Unravelling Glycochemistry with Ion Mobility Spectrometry and Gas-Phase Spectroscopy

Informations projet

GlycoSpec

N° de convention de subvention: 863934

DOI

10.3030/863934

Date de signature de la CE 2 Mars 2020

Date de début 1 Août 2020

Date de fin 31 Janvier 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 642 850,00

Contribution de l’UE

€ 2 642 850,00

Coordonné par

FREIE UNIVERSITAET BERLIN
Germany

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Publications

Peer reviewed articles (22)

Predicting Structural Motifs of Glycosaminoglycans using Cryogenic Infrared Spectroscopy and Random Forest

Auteurs: Riedel, J; Lettow, M.; Grabarics, M.; Götze, M.; Miller, R. L.; Boons, G.-J.; Meijer, G.; von Helden, G; Szekeres, G. P.; Pagel, K.
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, 2023, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c12762

Untersuchung des reaktiven Intermediats der RNA Autohydrolyse mittels kryogener Infrarotspektroskopie in der Gasphase

Auteurs: Kim Greis, Carla Kirschbaum, Dr. Martín I. Taccone, Dr. Michael Götze, Sandy Gewinner, Dr. Wieland Schöllkopf, Prof. Gerard Meijer, Prof. Gert von Helden, Prof. Kevin Pagel
Publié dans: Angewandte Chemie, Numéro 134, 2022, ISSN 0044-8249
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/ange.202115481

A 3D-Printed Offline Nano-ESI Source for Bruker MS Instruments

Auteurs: Michael Götze, Lukasz Polewski, Leïla Bechtella, Kevin Pagel
Publié dans: Journal of the American Society for Mass Spectrometry, Numéro 34, 2023, Page(s) 2403-2406, ISSN 1044-0305
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1021/jasms.3c00214

Establishing Fatty Acid Double Bond Position and Configuration by Gas-Phase Infrared Spectroscopy

Auteurs: Kirschbaum, C.; Young, R. S. E.; Greis, K.; Menzel, J. P.; Gewinner, S.; Schöllkopf, W.; Meijer, G.; von Helden, G.; Causon, T.; Narreddula, V. R.; Poad, B. L. J.; Blanksby, S. J.; Pagel, K.,
Publié dans: Chemical Science, Numéro 14, 2023, Page(s) 2518-2527, ISSN 2041-6539
Éditeur: RSC
DOI: 10.1039/d2sc06487a

Lipid Analysis by Mass Spectrometry coupled with Laser Light, Analysis and Sensing

Auteurs: Kirschbaum, C.; Pagel, K.
Publié dans: Analysis and Sensing, 2023, Page(s) e202200103, ISSN 2629-2742
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/anse.202200103

Decoding the Fucose Migration Product during Mass-Spectrometric Analysis of Blood Group Epitopes

Auteurs: Lettow, M.; Mucha, E.; Greis, K.; Yaman, M.; Manz, C.; Hoffmann, W.; Lambeth, T.R.; Meijer, G.; Julian, R.R.; von Helden, G.; Marianski, M.; Pagel, K.
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, 2023, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202302883

Cryogenic infrared spectroscopy provides mechanistic insight into the fragmentation of phospholipid silver adducts

Auteurs: Kirschbaum, C.; Greis, K.; Gewinner, S.; Schöllkopf, W.; Meijer, G.; Helden, G.; Pagel, K.
Publié dans: Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2022, ISSN 1618-2642
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00216-022-03927-6

The Effect of Electron Density in Acyl Protecting Groups on the Selectivity of Galactosylations

Auteurs: Greis, K.; Leichnitz, S.; Kirschbaum, C.; Chang, C.-W.; Meijer, G.; von Helden, G.; Seeberger, P. H.; Pagel, K.
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 144, 2022, Page(s) 20258–20266, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c05859

Neighboring Group Participation of Benzoyl Protecting Groups in C3- and C6-Fluorinated Glucose

Auteurs: Kim Greis, Carla Kirschbaum, Giulio Fittolani, Eike Mucha, Rayoon Chang, Gert von Helden, Gerard Meijer, Martina Delbianco, Peter H. Seeberger, Kevin Pagel
Publié dans: European Journal of Organic Chemistry, 2022, ISSN 1434-193X
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/ejoc.202200255

State-of-the-art Glycosaminoglycan Characterization

Auteurs: Zappe, A.; Miller, R.L.; Struwe, W.B.; Pagel, K.
Publié dans: Mass Spectrometry Reviews, Numéro 41, 2022, Page(s) 194-202, ISSN 1098-2787
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/mas.21737

The Impact of Leaving Group Anomericity on the Structure of Glycosyl Cations

Auteurs: Greis, K.; Mucha, E.; Lettow, M.; Thomas, D. A.; Kirschbaum, C.; Moon, S.; Pardo, A.; von Helden, G.; Meijer, G.; Gilmore, K.; Seeberger, P. H.; Pagel, K.
Publié dans: ChemPhysChem, Numéro 21, 2020, Page(s) 1905-1907, ISSN 1439-4235
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cphc.202000473

Studying the Key Intermediate of RNA Autohydrolysis by Cryogenic Gas-Phase Infrared Spectroscopy

Auteurs: Kim Greis, Carla Kirschbaum, Dr. Martín I. Taccone, Dr. Michael Götze, Sandy Gewinner, Dr. Wieland Schöllkopf, Prof. Gerard Meijer, Prof. Gert von Helden, Prof. Kevin Pagel
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, 2022, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202115481

Characterization and Fate of a Septanosyl Ferrier Cation in the Gas and Solution Phases

Auteurs: Kim Greis; Caleb E. Griesbach; Carla Kirschbaum; Gerard Meijer; Gert von Helden; Kevin Pagel; Mark W. Peczuh
Publié dans: The Journal of Organic Chemistry, Numéro 88, 2023, ISSN 0022-3263
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.joc.3c00079

Elucidating reactive sugar-intermediates by mass spectrometry

Auteurs: Chun-Wei Chang, Dana Wehner, Gurpur Rakesh D. Prabhu, Eunjin Moon, Marc Safferthal, Leïla Bechtella, Nicklas Österlund, Gaël M. Vos, Kevin Pagel
Publié dans: Communications Chemistry, Numéro 8, 2025, ISSN 2399-3669
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42004-025-01467-5

Mechanistic insight into benzylidene-directed glycosylation reactions using cryogenic infrared spectroscopy

Auteurs: Chun-Wei Chang, Kim Greis, Gurpur Rakesh D. Prabhu, Dana Wehner, Carla Kirschbaum, Katja Ober, América Y. Torres-Boy, Sabrina Leichnitz, Gerard Meijer, Gert von Helden, Peter H. Seeberger, Kevin Pagel
Publié dans: Nature Synthesis, Numéro 3, 2024, Page(s) 1377-1384, ISSN 2731-0582
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44160-024-00619-0

Direct Experimental Characterization of a Sialyl Cation

Auteurs: Franziska Dahlmann, Caleb E. Griesbach, América Y. Torres‐Boy, Gert von Helden, Mark W. Peczuh, Kevin Pagel, Kim Greis
Publié dans: Chemistry – A European Journal, Numéro 31, 2025, ISSN 0947-6539
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202403724

Direct Experimental Characterization of the Ferrier Glycosyl Cation in the Gas Phase.

Auteurs: Kim Greis; Kim Greis; Carla Kirschbaum; Carla Kirschbaum; Sabrina Leichnitz; Sabrina Leichnitz; Sandy Gewinner; Wieland Schöllkopf; Gert von Helden; Gerard Meijer; Peter H. Seeberger; Peter H. Seeberger; Kevin Pagel; Kevin Pagel
Publié dans: Organic Letters, 2020, Page(s) 8916-8919, ISSN 1523-7060
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.orglett.0c03301

Studying the Intrinsic Reactivity of Chromanes by Gas-Phase Infrared Spectroscopy

Auteurs: Carla Kirschbaum, Kim Greis, América Y. Torres-Boy, Jerome Riedel, Sandy Gewinner, Wieland Schöllkopf, Gerard Meijer, Gert von Helden, Kevin Pagel
Publié dans: Journal of the American Society for Mass Spectrometry, Numéro 35, 2024, Page(s) 1950-1958, ISSN 1044-0305
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1021/jasms.4c00216

Multiply charged ion profiles in the UHPLC-HRMS analysis of palytoxin analogues from <i>Ostreopsis</i> cf. <i>ovata</i> blooms

Auteurs: Noemí Inmaculada Medina-Pérez, Francisco Javier Santos, Elisa Berdalet, Encarnación Moyano
Publié dans: Analytical Methods, Numéro 15, 2024, Page(s) 1355-1364, ISSN 1759-9660
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2ay02019j

Mass Spectrometry-Based Techniques to Elucidate the Sugar Code.

Auteurs: Márkó Grabarics; Márkó Grabarics; Maike Lettow; Maike Lettow; Carla Kirschbaum; Carla Kirschbaum; Kim Greis; Kim Greis; Christian Manz; Christian Manz; Kevin Pagel; Kevin Pagel
Publié dans: Chemical Reviews, 2021, ISSN 0009-2665
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.chemrev.1c00380

Reinvestigation of the internal glycan rearrangement of Lewis a and blood group type H1 epitopes

Auteurs: Vasilis Kontodimas, Murat Yaman, Kim Greis, Maike Lettow, Kevin Pagel, Mateusz Marianski
Publié dans: Physical Chemistry Chemical Physics, Numéro 26, 2024, Page(s) 14160-14170, ISSN 1463-9076
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3cp04491b

Glycosaminoglycans: What Remains To Be Deciphered?

Auteurs: Serge Perez; Olga Makshakova; Jesus Angulo; Emiliano Bedini; Antonella Bisio; Jose Luis de Paz; Elisa Fadda; Marco Guerrini; Michal Hricovini; Milos Hricovini; Frederique Lisacek; Pedro M. Nieto; Kevin Pagel; Giulia Paiardi; Ralf Richter; Sergey A. Samsonov; Romain R. Vivès; Dragana Nikitovic; Sylvie Ricard Blum
Publié dans: JACS Au, Numéro 4, 2023, ISSN 2691-3704
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacsau.2c00569