Vienna International Postdoctoral Program

Projektinformationen

VIP-2

ID Finanzhilfevereinbarung: 847548

DOI

10.3030/847548

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 8 Mai 2019

Startdatum 1 Januar 2020

Enddatum 31 Dezember 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Gesamtkosten

€ 9 930 600,00

EU-Beitrag

€ 4 965 300,00

Koordiniert durch

FORSCHUNGSINSTITUT FUR MOLEKULARE PATHOLOGIE GESELLSCHAFT MBH
Austria

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Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Documents, reports (3)

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (25)

Structural basis for regulation of apoptosis and autophagy by the BIRC6/SMAC complex

Autoren: Julian F. Ehrmann, Daniel B. Grabarczyk, Maria Heinke, Luiza Deszcz, Robert Kurzbauer, Otto Hudecz, Alexandra Shulkina, Rebeca Gogova, Anton Meinhart, Gijs A. Versteeg, and Tim Clausen
Veröffentlicht in: Science, 2023, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.ade8873

Optical Near-Field Electron Microscopy

Autoren: Raphaël Marchand; Radek Šachl; Martin Kalbac; Martin Hof; Rudolf M. Tromp; Rudolf M. Tromp; Mariana Amaro; Sense Jan van der Molen; Thomas Juffmann
Veröffentlicht in: Physical Review Applied, 16(1), Ausgabe 9, 2021, ISSN 2331-7019
Herausgeber: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevapplied.16.014008

Reconstitution defines the roles of p62, NBR1 and TAX1BP1 in ubiquitin condensate formation and autophagy initiation

Autoren: Eleonora Turco, Adriana Savova, Flora Gere, Luca Ferrari, Julia Romanov, Martina Schuschnig & Sascha Martens
Veröffentlicht in: Nat Commun., 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-25572-w

The histone variant H2A.W and linker histone H1 co-regulate heterochromatin accessibility and DNA methylation

Autoren: Pierre Bourguet, Colette L. Picard, Ramesh Yelagandula, Thierry Pélissier, Zdravko J. Lorković, Suhua Feng2, Marie-Noëlle Pouch-Pélissier, Anna Schmücker, Steven E. Jacobsen, Frédéric Berger & Olivier Mathieu
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-22993-5

Unlocking the Hydrolytic Mechanism of GH92 α‐1,2‐Mannosidases: Computation Inspires the use of C‐Glycosides as Michaelis Complex Mimics

Autoren: Takatsugu Miyazaki; Santiago Alonso-Gil; Radek Pohl; Jakub Kaminsky; Kamil Parkan
Veröffentlicht in: Chem. Eur. J., Ausgabe 4, 2022, ISSN 1521-3765
Herausgeber: European Chemical Societies Publishing
DOI: 10.1002/chem.202200148

Molecular principles of Piwi-mediated cotranscriptional silencing through the dimeric SFiNX complex

Autoren: Jakob Schnabl, Juncheng Wang, Ulrich Hohmann, Maja Gehre, Julia Batki, Veselin I. Andreev, Kim Purkhauser, Nina Fasching, Peter Duchek, Maria Novatchkova, Karl Mechtler, Clemens Plaschka, Dinshaw J. Patel and Julius Brennecke
Veröffentlicht in: Genes & development, 2021, ISSN 1549-5477
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gad.347989.120

Domestication and lowland adaptation of coastal preceramic maize from Paredones, Peru

Autoren: Miguel Vallebueno-Estrada, Guillermo G Hernández-Robles, Eduardo González-Orozco, Ivan Lopez-Valdivia, Teresa Rosales Tham, Víctor Vásquez Sánchez, Kelly Swarts, Tom D Dillehay, Jean-Philippe Vielle-Calzada, Rafael Montiel
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 12, 2023, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.83149

A split-site E3 ligase mechanism enables ZNFX1 to ubiquitinate and cluster single-stranded RNA into ubiquitin-coated nucleoprotein particles

Autoren: Daniel B. Grabarczyk, Eric J. Aird, Vanessa Reznikow, Paul C. Kirchgatterer, Julian F. Ehrmann, Robert Kurzbauer, Lillie E. Bell, Max J. Kellner, Ritika Aggarwal, Alexander Schleiffer, Victoria Faas, Luiza Deszcz, Anton Meinhart, Gijs A. Versteeg, Josef M. Penninger, Lukas S. Stelzl, Moritz M. Gaidt, Ingrid Tessmer, Jacob E. Corn, Tim Clausen
Veröffentlicht in: Cell, Ausgabe 188, 2026, Seite(n) 5995-6011.e17, ISSN 0092-8674
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2025.08.006

MonteCarbo: A software to generate and dock multifunctionalized ring molecules

Autoren: Santiago Alonso-Gil
Veröffentlicht in: Journal of Computational Chemistry, 2021, ISSN 1096-987X
Herausgeber: Wiley Online Library
DOI: 10.1002/jcc.26559

Electrostatic changes enabled the diversification of an exocyst subunit via protein complex escape

Autoren: Juan Carlos De la Concepcion, Héloïse Duverge, Yoonwoo Kim, Jose Julian, Haonan D. Xu, Matthew N. Watt, Sara Ait Ikene, Anita Bianchi, Nenad Grujic, Ranjith K. Papareddy, Irina Grishkovskaya, David Haselbach, David H. Murray, Marion Clavel, Nicholas A. T. Irwin, Yasin Dagdas
Veröffentlicht in: Nature Plants, Ausgabe 11, 2025, Seite(n) 2350-2367, ISSN 2055-0278
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41477-025-02135-1

Proteasome and selective autophagy: Brothers-in-arms for organelle quality control

Autoren: Marion Clavel, Yasin Dagdas
Veröffentlicht in: Current Opinion in Plant Biology, Ausgabe 63, 2025, Seite(n) 102106, ISSN 1369-5266
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pbi.2021.102106

Polycomb-mediated repression of paternal chromosomes maintains haploid dosage in diploid embryos of Marchantia

Autoren: Sean Akira Montgomery; Tetsuya Hisanaga; Nan Wang; Elin Axelsson; Svetlana Akimcheva; Milos Sramek; Chang Liu; Frédéric Berger
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 5, 2022, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.79258

HUWE1 employs a giant substrate-binding ring to feed and regulate its HECT E3 domain.

Autoren: Daniel B. Grabarczyk; Olga A Petrova; Luiza Deszcz; Robert Kurzbauer; Paul Murphy; Juraj Ahel; Antonia Vogel; Rebeca Gogova; Victoria Faas; Darja Kordic; Alexander Schleiffer; Anton Meinhart; Richard Imre; Anita Lehner; Jana Neuhold; Gerd Bader; Peggy Stolt-Bergner; Jark Böttcher; Bernhard Wolkerstorfer; Gerhard Fischer; Irina Grishkovskaya; David Haselbach; Dirk Kessler; Tim Clausen
Veröffentlicht in: Nature Chemical Biology, Ausgabe 8, 2021, ISSN 1552-4450
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-021-00831-5

Interaction preferences between protein side chains and key epigenetic modifications 5-methylcytosine, 5-hydroxymethycytosine and N6-methyladenine

Autoren: Matea Hajnic, Santiago Alonso‑Gil, Anton A. Polyansky, Anita de Ruiter & Bojan Zagrovic
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2022, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-022-23585-z

Human blastoids model blastocyst development and implantation

Autoren: Harunobu Kagawa, Alok Javali, Heidar Heidari Khoei, Theresa Maria Sommer, Giovanni Sestini, Maria Novatchkova, Yvonne Scholte op Reimer, Gaël Castel, Alexandre Bruneau, Nina Maenhoudt, Jenna Lammers, Sophie Loubersac, Thomas Freour, Hugo Vankelecom, Laurent David & Nicolas Rivron
Veröffentlicht in: Nature, 2021, ISSN 1476-4687
Herausgeber: Springer Nature Limited
DOI: 10.1038/s41586-021-04267-8

Major alleles of CDCA7 shape CG methylation in Arabidopsis thaliana

Autoren: Pierre Bourguet, Zdravko J. Lorković, Darya Kripkiy Casado, Valentin Bapteste, Chung Hyun Cho, Anna A. Igolkina, Cheng-Ruei Lee, Magnus Nordborg, Frédéric Berger, Eriko Sasaki
Veröffentlicht in: Nature Plants, Ausgabe 11, 2025, Seite(n) 2511-2530, ISSN 2055-0278
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41477-025-02148-w

The Drosophila ZAD zinc finger protein Kipferl guides Rhino to piRNA clusters

Autoren: Lisa Baumgartner, Dominik Handler, Sebastian Wolfgang Platzer, Changwei Yu, Peter Duchek, Julius Brennecke
Veröffentlicht in: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2022.07.12.499685

Epiblast inducers capture mouse trophectoderm stem cells in vitro and pattern blastoids for implantation in utero

Autoren: Jinwoo Seong, Javier Frias-Aldeguer, Viktoria Holzmann, Harunobu Kagawa, Giovanni Sestini, Heidar Heidari Khoei, Yvonne Scholte Op Reimer, Maarten Kip, Saurabh J Pradhan, Lucas Verwegen, Judith Vivié, Linfeng Li, Anna Alemany, Jeroen Korving, Frank Darmis, Alexander van Oudenaarden, Derk Ten Berge, Niels Geijsen, Nicolas C Rivron
Veröffentlicht in: Cell Stem Cell, 2022, ISSN 1875-9777
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.stem.2022.06.002

All Light, Everywhere? Photoreceptors at Nonconventional Sites

Autoren: Audrey Mat, Hong Ha Vu, Eva Wolf, Kristin Tessmar-Raible
Veröffentlicht in: Physiology, Ausgabe 39, 2023, Seite(n) 30-43, ISSN 1548-9213
Herausgeber: American Physiological Society
DOI: 10.1152/physiol.00017.2023

Panoramix SUMOylation on chromatin connects the piRNA pathway to the cellular heterochromatin machinery

Autoren: Veselin I. Andreev, Changwei Yu, Juncheng Wang, Jakob Schnabl, Laszlo Tirian, Maja Gehre, Dominik Handler, Peter Duchek, Maria Novatchkova, Lisa Baumgartner, Katharina Meixner, Grzegorz Sienski, Dinshaw J. Patel and Julius Brennecke
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, 2022, ISSN 1545-9985
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1038/s41594-022-00721-x

Cell cycle status of male and female gametes during Arabidopsis reproduction

Autoren: Yoav Voichek, Bohdana Hurieva, Caroline Michaud, Anna Schmücker, Zaida Vergara, Bénédicte Desvoyes, Crisanto Gutierrez, Viktoria Nizhynska, Benjamin Jaegle, Michael Borg, Frédéric Berger, Magnus Nordborg, Mathieu Ingouff
Veröffentlicht in: Plant Physiology, Ausgabe 194, 2023, Seite(n) 412-421, ISSN 0032-0889
Herausgeber: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plphys/kiad512

Deep evolutionary origin of gamete-directed zygote activation by KNOX/BELL transcription factors in green plants

Autoren: Tetsuya Hisanaga; Tetsuya Hisanaga; Shota Fujimoto; Yihui Cui; Katsutoshi Sato; Ryosuke Sano; Shohei Yamaoka; Takayuki Kohchi; Frédéric Berger; Keiji Nakajima
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 1, 2021, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2020.04.08.031930

Potential synthetic associations created by epistasis

Autoren: Hai-Jun Liu, Jingxian Fu, Shuhua Xu, Magnus Nordborg
Veröffentlicht in: Genome Biology, Ausgabe 26, 2025, ISSN 1474-760X
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13059-025-03807-z

Virus-like transposons cross the species barrier and drive the evolution of genetic incompatibilities

Autoren: Sonya A. Widen, Israel Campo Bes, Alevtina Koreshova, Pinelopi Pliota, Daniel Krogull, Alejandro Burga
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 380, 2024, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.ade0705

36‐year study reveals stability of a wild wheat population across microhabitats

Autoren: Tal Dahan‐Meir, Thomas James Ellis, Fabrizio Mafessoni, Hanan Sela, Ori Rudich, Jacob Manisterski, Naomi Avivi‐Ragolsky, Amir Raz, Moshe Feldman, Yehoshua Anikster, Magnus Nordborg, Avraham A. Levy
Veröffentlicht in: Molecular Ecology, Ausgabe 33, 2024, ISSN 0962-1083
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.17512