada, Guillermo G Hernández-Robles, Eduardo González-Orozco, Ivan Lopez-Valdivia, Teresa Rosales Tham, Víctor Vásquez Sánchez, Kelly Swarts, Tom D Dillehay, Jean-Philippe Vielle-Calzada, Rafael Montiel
Publié dans: eLife, Numéro 12, 2023, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.83149

A split-site E3 ligase mechanism enables ZNFX1 to ubiquitinate and cluster single-stranded RNA into ubiquitin-coated nucleoprotein particles

Auteurs: Daniel B. Grabarczyk, Eric J. Aird, Vanessa Reznikow, Paul C. Kirchgatterer, Julian F. Ehrmann, Robert Kurzbauer, Lillie E. Bell, Max J. Kellner, Ritika Aggarwal, Alexander Schleiffer, Victoria Faas, Luiza Deszcz, Anton Meinhart, Gijs A. Versteeg, Josef M. Penninger, Lukas S. Stelzl, Moritz M. Gaidt, Ingrid Tessmer, Jacob E. Corn, Tim Clausen
Publié dans: Cell, Numéro 188, 2026, Page(s) 5995-6011.e17, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2025.08.006

MonteCarbo: A software to generate and dock multifunctionalized ring molecules

Auteurs: Santiago Alonso-Gil
Publié dans: Journal of Computational Chemistry, 2021, ISSN 1096-987X
Éditeur: Wiley Online Library
DOI: 10.1002/jcc.26559

Electrostatic changes enabled the diversification of an exocyst subunit via protein complex escape

Auteurs: Juan Carlos De la Concepcion, Héloïse Duverge, Yoonwoo Kim, Jose Julian, Haonan D. Xu, Matthew N. Watt, Sara Ait Ikene, Anita Bianchi, Nenad Grujic, Ranjith K. Papareddy, Irina Grishkovskaya, David Haselbach, David H. Murray, Marion Clavel, Nicholas A. T. Irwin, Yasin Dagdas
Publié dans: Nature Plants, Numéro 11, 2025, Page(s) 2350-2367, ISSN 2055-0278
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41477-025-02135-1

Proteasome and selective autophagy: Brothers-in-arms for organelle quality control

Auteurs: Marion Clavel, Yasin Dagdas
Publié dans: Current Opinion in Plant Biology, Numéro 63, 2025, Page(s) 102106, ISSN 1369-5266
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pbi.2021.102106

Polycomb-mediated repression of paternal chromosomes maintains haploid dosage in diploid embryos of Marchantia

Auteurs: Sean Akira Montgomery; Tetsuya Hisanaga; Nan Wang; Elin Axelsson; Svetlana Akimcheva; Milos Sramek; Chang Liu; Frédéric Berger
Publié dans: eLife, Numéro 5, 2022, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.79258

HUWE1 employs a giant substrate-binding ring to feed and regulate its HECT E3 domain.

Auteurs: Daniel B. Grabarczyk; Olga A Petrova; Luiza Deszcz; Robert Kurzbauer; Paul Murphy; Juraj Ahel; Antonia Vogel; Rebeca Gogova; Victoria Faas; Darja Kordic; Alexander Schleiffer; Anton Meinhart; Richard Imre; Anita Lehner; Jana Neuhold; Gerd Bader; Peggy Stolt-Bergner; Jark Böttcher; Bernhard Wolkerstorfer; Gerhard Fischer; Irina Grishkovskaya; David Haselbach; Dirk Kessler; Tim Clausen
Publié dans: Nature Chemical Biology, Numéro 8, 2021, ISSN 1552-4450
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-021-00831-5

Interaction preferences between protein side chains and key epigenetic modifications 5-methylcytosine, 5-hydroxymethycytosine and N6-methyladenine

Auteurs: Matea Hajnic, Santiago Alonso‑Gil, Anton A. Polyansky, Anita de Ruiter & Bojan Zagrovic
Publié dans: Scientific Reports, 2022, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-022-23585-z

Human blastoids model blastocyst development and implantation

Auteurs: Harunobu Kagawa, Alok Javali, Heidar Heidari Khoei, Theresa Maria Sommer, Giovanni Sestini, Maria Novatchkova, Yvonne Scholte op Reimer, Gaël Castel, Alexandre Bruneau, Nina Maenhoudt, Jenna Lammers, Sophie Loubersac, Thomas Freour, Hugo Vankelecom, Laurent David & Nicolas Rivron
Publié dans: Nature, 2021, ISSN 1476-4687
Éditeur: Springer Nature Limited
DOI: 10.1038/s41586-021-04267-8

Major alleles of CDCA7 shape CG methylation in Arabidopsis thaliana

Auteurs: Pierre Bourguet, Zdravko J. Lorković, Darya Kripkiy Casado, Valentin Bapteste, Chung Hyun Cho, Anna A. Igolkina, Cheng-Ruei Lee, Magnus Nordborg, Frédéric Berger, Eriko Sasaki
Publié dans: Nature Plants, Numéro 11, 2025, Page(s) 2511-2530, ISSN 2055-0278
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41477-025-02148-w

The Drosophila ZAD zinc finger protein Kipferl guides Rhino to piRNA clusters

Auteurs: Lisa Baumgartner, Dominik Handler, Sebastian Wolfgang Platzer, Changwei Yu, Peter Duchek, Julius Brennecke
Publié dans: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2022.07.12.499685

Epiblast inducers capture mouse trophectoderm stem cells in vitro and pattern blastoids for implantation in utero

Auteurs: Jinwoo Seong, Javier Frias-Aldeguer, Viktoria Holzmann, Harunobu Kagawa, Giovanni Sestini, Heidar Heidari Khoei, Yvonne Scholte Op Reimer, Maarten Kip, Saurabh J Pradhan, Lucas Verwegen, Judith Vivié, Linfeng Li, Anna Alemany, Jeroen Korving, Frank Darmis, Alexander van Oudenaarden, Derk Ten Berge, Niels Geijsen, Nicolas C Rivron
Publié dans: Cell Stem Cell, 2022, ISSN 1875-9777
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.stem.2022.06.002

All Light, Everywhere? Photoreceptors at Nonconventional Sites

Auteurs: Audrey Mat, Hong Ha Vu, Eva Wolf, Kristin Tessmar-Raible
Publié dans: Physiology, Numéro 39, 2023, Page(s) 30-43, ISSN 1548-9213
Éditeur: American Physiological Society
DOI: 10.1152/physiol.00017.2023

Panoramix SUMOylation on chromatin connects the piRNA pathway to the cellular heterochromatin machinery

Auteurs: Veselin I. Andreev, Changwei Yu, Juncheng Wang, Jakob Schnabl, Laszlo Tirian, Maja Gehre, Dominik Handler, Peter Duchek, Maria Novatchkova, Lisa Baumgartner, Katharina Meixner, Grzegorz Sienski, Dinshaw J. Patel and Julius Brennecke
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, 2022, ISSN 1545-9985
Éditeur: Springer
DOI: 10.1038/s41594-022-00721-x

Cell cycle status of male and female gametes during Arabidopsis reproduction

Auteurs: Yoav Voichek, Bohdana Hurieva, Caroline Michaud, Anna Schmücker, Zaida Vergara, Bénédicte Desvoyes, Crisanto Gutierrez, Viktoria Nizhynska, Benjamin Jaegle, Michael Borg, Frédéric Berger, Magnus Nordborg, Mathieu Ingouff
Publié dans: Plant Physiology, Numéro 194, 2023, Page(s) 412-421, ISSN 0032-0889
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plphys/kiad512

Deep evolutionary origin of gamete-directed zygote activation by KNOX/BELL transcription factors in green plants

Auteurs: Tetsuya Hisanaga; Tetsuya Hisanaga; Shota Fujimoto; Yihui Cui; Katsutoshi Sato; Ryosuke Sano; Shohei Yamaoka; Takayuki Kohchi; Frédéric Berger; Keiji Nakajima
Publié dans: eLife, Numéro 1, 2021, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2020.04.08.031930

Potential synthetic associations created by epistasis

Auteurs: Hai-Jun Liu, Jingxian Fu, Shuhua Xu, Magnus Nordborg
Publié dans: Genome Biology, Numéro 26, 2025, ISSN 1474-760X
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13059-025-03807-z

Virus-like transposons cross the species barrier and drive the evolution of genetic incompatibilities

Auteurs: Sonya A. Widen, Israel Campo Bes, Alevtina Koreshova, Pinelopi Pliota, Daniel Krogull, Alejandro Burga
Publié dans: Science, Numéro 380, 2024, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.ade0705

36‐year study reveals stability of a wild wheat population across microhabitats

Auteurs: Tal Dahan‐Meir, Thomas James Ellis, Fabrizio Mafessoni, Hanan Sela, Ori Rudich, Jacob Manisterski, Naomi Avivi‐Ragolsky, Amir Raz, Moshe Feldman, Yehoshua Anikster, Magnus Nordborg, Avraham A. Levy
Publié dans: Molecular Ecology, Numéro 33, 2024, ISSN 0962-1083
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.17512