Methane and Ammonium Removal In redoX transition zones

Información del proyecto

MARIX

Identificador del acuerdo de subvención: 854088

DOI

10.3030/854088

Fecha de la firma de la CE 5 Febrero 2020

Fecha de inicio 1 Marzo 2020

Fecha de finalización 31 Agosto 2027

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 7 610 000,00

Aportación de la UE

€ 7 610 000,00

Coordinado por

STICHTING RADBOUD UNIVERSITEIT
Netherlands

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Publicaciones

Peer reviewed articles (34)

Sedimentary molybdenum and uranium: Improving proxies for deoxygenation in coastal depositional environments

Autores: K. Mareike Paul, NIels A.G.M. van Helmond, Caroline P. Slomp, Sami A. Jokinen, Joonas J. Virtasal, Helena L. Filipsson, Tom Jilbert
Publicado en: Chemical Geology, Edición 651, 2023, ISSN 0346-251X
Editor: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.chemgeo.2022.121203

Nitrate Leaching and its Implication for Fe and as Mobility in a Southeast Asian Aquifer

Autores: Martyna Glodowska; Yinxiao Ma; Garrett Smith; Andreas Kappler; Mike Jetten; Cornelia U. Welte
Publicado en: FEMS Microbiology Ecology, Edición 1, 2023, Página(s) 1-10, ISSN 1574-6941
Editor: Oxford
DOI: 10.2139/ssrn.4255499

Amsterdam urban canals contain novel niches for methane-cycling microorganisms

Autores: Pelsma, Koen A.J. Zandt, M.H. in 't Camp, Huub J.M. Op den Jetten, Mike S.M. Dean, J.F. Welte, C.U.
Publicado en: environmental microbiology, Edición 24, 2022, Página(s) 82-97, ISSN 1462-2920
Editor: ami
DOI: 10.1111/1462-2920.15864

Effects of redox variability and early diagenesis on marine sedimentary Hg records

Autores: J. Frieling, T.A. Mather, C. Marz, H.C. Jenkyns, R. Hennekam, G.-j.Reichart C. P. Slomp, N.A.G.M. van Helmond
Publicado en: Geochimica et Cosmochimica Acta, Edición 351, 2023, Página(s) 78-95, ISSN 0346-251X
Editor: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.gca.2023.04.015

Characterization of a nitrite-reducing octaheme hydroxylamine oxidoreductase that lacks the tyrosine cross-link

Autores: Christina Ferousi, Rob A. Schmitz, Wouter J. Maalcke, Simon Lindhoud, Wouter Versantvoort, Mike S.M. Jetten, Joachim Reimann, Boran Kartal
Publicado en: Journal of Biological Chemistry, Edición 296, 2021, Página(s) 100476, ISSN 0021-9258
Editor: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2021.100476

Novel and unusual genes for nitrogen and metal cycling in <i>Planctomycetota</i>- and KSB1-affiliated metagenome-assembled genomes reconstructed from a marine subsea tunnel

Autores: Carolina Suarez; Thomas Hackl; Britt-Marie Wilen; Frank Persson; Per Hagelia; Mike S M Jetten; Paula Dalcin Martins
Publicado en: FEMS Microbiology Letters, 370, pp. 1-10, Edición 5, 2022, Página(s) 1-10, ISSN 1574-6968
Editor: fems
DOI: 10.1093/femsle/fnad049

Methanotrophic potential of Dutch canal wall biofilms is driven by <i>Methylomonadaceae</i>

Autores: Koen A J Pelsma; Daniël A M Verhagen; Joshua F Dean; Mike S M Jetten; Cornelia U Welte
Publicado en: FEMS Microbiology Ecology, 99, 10, pp. 1-9, Edición 2, 2023, Página(s) 1-9, ISSN 1574-6941
Editor: Oxford
DOI: 10.1093/femsec/fiad110

Methanethiol Consumption and Hydrogen Sulfide Production by the Thermoacidophilic Methanotroph Methylacidiphilum fumariolicum SolV

Autores: Rob A. Schmitz; Sepehr S. Mohammadi; Timo van Erven; Tom Berben; Mike S. M. Jetten; Arjan Pol; Huub J. M. Op den Camp
Publicado en: frontiers in microbiology, Edición 5, 2022, Página(s) 1-10, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2022.857442

Microbial activity, methane production, and carbon storage in Early Holocene North Sea peats

Autores: Lippmann, T.J.R., M.H. in ’t Zandt, N.N.L. van der Putten, F.S. Busshers, M.P. Hijma, P. van der Velden, T. de Groot, Z. van Aalderen, O.H. Meisel, C.P. Slomp, H. Niemann, M.S.M. Jetten, H.A.J. Dolman, C.U. Welte
Publicado en: Biogeosciences, Edición 18, 2021, Página(s) 5491-5511, ISSN 1726-4170
Editor: European Geosciences Union (EGU).
DOI: 10.5194/bg-18-5491-2021

Pathways of methane removal in the sediment and water column of a seasonally anoxic eutrophic marine basin

Autores: Olga M. Żygadłowska, Jessica Venetz Robin Klomp, Wytze K. Lenstra, Niels A. G. M. van Helmond, Thomas Röckmann, Anna J. Wallenius, Paula Dalcin Martins, Annelies J. Veraart, Mike S. M. Jetten, Caroline P. Slomp
Publicado en: frontiers in marine science, 2023, Página(s) 1-10, ISSN 2296-7745
Editor: frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2023.1085728

Metascan: METabolic Analysis, SCreening and ANnotation of Metagenomes

Autores: Geert Cremers; Mike S. M. Jetten; Huub J. M. Op den Camp; Sebastian Lücker
Publicado en: urn:issn:1664-302X, Edición 5, 2022, Página(s) 1-12, ISSN 2673-7647
Editor: frontiers
DOI: 10.3389/fbinf.2022.861505

A Novel Laboratory-Scale Mesocosm Setup to Study Methane Emission Mitigation by Sphagnum Mosses and Associated Methanotrophs

Autores: Martine A. R. Kox, Alfons J. P. Smolders, Daan R. Speth, Leon P. M. Lamers, Huub J. M. Op den Camp, Mike S. M. Jetten, Maartje A. H. J. van Kessel
Publicado en: Frontiers in Microbiology, Edición 12, 2021, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.651103

Simultaneous Anaerobic and Aerobic Ammonia and Methane Oxidation under Oxygen Limitation Conditions

Autores: Maartje A. H. J. van Kessel, Karin Stultiens, Arjan Pol, Mike S. M. Jetten, Boran Kartal, Huub J. M. Op den Camp
Publicado en: Applied and Environmental Microbiology, Edición 87/13, 2021, ISSN 0099-2240
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aem.00043-21

Structural and functional characterization of the intracellular filament-forming nitrite oxidoreductase multiprotein complex

Autores: Tadeo Moreno Chicano, Lea Dietrich, Naomi M. de Almeida, Mohd. Akram, Elisabeth Hartmann, Franziska Leidreiter, Daniel Leopoldus, Melanie Mueller, Ricardo Sánchez, Guylaine H. L. Nuijten, Joachim Reimann, Kerstin-Anikó Seifert, Ilme Schlichting, Laura van Niftrik, Mike S. M. Jetten, Andreas Dietl, Boran Kartal, Kristian Parey, Thomas R. M. Barends
Publicado en: Nature Microbiology, Edición 6/9, 2021, Página(s) 1129-1139, ISSN 2058-5276
Editor: springer Nature
DOI: 10.1038/s41564-021-00934-8

Probing Denitrifying Anaerobic Methane Oxidation via Antimicrobial Intervention: Implications for Innovative Wastewater Management

Autores: Martijn Wissink; Martyna Glodowska; Marnix R. van der Kolk; Mike S. M. Jetten; Cornelia U. Welte
Publicado en: Crossref, Edición 3, 2024, Página(s) 6250–6257, ISSN 2409-7632
Editor: acs
DOI: 10.1021/acs.est.3c07197

Unraveling Nitrogen, Sulfur, and Carbon Metabolic Pathways and Microbial Community Transcriptional Responses to Substrate Deprivation and Toxicity Stresses in a Bioreactor Mimicking Anoxic Brackish Coastal Sediment Conditions

Autores: Paula Dalcin Martins, Maider J. Echeveste Medrano†, Arslan Arshad, Julia M. Kurth, Heleen T. Ouboter, Huub J. M. Op den Camp, Mike S. M. Jetten and Cornelia U. Welte*
Publicado en: frontiers in microbiology, Edición feb 2022, 2022, Página(s) 1-8, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2022.798906

Regulation of coastal methane sinks by a structured gradient of microbial methane oxidizers

Autores: Zhanfei He, Jiaqi Wang, Jiajie Hu, Hanqing Yu, Mike S.M. Jetten, Huan Liu, Chaoyang Cai, Yan Liu, Hongxing Ren, Xu Zhang, Miaolian Hua, Xinhua Xu, Ping Zheng, Baolan Hu
Publicado en: Environmental Pollution, Edición 244, 2019, Página(s) 228-237, ISSN 0269-7491
Editor: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.envpol.2018.10.057

Versatile methanotrophs form an active methane biofilter in the oxycline of a seasonally stratified coastal basin

Autores: Jessica Venetz; Olga M. Żygadłowska; Wytze K. Lenstra; Niels A.G.M. van Helmond; Guylaine H.L. Nuijten; Anna J. Wallenius; Paula Dalcin Martins; Caroline P. Slomp; Mike S.M. Jetten; Annelies J. Veraart
Publicado en: Environmental Microbiology, 25, 11, pp. 2277-2288, Edición 6, 2023, ISSN 1462-2920
Editor: ami
DOI: 10.1101/2022.10.28.513710

Metagenomic evidence of a novel family of anammox bacteria in a subsea environment

Autores: Carolina Suarez, Paula Dalcin Martins, Mike Jetten, Sabina Karačić, Britt Marie Wilén, Oskar Modin, Per Hagelia, Malte Hermansson, Frank Persson
Publicado en: environmental microbiology, Edición 1, 2022, Página(s) 1-10, ISSN 1462-2912
Editor: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.16006

Seasonal dynamics of the microbial methane filter in the water column of a eutrophic coastal basin

Autores: Jessica Venetz, Olga M Żygadłowska, Nicky Dotsios, Anna J Wallenius, Niels A G M van Helmond, Wytze K Lenstra, Robin Klomp, Caroline P Slomp, Mike S M Jetten, Annelies J Veraart
Publicado en: FEMS Microbiology Ecology, 2024, Página(s) 1-12, ISSN 1574-6941
Editor: Oxford Academic
DOI: 10.1093/femsec/fiae007

Selective enrichment and metagenomic analysis of three novel comammox Nitrospira in a urine-fed membrane bioreactor

Autores: Jiyun Li, Zheng-Shuang Hua, Tao Liu, Chengwen Wang, Jie Li, Ge Bai, Sebastian Lücker, Mike S. M. Jetten, Min Zheng, Jianhua Guo
Publicado en: ISME Communications, Edición 1/1, 2021, ISSN 2730-6151
Editor: isme
DOI: 10.1038/s43705-021-00005-3

Autotrophic and mixotrophic metabolism of an anammox bacterium revealed by in vivo 13C and 2H metabolic network mapping

Autores: Christopher E. Lawson, Guylaine H. L. Nuijten, Rob M. de Graaf, Tyler B. Jacobson, Martin Pabst, David. M. Stevenson, Mike S. M. Jetten, Daniel R. Noguera, Katherine D. McMahon, Daniel Amador-Noguez, Sebastian Lücker
Publicado en: The ISME Journal, Edición 15/3, 2021, Página(s) 673-687, ISSN 1751-7362
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-020-00805-w

Gene-Based Modeling of Methane Oxidation in Coastal Sediments: Constraints on the Efficiency of the Microbial Methane Filter

Autores: Wytze K. Lenstra; Niels A. G. M. van Helmond; Paula Dalcin Martins; Anna J. Wallenius; Mike S. M. Jetten; Caroline P. Slomp
Publicado en: Environmental Science & Technology, 57, 34, pp. 1-10, Edición 6, 2023, ISSN 1520-5851
Editor: acs
DOI: 10.1021/acs.est.3c02023

Mechanisms of extracellular electron transfer in anaerobic methanotrophic archaea

Autores: Heleen T. Ouboter, Rob Mesman, Tom Sleutels, Jelle Postma, Martijn Wissink, Mike S. M. Jetten, Annemiek Ter Heijne, Tom Berben, Cornelia U. Welte
Publicado en: Nature communications, 2024, Página(s) 1-12, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-45758-2

Sediments as a Source of Iron, Manganese, Cobalt and Nickel to Continental Shelf Waters (Louisiana, Gulf of Mexico)

Autores: Wytze K. Lenstra, Niels A. G. M. van Helmond, Olga M. Żygadłowska, Roosmarijn van Zummeren, Rob Witbaard and Caroline P. Slomp
Publicado en: Frontiers in Marine Sciences, Edición 1, 2022, Página(s) 1-8, ISSN 2296-7745
Editor: frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2022.811953

A sequential extraction procedure for particulate manganese and its application to coastal marine sediments

Autores: W.K.Lenstra, R. Klomp, F.Molema, T.Behrends,C.P.Slomp
Publicado en: Chemical Geology, Edición 1, 2021, Página(s) 1-10, ISSN 0009-2541
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.chemgeo.2021.120538

Investigating the Chemolithoautotrophic and Formate Metabolism of Nitrospira moscoviensis by Constraint-Based Metabolic Modeling and 13 C-Tracer Analysis

Autores: Christopher E. Lawson, Aniela B. Mundinger, Hanna Koch, Tyler B. Jacobson, Coty A. Weathersby, Mike S. M. Jetten, Martin Pabst, Daniel Amador-Noguez, Daniel R. Noguera, Katherine McMahon, Sebastian Lücker
Publicado en: mSystems, Edición 6/4, 2021, ISSN 2379-5077
Editor: asm
DOI: 10.1128/msystems.00173-21

Enrichment of novel Verrucomicrobia , Bacteroidetes , and Krumholzibacteria in an oxygen‐limited methane‐ and iron‐fed bioreactor inoculated with Bothnian Sea sediments

Autores: Paula Dalcin Martins, Anniek Jong, Wytze K. Lenstra, Niels A. G. M. Helmond, Caroline P. Slomp, Mike S. M. Jetten, Cornelia U. Welte, Olivia Rasigraf
Publicado en: MicrobiologyOpen, Edición 10/1, 2021, ISSN 2045-8827
Editor: John Wiley and Sons Inc.
DOI: 10.1002/mbo3.1175

Methanogenic archaea use a bacteria-like methyltransferase system to demethoxylate aromatic compounds

Autores: Julia M. Kurth, Masaru K. Nobu, Hideyuki Tamaki, Nadieh de Jonge, Stefanie Berger, Mike S. M. Jetten, Kyosuke Yamamoto, Daisuke Mayumi, Susumu Sakata, Liping Bai, Lei Cheng, Jeppe Lund Nielsen, Yoichi Kamagata, Tristan Wagner, Cornelia U. Welte
Publicado en: The ISME Journal, 2021, ISSN 1751-7362
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-021-01025-6

Methane-Dependent Extracellular Electron Transfer at the Bioanode by the Anaerobic Archaeal Methanotroph “Candidatus Methanoperedens”

Autores: Heleen T. Ouboter, Tom Berben, Stefanie Berger, Mike S. M. Jetten, Tom Sleutels, Annemiek Ter Heijne and Cornelia U. Welte
Publicado en: frontiers in microbiology, Edición 1, 2022, Página(s) 1-10, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2022.820989

Complete Genome Sequence of the Aerobic Facultative Methanotroph Methylocella tundrae Strain T4

Autores: Martine A. R. Kox, Muhammad Farhan Ul Haque, Theo A. van Alen, Andrew T. Crombie, Mike S. M. Jetten, Huub J. M. Op den Camp, Svetlana N. Dedysh, Maartje A. H. J. van Kessel, J. Colin Murrell
Publicado en: Microbiology Resource Announcements, Edición 8/20, 2019, Página(s) 1-2, ISSN 2576-098X
Editor: asm
DOI: 10.1128/mra.00286-19

Anaerobic methanotrophy is stimulated by graphene oxide in a brackish urban canal sediment

Autores: Koen A. J. Pelsma; Niels A. G. M. van Helmond; Wytze K. Lenstra; Thomas Röckmann; Mike S. M. Jetten; Caroline P. Slomp; Cornelia U. Welte
Publicado en: environmental microbiology, Edición 2, 2023, Página(s) 3104-3115, ISSN 1462-2920
Editor: ami
DOI: 10.1111/1462-2920.16501

Simultaneous sulfide and methane oxidation by an extremophile

Autores: Rob A. Schmitz, Stijn H. Peeters, Sepehr S. Mohammadi, Tom Berben, Timo van Erven, Carmen A. Iosif, Theo van Alen, Wouter Versantvoort, Mike S. M. Jetten, Huub J. M. Op den Camp & Arjan Pol
Publicado en: Nature communications, 2023, Página(s) 1-10, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38699-9

Anthropogenic and Environmental Constraints on the Microbial Methane Cycle in Coastal Sediments

Autores: Anna J. Wallenius, Paula Dalcin Martins, Caroline P. Slomp, Mike S. M. Jetten
Publicado en: Frontiers in Microbiology, Edición 12, 2021, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.631621