New Reagents for Quantifying the Routing and Kinetics of T-cell Activation

Informations projet

KineTic

N° de convention de subvention: 865175

DOI

10.3030/865175

Projet clôturé

Date de signature de la CE 12 Février 2020

Date de début 1 Août 2020

Date de fin 31 Janvier 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 000 000,00

Contribution de l’UE

€ 2 000 000,00

Coordonné par

UNIVERSITEIT LEIDEN
Netherlands

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Publications

Peer reviewed articles (17)

QUAS-R: An SLC1A5-mediated glutamine uptake assay with single-cell resolution reveals metabolic heterogeneity with immune populations

Auteurs: Leonard R. Pelgrom, Gavin M. Davis, Simon O’Shaughnessy, Emilie J.M. Wezenberg, Sander I. Van Kasteren, David K. Finlay, Linda V. Sinclair
Publié dans: Cell Reports, Numéro 42, 2024, Page(s) 112828, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112828

Single-cell analysis of regions of interest (SCARI) using a photosensitive tag

Auteurs: Anne M. van der Leun, Mirjam E. Hoekstra, Luuk Reinalda, Colinda L. G. J. Scheele, Mireille Toebes, Michel J. van de Graaff, Linda Y. Y. Chen, Hanjie Li, Akhiad Bercovich, Yaniv Lubling, Eyal David, Daniela S. Thommen, Amos Tanay, Jacco van Rheenen, Ido Amit, Sander I. van Kasteren & Ton N. Schumacher
Publié dans: Nature Chemical biology, Numéro 17, 2021, Page(s) 1139-1147, ISSN 1552-4450
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-021-00839-x

Using BONCAT to dissect the proteome of <i>S. aureus</i> persisters

Auteurs: Eva D. C. George Matlalcuatzi, Thomas Bakkum, Pooja S. Thomas, Stephan Hacker, Bogdan I. Florea, Bastienne Vriesendorp, Daniel E. Rozen, Sander I. van Kasteren
Publié dans: mSphere, Numéro 10, 2025, Page(s) e00431-25, ISSN 2379-5042
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/msphere.00431-25

Citrullinated human and murine MOG35-55 display distinct biophysical and biochemical behavior

Auteurs: W. Doelman, R.C. Reijnen, N. Dijksman, A.P.A. Janssen, N. van Driel, B.A. ’t Hart, I. Philippens, C. Araman, W. Baron, S.I. van Kasteren
Publié dans: Journal of Biological Chemistry, 2023, ISSN 1083-351X
Éditeur: Elsevier Inc on behalf of American Society for Biochemistry and Molecular Biology
DOI: 10.1016/j.jbc.2023.103065

Bioorthogonal Correlative Light-Electron Microscopy of Mycobacterium tuberculosis in Macrophages Reveals the Effect of Antituberculosis Drugs on Subcellular Bacterial Distribution

Auteurs: Thomas Bakkum, Matthias T. Heemskerk, Erik Bos, Mirjam Groenewold, Nikolaos Oikonomeas-Koppasis, Kimberley V. Walburg, Suzanne van Veen, Martijn J. C. van der Lienden, Tyrza van Leeuwen, Marielle C. Haks, Tom H. M. Ottenhoff, Abraham J. Koster, and Sander I. van Kasteren
Publié dans: ACS Central Science, Numéro 6,11, 2020, Page(s) 1997–2007, ISSN 2374-7943
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acscentsci.0c00539

A Lysosome-Targeted Tetrazine for Organelle-Specific Click-to-Release Chemistry in Antigen Presenting Cells

Auteurs: Nina A.M. Ligthart, Mark A.R. de Geus, Merel A.T. van de Plassche, Diana Torres García, Marjolein M.E. Isendoorn, Luuk Reinalda, Daniëlle Ofman, Tyrza van Leeuwen, Sander I. van Kasteren
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 145, 2023, Page(s) 12630-12640, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c02139

Probing the metalloproteome: an 8-mercaptoquinoline motif enriches minichromosome maintenance complex components as significant metalloprotein targets in live cells

Auteurs: Sean M. McKenna, Bogdan I. Florea, Daniela M. Zisterer, Sander I. van Kasteren, Joanna F. McGouran
Publié dans: RSC Chemical Biology, Numéro 5, 2024, Page(s) 776-786, ISSN 2633-0679
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4cb00053f

Subcellular glycan-mannose receptor binding kinetics correlate with myeloid cell function

Auteurs: Kas Steuten, Johannes J. A. Bakker, Ward Doelman, Diana Torres-García, Amit Cherian, Christian Kurts, Roger Riera, Lorenzo Albertazzi, Sander I. van Kasteren
Publié dans: Nature Communications, Numéro 17, 2026, Page(s) n.a., ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-67602-x

Live-cell imaging of sterculic acid - a naturally occurring 1,2-cyclopropene fatty acid - by bioorthogonal reaction with turn-on tetrazine-fluorophore conjugates

Auteurs: Kristine Bertheussen; Merel van de Plassche; Thomas Bakkum; Berend Gagestein; Iakovia Ttofi; Alexi J. C. Sarris; Herman S. Overkleeft; Mario van der Stelt; Sander I. van Kasteren
Publié dans: Angewandte Chemie (International Edition), Numéro 1, 2022, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.

Application of a Highly Selective Cathepsin S Two-step Activity-Based Probe in Multicolor Bio-Orthogonal Correlative Light-Electron Microscopy

Auteurs: Floris J. van Dalen; Thomas Bakkum; Tyrza van Leeuwen; Mirjam Groenewold; Edgar Deu; Abraham J. Koster; Sander I. van Kasteren; Martijn Verdoes
Publié dans: Frontiers in Chemistry, Numéro 1, 2021, Page(s) 628433, ISSN 2296-2646
Éditeur: Frontiers
DOI: 10.3389/fchem.2020.628433

Bioorthogonal Peptide Enrichment From Complex Samples Using a Rink-Amide-Based Catch-and-Release Strategy

Auteurs: Tyrza van Leeuwen, Ward Doelman, Robin W.R. van den Kieboom, Bogdan I. Florea, Sander I. van Kasteren
Publié dans: ChemBioChem, Numéro e202300082, 2023, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202300082

A Bioorthogonal Dual Fluorogenic Probe for the Live‐Cell Monitoring of Nutrient Uptake by Mammalian Cells

Auteurs: Yixuan Wang, Diana Torres‐García, Thijmen P. Mostert, Luuk Reinalda, Sander I. Van Kasteren
Publié dans: Angewandte Chemie, Numéro 136, 2025, Page(s) n.a., ISSN 0044-8249
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/ange.202401733

<i>trans</i>-Cyclooctene-caged-IL-1β immunocytokine-constructs ligated to unmodified nanobodies allow click-2-release-based control of cytokine activity

Auteurs: Amber Barendrecht, Heleen H. C. Peeters, Diana Torres-García, M. Thierry Shema, Alexi J. C. Sarris, Shimrit David, Göktuğ Aba, Camille M. Le Gall, Martin Wilkovitsch, Martijn Verdoes, Hannes Mikula, Mark A. Travis, Sander I. van Kasteren
Publié dans: RSC Chemical Biology, Numéro 6, 2025, Page(s) 1068-1078, ISSN 2633-0679
Éditeur: Royal Society of Chemistry (RSC)
DOI: 10.1039/d5cb00113g

Methyltetrazine as a small live-cell compatible bioorthogonal handle for imaging enzyme activities in situ

Auteurs: Diana Torres-García; Merel A. T. van de Plassche; Emma van Boven; Tyrza van Leeuwen; Mirjam G. J. Groenewold; Alexi J. C. Sarris; Luuk Klein; Herman S. Overkleeft; Sander I. van Kasteren
Publié dans: RSC Chemical Biology, Numéro 1, 2022, Page(s) 1325-1330, ISSN 2633-0679
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2cb00120a

Bioorthogonal click chemistry to visualize an immunogenic HLA-A2-restricted hepatitis B virus epitope in human monocyte-derived dendritic cells

Auteurs: Thijmen P Mostert, Amy L Kessler, Robbie J Luijten, Ward Doelman, Marjolein M E Isendoorn, Dmitri V Filippov, Sander I van Kasteren, Sonja I Buschow
Publié dans: The Journal of Immunology, Numéro 24, 2025, Page(s) vkaf312, ISSN 0022-1767
Éditeur: American Association of Immunologists
DOI: 10.1093/jimmun/vkaf312

Single-molecule imaging of glycan–lectin interactions on cells with Glyco-PAINT

Auteurs: Roger Riera, Tim P. Hogervorst, Ward Doelman, Yan Ni, Silvia Pujals, Evangelia Bolli, Jeroen D. C. Codée, Sander I. van Kasteren & Lorenzo Albertazzi
Publié dans: Nature Chemical Biology, Numéro 17, 2021, Page(s) 1281-1288, ISSN 1552-4450
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-021-00896-2

Bioorthogonal protein labelling enables the study of antigen processing of citrullinated and carbamylated auto-antigens

Auteurs: Tyrza van Leeuwen; Can Araman; Linda Pieper Pournara; Arieke S. B. Kampstra; Thomas Bakkum; Mikkel H. S. Marqvorsen; Clarissa R. Nascimento; G. J. Mirjam Groenewold; Willemijn van der Wulp; Marcel Camps; George M.C. Janssen; Peter A. van Veelen; Gerard J. P. van Westen; Antonius P A Janssen; Bogdan I. Florea; Herman S. Overkleeft; Ferry Ossendorp; René E. M. Toes; Sander I. van Kasteren
Publié dans: RSC Chemical Biology, Numéro 2, 2021, Page(s) 855-862, ISSN 2633-0679
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cb00009h