Description du projet
La réparation de l’ADN pourrait impliquer des dommages collatéraux
Les lésions de l’ADN surviennent continuellement tout au long de la vie. Avec une exposition à des produits chimiques nocifs, à des processus pathologiques et au vieillissement naturel, l’ADN est endommagé — et l’organisme dispose de mécanismes pour le réparer. Alors que de nombreuses recherches ont élucidé les mécanismes de la réparation de l’ADN relatifs aux séquences codant des protéines, nous savons relativement peu de choses sur le rôle potentiel des régions épigénétiques dans le processus de réparation, et inversement. Les éléments épigénétiques sont des régions de l’ADN qui régulent l’expression génétique par le biais de changements physiques comme la méthylation. Le projet EpigeneticScars, financé par l’UE, utilise des capteurs de la réparation des cassures double brin (CDB) de l’ADN afin de localiser les sites de réparation. L’étude de ces sites pourrait permettre de savoir si le paysage épigénétique naturel influence le processus de réparation, et si ce processus comporte des effets épigénétiques sur le long terme (voire héréditaires) pour le site de la réparation.
Objectif
DNA safekeeping is one of the most important functions of the cell. Since DNA damage occurs in the context of chromatin, it affects both the DNA itself, but also the epigenetic landscape. While the repair mechanism of the DNA has been extensively studied, questions abound regarding the restoration of the epigenetic landscape, and the long-term effects that damage leaves in the region. In this proposal I aim to address these questions using modified DSBs repair sensors from different pathways such as “homologous recombination” and “non-homologous end joining” to map the repair process. Our method will allow us to investigate the influence of the natural epigenetic landscape on pathway choice, the dynamic process of repair and the restoration of the region. Moreover, we will investigate whether certain repair processes leave long- lasting effects at the site of damage or even “epigenetic scars”. The advantage of our method is that it allows us to map each sensor repair time-line in an unbiased and high throughput manner over extended periods of time, even once the damage is already repaired. These questions are especially important for our understanding of ageing, and age-related diseases that are driven by DNA damage. Last, we will test the long-lasting effects of past damage in two different contexts: animal models of neurodegeneration, where DNA damage accumulates, and in the efficiency of reprograming to produce healthy induced pluripotent stem cells (IPCs).
Champ scientifique
- natural sciencesbiological sciencesneurobiology
- natural sciencesbiological sciencesgeneticsDNA
- medical and health sciencesmedical biotechnologycells technologiesstem cells
- engineering and technologyelectrical engineering, electronic engineering, information engineeringelectronic engineeringsensors
- natural sciencesbiological sciencesgeneticsepigenetics
Programme(s)
Thème(s)
Régime de financement
ERC-STG - Starting GrantInstitution d’accueil
84105 Beer Sheva
Israël