Pathogen Oriented SNARE Trafficking for Immune Tailoring

Informations projet

POST-IT

N° de convention de subvention: 862137

DOI

10.3030/862137

Projet clôturé

Date de signature de la CE 30 Janvier 2020

Date de début 1 Mai 2020

Date de fin 30 Avril 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 000 000,00

Contribution de l’UE

€ 2 000 000,00

Coordonné par

RIJKSUNIVERSITEIT GRONINGEN
Netherlands

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan (DMP)

Participation in the Open Research Data Pilot

Publications

Peer reviewed articles (27)

The PIKfyve Inhibitor Apilimod: A Double-Edged Sword against COVID-19

Auteurs: Maksim V. Baranov, Frans Bianchi, Geert van den Bogaart
Publié dans: Cells, Numéro 10/1, 2021, Page(s) 30, ISSN 2073-4409
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/cells10010030

Rerouting trafficking circuits through posttranslational SNARE modifications

Auteurs: Warner, H.M., Mahajan, S., & van den Bogaart, G.
Publié dans: Journal of Cell Science, Numéro 35, 2022, Page(s) jcs260112, ISSN 1477-9137
Éditeur: Company of Biologists
DOI: 10.1242/jcs.260112

CD36 as a double-edged sword in cancer

Auteurs: Muwei Jiang, Renske Karsenberg, Frans Bianchi, Geert van den Bogaart
Publié dans: Immunology Letters, Numéro 265, 2024, Page(s) 7-15, ISSN 0165-2478
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.imlet.2023.12.002

5-Ethynyluridine: a bio-orthogonal uridine variant for mRNA-based therapies and vaccines.

Auteurs: Maassen, S., Coenen, B., Dulk, S., van der Werff, M., Warner, H., Spada, F., Frischmuth, T., Incarnato, D., & van den Bogaart, G.
Publié dans: ChemBioChem, Numéro 24, 2023, Page(s) e202200658, ISSN 1439-7633
Éditeur: John Wiley
DOI: 10.1002/cbic.202200658

Unveiling the impact of <scp>GOLM1</scp>/<scp>GP73</scp> on cytokine production in cancer and infectious disease

Auteurs: Myrthe T Frans, Ella M Kuipers, Frans Bianchi, Geert van den Bogaart
Publié dans: Immunology &amp; Cell Biology, Numéro 101, 2023, Page(s) 727-734, ISSN 0818-9641
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/imcb.12664

A quantitative in vitro collagen uptake assay

Auteurs: Sjors Maassen, Harry M. Warner, Pieter Grijpstra, Geert van den Bogaart
Publié dans: MethodsX, Numéro 11, 2023, Page(s) 102288, ISSN 2215-0161
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.mex.2023.102288

Cofilin-Driven Nuclear Deformation Drives Dendritic Cell Migration Through the Extracellular Matrix

Auteurs: Harry Marcus Warner, Giulia Franciosa, Guus van der Borg, Felix Faas, Claire Koenig, Rinse de Boer, Rene Classens, Sjors Maassen, Maksim Baranov, Shweta Mahajan, Deepti Dabral, Britt Coenen, Frans Bianchi, Niek van Hilten, Herre Jelger Risselada, Wouter Roos, Jesper Velgaard Olsen, Laia Querol Cano, Geert van den Bogaart
Publié dans: Cell Reports, Numéro 43, 2023, Page(s) 113866., ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.2139/ssrn.4332064

Vacuolar escape of foodborne bacterial pathogens

Auteurs: Frans Bianchi, Geert van den Bogaart
Publié dans: Journal of Cell Science, Numéro 134/5, 2020, Page(s) jcs247221, ISSN 0021-9533
Éditeur: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jcs.247221

Fluorescence lifetime imaging of pH along the secretory pathway

Auteurs: Linders P; ter Beest M; van den Bogaart G; van den Bogaart G
Publié dans: ACS chemical biology, Numéro 15548929, 2022, Page(s) 240-251, ISSN 1554-8929
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.1c00907

Giant worm-shaped ESCRT scaffolds surround actin-independent integrin clusters

Auteurs: Femmy C. Stempels, Muwei Jiang, Harry M. Warner, Magda-Lena Moser, Maaike H. Janssens, Sjors Maassen, Iris H. Nelen, Rinse de Boer, William F. Jiemy, David Knight, Julian Selley, Ronan O’Cualain, Maksim V. Baranov, Thomas C.Q. Burgers, Roberto Sansevrino, Dragomir Milovanovic, Peter Heeringa, Matthew C. Jones, Rifka Vlijm, Martin ter Beest, Geert van den Bogaart
Publié dans: Journal of Cell Biology, Numéro 222, 2023, ISSN 0021-9525
Éditeur: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.202205130

The Roles of Phospholipase A2 in Phagocytes

Auteurs: Dabral, D., van den Bogaart, G
Publié dans: Front. Cell Dev. Biol., Numéro 2296634X, 2021, Page(s) 673502, ISSN 2296-634X
Éditeur: Frontiers
DOI: 10.3389/fcell.2021.673502

Mitochondrial interaction of fibrosis-protective 5-methoxy tryptophan enhances collagen uptake by macrophages.

Auteurs: Maassen, S., Warner, H., Ioannidis, M., Jansma, J., Markus, H., El Aidy, S., Chiara, M., Luis Chiara, J., Maierhofer, L., Weavers, H. & van den Bogaart, G.
Publié dans: Free Radic. Biol. Med., Numéro 18734596, 2022, Page(s) 287-297, ISSN 1873-4596
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.freeradbiomed.2022.06.235

Reverse Signaling by MHC-I Molecules in Immune and Non-Immune Cell Types

Auteurs: Elke M. Muntjewerff, Luca D. Meesters, Geert van den Bogaart, Natalia H. Revelo
Publié dans: Frontiers in Immunology, Numéro 11, 2020, ISSN 1664-3224
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fimmu.2020.605958

Congenital disorder of glycosylation caused by starting site-specific variant in syntaxin-5

Auteurs: Peter T. A. Linders, Eveline C. F. Gerretsen, Angel Ashikov, Mari-Anne Vals, Rinse de Boer, Natalia H. Revelo, Richard Arts, Melissa Baerenfaenger, Fokje Zijlstra, Karin Huijben, Kimiyo Raymond, Kai Muru, Olga Fjodorova, Sander Pajusalu, Katrin Õunap, Martin ter Beest, Dirk Lefeber, Geert van den Bogaart
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-26534-y

Antigen presentation of post‐translationally modified peptides in major histocompatibility complexes

Auteurs: Alexine S de Wit, Frans Bianchi, Geert van den Bogaart
Publié dans: Immunology &amp; Cell Biology, Numéro 103, 2025, Page(s) 161-177, ISSN 0818-9641
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/imcb.12839

What makes (hydroxy)chloroquine ineffective against COVID-19: insights from cell biology

Auteurs: Dania Altulea, Sjors Maassen, Maksim V Baranov, G van den Bogaart
Publié dans: Journal of Molecular Cell Biology, Numéro 13/3, 2021, Page(s) 175-184, ISSN 1759-4685
Éditeur: Oxford Academic
DOI: 10.1093/jmcb/mjab016

Protonophore activity of short‐chain fatty acids induces their intracellular accumulation and acidification

Auteurs: Muwei Jiang, Frans Bianchi, Geert van den Bogaart
Publié dans: FEBS Letters, 2025, ISSN 0014-5793
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1002/1873-3468.70064

A sensitive and less cytotoxic assay for identification of proliferating T cells based on bioorthogonally-functionalized uridine analogue.

Auteurs: Stempels, F.C., de Wit, A.S., Swierstra, M.S., Maassen, S., Bianchi, F., van den Bogaart, G., & Baranov, M.V.
Publié dans: J. Immunol. Methods., Numéro 00221759, 2022, Page(s) 113228, ISSN 0022-1759
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jim.2022.113228

Itaconate promotes a wound resolving phenotype in pro-inflammatory macrophages

Auteurs: Maassen, S., Coenen, B., Ioannidis, M., Harber, K., Grijpstra, P., Van den Bossche, J., & van den Bogaart, G.
Publié dans: Redox Biol, Numéro 59, 2023, Page(s) 102591, ISSN 2213-2317
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.redox.2022.102591

Chromogranin A regulates gut permeability via the antagonistic actions of its proteolytic peptides

Auteurs: Elke M. Muntjewerff, Kechun Tang, Lisanne Lutter, Gustaf Christoffersson, Mara J. T. Nicolasen, Hong Gao, Gajanan D. Katkar, Soumita Das, Martin ter Beest, Wei Ying, Pradipta Ghosh, Sahar El Aidy, Bas Oldenburg, Geert van den Bogaart, Sushil K. Mahata
Publié dans: Acta Physiologica, Numéro 232/2, 2021, ISSN 1748-1708
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/apha.13655

Transmembrane helices are an overlooked and evolutionarily conserved source of major histocompatibility complex class II epitopes. 12: .

Auteurs: Bilderbeek, R., Baranov, M., van den Bogaart., G., & Bianchi, F.
Publié dans: Front. Immunol., Numéro 16643224, 2022, Page(s) 763044, ISSN 1664-3224
Éditeur: Frontiers
DOI: 10.3389/fimmu.2021.763044

Immunosuppression of Macrophages Underlies the Cardioprotective Effects of CST (Catestatin)

Auteurs: Wei Ying, Kechun Tang, Ennio Avolio, Jan M. Schilling, Teresa Pasqua, Matthew A. Liu, Hongqiang Cheng, Hong Gao, Jing Zhang, Sumana Mahata, Myung S. Ko, Gautam Bandyopadhyay, Soumita Das, David M. Roth, Debashis Sahoo, Nicholas J.G. Webster, Farah Sheikh, Gourisankar Ghosh, Hemal H. Patel, Pradipta Ghosh, Geert van den Bogaart, Sushil K. Mahata
Publié dans: Hypertension, Numéro 77/5, 2021, Page(s) 1670-1682, ISSN 0194-911X
Éditeur: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1161/hypertensionaha.120.16809

Close membrane apposition facilitates ion gradients in the lumen of phagosomes

Auteurs: Baranov, M.V., Ioannidis, M., Balahsioui, S., Boersma, A., de Boer R., Kumar, M., Niwa, M., Hirayama, T., Zhou, Q., Hopkins, T.M., Grijpstra, P., Thutupalli, S., Sacanna, S., & van den Bogaart G.
Publié dans: Biophys. Rep., Numéro 26670747, 2022, Page(s) 100069, ISSN 2667-0747
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.bpr.2022.100069

Antigen Cross-Presentation by Macrophages

Auteurs: Elke M. Muntjewerff, Luca D. Meesters, Geert van den Bogaart
Publié dans: Frontiers in Immunology, Numéro 11, 2020, ISSN 1664-3224
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fimmu.2020.01276

Novel and conventional inhibitors of canonical autophagy differently affect LC3-associated phagocytosis

Auteurs: Femmy C. Stempels; Maaike H. Janssens; Martin Beest; Rob J. Mesman; Natalia H. Revelo; Melina Ioannidis; Geert den Bogaart
Publié dans: urn:issn:, Numéro 00145793, 2022, ISSN 0014-5793
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.5281/zenodo.5714529

Sugary Logistics Gone Wrong: Membrane Trafficking and Congenital Disorders of Glycosylation

Auteurs: Peter T. A. Linders, Ella Peters, Martin ter Beest, Dirk J. Lefeber, Geert van den Bogaart
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 21/13, 2020, Page(s) 4654, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms21134654

Modulation of Immune Responses by Particle Size and Shape

Auteurs: Maksim V. Baranov, Manoj Kumar, Stefano Sacanna, Shashi Thutupalli, Geert van den Bogaart
Publié dans: Frontiers in Immunology, Numéro 11, 2021, ISSN 1664-3224
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fimmu.2020.607945