Description du projet
Des scientifiques révèlent de nouveaux plans pour les modifications post-translationnelles au sein des protéines
Une fois que l’ADN est transcrit en ARN, celui-ci permet de traduire le code des protéines à l’aide des ribosomes. De nombreuses protéines sont soumises à des modifications post-translationnelles (MPT) qui peuvent survenir à n’importe quel moment de leur cycle de vie. Il existe actuellement quelques centaines de types de MPT différents connus, et ils jouent un rôle important dans la diversité protéique. Alors que le génome humain contient environ 20 à 25 000 gènes, le protéome humain comporte quant à lui plus d’un million de protéines différentes. Le projet nbPTMs ambitieux financé par l’UE est parti à la découverte des modifications post-translationnelles basées sur des nucléotides, jusqu’ici inconnues, et a pour objectif de les cartographier à travers les protéomes eucaryotes. Cataloguer les nouveaux substrats chimiques des modifications, leurs emplacements et le type de modifications auquel elles sont soumises permet de fournir un point de départ, de manière à étudier leurs rôles dans des contextes de santé et de maladie.
Objectif
Nucleotide-based post-translational modifications (nbPTMs) play key roles in health and disease, from bacterial pathogenesis to cancer. However, technical challenges of these versatile, but chemically complex protein modifications have constrained our fundamental understanding of even the most intensely studied nbPTMs for decades. The overarching aim of this proposal is to establish, apply and disseminate a methodology to unveil novel types of nbPTMs and allow site-specific proteomic analyses. The conceptual innovation lies in a strategy for turning the complex chemical structures of nbPTMs from a challenge to an advantage. First, shared chemical moieties will be exploited to develop pan-specific enrichment of multiple nbPTMs. For this purpose, we will generate the first nbPTMs-specific antibodies by converting specific signalling proteins into biotechnology tools for chemoenzymatic synthesis of challenging peptide antigens (aim 1). Second, we will take advantage of the chemical lability of nbPTMs to analyse modified peptides using a nucleobase-targeted mass spectrometry approach (aim 2). The unbiased scope of our methodology will make possible the discovery of as yet unknown forms of nbPTMs (aim 3) and nbPTM site mapping throughout eukaryotic proteomes (aim 4). These new materials, methods, discoveries and datasets will be made publicly available to allow future investigations of nbPTMs by the scientific community. The new substrates, sites and nbPTMs will provide starting points for biological characterization (aim 5). Poised at the interface of biology and technology, this interdisciplinary research project has the potential to explore new territories within established biomedical fields and to contribute to the knowledge base for improved treatment of diseases.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2019-COG
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80539 Munchen
Allemagne