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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Diagnostic drug response-profiling using SLAMseq

Description du projet

Une méthodologie pour évaluer rapidement la réponse aux médicaments

Pouvoir prédire la réponse à un traitement médicamenteux améliorerait sans aucun doute son efficacité et limiterait les traitements inutiles et les effets secondaires liés aux médicaments. Pour traiter ce problème, le projet SLAM-Dx financé par l’UE a mis au point une méthode très sensible (SLAMseq) permettant de quantifier l’ARN existant et nouvellement synthétisé dans les cellules. Cette méthode devrait permettre de déterminer l’effet d’un traitement médicamenteux associé à des modifications de l’expression génétique provoquées par des thérapeutiques spécifiques. La rapidité, l’efficacité et la précision de SLAMseq en font un outil idéal pour guider les protocoles de traitement anticancéreux personnalisés en clinique. De plus, la méthode SLAMseq peut être utilisée pour un criblage à haut débit au cours du processus de développement de médicaments.

Objectif

One of the greatest challenges today is to select the right drug for the right patient at the right time. A lack of diagnostic tools for predicting therapy response currently hampers patient-tailored treatment decisions in the clinic with severe implications for economy and – most importantly – patient survival.

Profiling transcriptional responses to drug treatment is a key method for probing the activity of targeted therapeutics and guiding their use in the clinic. A major limitation of established gene expression profiling techniques (such as microarrays and RNA-seq) is their limited time resolution precluding the distinction of direct from secondary transcriptional responses to drug therapy. This hampers their utility for deciphering drug action and guiding patient-tailored treatment decisions.

To overcome this problem, as part of an ERC-StG project (Systematic in-vivo analysis of chromatin-associated targets in leukemia, 336860) I have co-developed thiol(SH)-linked alkylation for the metabolic sequencing of RNA (SLAMseq) as a rapid, robust and highly scalable method for the unbiased quantification of changes in mRNA production upon cell perturbations. Its unique features (low input cell numbers, short treatment-to-sample time, 1-day protocol library preparation in 96-well format) may qualify SLAMseq as the first method to probe the function, efficacy and selectivity of candidate therapeutics in primary (tumor) cells with unprecedented precision and on a large scale.

In this ERC-PoC project, I propose to establish technical and commercial proof-of-concept for SLAMseq’s application in preclinical and clinical drug development and optimization, and for patient-tailored treatment selection. Upon the successful proof-of-concept for SLAMseq’s application as diagnostic tool, SLAM-Dx has the potential to revolutionize translational research and personalised medicine in a variety of disease areas.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-POC-LS - ERC Proof of Concept Lump Sum Pilot

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2019-PoC

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

FORSCHUNGSINSTITUT FUR MOLEKULARE PATHOLOGIE GESELLSCHAFT MBH
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 150 000,00
Adresse
CAMPUS-VIENNA-BIOCENTER 1
1030 Wien
Autriche

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Région
Ostösterreich Wien Wien
Type d’activité
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 150 000,00

Bénéficiaires (1)

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