Methane and Ammonium Removal In redoX transition zones

Informations projet

MARIX

N° de convention de subvention: 854088

DOI

10.3030/854088

Date de signature de la CE 5 Février 2020

Date de début 1 Mars 2020

Date de fin 31 Août 2027

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 7 610 000,00

Contribution de l’UE

€ 7 610 000,00

Coordonné par

STICHTING RADBOUD UNIVERSITEIT
Netherlands

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Publications

Peer reviewed articles (34)

Sedimentary molybdenum and uranium: Improving proxies for deoxygenation in coastal depositional environments

Auteurs: K. Mareike Paul, NIels A.G.M. van Helmond, Caroline P. Slomp, Sami A. Jokinen, Joonas J. Virtasal, Helena L. Filipsson, Tom Jilbert
Publié dans: Chemical Geology, Numéro 651, 2023, ISSN 0346-251X
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.chemgeo.2022.121203

Nitrate Leaching and its Implication for Fe and as Mobility in a Southeast Asian Aquifer

Auteurs: Martyna Glodowska; Yinxiao Ma; Garrett Smith; Andreas Kappler; Mike Jetten; Cornelia U. Welte
Publié dans: FEMS Microbiology Ecology, Numéro 1, 2023, Page(s) 1-10, ISSN 1574-6941
Éditeur: Oxford
DOI: 10.2139/ssrn.4255499

Amsterdam urban canals contain novel niches for methane-cycling microorganisms

Auteurs: Pelsma, Koen A.J. Zandt, M.H. in 't Camp, Huub J.M. Op den Jetten, Mike S.M. Dean, J.F. Welte, C.U.
Publié dans: environmental microbiology, Numéro 24, 2022, Page(s) 82-97, ISSN 1462-2920
Éditeur: ami
DOI: 10.1111/1462-2920.15864

Effects of redox variability and early diagenesis on marine sedimentary Hg records

Auteurs: J. Frieling, T.A. Mather, C. Marz, H.C. Jenkyns, R. Hennekam, G.-j.Reichart C. P. Slomp, N.A.G.M. van Helmond
Publié dans: Geochimica et Cosmochimica Acta, Numéro 351, 2023, Page(s) 78-95, ISSN 0346-251X
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.gca.2023.04.015

Characterization of a nitrite-reducing octaheme hydroxylamine oxidoreductase that lacks the tyrosine cross-link

Auteurs: Christina Ferousi, Rob A. Schmitz, Wouter J. Maalcke, Simon Lindhoud, Wouter Versantvoort, Mike S.M. Jetten, Joachim Reimann, Boran Kartal
Publié dans: Journal of Biological Chemistry, Numéro 296, 2021, Page(s) 100476, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2021.100476

Novel and unusual genes for nitrogen and metal cycling in <i>Planctomycetota</i>- and KSB1-affiliated metagenome-assembled genomes reconstructed from a marine subsea tunnel

Auteurs: Carolina Suarez; Thomas Hackl; Britt-Marie Wilen; Frank Persson; Per Hagelia; Mike S M Jetten; Paula Dalcin Martins
Publié dans: FEMS Microbiology Letters, 370, pp. 1-10, Numéro 5, 2022, Page(s) 1-10, ISSN 1574-6968
Éditeur: fems
DOI: 10.1093/femsle/fnad049

Methanotrophic potential of Dutch canal wall biofilms is driven by <i>Methylomonadaceae</i>

Auteurs: Koen A J Pelsma; Daniël A M Verhagen; Joshua F Dean; Mike S M Jetten; Cornelia U Welte
Publié dans: FEMS Microbiology Ecology, 99, 10, pp. 1-9, Numéro 2, 2023, Page(s) 1-9, ISSN 1574-6941
Éditeur: Oxford
DOI: 10.1093/femsec/fiad110

Methanethiol Consumption and Hydrogen Sulfide Production by the Thermoacidophilic Methanotroph Methylacidiphilum fumariolicum SolV

Auteurs: Rob A. Schmitz; Sepehr S. Mohammadi; Timo van Erven; Tom Berben; Mike S. M. Jetten; Arjan Pol; Huub J. M. Op den Camp
Publié dans: frontiers in microbiology, Numéro 5, 2022, Page(s) 1-10, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2022.857442

Microbial activity, methane production, and carbon storage in Early Holocene North Sea peats

Auteurs: Lippmann, T.J.R., M.H. in ’t Zandt, N.N.L. van der Putten, F.S. Busshers, M.P. Hijma, P. van der Velden, T. de Groot, Z. van Aalderen, O.H. Meisel, C.P. Slomp, H. Niemann, M.S.M. Jetten, H.A.J. Dolman, C.U. Welte
Publié dans: Biogeosciences, Numéro 18, 2021, Page(s) 5491-5511, ISSN 1726-4170
Éditeur: European Geosciences Union (EGU).
DOI: 10.5194/bg-18-5491-2021

Pathways of methane removal in the sediment and water column of a seasonally anoxic eutrophic marine basin

Auteurs: Olga M. Żygadłowska, Jessica Venetz Robin Klomp, Wytze K. Lenstra, Niels A. G. M. van Helmond, Thomas Röckmann, Anna J. Wallenius, Paula Dalcin Martins, Annelies J. Veraart, Mike S. M. Jetten, Caroline P. Slomp
Publié dans: frontiers in marine science, 2023, Page(s) 1-10, ISSN 2296-7745
Éditeur: frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2023.1085728

Metascan: METabolic Analysis, SCreening and ANnotation of Metagenomes

Auteurs: Geert Cremers; Mike S. M. Jetten; Huub J. M. Op den Camp; Sebastian Lücker
Publié dans: urn:issn:1664-302X, Numéro 5, 2022, Page(s) 1-12, ISSN 2673-7647
Éditeur: frontiers
DOI: 10.3389/fbinf.2022.861505

A Novel Laboratory-Scale Mesocosm Setup to Study Methane Emission Mitigation by Sphagnum Mosses and Associated Methanotrophs

Auteurs: Martine A. R. Kox, Alfons J. P. Smolders, Daan R. Speth, Leon P. M. Lamers, Huub J. M. Op den Camp, Mike S. M. Jetten, Maartje A. H. J. van Kessel
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 12, 2021, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.651103

Simultaneous Anaerobic and Aerobic Ammonia and Methane Oxidation under Oxygen Limitation Conditions

Auteurs: Maartje A. H. J. van Kessel, Karin Stultiens, Arjan Pol, Mike S. M. Jetten, Boran Kartal, Huub J. M. Op den Camp
Publié dans: Applied and Environmental Microbiology, Numéro 87/13, 2021, ISSN 0099-2240
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aem.00043-21

Structural and functional characterization of the intracellular filament-forming nitrite oxidoreductase multiprotein complex

Auteurs: Tadeo Moreno Chicano, Lea Dietrich, Naomi M. de Almeida, Mohd. Akram, Elisabeth Hartmann, Franziska Leidreiter, Daniel Leopoldus, Melanie Mueller, Ricardo Sánchez, Guylaine H. L. Nuijten, Joachim Reimann, Kerstin-Anikó Seifert, Ilme Schlichting, Laura van Niftrik, Mike S. M. Jetten, Andreas Dietl, Boran Kartal, Kristian Parey, Thomas R. M. Barends
Publié dans: Nature Microbiology, Numéro 6/9, 2021, Page(s) 1129-1139, ISSN 2058-5276
Éditeur: springer Nature
DOI: 10.1038/s41564-021-00934-8

Probing Denitrifying Anaerobic Methane Oxidation via Antimicrobial Intervention: Implications for Innovative Wastewater Management

Auteurs: Martijn Wissink; Martyna Glodowska; Marnix R. van der Kolk; Mike S. M. Jetten; Cornelia U. Welte
Publié dans: Crossref, Numéro 3, 2024, Page(s) 6250–6257, ISSN 2409-7632
Éditeur: acs
DOI: 10.1021/acs.est.3c07197

Unraveling Nitrogen, Sulfur, and Carbon Metabolic Pathways and Microbial Community Transcriptional Responses to Substrate Deprivation and Toxicity Stresses in a Bioreactor Mimicking Anoxic Brackish Coastal Sediment Conditions

Auteurs: Paula Dalcin Martins, Maider J. Echeveste Medrano†, Arslan Arshad, Julia M. Kurth, Heleen T. Ouboter, Huub J. M. Op den Camp, Mike S. M. Jetten and Cornelia U. Welte*
Publié dans: frontiers in microbiology, Numéro feb 2022, 2022, Page(s) 1-8, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2022.798906

Regulation of coastal methane sinks by a structured gradient of microbial methane oxidizers

Auteurs: Zhanfei He, Jiaqi Wang, Jiajie Hu, Hanqing Yu, Mike S.M. Jetten, Huan Liu, Chaoyang Cai, Yan Liu, Hongxing Ren, Xu Zhang, Miaolian Hua, Xinhua Xu, Ping Zheng, Baolan Hu
Publié dans: Environmental Pollution, Numéro 244, 2019, Page(s) 228-237, ISSN 0269-7491
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.envpol.2018.10.057

Versatile methanotrophs form an active methane biofilter in the oxycline of a seasonally stratified coastal basin

Auteurs: Jessica Venetz; Olga M. Żygadłowska; Wytze K. Lenstra; Niels A.G.M. van Helmond; Guylaine H.L. Nuijten; Anna J. Wallenius; Paula Dalcin Martins; Caroline P. Slomp; Mike S.M. Jetten; Annelies J. Veraart
Publié dans: Environmental Microbiology, 25, 11, pp. 2277-2288, Numéro 6, 2023, ISSN 1462-2920
Éditeur: ami
DOI: 10.1101/2022.10.28.513710

Metagenomic evidence of a novel family of anammox bacteria in a subsea environment

Auteurs: Carolina Suarez, Paula Dalcin Martins, Mike Jetten, Sabina Karačić, Britt Marie Wilén, Oskar Modin, Per Hagelia, Malte Hermansson, Frank Persson
Publié dans: environmental microbiology, Numéro 1, 2022, Page(s) 1-10, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.16006

Seasonal dynamics of the microbial methane filter in the water column of a eutrophic coastal basin

Auteurs: Jessica Venetz, Olga M Żygadłowska, Nicky Dotsios, Anna J Wallenius, Niels A G M van Helmond, Wytze K Lenstra, Robin Klomp, Caroline P Slomp, Mike S M Jetten, Annelies J Veraart
Publié dans: FEMS Microbiology Ecology, 2024, Page(s) 1-12, ISSN 1574-6941
Éditeur: Oxford Academic
DOI: 10.1093/femsec/fiae007

Selective enrichment and metagenomic analysis of three novel comammox Nitrospira in a urine-fed membrane bioreactor

Auteurs: Jiyun Li, Zheng-Shuang Hua, Tao Liu, Chengwen Wang, Jie Li, Ge Bai, Sebastian Lücker, Mike S. M. Jetten, Min Zheng, Jianhua Guo
Publié dans: ISME Communications, Numéro 1/1, 2021, ISSN 2730-6151
Éditeur: isme
DOI: 10.1038/s43705-021-00005-3

Autotrophic and mixotrophic metabolism of an anammox bacterium revealed by in vivo 13C and 2H metabolic network mapping

Auteurs: Christopher E. Lawson, Guylaine H. L. Nuijten, Rob M. de Graaf, Tyler B. Jacobson, Martin Pabst, David. M. Stevenson, Mike S. M. Jetten, Daniel R. Noguera, Katherine D. McMahon, Daniel Amador-Noguez, Sebastian Lücker
Publié dans: The ISME Journal, Numéro 15/3, 2021, Page(s) 673-687, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-020-00805-w

Gene-Based Modeling of Methane Oxidation in Coastal Sediments: Constraints on the Efficiency of the Microbial Methane Filter

Auteurs: Wytze K. Lenstra; Niels A. G. M. van Helmond; Paula Dalcin Martins; Anna J. Wallenius; Mike S. M. Jetten; Caroline P. Slomp
Publié dans: Environmental Science & Technology, 57, 34, pp. 1-10, Numéro 6, 2023, ISSN 1520-5851
Éditeur: acs
DOI: 10.1021/acs.est.3c02023

Mechanisms of extracellular electron transfer in anaerobic methanotrophic archaea

Auteurs: Heleen T. Ouboter, Rob Mesman, Tom Sleutels, Jelle Postma, Martijn Wissink, Mike S. M. Jetten, Annemiek Ter Heijne, Tom Berben, Cornelia U. Welte
Publié dans: Nature communications, 2024, Page(s) 1-12, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-45758-2

Sediments as a Source of Iron, Manganese, Cobalt and Nickel to Continental Shelf Waters (Louisiana, Gulf of Mexico)

Auteurs: Wytze K. Lenstra, Niels A. G. M. van Helmond, Olga M. Żygadłowska, Roosmarijn van Zummeren, Rob Witbaard and Caroline P. Slomp
Publié dans: Frontiers in Marine Sciences, Numéro 1, 2022, Page(s) 1-8, ISSN 2296-7745
Éditeur: frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2022.811953

A sequential extraction procedure for particulate manganese and its application to coastal marine sediments

Auteurs: W.K.Lenstra, R. Klomp, F.Molema, T.Behrends,C.P.Slomp
Publié dans: Chemical Geology, Numéro 1, 2021, Page(s) 1-10, ISSN 0009-2541
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.chemgeo.2021.120538

Investigating the Chemolithoautotrophic and Formate Metabolism of Nitrospira moscoviensis by Constraint-Based Metabolic Modeling and 13 C-Tracer Analysis

Auteurs: Christopher E. Lawson, Aniela B. Mundinger, Hanna Koch, Tyler B. Jacobson, Coty A. Weathersby, Mike S. M. Jetten, Martin Pabst, Daniel Amador-Noguez, Daniel R. Noguera, Katherine McMahon, Sebastian Lücker
Publié dans: mSystems, Numéro 6/4, 2021, ISSN 2379-5077
Éditeur: asm
DOI: 10.1128/msystems.00173-21

Enrichment of novel Verrucomicrobia , Bacteroidetes , and Krumholzibacteria in an oxygen‐limited methane‐ and iron‐fed bioreactor inoculated with Bothnian Sea sediments

Auteurs: Paula Dalcin Martins, Anniek Jong, Wytze K. Lenstra, Niels A. G. M. Helmond, Caroline P. Slomp, Mike S. M. Jetten, Cornelia U. Welte, Olivia Rasigraf
Publié dans: MicrobiologyOpen, Numéro 10/1, 2021, ISSN 2045-8827
Éditeur: John Wiley and Sons Inc.
DOI: 10.1002/mbo3.1175

Methanogenic archaea use a bacteria-like methyltransferase system to demethoxylate aromatic compounds

Auteurs: Julia M. Kurth, Masaru K. Nobu, Hideyuki Tamaki, Nadieh de Jonge, Stefanie Berger, Mike S. M. Jetten, Kyosuke Yamamoto, Daisuke Mayumi, Susumu Sakata, Liping Bai, Lei Cheng, Jeppe Lund Nielsen, Yoichi Kamagata, Tristan Wagner, Cornelia U. Welte
Publié dans: The ISME Journal, 2021, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-021-01025-6

Methane-Dependent Extracellular Electron Transfer at the Bioanode by the Anaerobic Archaeal Methanotroph “Candidatus Methanoperedens”

Auteurs: Heleen T. Ouboter, Tom Berben, Stefanie Berger, Mike S. M. Jetten, Tom Sleutels, Annemiek Ter Heijne and Cornelia U. Welte
Publié dans: frontiers in microbiology, Numéro 1, 2022, Page(s) 1-10, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2022.820989

Complete Genome Sequence of the Aerobic Facultative Methanotroph Methylocella tundrae Strain T4

Auteurs: Martine A. R. Kox, Muhammad Farhan Ul Haque, Theo A. van Alen, Andrew T. Crombie, Mike S. M. Jetten, Huub J. M. Op den Camp, Svetlana N. Dedysh, Maartje A. H. J. van Kessel, J. Colin Murrell
Publié dans: Microbiology Resource Announcements, Numéro 8/20, 2019, Page(s) 1-2, ISSN 2576-098X
Éditeur: asm
DOI: 10.1128/mra.00286-19

Anaerobic methanotrophy is stimulated by graphene oxide in a brackish urban canal sediment

Auteurs: Koen A. J. Pelsma; Niels A. G. M. van Helmond; Wytze K. Lenstra; Thomas Röckmann; Mike S. M. Jetten; Caroline P. Slomp; Cornelia U. Welte
Publié dans: environmental microbiology, Numéro 2, 2023, Page(s) 3104-3115, ISSN 1462-2920
Éditeur: ami
DOI: 10.1111/1462-2920.16501

Simultaneous sulfide and methane oxidation by an extremophile

Auteurs: Rob A. Schmitz, Stijn H. Peeters, Sepehr S. Mohammadi, Tom Berben, Timo van Erven, Carmen A. Iosif, Theo van Alen, Wouter Versantvoort, Mike S. M. Jetten, Huub J. M. Op den Camp & Arjan Pol
Publié dans: Nature communications, 2023, Page(s) 1-10, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38699-9

Anthropogenic and Environmental Constraints on the Microbial Methane Cycle in Coastal Sediments

Auteurs: Anna J. Wallenius, Paula Dalcin Martins, Caroline P. Slomp, Mike S. M. Jetten
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 12, 2021, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.631621