Unravelling Glycochemistry with Ion Mobility Spectrometry and Gas-Phase Spectroscopy

Projektinformationen

GlycoSpec

ID Finanzhilfevereinbarung: 863934

DOI

10.3030/863934

EK-Unterschriftsdatum 2 März 2020

Startdatum 1 August 2020

Enddatum 31 Januar 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 642 850,00

EU-Beitrag

€ 2 642 850,00

Koordiniert durch

FREIE UNIVERSITAET BERLIN
Germany

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (22)

Predicting Structural Motifs of Glycosaminoglycans using Cryogenic Infrared Spectroscopy and Random Forest

Autoren: Riedel, J; Lettow, M.; Grabarics, M.; Götze, M.; Miller, R. L.; Boons, G.-J.; Meijer, G.; von Helden, G; Szekeres, G. P.; Pagel, K.
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, 2023, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c12762

Untersuchung des reaktiven Intermediats der RNA Autohydrolyse mittels kryogener Infrarotspektroskopie in der Gasphase

Autoren: Kim Greis, Carla Kirschbaum, Dr. Martín I. Taccone, Dr. Michael Götze, Sandy Gewinner, Dr. Wieland Schöllkopf, Prof. Gerard Meijer, Prof. Gert von Helden, Prof. Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie, Ausgabe 134, 2022, ISSN 0044-8249
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/ange.202115481

A 3D-Printed Offline Nano-ESI Source for Bruker MS Instruments

Autoren: Michael Götze, Lukasz Polewski, Leïla Bechtella, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Journal of the American Society for Mass Spectrometry, Ausgabe 34, 2023, Seite(n) 2403-2406, ISSN 1044-0305
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1021/jasms.3c00214

Establishing Fatty Acid Double Bond Position and Configuration by Gas-Phase Infrared Spectroscopy

Autoren: Kirschbaum, C.; Young, R. S. E.; Greis, K.; Menzel, J. P.; Gewinner, S.; Schöllkopf, W.; Meijer, G.; von Helden, G.; Causon, T.; Narreddula, V. R.; Poad, B. L. J.; Blanksby, S. J.; Pagel, K.,
Veröffentlicht in: Chemical Science, Ausgabe 14, 2023, Seite(n) 2518-2527, ISSN 2041-6539
Herausgeber: RSC
DOI: 10.1039/d2sc06487a

Lipid Analysis by Mass Spectrometry coupled with Laser Light, Analysis and Sensing

Autoren: Kirschbaum, C.; Pagel, K.
Veröffentlicht in: Analysis and Sensing, 2023, Seite(n) e202200103, ISSN 2629-2742
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/anse.202200103

Decoding the Fucose Migration Product during Mass-Spectrometric Analysis of Blood Group Epitopes

Autoren: Lettow, M.; Mucha, E.; Greis, K.; Yaman, M.; Manz, C.; Hoffmann, W.; Lambeth, T.R.; Meijer, G.; Julian, R.R.; von Helden, G.; Marianski, M.; Pagel, K.
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, 2023, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202302883

Cryogenic infrared spectroscopy provides mechanistic insight into the fragmentation of phospholipid silver adducts

Autoren: Kirschbaum, C.; Greis, K.; Gewinner, S.; Schöllkopf, W.; Meijer, G.; Helden, G.; Pagel, K.
Veröffentlicht in: Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2022, ISSN 1618-2642
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00216-022-03927-6

The Effect of Electron Density in Acyl Protecting Groups on the Selectivity of Galactosylations

Autoren: Greis, K.; Leichnitz, S.; Kirschbaum, C.; Chang, C.-W.; Meijer, G.; von Helden, G.; Seeberger, P. H.; Pagel, K.
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, Ausgabe 144, 2022, Seite(n) 20258–20266, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c05859

Neighboring Group Participation of Benzoyl Protecting Groups in C3- and C6-Fluorinated Glucose

Autoren: Kim Greis, Carla Kirschbaum, Giulio Fittolani, Eike Mucha, Rayoon Chang, Gert von Helden, Gerard Meijer, Martina Delbianco, Peter H. Seeberger, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: European Journal of Organic Chemistry, 2022, ISSN 1434-193X
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/ejoc.202200255

State-of-the-art Glycosaminoglycan Characterization

Autoren: Zappe, A.; Miller, R.L.; Struwe, W.B.; Pagel, K.
Veröffentlicht in: Mass Spectrometry Reviews, Ausgabe 41, 2022, Seite(n) 194-202, ISSN 1098-2787
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/mas.21737

The Impact of Leaving Group Anomericity on the Structure of Glycosyl Cations

Autoren: Greis, K.; Mucha, E.; Lettow, M.; Thomas, D. A.; Kirschbaum, C.; Moon, S.; Pardo, A.; von Helden, G.; Meijer, G.; Gilmore, K.; Seeberger, P. H.; Pagel, K.
Veröffentlicht in: ChemPhysChem, Ausgabe 21, 2020, Seite(n) 1905-1907, ISSN 1439-4235
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cphc.202000473

Studying the Key Intermediate of RNA Autohydrolysis by Cryogenic Gas-Phase Infrared Spectroscopy

Autoren: Kim Greis, Carla Kirschbaum, Dr. Martín I. Taccone, Dr. Michael Götze, Sandy Gewinner, Dr. Wieland Schöllkopf, Prof. Gerard Meijer, Prof. Gert von Helden, Prof. Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, 2022, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202115481

Characterization and Fate of a Septanosyl Ferrier Cation in the Gas and Solution Phases

Autoren: Kim Greis; Caleb E. Griesbach; Carla Kirschbaum; Gerard Meijer; Gert von Helden; Kevin Pagel; Mark W. Peczuh
Veröffentlicht in: The Journal of Organic Chemistry, Ausgabe 88, 2023, ISSN 0022-3263
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.joc.3c00079

Elucidating reactive sugar-intermediates by mass spectrometry

Autoren: Chun-Wei Chang, Dana Wehner, Gurpur Rakesh D. Prabhu, Eunjin Moon, Marc Safferthal, Leïla Bechtella, Nicklas Österlund, Gaël M. Vos, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Communications Chemistry, Ausgabe 8, 2025, ISSN 2399-3669
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42004-025-01467-5

Mechanistic insight into benzylidene-directed glycosylation reactions using cryogenic infrared spectroscopy

Autoren: Chun-Wei Chang, Kim Greis, Gurpur Rakesh D. Prabhu, Dana Wehner, Carla Kirschbaum, Katja Ober, América Y. Torres-Boy, Sabrina Leichnitz, Gerard Meijer, Gert von Helden, Peter H. Seeberger, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Nature Synthesis, Ausgabe 3, 2024, Seite(n) 1377-1384, ISSN 2731-0582
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44160-024-00619-0

Direct Experimental Characterization of a Sialyl Cation

Autoren: Franziska Dahlmann, Caleb E. Griesbach, América Y. Torres‐Boy, Gert von Helden, Mark W. Peczuh, Kevin Pagel, Kim Greis
Veröffentlicht in: Chemistry – A European Journal, Ausgabe 31, 2025, ISSN 0947-6539
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202403724

Direct Experimental Characterization of the Ferrier Glycosyl Cation in the Gas Phase.

Autoren: Kim Greis; Kim Greis; Carla Kirschbaum; Carla Kirschbaum; Sabrina Leichnitz; Sabrina Leichnitz; Sandy Gewinner; Wieland Schöllkopf; Gert von Helden; Gerard Meijer; Peter H. Seeberger; Peter H. Seeberger; Kevin Pagel; Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Organic Letters, 2020, Seite(n) 8916-8919, ISSN 1523-7060
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.orglett.0c03301

Studying the Intrinsic Reactivity of Chromanes by Gas-Phase Infrared Spectroscopy

Autoren: Carla Kirschbaum, Kim Greis, América Y. Torres-Boy, Jerome Riedel, Sandy Gewinner, Wieland Schöllkopf, Gerard Meijer, Gert von Helden, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Journal of the American Society for Mass Spectrometry, Ausgabe 35, 2024, Seite(n) 1950-1958, ISSN 1044-0305
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1021/jasms.4c00216

Multiply charged ion profiles in the UHPLC-HRMS analysis of palytoxin analogues from <i>Ostreopsis</i> cf. <i>ovata</i> blooms

Autoren: Noemí Inmaculada Medina-Pérez, Francisco Javier Santos, Elisa Berdalet, Encarnación Moyano
Veröffentlicht in: Analytical Methods, Ausgabe 15, 2024, Seite(n) 1355-1364, ISSN 1759-9660
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2ay02019j

Mass Spectrometry-Based Techniques to Elucidate the Sugar Code.

Autoren: Márkó Grabarics; Márkó Grabarics; Maike Lettow; Maike Lettow; Carla Kirschbaum; Carla Kirschbaum; Kim Greis; Kim Greis; Christian Manz; Christian Manz; Kevin Pagel; Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Chemical Reviews, 2021, ISSN 0009-2665
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.chemrev.1c00380

Reinvestigation of the internal glycan rearrangement of Lewis a and blood group type H1 epitopes

Autoren: Vasilis Kontodimas, Murat Yaman, Kim Greis, Maike Lettow, Kevin Pagel, Mateusz Marianski
Veröffentlicht in: Physical Chemistry Chemical Physics, Ausgabe 26, 2024, Seite(n) 14160-14170, ISSN 1463-9076
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3cp04491b

Glycosaminoglycans: What Remains To Be Deciphered?

Autoren: Serge Perez; Olga Makshakova; Jesus Angulo; Emiliano Bedini; Antonella Bisio; Jose Luis de Paz; Elisa Fadda; Marco Guerrini; Michal Hricovini; Milos Hricovini; Frederique Lisacek; Pedro M. Nieto; Kevin Pagel; Giulia Paiardi; Ralf Richter; Sergey A. Samsonov; Romain R. Vivès; Dragana Nikitovic; Sylvie Ricard Blum
Veröffentlicht in: JACS Au, Ausgabe 4, 2023, ISSN 2691-3704
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacsau.2c00569