Methane and Ammonium Removal In redoX transition zones

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Publications

Hydrogen Oxidation Benefits Alphaproteobacterial Methanotrophs Under Severe Methane Limitation

Auteurs: Ida F. Peterse, Arjan Pol, Geert Cremers, Tom Berben, Theo A. van Alen, Huub J. M. Op den Camp, Annelies J. Veraart, Sebastian Lücker
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 27, 2025, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.70163

Fe(II)Cl2 amendment suppresses pond methane emissions by stimulating iron-dependent anaerobic oxidation of methane

Auteurs: Quinten Struik, José R Paranaíba, Martyna Glodowska, Sarian Kosten, Berber M J W Meulepas, Ana B Rios-Miguel, Mike S M Jetten, Miquel Lürling, Guido Waajen, Thomas P A Nijman, Annelies J Veraart
Publié dans: FEMS Microbiology Ecology, Numéro 100, 2024, ISSN 1574-6941
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/femsec/fiae061

Sedimentary molybdenum and uranium: Improving proxies for deoxygenation in coastal depositional environments

Auteurs: K. Mareike Paul, NIels A.G.M. van Helmond, Caroline P. Slomp, Sami A. Jokinen, Joonas J. Virtasal, Helena L. Filipsson, Tom Jilbert
Publié dans: Chemical Geology, Numéro 651, 2023, ISSN 0346-251X
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.chemgeo.2022.121203

Nitrate Leaching and its Implication for Fe and as Mobility in a Southeast Asian Aquifer

Auteurs: Martyna Glodowska; Yinxiao Ma; Garrett Smith; Andreas Kappler; Mike Jetten; Cornelia U. Welte
Publié dans: FEMS Microbiology Ecology, Numéro 1, 2023, Page(s) 1-10, ISSN 1574-6941
Éditeur: Oxford
DOI: 10.2139/ssrn.4255499

Iron Modulates the Growth and Activity of Nitrate-Dependent Methanotrophic Bacteria by Reprogramming Carbon Metabolism

Auteurs: Xiangwu Yao, Meng Zhang, Mike S. M. Jetten, Lizhong Zhu, Baolan Hu
Publié dans: Environmental Science & Technology, Numéro 59, 2025, Page(s) 9134-9145, ISSN 0013-936X
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.est.5c01275

Long-Term Euxinia Restricts Microbial Methane Removal in Eutrophic Coastal Basins

Auteurs: Jessica Venetz, Nicky Dotsios, Olga M. Żygadłowska, Wytze K. Lenstra, Niels A.G.M van Helmond, Christoph Humborg, Katherine D. McMahon, Dina in ’t Zandt, Caroline P. Slomp, Mike S. M. Jetten, Annelies J. Veraart
Publié dans: Environmental Science & Technology, Numéro 59, 2025, Page(s) 21988-22000, ISSN 0013-936X
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.est.5c05066

Nitrous oxide sources, mechanisms and mitigation

Auteurs: Guibing Zhu, Hao Shi, Lei Zhong, Guang He, Baozhan Wang, Jun Shan, Ping Han, Tongxu Liu, Shanyun Wang, Chunlei Liu, Nan Zhang, Liping Jiang, Longbin Yu, Chunhui Zhan, Ziyang Tang, Teng Wen, Bin Ma, Xiaoxuan Su, Shujun Zhang, Jinbo Zhang, Hongjie Di, Lijun Hou, Alexander H. Krichels, Mark Trimmer, Mike S. M. Jetten, Yongzhen Peng, Frank E. Löffler, Hanqin Tian, Yong-Guan Zhu
Publié dans: Nature Reviews Earth & Environment, Numéro 6, 2025, Page(s) 574-592, ISSN 2662-138X
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s43017-025-00707-5

Amsterdam urban canals contain novel niches for methane-cycling microorganisms

Auteurs: Pelsma, Koen A.J. Zandt, M.H. in 't Camp, Huub J.M. Op den Jetten, Mike S.M. Dean, J.F. Welte, C.U.
Publié dans: environmental microbiology, Numéro 24, 2022, Page(s) 82-97, ISSN 1462-2920
Éditeur: ami
DOI: 10.1111/1462-2920.15864

Dissolved Mn(III) is a key redox intermediate in sediments of a seasonally euxinic coastal basin

Auteurs: Robin Klomp, Olga M. Żygadłowska, Mike S. M. Jetten, Véronique E. Oldham, Niels A. G. M. van Helmond, Caroline P. Slomp, Wytze K. Lenstra
Publié dans: Biogeosciences, Numéro 22, 2025, Page(s) 751-765, ISSN 1726-4189
Éditeur: Copernicus GmbH
DOI: 10.5194/bg-22-751-2025

Hydroxylamine production by Alcaligenes faecalis challenges the paradigm of heterotrophic nitrification

Auteurs: Wouter B. Lenferink, Lars R. Bakken, Mike S. M. Jetten, Maartje A. H. J. van Kessel, Sebastian Lücker
Publié dans: Science Advances, Numéro 10, 2024, ISSN 2375-2548
Éditeur: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.adl3587

Effects of redox variability and early diagenesis on marine sedimentary Hg records

Auteurs: J. Frieling, T.A. Mather, C. Marz, H.C. Jenkyns, R. Hennekam, G.-j.Reichart C. P. Slomp, N.A.G.M. van Helmond
Publié dans: Geochimica et Cosmochimica Acta, Numéro 351, 2023, Page(s) 78-95, ISSN 0346-251X
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.gca.2023.04.015

Methanotrophic flexibility of ‘Ca. Methanoperedens’ and its interactions with sulfate-reducing bacteria in the sediment of meromictic Lake Cadagno

Auteurs: Maider J. Echeveste Medrano, Guangyi Su, Lucas A. Blattner, Pedro Leão, Irene Sánchez-Andrea, Mike S. M. Jetten, Cornelia U. Welte, Jakob Zopfi
Publié dans: environmental; microbiology, 2024, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1101/2024.11.08.622632

The clumped isotope signatures of multiple methanogenesis metabolisms

Auteurs: Jiawen Li, Jeanine L. Ash, Alec Cobban, Briana C. Kubik, Gabriella Rizzo, Mia Thompson, Laetitia Guibourdenche, Stefanie Berger, Kaycee Morra, Ying Lin, Elliott P. Mueller, Andrew L. Masterson, Rebekah Stein, Marilyn Fogel, Mark A. Torres, Xiahong Feng, James F. Holden, Anna Martini, Cornelia U. Welte, Mike Jetten, Edward D. Young, William D. Leavitt
Publié dans: environmental science and technology, 2024, ISSN 0013-936X
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1101/2024.12.18.629299

Characterization of a nitrite-reducing octaheme hydroxylamine oxidoreductase that lacks the tyrosine cross-link

Auteurs: Christina Ferousi, Rob A. Schmitz, Wouter J. Maalcke, Simon Lindhoud, Wouter Versantvoort, Mike S.M. Jetten, Joachim Reimann, Boran Kartal
Publié dans: Journal of Biological Chemistry, Numéro 296, 2021, Page(s) 100476, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2021.100476

Methane-dependent complete denitrification by a single Methylomirabilis bacterium

Auteurs: Xiangwu Yao, Jiaqi Wang, Mingyue He, Zishu Liu, Yuxiang Zhao, Yufen Li, Taolve Chi, Lin Zhu, Ping Zheng, Mike S. M. Jetten, Baolan Hu
Publié dans: Nature Microbiology, Numéro 9, 2024, Page(s) 464-476, ISSN 2058-5276
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41564-023-01578-6

Ebullition drives high methane emissions from a eutrophic coastal basin

Auteurs: Olga M. Żygadłowska, Jessica Venetz, Wytze K. Lenstra, Niels A.G.M. van Helmond, Robin Klomp, Thomas Röckmann, Annelies J. Veraart, Mike S.M. Jetten, Caroline P. Slomp
Publié dans: Geochimica et Cosmochimica Acta, Numéro 384, 2024, Page(s) 1-13, ISSN 0016-7037
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.gca.2024.08.028

Novel and unusual genes for nitrogen and metal cycling in Planctomycetota- and KSB1-affiliated metagenome-assembled genomes reconstructed from a marine subsea tunnel

Auteurs: Carolina Suarez; Thomas Hackl; Britt-Marie Wilen; Frank Persson; Per Hagelia; Mike S M Jetten; Paula Dalcin Martins
Publié dans: FEMS Microbiology Letters, 370, pp. 1-10, Numéro 5, 2022, Page(s) 1-10, ISSN 1574-6968
Éditeur: fems
DOI: 10.1093/femsle/fnad049

Methanotrophic Flexibility of ‘Ca. Methanoperedens’ and Its Interactions With Sulphate‐Reducing Bacteria in the Sediment of Meromictic Lake Cadagno

Auteurs: Maider J. Echeveste Medrano, Guangyi Su, Lucas A. Blattner, Pedro Leão, Irene Sánchez‐Andrea, Mike S. M. Jetten, Cornelia U. Welte, Jakob Zopfi
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 27, 2025, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.70133

Methanotrophic potential of Dutch canal wall biofilms is driven by Methylomonadaceae

Auteurs: Koen A J Pelsma; Daniël A M Verhagen; Joshua F Dean; Mike S M Jetten; Cornelia U Welte
Publié dans: FEMS Microbiology Ecology, 99, 10, pp. 1-9, Numéro 2, 2023, Page(s) 1-9, ISSN 1574-6941
Éditeur: Oxford
DOI: 10.1093/femsec/fiad110

Methanethiol Consumption and Hydrogen Sulfide Production by the Thermoacidophilic Methanotroph Methylacidiphilum fumariolicum SolV

Auteurs: Rob A. Schmitz; Sepehr S. Mohammadi; Timo van Erven; Tom Berben; Mike S. M. Jetten; Arjan Pol; Huub J. M. Op den Camp
Publié dans: frontiers in microbiology, Numéro 5, 2022, Page(s) 1-10, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2022.857442

Nitrate-dependent anaerobic methane oxidation (N-DAMO) as a bioremediation strategy for waters affected by agricultural runoff

Auteurs: Annabel Legierse, Quinten Struik, Garrett Smith, Maider J Echeveste Medrano, Stefan Weideveld, Gijs van Dijk, Alfons J P Smolders, Mike Jetten, Annelies J Veraart, Cornelia U Welte, Martyna Glodowska
Publié dans: FEMS Microbiology Letters, Numéro 370, 2023, ISSN 1574-6968
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/femsle/fnad041

Microbial activity, methane production, and carbon storage in Early Holocene North Sea peats

Auteurs: Lippmann, T.J.R., M.H. in ’t Zandt, N.N.L. van der Putten, F.S. Busshers, M.P. Hijma, P. van der Velden, T. de Groot, Z. van Aalderen, O.H. Meisel, C.P. Slomp, H. Niemann, M.S.M. Jetten, H.A.J. Dolman, C.U. Welte
Publié dans: Biogeosciences, Numéro 18, 2021, Page(s) 5491-5511, ISSN 1726-4170
Éditeur: European Geosciences Union (EGU).
DOI: 10.5194/bg-18-5491-2021

Pathways of methane removal in the sediment and water column of a seasonally anoxic eutrophic marine basin

Auteurs: Olga M. Żygadłowska, Jessica Venetz Robin Klomp, Wytze K. Lenstra, Niels A. G. M. van Helmond, Thomas Röckmann, Anna J. Wallenius, Paula Dalcin Martins, Annelies J. Veraart, Mike S. M. Jetten, Caroline P. Slomp
Publié dans: frontiers in marine science, 2023, Page(s) 1-10, ISSN 2296-7745
Éditeur: frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2023.1085728

Neodymium as Metal Cofactor for Biological Methanol Oxidation: Structure and Kinetics of an XoxF1-Type Methanol Dehydrogenase

Auteurs: Rob A. Schmitz, Nunzia Picone, Helena Singer, Andreas Dietl, Kerstin-Anikó Seifert, Arjan Pol, Mike S. M. Jetten, Thomas R. M. Barends, Lena J. Daumann, Huub J. M. Op den Camp
Publié dans: mBio, Numéro 12, 2022, ISSN 2150-7511
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.01708-21

Metascan: METabolic Analysis, SCreening and ANnotation of Metagenomes

Auteurs: Geert Cremers; Mike S. M. Jetten; Huub J. M. Op den Camp; Sebastian Lücker
Publié dans: urn:issn:1664-302X, Numéro 5, 2022, Page(s) 1-12, ISSN 2673-7647
Éditeur: frontiers
DOI: 10.3389/fbinf.2022.861505

High diversity of nitrifying bacteria and archaea in biofilms from a subsea tunnel

Auteurs: Linnea F M Kop, Hanna Koch, Paula Dalcin Martins, Carolina Suarez, Sabina Karačić, Frank Persson, Britt-Marie Wilén, Per Hagelia, Mike S M Jetten, Sebastian Lücker
Publié dans: FEMS Microbiology Ecology, Numéro 101, 2025, ISSN 1574-6941
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/femsec/fiaf032

Sediments from a seasonally euxinic coastal ecosystem show high nitrogen cycling potential

Auteurs: Isabel M. L. Rigutto, Ştefania C. Sburlan, Lars W. P. de Bont, Tom Berben, Rob M. de Graaf, Caroline P. Slomp, Mike S. M. Jetten
Publié dans: environmental microbiology, 2025, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1101/2025.02.26.640368

A Novel Laboratory-Scale Mesocosm Setup to Study Methane Emission Mitigation by Sphagnum Mosses and Associated Methanotrophs

Auteurs: Martine A. R. Kox, Alfons J. P. Smolders, Daan R. Speth, Leon P. M. Lamers, Huub J. M. Op den Camp, Mike S. M. Jetten, Maartje A. H. J. van Kessel
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 12, 2021, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.651103

Seasonal euxinia in a coastal basin: Impact on sedimentary molybdenum enrichments and isotope signatures

Auteurs: Olga M. Zygadlowska, Niels A.G.M. van Helmond, Wytze K. Lenstra, Robin Klomp, Rens Accou, Rebecca Puyk, Alexander J. Dickson, Mike S.M. Jetten, Caroline P. Slomp
Publié dans: Chemical Geology, Numéro 670, 2024, Page(s) 122430, ISSN 0009-2541
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.chemgeo.2024.122430

Simultaneous Anaerobic and Aerobic Ammonia and Methane Oxidation under Oxygen Limitation Conditions

Auteurs: Maartje A. H. J. van Kessel, Karin Stultiens, Arjan Pol, Mike S. M. Jetten, Boran Kartal, Huub J. M. Op den Camp
Publié dans: Applied and Environmental Microbiology, Numéro 87/13, 2021, ISSN 0099-2240
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aem.00043-21

Structural and functional characterization of the intracellular filament-forming nitrite oxidoreductase multiprotein complex

Auteurs: Tadeo Moreno Chicano, Lea Dietrich, Naomi M. de Almeida, Mohd. Akram, Elisabeth Hartmann, Franziska Leidreiter, Daniel Leopoldus, Melanie Mueller, Ricardo Sánchez, Guylaine H. L. Nuijten, Joachim Reimann, Kerstin-Anikó Seifert, Ilme Schlichting, Laura van Niftrik, Mike S. M. Jetten, Andreas Dietl, Boran Kartal, Kristian Parey, Thomas R. M. Barends
Publié dans: Nature Microbiology, Numéro 6/9, 2021, Page(s) 1129-1139, ISSN 2058-5276
Éditeur: springer Nature
DOI: 10.1038/s41564-021-00934-8

Probing Denitrifying Anaerobic Methane Oxidation via Antimicrobial Intervention: Implications for Innovative Wastewater Management

Auteurs: Martijn Wissink; Martyna Glodowska; Marnix R. van der Kolk; Mike S. M. Jetten; Cornelia U. Welte
Publié dans: Crossref, Numéro 3, 2024, Page(s) 6250–6257, ISSN 2409-7632
Éditeur: acs
DOI: 10.1021/acs.est.3c07197

Eutrophication and Deoxygenation Drive High Methane Emissions from a Brackish Coastal System

Auteurs: Olga M. Żygadłowska, Florian Roth, Niels A. G. M. van Helmond, Wytze K. Lenstra, Jessica Venetz, Nicky Dotsios, Thomas Röckmann, Annelies J. Veraart, Christian Stranne, Christoph Humborg, Mike S. M. Jetten, Caroline P. Slomp
Publié dans: Environmental Science & Technology, Numéro 58, 2024, Page(s) 10582-10590, ISSN 0013-936X
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.est.4c00702

Metabolic and phylogenetic diversity in the phylum Nitrospinota revealed by comparative genome analyses

Auteurs: Linnea F M Kop, Hanna Koch, Mike S M Jetten, Holger Daims, Sebastian Lücker
Publié dans: ISME Communications, Numéro 4, 2024, ISSN 2730-6151
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/ismeco/ycad017

A ubiquitous and diverse methanogenic community drives microbial methane cycling in eutrophic coastal sediments

Auteurs: Anna J Wallenius, Jessica Venetz, Olga M Zygadlowska, Wytze K Lenstra, Niels A G M van Helmond, Paula Dalcin Martins, Caroline P Slomp, Mike S M Jetten
Publié dans: FEMS Microbiology Ecology, Numéro 101, 2025, ISSN 1574-6941
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/femsec/fiaf075

Predicting and improving the microbial removal of organic micropollutants during wastewater treatment: A review

Auteurs: Ana B. Rios-Miguel, Tamara J.H.M. van Bergen, Caterina Zillien, Ad M.J. Ragas, Rosalie van Zelm, Mike S.M. Jetten, A. Jan Hendriks, Cornelia U. Welte
Publié dans: Chemosphere, Numéro 333, 2025, Page(s) 138908, ISSN 0045-6535
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.chemosphere.2023.138908

Unraveling Nitrogen, Sulfur, and Carbon Metabolic Pathways and Microbial Community Transcriptional Responses to Substrate Deprivation and Toxicity Stresses in a Bioreactor Mimicking Anoxic Brackish Coastal Sediment Conditions

Auteurs: Paula Dalcin Martins, Maider J. Echeveste Medrano†, Arslan Arshad, Julia M. Kurth, Heleen T. Ouboter, Huub J. M. Op den Camp, Mike S. M. Jetten and Cornelia U. Welte*
Publié dans: frontiers in microbiology, Numéro feb 2022, 2022, Page(s) 1-8, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2022.798906

Regulation of coastal methane sinks by a structured gradient of microbial methane oxidizers

Auteurs: Zhanfei He, Jiaqi Wang, Jiajie Hu, Hanqing Yu, Mike S.M. Jetten, Huan Liu, Chaoyang Cai, Yan Liu, Hongxing Ren, Xu Zhang, Miaolian Hua, Xinhua Xu, Ping Zheng, Baolan Hu
Publié dans: Environmental Pollution, Numéro 244, 2019, Page(s) 228-237, ISSN 0269-7491
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.envpol.2018.10.057

Versatile methanotrophs form an active methane biofilter in the oxycline of a seasonally stratified coastal basin

Auteurs: Jessica Venetz; Olga M. Żygadłowska; Wytze K. Lenstra; Niels A.G.M. van Helmond; Guylaine H.L. Nuijten; Anna J. Wallenius; Paula Dalcin Martins; Caroline P. Slomp; Mike S.M. Jetten; Annelies J. Veraart
Publié dans: Environmental Microbiology, 25, 11, pp. 2277-2288, Numéro 6, 2023, ISSN 1462-2920
Éditeur: ami
DOI: 10.1101/2022.10.28.513710

Benzimidazole fungicide biotransformation by comammox Nitrospira bacteria: Transformation pathways and associated proteomic responses

Auteurs: Ping Han, Ana B. Rios-Miguel, Xiufeng Tang, Yaochun Yu, Li-Jun Zhou, Lijun Hou, Min Liu, Dongyao Sun, Mike S.M. Jetten, Cornelia U. Welte, Yujie Men, Sebastian Lücker
Publié dans: Journal of Hazardous Materials, Numéro 445, 2025, Page(s) 130558, ISSN 0304-3894
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jhazmat.2022.130558

Metagenomic evidence of a novel family of anammox bacteria in a subsea environment

Auteurs: Carolina Suarez, Paula Dalcin Martins, Mike Jetten, Sabina Karačić, Britt Marie Wilén, Oskar Modin, Per Hagelia, Malte Hermansson, Frank Persson
Publié dans: environmental microbiology, Numéro 1, 2022, Page(s) 1-10, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.16006

Seasonal dynamics of the microbial methane filter in the water column of a eutrophic coastal basin

Auteurs: Jessica Venetz, Olga M Żygadłowska, Nicky Dotsios, Anna J Wallenius, Niels A G M van Helmond, Wytze K Lenstra, Robin Klomp, Caroline P Slomp, Mike S M Jetten, Annelies J Veraart
Publié dans: FEMS Microbiology Ecology, 2024, Page(s) 1-12, ISSN 1574-6941
Éditeur: Oxford Academic
DOI: 10.1093/femsec/fiae007

Activity-based labelling of ammonia- and alkane-oxidizing microorganisms including ammonia-oxidizing archaea

Auteurs: Sebastian Lücker, Dimitra Sakoula, Arne Schatteman, Pieter Blom, Mike Jetten, Maartje van Kessel, Laura Lehtovirta-Morley
Publié dans: isme journal, 2024, ISSN 1751-7370
Éditeur: Oxford
DOI: 10.21203/rs.3.rs-3237955/v1

Sedimentary vanadium depletion under sulfidic conditions: Implications for (paleo)redox proxy applications

Auteurs: Niels A.G.M. van Helmond, Olga M. Żygadłowska, Wytze K. Lenstra, Robin Klomp, Christoph Humborg, Daniel J. Conley, Mike S.M. Jetten, Caroline P. Slomp
Publié dans: Geochimica et Cosmochimica Acta, Numéro 393, 2025, Page(s) 238-253, ISSN 0016-7037
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.gca.2025.01.022

Physiological stress response to sulfide exposure of freshwater anaerobic methanotrophic archaea

Auteurs: Maider J. Echeveste Medrano, Sarah Lee, Rob de Graaf, B. Conall Holohan, Irene Sánchez-Andrea, Mike S. M. Jetten, Cornelia U. Welte
Publié dans: es&t, 2025, ISSN 0013-936X
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1101/2024.11.08.622618

Contrasting Methane, Sulfide and Nitrogen‐Loading Regimes in Bioreactors Shape Microbial Communities Originating From Methane‐Rich Coastal Sediment of the Stockholm Archipelago

Auteurs: Maider J. Echeveste Medrano, Garrett J. Smith, Irene Sánchez‐Andrea, Mike S. M. Jetten, Cornelia U. Welte
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 27, 2025, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.70056

Selective enrichment and metagenomic analysis of three novel comammox Nitrospira in a urine-fed membrane bioreactor

Auteurs: Jiyun Li, Zheng-Shuang Hua, Tao Liu, Chengwen Wang, Jie Li, Ge Bai, Sebastian Lücker, Mike S. M. Jetten, Min Zheng, Jianhua Guo
Publié dans: ISME Communications, Numéro 1/1, 2021, ISSN 2730-6151
Éditeur: isme
DOI: 10.1038/s43705-021-00005-3

Autotrophic and mixotrophic metabolism of an anammox bacterium revealed by in vivo 13C and 2H metabolic network mapping

Auteurs: Christopher E. Lawson, Guylaine H. L. Nuijten, Rob M. de Graaf, Tyler B. Jacobson, Martin Pabst, David. M. Stevenson, Mike S. M. Jetten, Daniel R. Noguera, Katherine D. McMahon, Daniel Amador-Noguez, Sebastian Lücker
Publié dans: The ISME Journal, Numéro 15/3, 2021, Page(s) 673-687, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-020-00805-w

Comparative genome analysis reveals broad phylogenetic and functional diversity within the order Nitrospirales

Auteurs: Linnea F M Kop, Hanna Koch, Daan Speth, Claudia Lüke, Eva Spieck, Mike S M Jetten, Holger Daims, Sebastian Lücker
Publié dans: The ISME Journal, Numéro 19, 2025, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1093/ismejo/wraf151

Gene-Based Modeling of Methane Oxidation in Coastal Sediments: Constraints on the Efficiency of the Microbial Methane Filter

Auteurs: Wytze K. Lenstra; Niels A. G. M. van Helmond; Paula Dalcin Martins; Anna J. Wallenius; Mike S. M. Jetten; Caroline P. Slomp
Publié dans: Environmental Science & Technology, 57, 34, pp. 1-10, Numéro 6, 2023, ISSN 1520-5851
Éditeur: acs
DOI: 10.1021/acs.est.3c02023

Osmoregulation in freshwater anaerobic methane-oxidizing archaea under salt stress

Auteurs: Maider J Echeveste Medrano, Andy O Leu, Martin Pabst, Yuemei Lin, Simon J McIlroy, Gene W Tyson, Jitske van Ede, Irene Sánchez-Andrea, Mike S M Jetten, Robert Jansen, Cornelia U Welte
Publié dans: The ISME Journal, Numéro 18, 2024, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1093/ismejo/wrae137

Mechanisms of extracellular electron transfer in anaerobic methanotrophic archaea

Auteurs: Heleen T. Ouboter, Rob Mesman, Tom Sleutels, Jelle Postma, Martijn Wissink, Mike S. M. Jetten, Annemiek Ter Heijne, Tom Berben, Cornelia U. Welte
Publié dans: Nature communications, 2024, Page(s) 1-12, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-45758-2

Sediments as a Source of Iron, Manganese, Cobalt and Nickel to Continental Shelf Waters (Louisiana, Gulf of Mexico)

Auteurs: Wytze K. Lenstra, Niels A. G. M. van Helmond, Olga M. Żygadłowska, Roosmarijn van Zummeren, Rob Witbaard and Caroline P. Slomp
Publié dans: Frontiers in Marine Sciences, Numéro 1, 2022, Page(s) 1-8, ISSN 2296-7745
Éditeur: frontiers
DOI: 10.3389/fmars.2022.811953

Trace metals in coastal marine sediments: Natural and anthropogenic sources, correlation matrices, and proxy potentials

Auteurs: K. Mareike Paul, Niels A.G.M. van Helmond, Caroline P. Slomp, Tom Jilbert
Publié dans: Science of The Total Environment, Numéro 951, 2024, Page(s) 175789, ISSN 0048-9697
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.scitotenv.2024.175789

A sequential extraction procedure for particulate manganese and its application to coastal marine sediments

Auteurs: W.K.Lenstra, R. Klomp, F.Molema, T.Behrends,C.P.Slomp
Publié dans: Chemical Geology, Numéro 1, 2021, Page(s) 1-10, ISSN 0009-2541
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.chemgeo.2021.120538

Sulfide Toxicity as Key Control on Anaerobic Oxidation of Methane in Eutrophic Coastal Sediments

Auteurs: Paula Dalcin Martins, João P. R. C. de Monlevad, Maider J. Echeveste Medrano, Wytze Klaas Lenstra, Anna Julia Wallenius, Martijn Hermans, Caroline P. Slomp, Cornelia Ulrike Welte, Mike S. M. Jetten, Niels A. G. M. van Helmond
Publié dans: Environmental Science & Technology, Numéro 58, 2024, Page(s) 11421-11435, ISSN 0013-936X
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.est.3c10418

Investigating the Chemolithoautotrophic and Formate Metabolism of Nitrospira moscoviensis by Constraint-Based Metabolic Modeling and 13 C-Tracer Analysis

Auteurs: Christopher E. Lawson, Aniela B. Mundinger, Hanna Koch, Tyler B. Jacobson, Coty A. Weathersby, Mike S. M. Jetten, Martin Pabst, Daniel Amador-Noguez, Daniel R. Noguera, Katherine McMahon, Sebastian Lücker
Publié dans: mSystems, Numéro 6/4, 2021, ISSN 2379-5077
Éditeur: asm
DOI: 10.1128/msystems.00173-21

Enrichment of novel Verrucomicrobia , Bacteroidetes , and Krumholzibacteria in an oxygen‐limited methane‐ and iron‐fed bioreactor inoculated with Bothnian Sea sediments

Auteurs: Paula Dalcin Martins, Anniek Jong, Wytze K. Lenstra, Niels A. G. M. Helmond, Caroline P. Slomp, Mike S. M. Jetten, Cornelia U. Welte, Olivia Rasigraf
Publié dans: MicrobiologyOpen, Numéro 10/1, 2021, ISSN 2045-8827
Éditeur: John Wiley and Sons Inc.
DOI: 10.1002/mbo3.1175

Precession-driven variations in phosphorus cycling facilitated Earth’s oxygenation in the early Proterozoic

Auteurs: Wytze K. Lenstra, Margriet L. Lantink, Rick Hennekam, Paul R.D. Mason, Gert-Jan Reichart, Frederik J. Hilgen, Caroline P. Slomp
Publié dans: Chemical Geology, Numéro 691, 2025, Page(s) 122857, ISSN 0009-2541
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.chemgeo.2025.122857

Methanogenic archaea use a bacteria-like methyltransferase system to demethoxylate aromatic compounds

Auteurs: Julia M. Kurth, Masaru K. Nobu, Hideyuki Tamaki, Nadieh de Jonge, Stefanie Berger, Mike S. M. Jetten, Kyosuke Yamamoto, Daisuke Mayumi, Susumu Sakata, Liping Bai, Lei Cheng, Jeppe Lund Nielsen, Yoichi Kamagata, Tristan Wagner, Cornelia U. Welte
Publié dans: The ISME Journal, 2021, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-021-01025-6

Activity-based labelling of ammonia- and alkane-oxidizing microorganisms including ammonia-oxidizing archaea

Auteurs: Dimitra Sakoula, Arne Schatteman, Pieter Blom, Mike S M Jetten, Maartje A H J van Kessel, Laura Lehtovirta-Morley, Sebastian Lücker
Publié dans: ISME Communications, Numéro 4, 2024, ISSN 2730-6151
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/ismeco/ycae092

Methane-Dependent Extracellular Electron Transfer at the Bioanode by the Anaerobic Archaeal Methanotroph “Candidatus Methanoperedens”

Auteurs: Heleen T. Ouboter, Tom Berben, Stefanie Berger, Mike S. M. Jetten, Tom Sleutels, Annemiek Ter Heijne and Cornelia U. Welte
Publié dans: frontiers in microbiology, Numéro 1, 2022, Page(s) 1-10, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2022.820989

Complete Genome Sequence of the Aerobic Facultative Methanotroph Methylocella tundrae Strain T4

Auteurs: Martine A. R. Kox, Muhammad Farhan Ul Haque, Theo A. van Alen, Andrew T. Crombie, Mike S. M. Jetten, Huub J. M. Op den Camp, Svetlana N. Dedysh, Maartje A. H. J. van Kessel, J. Colin Murrell
Publié dans: Microbiology Resource Announcements, Numéro 8/20, 2019, Page(s) 1-2, ISSN 2576-098X
Éditeur: asm
DOI: 10.1128/mra.00286-19

Anaerobic methanotrophy is stimulated by graphene oxide in a brackish urban canal sediment

Auteurs: Koen A. J. Pelsma; Niels A. G. M. van Helmond; Wytze K. Lenstra; Thomas Röckmann; Mike S. M. Jetten; Caroline P. Slomp; Cornelia U. Welte
Publié dans: environmental microbiology, Numéro 2, 2023, Page(s) 3104-3115, ISSN 1462-2920
Éditeur: ami
DOI: 10.1111/1462-2920.16501

Simultaneous sulfide and methane oxidation by an extremophile

Auteurs: Rob A. Schmitz, Stijn H. Peeters, Sepehr S. Mohammadi, Tom Berben, Timo van Erven, Carmen A. Iosif, Theo van Alen, Wouter Versantvoort, Mike S. M. Jetten, Huub J. M. Op den Camp & Arjan Pol
Publié dans: Nature communications, 2023, Page(s) 1-10, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38699-9

Anthropogenic and Environmental Constraints on the Microbial Methane Cycle in Coastal Sediments

Auteurs: Anna J. Wallenius, Paula Dalcin Martins, Caroline P. Slomp, Mike S. M. Jetten
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 12, 2021, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.631621

Seasonal dynamics of nitrification in the water column of marine Lake Grevelingen

Auteurs: Nicky Dotsios, Jessica Venetz, Olga M. Zygadlowska, Wytze K. Lenstra, Niels A.G.M. van Helmond, Anna J. Wallenius, Robin Klomp, Caroline P. Slomp, Mike S.M. Jetten, Maartje A.H.J. van Kessel, Sebastian Lücker
Publié dans: 2025
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.06.29.662106

Mini-bacterioferritins: Structural insight into a new type of ferritin-like protein from an anaerobic methane-oxidising archaeon

Auteurs: Martijn Wissink, Sylvain Engilberge, Pedro Leão, Robert S. Jansen, Mike S. M. Jetten, Antoine Royant, Cornelia U. Welte, Tristan Wagner
Publié dans: 2025
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.06.06.658376

Long-term euxinia hinders microbial ammonium removal in brackish coastal waters

Auteurs: Nicky Dotsios, Lina Piso, Jessica Venetz, Olga M. Żygadłowska, Niels A.G.M. van Helmond, Wytze K. Lenstra, Claudia Frey, Alessandra Mazzoli, Moritz F. Lehmann, Florian Roth, Christian Stranne, Christoph Humborg, Tom Berben, Pedro E. Leão, Maartje A.H.J. van Kessel, Sebastian Lücker, Mike S.M. Jetten, Caroline P. Slomp
Publié dans: 2025
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.06.30.662269

Unraveling nitrogen, sulfur and carbon metabolic pathways and microbial community transcriptional responses to substrate deprivation and toxicity stresses in a bioreactor mimicking anoxic brackish coastal sediment conditions

Auteurs: Paula Dalcin Martins, Maider J. Echeveste, Arslan Arshad, Julia Kurth, Heleen Ouboter, Mike S. M. Jetten, Cornelia U. Welte
Publié dans: BiorXiv, 2021, ISSN 2692-8205
Éditeur: cold spring harbor lab
DOI: 10.1101/2021.08.31.458400

Biogeochemical drivers of microbial methane removal in eutrophic coastal waters

Auteurs: Venetz, J.
Publié dans: Numéro 2, 2024, ISBN 9789464962406
Éditeur: Radboud university

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