The dark side of evolution: the deleterious mutational landscape of RNA viruses

Informations projet

RNAVirFitness

N° de convention de subvention: 852223

DOI

10.3030/852223

Projet clôturé

Date de signature de la CE 10 Février 2020

Date de début 1 Juin 2020

Date de fin 31 Mars 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 495 625,00

Contribution de l’UE

€ 1 495 625,00

Coordonné par

TEL AVIV UNIVERSITY
Israel

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Publications

Peer reviewed articles (6)

Navigating a Fine Balance: Point-Mutant Cheater Viruses Disrupt the Viral Replication Cycle

Auteurs: Moran Meir, Arielle Kahn, Carmel Farage, Yael Maoz, Noam Harel, Adi Ben Zvi, Shir Segev, Maria Volkov, Ravit Yahud, Uri Gophna, Adi Stern
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, Numéro 42, 2025, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msae258

Mutation rate, selection, and epistasis inferred from RNA virus haplotypes via neural posterior estimation

Auteurs: Itamar Caspi, Moran Meir, Nadav Ben Nun, Reem Abu Rass, Uri Yakhini, Adi Stern, Yoav Ram
Publié dans: Virus Evolution, 2023, ISSN 2057-1577
Éditeur: Oxford university press
DOI: 10.1093/ve/vead033

Drivers of adaptive evolution during chronic SARS-CoV-2 infections

Auteurs: Sheri Harari, Maayan Tahor, Natalie Rutsinsky, Suzy Meijer, Danielle Miller, Oryan Henig, Ora Halutz, Katia Levytskyi, Ronen Ben-Ami, Amos Adler, Yael Paran & Adi Stern
Publié dans: Nature Medicine, 2022, ISSN 1078-8956
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-022-01882-4

Using big sequencing data to identify chronic SARS-Coronavirus-2 infections

Auteurs: Sheri Harari, Danielle Miller, Shay Fleishon, David Burstein, Adi Stern
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-44803-4

Evidence for increased breakthrough rates of SARS-CoV-2 variants of concern in BNT162b2-mRNA-vaccinated individuals

Auteurs: Talia Kustin, Noam Harel, Uriah Finkel, Shay Perchik, Sheri Harari, Maayan Tahor, Itamar Caspi, Rachel Levy, Michael Leshchinsky, Shifra Ken Dror, Galit Bergerzon, Hala Gadban, Faten Gadban, Eti Eliassian, Orit Shimron, Loulou Saleh, Haim Ben-Zvi, Elena Keren Taraday, Doron Amichay, Anat Ben-Dor, Dana Sagas, Merav Strauss, Yonat Shemer Avni, Amit Huppert, Eldad Kepten, Ran D. Balicer, Doron Netzer
Publié dans: Nature Medicine, Numéro 27/8, 2021, Page(s) 1379-1384, ISSN 1078-8956
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-021-01413-7

Diverse patterns of intra-host genetic diversity in chronically infected SARS-CoV-2 patients

Auteurs: Natalie Rutsinsky, Adi Ben Zvi, Ido Fabian, Shir T. Segev, Bar Jacobi, Sheri Harari, Suzy Meijers, Yael Paran, Adi Stern
Publié dans: Virus Evolution, 2026, ISSN 2057-1577
Éditeur: Oxford Academix Press
DOI: 10.1101/2024.11.23.624482