Deciphering the principles governing robust targeting of proteins to organelles

Informations projet

OnTarget

N° de convention de subvention: 864068

DOI

10.3030/864068

Projet clôturé

Date de signature de la CE 12 Decembre 2019

Date de début 1 Septembre 2020

Date de fin 31 Août 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 000 000,00

Contribution de l’UE

€ 2 000 000,00

Coordonné par

WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE
Israel

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Publications

Peer reviewed articles (19)

A Similarity-Based Method for Predicting Enzymatic Functions in Yeast Uncovers a New AMP Hydrolase

Auteurs: Nir Cohen Amit Kahana MayaSchuldiner
Publié dans: Journal of Molecular Biology, 2022, Page(s) 167478, ISSN 0022-2836
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2022.167478

Pls1 Is a Peroxisomal Matrix Protein with a Role in Regulating Lysine Biosynthesis

Auteurs: Yotam David; Inês Gomes Castro; Eden Yifrach; Chen Bibi; Enas Katawi; Dekel Yahav Har-Shai; Sagie Brodsky; Naama Barkai; Tommer Ravid; Miriam Eisenstein; Shmuel Pietrokovski; Maya Schuldiner; Einat Zalckvar
Publié dans: Cells; Volume 11; Numéro 9; Pages: 1426, Numéro 1, 2022, ISSN 2073-4409
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/cells11091426

ER-SURF: Riding the Endoplasmic Reticulum Surface to Mitochondria

Auteurs: Christian Koch; Maya Schuldiner; Johannes Herrmann
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, 2021, Page(s) 9655, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22179655

Beyond rare disorders: A new era for peroxisomal pathophysiology

Auteurs: Einat Zalckvar; Maya Schuldiner
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 1, 2022, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.05.028

Phosphorylation of the receptor protein Pex5p modulates import of proteins into peroxisomes

Auteurs: Sven Fischer, Jérôme Bürgi, Shiran Gabay-Maskit, Renate Maier, Thomas Mastalski, Eden Yifrach, Agnieszka Obarska-Kosinska, Markus Rudowitz, Ralf Erdmann, Harald W Platta, Matthias Wilmanns, Maya Schuldiner, Einat Zalckvar, Silke Oeljeklaus, Friedel Drepper, Bettina Warscheid
Publié dans: Biological Chemistry, 2022, ISSN 1431-6730
Éditeur: Walter de Gruyter GmbH & Co. KG
DOI: 10.1515/hsz-2022-0168

An avoidance segment resolves a lethal nuclear–mitochondrial targeting conflict during ribosome assembly

Auteurs: Michaela Oborská-Oplová, Alexander Gregor Geiger, Erich Michel, Purnima Klingauf-Nerurkar, Sven Dennerlein, Yury S. Bykov, Simona Amodeo, André Schneider, Maya Schuldiner, Peter Rehling, Vikram Govind Panse
Publié dans: Nature Cell Biology, Numéro 27, 2025, Page(s) 336-346, ISSN 1465-7392
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-024-01588-4

Systematic Approaches to Study Eclipsed Targeting of Proteins Uncover a New Family of Mitochondrial Proteins

Auteurs: Mark M, Klein O, Zhang Y, Das K, Elbaz A, Hazan RN, Lichtenstein M, Lehming N, Schuldiner M, Pines O
Publié dans: Cells, Numéro 12(11), 2023, Page(s) 1550, ISSN 2073-4409
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/cells12111550

Peroxisome function relies on organelle-associated mRNA translation

Auteurs: Noa Dahan, Yury S Bykov, Elizabeth A Boydston, Amir Fadel, Zohar Gazi, Hodaya Hochberg-Laufer, James Martenson, Vlad Denic, Yaron Shav-Tal , Jonathan S Weissman, Naama Aviram, Einat Zalckvar, Maya Schuldiner
Publié dans: Science Advances, 2022, Page(s) eabk2141, ISSN 2375-2548
Éditeur: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.abk2141

Sec61 channel subunit Sbh1/Sec61β promotes ER translocation of proteins with suboptimal targeting sequences and is fine-tuned by phosphorylation

Auteurs: Guido Barbieri, Julien Simon, Cristina R Lupusella, Fabio Pereira, Francesco Elia, Hadar Meyer, Maya Schuldiner, Steven D Hanes, Duy Nguyen, Volkhard Helms, Karin Römisch
Publié dans: Journal of Biological Chemistry, 2023, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2023.102895

Mpf1 affects the dual distribution of tail-anchored proteins between mitochondria and peroxisomes

Auteurs: Nitya Aravindan, Daniela G Vitali, Julia Breuer, Jessica Oberst, Einat Zalckvar, Maya Schuldiner, Doron Rapaport
Publié dans: EMBO Reports, 2025, ISSN 1469-3178
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44319-025-00440-6

A toolbox for systematic discovery of stable and transient protein interactors in baker's yeast

Auteurs: Nir Cohen; Zohar Gazi; Emma Fenech; Meital Kupervaser; Maya Schuldiner
Publié dans: Molecular Systems Biology, Numéro 1, 2023, ISSN 1744-4292
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.202211084

Novel targeting assay uncovers targeting information within peroxisomal ABC transporter Pxa1

Auteurs: Renate L.M. Jansen, Marco van den Noort, Arjen M. Krikken, Chen Bibi, Astrid Böhm, Maya Schuldiner, Einat Zalckvar, Ida J. van der Klei
Publié dans: BBA- Molecular Cell Research, 2023, ISSN 0167-4889
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbamcr.2023.119471

Determining the targeting specificity of the selective peroxisomal targeting factor Pex9

Auteurs: Eden Yifrach, Markus Rudowitz, Luis Daniel Cruz-Zaragoza, Asa Tirosh, Zohar Gazi, Yoav Peleg, Markus Kunze, Miriam Eisenstein, Wolfgang Schliebs, Maya Schuldiner, Ralf Erdmann, Einat Zalckvar
Publié dans: Biological Chemistry, 2022, ISSN 1431-6730
Éditeur: Walter de Gruyter GmbH & Co. KG
DOI: 10.1515/hsz-2022-0116

Widespread use of unconventional targeting signals in mitochondrial ribosome proteins.

Auteurs: Yury S. Bykov; Tamara Flohr; Felix Boos; Naama Zung; Johannes M. Herrmann; Maya Schuldiner
Publié dans: The EMBO Journal, Numéro 1, 2022, Page(s) e109519, ISSN 1460-2075
Éditeur: EMBO Press
DOI: 10.15252/embj.2021109519

Proteins that carry dual targeting signals can act as tethers between peroxisomes and partner organelles

Auteurs: Elena Bittner, Thorsten Stehlik, Jason Lam, Lazar Dimitrov, Thomas Heimerl, Isabelle Schöck, Jannik Harberding, Anita Dornes, Nikola Heymons, Gert Bange, Maya Schuldiner, Einat Zalckvar, Michael Bölker, Randy Schekman, Johannes Freitag
Publié dans: PLOS Biology, Numéro 22, 2024, Page(s) e3002508, ISSN 1545-7885
Éditeur: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002508

A systematic proximity ligation approach to studying protein-substrate specificity identifies the substrate spectrum of the Ssh1 translocon

Auteurs: Nir Cohen, Naama Aviram, Maya Schuldiner
Publié dans: EMBO Journal, 2023, ISSN 1460-2075
Éditeur: EMBO Press
DOI: 10.15252/embj.2022113385

The Fast and the Furious: Golgi Contact Sites

Auteurs: Yotam David, Ines Castro, Maya Schuldiner
Publié dans: Contact, 2021, Page(s) 1-15, ISSN 2515-2564
Éditeur: SAGE publishing
DOI: 10.1177/25152564211034424

Systematic multi-level analysis of an organelle proteome reveals new peroxisomal functions

Auteurs: Eden Yifrach, Duncan Holbrook-Smith, Jérôme Bürgi, Alaa Othman, Miriam Eisenstein, Carlo Wt van Roermund, Wouter Visser, Asa Tirosh, Markus Rudowitz, Chen Bibi, Shahar Galor, Uri Weill, Amir Fadel, Yoav Peleg, Ralf Erdmann, Hans R Waterham, Ronald J A Wanders, Matthias Wilmanns, Nicola Zamboni, Maya Schuldiner, Einat Zalckvar
Publié dans: Molecular Systems Biology, 2022, ISSN 1744-4292
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.202211186

A proteome-wide yeast degron collection for the dynamic study of protein function

Auteurs: Rosario Valenti, Yotam David, Dunya Edilbi, Benjamin Dubreuil, Angela Boshnakovska, Yeynit Asraf, Tomer-Meir Salame, Ehud Sass, Peter Rehling, Maya Schuldiner
Publié dans: Journal of Cell Biology, Numéro 224, 2024, ISSN 0021-9525
Éditeur: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.202409050