The origin and evolution of Life in the universe

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Publications

Quorum sensing communication between lipid-based artificial cells

Auteurs: Antoni Llopis-Lorente; Bastiaan C. Buddingh'; R. Martínez-Máñez; Jan C. M. van Hest; Loai K. E. Abdelmohsen
Publié dans: Chemical Communications, 59(5), 579 - 582. Royal Society of Chemistry, Numéro Volume 59, Numéro 5, 2022, Page(s) 579 - 582, ISSN 1359-7345
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2cc05367e

On the diversity of F 420 ‐dependent oxidoreductases: A sequence‐ and structure‐based classification

Auteurs: María Laura Mascotti, Maximiliano Juri Ayub, Marco W. Fraaije
Publié dans: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, Numéro 89/11, 2021, Page(s) 1497-1507, ISSN 0887-3585
Éditeur: Wiley-Liss Inc
DOI: 10.1002/prot.26170

Role of Curvature-Sensing Proteins in the Uptake of Nanoparticles with Different Mechanical Properties

Auteurs: Daphne Montizaan, Catherine Saunders, Keni Yang, Sajitha Sasidharan, Sourav Maity, Catharina Reker-Smit, Marc C.A. Stuart, Costanza Montis, Debora Berti, Wouter H. Roos, Anna Salvati
Publié dans: Small, Numéro vol 19 , issue 39, 2023, Page(s) 2303267, ISSN 1613-6810
Éditeur: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202303267

Mutational and structural analysis of an ancestral fungal dye-decolorizing peroxidase

Auteurs: Ulises A. Zitare; Ulises A. Zitare; Mohamed H. Habib; Mohamed H. Habib; Henriëtte J. Rozeboom; María Laura Mascotti; María Laura Mascotti; Smilja Todorovic; Marco W. Fraaije
Publié dans: The FEBS Journal, Numéro VOLUME=288;ISSUE=11, 2020, Page(s) TARTPAGE=3602;ENDPAGE=3618, ISSN 1742-464X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.5281/zenodo.7190636

Achieving Control in Micro-/Nanomotor Mobility

Auteurs: Alexander D. Fusi, Yudong Li, Dr. A. Llopis-Lorente, Dr. Tania Patiño, Prof. Dr. Jan C. M. van Hest, Dr. Loai K. E. A. Abdelmohsen
Publié dans: Angewandte ChemieBron:Wiley Online Library: Complete Journals, Numéro volume 135, issue 5, 2023, ISSN 0044-8249
Éditeur: John Wiley and Sons,
DOI: 10.1002/ange.202214754

A comparative laboratory study of soft X-ray-induced ionization and fragmentation of five small PAH cations

Auteurs: Yining Huo, Mónica K. Espinoza Cangahuala, Vicente Zamudio-bayer, Marcelo Goulart, Markus Kubin, Martin Timm, J. Tobias Lau, Bernd von Issendorff, Ronnie Hoekstra, Shirin Faraji, Thomas Schlathölter
Publié dans: The European Physical Journal D, Numéro volume 77, issue 10, 2023, Page(s) 11 pages, ISSN 1434-6060
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1140/epjd/s10053-023-00763-w

Non-Linear Effects in Asymmetric Catalysis: Impact of Catalyst Precipitation

Auteurs: Yannick Geiger, Stéphane Bellemin-Laponnaz
Publié dans: ChemCatChem, Numéro vol 14, issue 9, 2022, Page(s) e202200165, pages 7, ISSN 1867-3880
Éditeur: Wiley - VCH Verlag GmbH & CO. KGaA
DOI: 10.1002/cctc.202200165

Temporal segregation of biosynthetic processes is responsible for metabolic oscillations during the budding yeast cell cycle

Auteurs: Vakil Takhaveev; Serdar Özsezen; Edward N. Smith; Andre Zylstra; Marten L. Chaillet; Haoqi Chen; Alexandros Papagiannakis; Andreas Milias-Argeitis; Matthias Heinemann
Publié dans: Nature Metabolism, Numéro volume 5, issue 2, 2023, Page(s) 294-313, ISSN 2522-5812
Éditeur: Nature Research
DOI: 10.3929/ethz-b-000601600

Bacterial multi-solute transporters

Auteurs: D J Slotboom*, T W Ettema, M Nijland, C Thangaratnarajah
Publié dans: FEBS Letters, Numéro vol 594, issue 23, 2020, Page(s) 3898-3907, ISSN 1742-4658
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/1873-3468.13912

Structural consequences of BMPR2 kinase domain mutations causing pulmonary arterial hypertension

Auteurs: Apirat Chaikuad, Chancievan Thangaratnarajah, Frank von Delft, Alex N Bullock
Publié dans: Scientific Reports, Numéro vol 9, issue 1, 2019, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-019-54830-7

Asymmetric Synthesis of Chiral‐at‐P Alkenylphosphonamidates through Nickel‐Catalyzed C−P Coupling of Phosphoramidites and Alkenyl Halides

Auteurs: Xiao‐Bing Chen; Damián Padín; Charlotte N. Stindt; Ben L. Feringa
Publié dans: Angewandte Chemie (International ed. in English, Numéro vol 62, number 33, 2023, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/ange.202307450

Metabolic dynamics during the cell cycle

Auteurs: Andre Zylstra, Matthias Heinemann
Publié dans: Current Opinion in Systems Biology, Numéro 24523100, 2022, ISSN 2452-3100
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.coisb.2022.100415

Observation of Hyperpositive Non-Linear Effect in Asymmetric Organozinc Alkylation in Presence of N-Pyrrolidinyl Norephedrine

Auteurs: Thibault Thierry, Yannick Geiger, Stéphane Bellemin-Laponnaz
Publié dans: Molecules, Numéro vol 27, issue12, 2022, Page(s) 9 pages, ISSN 1431-5157
Éditeur: MDPI AG
DOI: 10.3390/molecules27123780

Mutational and structural analysis of an ancestral fungal dye‐decolorizing peroxidase

Auteurs: Ulises A. Zitare, Mohamed H. Habib, Henriette Rozeboom, Maria L. Mascotti, Smilja Todorovic, Marco W. Fraaije
Publié dans: The FEBS Journal, 2020, ISSN 1742-464X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/febs.15687

Senescence in yeast is associated with amplified linear fragments of chromosome XII rather than ribosomal DNA circle accumulation

Auteurs: Andre Zylstra, Hanane Hadj-Moussa, Dorottya Horkai, Alex J. Whale, Baptiste Piguet, Jonathan Houseley
Publié dans: PLoS Biology, Numéro volume 21, issue 8, 2023, Page(s) 42 pages, ISSN 1544-9173
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002250

A target list for searching for habitable exomoons

Auteurs: Vera Dobos, András Haris, Inga E. E. Kamp, Floris F. S. van der Tak
Publié dans: Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Numéro 13652966, 2022, Page(s) 5290–5298, ISSN 1365-2966
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/mnras/stac1180

Endocytosis-like DNA uptake by cell wall-deficient bacteria

Auteurs: Renée Kapteijn, Shraddha Shitut, Dennis Aschmann, Le Zhang, Marit de Beer, Deniz Daviran, Rona Roverts, Anat Akiva, Gilles P. van Wezel, Alexander Kros & Dennis Claessen
Publié dans: Nature Communications, Numéro volume 13, issue 1, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33054-w

Engineering chemical communication between micro/nanosystems

Auteurs: Beatriz de Luis, Antoni Llopis-Lorente, Félix Sancenón and Ramón Martínez-Máñez
Publié dans: Chemical Society Reviews, Numéro 03060012, 2021, Page(s) 8829-8856, ISSN 0306-0012
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0cs01048k

Author Correction: CRISPR-based transcriptional activation tool for silent genes in filamentous fungi

Auteurs: László Mózsik, Mirthe Hoekzema, Niels A.W. de Kok, Roel A.L. Bovenberg, Yvonne Nygård, Arnold J.M. Driessen
Publié dans: Scientific Reports, Numéro vol 11, issue 1, 2021, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-99654-6

Artificial cells with viscoadaptive behavior based on hydrogel-loaded giant unilamellar vesicles

Auteurs: Antoni Llopis-Lorente, Maaike J. G. Schotman, Heorhii V. Humeniuk, Jan C. M. van Hest, Patricia Y. W. Dankers and Loai K. E. A. Abdelmohsen
Publié dans: Chemical Science, Numéro Numéro 2, 2024, 2024, Page(s) 629-638, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3sc04687g

Identification and characterization of archaeal and bacterial F420-dependent thioredoxin reductases

Auteurs: Guang Yang, Hein J Wijma, Henriëtte J Rozeboom, Maria Laura Mascotti, Marco W Fraaije
Publié dans: The FEBS Journal, Numéro volume 290, issue 19, 2023, Page(s) 4777-4791, ISSN 1742-464X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/febs.16896

Enantioselective Self-Replicators

Auteurs: Shuo Yang; Yannick Geiger; Marc Geerts; Marcel J. Eleveld; Armin Kiani; Sijbren Otto
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro volume 145, issue 30, 2023, Page(s) 16889-16898, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c05472

Long-term tidal evolution of the TRAPPIST-1 system

Auteurs: R. Brasser, G. Pichierri, V. Dobos, A. C. Barr
Publié dans: Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Numéro 13652966, 2022, Page(s) 2373–2385, ISSN 1365-2966
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/mnras/stac1907

All-Photochemical Rotation of Molecular Motors with a Phosphorus Stereoelement

Auteurs: Boursalian, Gregory B.; Nijboer, Eise R.; Dorel, Ruth; Pfeifer, Lukas; Markovitch, Omer; Blokhuis, Alex; Feringa, Ben L.
Publié dans: American Chemical Society, Numéro 142, 39, 2020, Page(s) 16868–16876, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.0c08249

A conserved sequence motif in the E. coli soluble FAD-containing pyridine nucleotide transhydrogenase is important for reaction efficiency

Auteurs: Michele Partipilo; Guang Yang; Maria Laura Mascotti; Hein J. Wijma; Dirk Jan Slotboom; Marco W. Fraaije
Publié dans: The Journal of Biological Chemistry, Numéro 298, issue 9, 2022, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102304

From the mysteries of the fly agaric: The toxin of the Amanita muscaria (Das Gift des Fliegenpilzes: Von den Geheimnissen des Narrenschwamms)

Auteurs: Sebastian Obermaier*, Michael Müller
Publié dans: Chemie in unserer zeit, Numéro vol 56, 2022, Page(s) """256--264", ISSN 0009-2851
Éditeur: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/ciuz.202000085

Small-molecule autocatalysis drives compartment growth, competition and reproduction

Auteurs: Heng Lu, Alex Blokhuis, Rebecca Turk-MacLeod, Jayaprakash Karuppusamy, Andrea Franconi, Gabrielle Woronoff, Cyrille Jeancolas, Afshin Abrishamkar, Estelle Loire, Fabien Ferrage, Philippe Pelupessy, Ludovic Jullien, Eörs Szathmary, Philippe Nghe & Andrew D. Griffiths
Publié dans: Nature Chemistry, Numéro nr 16, 2024, Page(s) 70-78, ISSN 1755-4349
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41557-023-01276-0

RNA-Protein Interactions in Molecular Life and Health: A Computational Approach

Auteurs: Driver, Mark D.; Onck, Patrick R.
Publié dans: Biophysical Journal, 120(3), 81A - 81A. CELL PRESS, Numéro 120, 2021, Page(s) 81A--81A, ISSN 0006-3495
Éditeur: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2020.11.702

Evolution of enzyme functionality in the flavin-containing monooxygenases

Auteurs: Gautier Bailleul, Guang Yang, Callum R Nicoll, Andrea Mattevi, Marco W Fraaije, Maria Laura Mascotti
Publié dans: Nature Communications, Numéro '14:1042, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-36756-x

Stoichiometry alone can steer supramolecular systems on complex free energy surfaces with high selectivity

Auteurs: Dávid Komáromy*, Theodora Tiemersma-Wegman, Johan Kemmink, Giuseppe Portale, Paul R. Adamski, Alex Blokhuis, Friso S. Aalbers, Ivana Marić, Guillermo Monreal Santiago, Jim Ottelé, Ankush Sood, Vittorio Saggiomo, Bin Liu, Pieter van der Meulen, Sijbren Otto
Publié dans: Chem, Numéro volume 7, 2021, Page(s) 1933--1951, ISSN 2451-9308
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.chempr.2021.05.020

Selective Disruption of Survivin's Protein-Protein Interactions: A Supramolecular Approach Based on Guanidiniocarbonylpyrrole

Auteurs: Dennis Aschmann, Dr. Cecilia Vallet, Dr. Sunil K. Tripathi, Dr. Yasser B. Ruiz-Blanco, Max Brabender, Prof. Dr. Carsten Schmuck, Prof. Dr. Elsa Sanchez-Garcia, Prof. Dr. Shirley K. Knauer, Prof.Dr. Michael Giese
Publié dans: ChemBioChem, Numéro issue 5, 2022, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202100618

Lipid-Based Nanoparticle Functionalization with Coiled-Coil Peptides for <i>In Vitro</i> and <i>In Vivo</i> Drug Delivery

Auteurs: Dennis Aschmann; Renzo A. Knol; Alexander Kros
Publié dans: Accounts of Chemical Research, Numéro 57, 8,, 2024, Page(s) 1098–1110, ISSN 0001-4842
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.accounts.3c00769

Cryo-EM studies of membrane proteins at 200 keV

Auteurs: Chancievan Thangaratnarajah, Jan Rheinberger, Cristina Paulino
Publié dans: Current Opinion in Structural Biology, Numéro volume 76, 2022, ISSN 1879-033X
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.sbi.2022.102440

Ancestral-sequence reconstruction unveils the structural basis of function in mammalian FMOs

Auteurs: Callum R Nicoll, Gautier Bailleul, Filippo Fiorentini, María Laura Mascotti, Marco W Fraaije*, Andrea Mattevi
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, Numéro vol 27, 2019, Page(s) 14-24, ISSN 1545-9985
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-019-0347-2

Structural properties of the HNF-1A transactivation domain

Auteurs: Laura Kind; Mark Driver; Arne Raasakka; Patrick R. Onck; Pål Rasmus Njølstad; Thomas Arnesen; Petri Kursula
Publié dans: JournalFrontiers in Molecular Biosciences, Numéro volume 10, 2023, ISSN 2296-889X
Éditeur: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.1101/2023.06.23.546236

Motility of Active Microparticles in Cell-Sized Lipid Vesicles

Auteurs: Shidong Song; Antoni Llopis-Lorente; Alexander F. Mason; Loai K. E. A. Abdelmohsen; Jan C. M. van Hest
Publié dans: ournal of the American Chemical Society, Numéro volume 144, issue 30, 2022, Page(s) 13831–13838, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c05232

Multi-site-specific polymer grafting from nucleic acids

Auteurs: Sandeepa K. Vittala 1, Roxanne E. Kieltyka
Publié dans: Chem, Numéro Vol 9 , issue 11, 2023, Page(s) Pages 3018-3020, ISSN 2451-9308
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.chempr.2023.10.012

Impact of ancestral sequence reconstruction on mechanistic and structural enzymology

Auteurs: Callum R Nicoll, Marta Massari, Marco W Fraaije, Maria Laura Mascotti, Andrea Mattevi
Publié dans: Current Opinion in Structural Biology, Numéro volume 82, 2023, Page(s) article number 102669, ISSN 0959-440X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2023.102669

Universal motifs and the diversity of autocatalytic systems

Auteurs: Alex Blokhuis*, David Lacoste, Philippe Nghe
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Numéro volume 117, nr 41, 2020, Page(s) 25230-25236, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2013527117

Ancestral reconstruction of mammalian FMO1 enables structural determination, revealing unique features that explain its catalytic properties

Auteurs: Gautier Bailleul, Callum R. Nicoll, María Laura Mascotti, Andrea Mattevi, Marco W. Fraaije
Publié dans: Journal of Biological Chemistry, Numéro 296, 2021, Page(s) 100221, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.ra120.016297

Horseradish Peroxidase-Functionalized Gold Nanoconjugates for Breast Cancer Treatment Based on Enzyme Prodrug Therapy

Auteurs: Gema Vivo-Llorca; Ángela Morellá-Aucejo; Alba García-Fernández; Paula Díez; Antoni Llopis-Lorente; Mar Orzáez; Ramón Martínez-Máñez
Publié dans: International Journal of Nanomedicine, Numéro 17, 2022, Page(s) Pages 409 - 422, ISSN 1176-9114
Éditeur: Dove Medical Press Ltd
DOI: 10.2147/ijn.s323802

Reconstructing the evolutionary history of F-420-dependent dehydrogenases

Auteurs: M Laura Mascotti, Hemant Kumar, Quoc-Thai Nguyen, Maximiliano Juri Ayub, Marco W. Fraaije
Publié dans: Scientific Reports, Numéro vol 8, issue 1, 2018, Page(s) 8, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-35590-2

Impacts of Severe Tropical Cyclone Olwyn and the biogeomorphic response, Hamelin Pool, Shark Bay, Western Australia

Auteurs: Thérèse E. Morris, Stephen Morris, Peter R.C.S. Fearns, Aditya Chopra, Mehrooz F. Aspandair, Lindsay B. Collins, Micheal J. O'Leary, Pieter T. Visscher
Publié dans: The Depositional Record, Numéro 20554877, 2022, Page(s) 786-828, ISSN 2055-4877
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/dep2.183

Natamycin sequesters ergosterol and interferes with substrate transport by the lysine transporter Lyp1 from yeast

Auteurs: Maria Szomek; Peter Reinholdt; Hanna-Loisa Walther; Holger A. Scheidt; Peter Müller; Sebastian Obermaier; Bert Poolman; Jacob Kongsted; Daniel Wüstner
Publié dans: Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes, 1864(11):184012, Numéro 3, 2022, ISSN 0005-2736
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbamem.2022.184012

Key features of inhibitor binding to the human mitochondrial pyruvate carrier hetero-dimer

Auteurs: Sotiria Tavoulari*, Tom J J Schirris, Vasiliki Mavridou, Chancievan Thangaratnarajah, Martin S King, Daniel T D Jones, Shujing Ding, Ian M Fearnley, Edmund R S Kunji
Publié dans: Molecular metabolism, Numéro vol 60, 2022, Page(s) 101469, 13 pages, ISSN 2212-8778
Éditeur: Elsevier GmbH
DOI: 10.1016/j.molmet.2022.101469

Complexes with Atomic Gold Ions: Efficient Bis-Ligand Formation

Auteurs: Felix Duensing, Elisabeth Gruber, Paul Martini, Marcelo Goulart, Michael Gatchell, Bilal Rasul, Olof Echt, Fabio Zappa, Masoomeh Mahmoodi-Darian*, Paul Scheier
Publié dans: Molecules, Numéro volume 26, 2021, ISSN 1431-5157
Éditeur: MDPI AG
DOI: 10.3390/molecules26123484

CRISPR-based transcriptional activation tool for silent genes in filamentous fungi

Auteurs: László Mózsik, Mirthe Hoekzema, Niels A W de Kok, Roel A L Bovenberg, Yvonne Nygård, Arnold J M Driessen
Publié dans: Scientific Reports, Numéro vol 11, issue 1, 2021, Page(s) 13 pages, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-80864-3

Switching the Mode of Drug Release from a Reaction-Coupled Low-Molecular-Weight Gelator System by Altering Its Reaction Pathway

Auteurs: Willem E. M. Noteborn; Sandeepa K. Vittala; Maria Broto Torredemer; Chandan Maity; Frank Versluis; Rienk Eelkema; Roxanne E. Kieltyka
Publié dans: Biomacromolecules, 24(1), 377 - 386. AMER CHEMICAL SOC, Numéro 24, 2023, ISSN 1525-7797
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.biomac.2c01197

The SLC25 Carrier Family: Important Transport Proteins in Mitochondrial Physiology and Pathology

Auteurs: Edmund R. S. Kunji, Martin S. King, Jonathan J. Ruprecht, Chancievan Thangaratnarajah
Publié dans: Physiology, Numéro 35/5, 2020, Page(s) 302-327, ISSN 1548-9213
Éditeur: American Physiological Society
DOI: 10.1152/physiol.00009.2020

Insights into the bilayer-mediated toppling mechanism of a folate-specific ECF transporter by cryo-EM

Auteurs: Chancievan Thangaratnarajah, Jan Rheinberger, Cristina Paulino, Dirk J. Slotboom
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 118/34, 2021, Page(s) e2105014118, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2105014118

"Soft-x-ray spectroscopy of <mml:math xmlns:mml=""http://www.w3.org/1998/Math/MathML""><mml:msup><mml:mi mathvariant=""normal"">coronene</mml:mi><mml:mo>+</mml:mo></mml:msup></mml:math> and <mml:math xmlns:mml=""http://www.w3.org/1998/Math/MathML""><mml:msup><mml:mrow><mml:mo>(</mml:mo><mml:mtext>coronene</mml:mtext><mml:mo>+</mml:mo><mml:mi mathvariant=""normal"">H</mml:mi><mml:mo>)</mml:mo></mml:mrow><mm"

Auteurs: Yining Huo; Mónica K. Espinoza Cangahuala; Marcelo Goulart; Vicente Zamudio-Bayer; Markus Kubin; Martin Timm; J. Tobias Lau; Bernd von Issendorff; Ronnie Hoekstra; Shirin Faraji; Thomas Schlathölter
Publié dans: Physical Review A - Atomic, Molecular, and Optical Physics, Numéro volume 106, issue 6, 2022, Page(s) 11, ISSN 2469-9926
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physreva.106.063104

Bidirectional ATP-driven transport of cobalamin by the mycobacterial ABC transporter BacA

Auteurs: Mark Nijland; Solène N. Lefebvre; Chancievan Thangaratnarajah; Dirk J. Slotboom
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15 / 1, 2024, Page(s) 9 pages, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-46917-1

Survival of Exomoons Around Exoplanets

Auteurs: V. Dobos, S. Charnoz, A. Pál, A. Roque-Bernard, Gy. M. Szabó
Publié dans: Publications of the Astronomical Society of the Pacific, Numéro 133/1027, 2021, Page(s) 094401, ISSN 0004-6280
Éditeur: University of Chicago Press
DOI: 10.1088/1538-3873/abfe04

Evolutionary and structural analyses of the NADPH oxidase family in eukaryotes reveal an initial calcium dependency

Auteurs: Marta Massari; Callum R. Nicoll; Sara Marchese; Andrea Mattevi; Maria Laura Mascotti
Publié dans: Redox Biology, Numéro volume 56, October, 2022, ISSN 2213-2317
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.redox.2022.102436

Turning Enantiomeric Relationships into Diastereomeric Ones: Self-Resolving α-Ureidophosphonates and Their Organocatalytic Enantioselective Synthesis

Auteurs: Vanda Dašková; Damián Padín; Ben L. Feringa
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 8, weekly, 2022, ISSN 1520-5126
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c10911

Expulsion mechanism of the substrate-translocating subunit in ECF transporters

Auteurs: Chancievan Thangaratnarajah, Mark Nijland, Luís Borges-Araújo, Aike Jeucken, Jan Rheinberger, Siewert J. Marrink, Paulo C. T. Souza, Cristina Paulino & Dirk J. Slotboom
Publié dans: Nature Communications, Numéro issue 1, article 4484, 2023, Page(s) 14 pages, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-40266-1

Investigating the biochemical signatures and physiological roles of the FMO family using molecular phylogeny

Auteurs: C. R. Nicoll, M. L. Mascotti
Publié dans: BBA Advances, Numéro volume 4, 2023, Page(s) article 100108, ISSN 2667-1603
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.bbadva.2023.100108

Pathogenic variants of the mitochondrial aspartate/glutamate carrier causing citrin deficiency

Auteurs: Sotiria Tavoulari, Denis Lacabanne, Chancievan Thangaratnarajah, Edmund R S Kunji*
Publié dans: Trends in endocrinology and metabolism, Numéro vol 33, issue 8, 2022, Page(s) 539-553, ISSN 1043-2760
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tem.2022.05.002

One Soai reaction, two mechanisms?

Auteurs: Yannick Geiger
Publié dans: Chemical Society Reviews, Numéro 14604744, 2022, ISSN 1460-4744
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cs01038g

Light-driven eco-evolutionary dynamics in a synthetic replicator system

Auteurs: Kai Liu, Alex Blokhuis, Chris van Ewijk, Armin Kiani, Juntian Wu, Wouter H Roos, Sijbren Otto
Publié dans: Nature Chemistry, Numéro 16, 2024, Page(s) 79–88, ISSN 1755-4330
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41557-023-01301-2

A mycobacterial ABC transporter mediates the uptake of hydrophilic compounds

Auteurs: Stephan Rempel, Cornelius Gati, Mark Nijland, Chancie Thangaratnarajah, Alexandros Karyolaimos, Jan-Willem L. de Gier, Albert Guskov, Dirk Slotboom*
Publié dans: Nature, Numéro vol 580 issue 7803, 2020, Page(s) 409-412, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2072-8

An X-ray spectroscopy study of structural stability of superhydrogenated pyrene derivatives

Auteurs: Yining Huo, Mónica Espinoza Cangahuala, Vicente Zamudio-Bayer, Marcelo Goulart, Markus Kubin, Martin Timm, J Tobias Lau, Bernd von Issendorff, Ronnie Hoekstra, Shirin Faraji, Thomas Schlathölter
Publié dans: Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Numéro 523 /1, 2023, Page(s) 865-875, ISSN 1365-2966
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/mnras/stad1341

Chemical Cascading Between Polymersomal Nanoreactor Populations

Auteurs: Yigit Altay, Antoni Llopis-Lorente, Loai K. E. A. Abdelmohsen, Jan C.M. van Hest
Publié dans: Macromolecular Chemistry and Physics, Numéro Volume 224, Numéro 1, 2023, ISSN 1022-1352
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/macp.202200269

Exploring Intra- and Inter-Regional Interactions in the IDP α-Synuclein Using smFRET and MD Simulations

Auteurs: Gobert Heesink; Mirjam J. Marseille; Mohammad A. A. Fakhree; Mark D. Driver; Kirsten A. van Leijenhorst-Groener; Patrick R. Onck; Christian Blum; Mireille M.A.E. Claessens
Publié dans: Biomacromolecules, Numéro volume 24, issue 8, 2023, Page(s) 3680–3688, ISSN 1525-7797
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.biomac.3c00404

Residues Ala420 and Glu466 allow for efficient catalysis of syringyl derivatives

Auteurs: Daniel Eggerichs; Nils Weindorf; Maria Laura Mascotti; Natalie Welzel; Marco W. Fraaije; Dirk Tischler
Publié dans: The Journal of Biological Chemistry, Numéro volume 13, issue 7, 2023, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2023.104898

In vitro and in vivo evaluation of clinically-approved ionizable cationic lipids shows divergent results between mRNA transfection and vaccine efficacy

Auteurs: Oscar Escalona-Rayo , Ye Zeng , Renzo A. Knol , Thomas J.F. Kock , Dennis Aschmann , Bram Slütter , Alexander Kros
Publié dans: Biomedicine & Pharmacotherapy, Numéro vol 165, 2023
Éditeur: Elsevier Masson SAS
DOI: 10.1016/j.biopha.2023.115065

Water content of rocky exoplanets in the habitable zone

Auteurs: Ádám Boldog, Vera Dobos, László L. Kiss, Marijn van der Perk and Amy C. Barr
Publié dans: Astronomy & Astrophysics, Numéro Volume 681,, 2024, Page(s) 13 pages
Éditeur: EDP Sciences
DOI: 10.1051/0004-6361/202346988

Hybrid Biodegradable Nanomotors through Compartmentalized Synthesis

Auteurs: Imke AB Pijpers, Shoupeng Cao, Antoni Llopis-Lorente, Jianzhi Zhu, Shidong Song, Rick RM Joosten, Fenghua Meng, Heiner Friedrich, David S Williams, Samuel Sánchez, Jan CM van Hest, Loai KEA Abdelmohsen
Publié dans: Nano Letters, Numéro issue 20 / 6, 2020, Page(s) 4472-4480
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.0c01268

PyATMOS: A Scalable Grid of Hypothetical Planetary Atmospheres

Auteurs: Chopra, Aditya ; Bell, Aaron C ; Fawcett, William ; Talebi, Rodd ; Angerhausen, Daniel ; Güneş Baydin, Atılım ; Berea, Anamaria ; Cabrol, Nathalie A. ; Kempes, Christopher ; Mascaro, Massimo
Publié dans: astro-ph > arXiv:2308.10624, 2023, Page(s) 9 pages
Éditeur: Astrophysics Data System
DOI: 10.48550/arxiv.2308.10624

EXO-ATMOS: A scalable grid of hypothetical planetary atmospheres

Auteurs: Chopra, Aditya ; Bell, Aaron ; Fawcett, William ; Talebi, Rodd ; Angerhausen, Daniel ; Güneş Baydin, Atılım ; Berea, Anamaria ; Cabrol, Nathalie A. ; Kempes, Christopher P. ; Mascaro, Massimo
Publié dans: 14th Europlanet Science Congress 2020, held virtually, 21 September 2020 - 9 October, 2020., 2020
Éditeur: Astrophysics Data System
DOI: 10.5194/epsc2020-664

The Biological Overview Effect

Auteurs: Lineweaver, Charles H. ; Chopra, Aditya
Publié dans: Astrophysics and Space Science Proceedings, Numéro volume 58, 2021, ISBN 978-3-030-70482-7
Éditeur: springer
DOI: 10.1007/978-3-030-70482-7_11

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